More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_16191 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008819  NATL1_19381  Fe-S oxidoreductase  69.67 
 
 		 537 aa  829    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0679  radical SAM domain-containing protein  66.6 
 
 		 532 aa  745    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.538704  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1063  Fe-S oxidoreductase  72.06 
 
 		 537 aa  826    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.297828  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2065  Radical SAM domain protein  68.48 
 
 		 530 aa  769    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1258  radical SAM family protein  67.25 
 
 		 529 aa  748    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16781  Fe-S oxidoreductase  64.38 
 
 		 539 aa  753    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2963  Radical SAM domain protein  64.59 
 
 		 522 aa  731    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2035  Elongator protein 3/MiaB/NifB  77.99 
 
 		 518 aa  883    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17011  Fe-S oxidoreductase  66.54 
 
 		 539 aa  768    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0308  Elongator protein 3/MiaB/NifB  77.59 
 
 		 529 aa  886    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1590  Fe-S oxidoreductase  66.15 
 
 		 539 aa  764    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  hitchhiker  0.00141696  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0799  Elongator protein 3  68.46 
 
 		 526 aa  755    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0832  Radical SAM domain protein  66.6 
 
 		 527 aa  736    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.170506 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23771  Fe-S oxidoreductase  80.92 
 
 		 538 aa  904    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0282707 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16191  Fe-S oxidoreductase  100 
 
 		 544 aa  1131    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.468335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16891  Fe-S oxidoreductase  66.54 
 
 		 539 aa  769    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.779533  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2089  Radical SAM domain protein  68.48 
 
 		 530 aa  770    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.670556 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0238  radical SAM domain-containing protein  27.67 
 
 		 461 aa  111  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.140637  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2195  Radical SAM domain protein  29.43 
 
 		 460 aa  106  9e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.565929  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1693  radical SAM family protein  26.52 
 
 		 467 aa  102  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3608  radical SAM domain-containing protein  28.52 
 
 		 459 aa  100  8e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2523  Radical SAM domain protein  26.88 
 
 		 424 aa  89.7  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0388324 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0454  radical SAM domain-containing protein  32.04 
 
 		 576 aa  88.6  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.849524 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0820  Radical SAM domain protein  32.04 
 
 		 583 aa  87.8  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4225  radical SAM domain-containing protein  31.49 
 
 		 576 aa  86.7  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.332961 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0920  radical SAM domain-containing protein  25.55 
 
 		 451 aa  85.5  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1699  Radical SAM domain protein  26.62 
 
 		 424 aa  83.6  0.000000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000206113  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3090  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  28.49 
 
 		 476 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000038537  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2566  radical SAM domain-containing protein  24.62 
 
 		 426 aa  81.6  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.162584  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2577  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  27.39 
 
 		 674 aa  80.5  0.00000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.451691  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0909  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  29.5 
 
 		 681 aa  78.6  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3236  Radical SAM domain protein  26.07 
 
 		 462 aa  77.8  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3553  Radical SAM domain protein  25.63 
 
 		 474 aa  77.8  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2283  Radical SAM domain protein  25.23 
 
 		 473 aa  77  0.0000000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.257116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2963  radical SAM domain-containing protein  25.26 
 
 		 476 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000286011  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0689  Radical SAM domain protein  26.03 
 
 		 459 aa  75.9  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3569  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  26.72 
 
 		 478 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.663184 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2416  radical SAM family protein  28.02 
 
 		 475 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000137144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1016  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester oxidative cyclase  28.03 
 
 		 584 aa  75.1  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1150  oxidative cyclase-related protein  28.02 
 
 		 475 aa  74.7  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3415  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  30.41 
 
 		 472 aa  74.7  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0671  Radical SAM domain protein  25.77 
 
 		 468 aa  74.3  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1705  cobalamin B12-binding/radical SAM family protein  29.82 
 
 		 472 aa  73.9  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.900478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3057  Radical SAM domain protein  24.65 
 
 		 518 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00748759  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1648  Radical SAM domain protein  27.61 
 
 		 450 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  27.24 
 
 		 1250 aa  73.2  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0143  cobalamin B12-binding domain-containing protein  24.24 
 
 		 583 aa  72  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0605658  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2873  radical SAM domain-containing protein  24.14 
 
 		 520 aa  72.4  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000297506  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2351  Radical SAM domain protein  24.33 
 
 		 426 aa  72.8  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3058  radical SAM domain-containing protein  21.47 
 
 		 529 aa  72  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111955  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3593  radical SAM domain-containing protein  27.49 
 
 		 472 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000974767  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0762  Fe-S oxidoreductase  24.82 
 
 		 484 aa  71.6  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.151938  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2825  radical SAM domain-containing protein  25.7 
 
 		 476 aa  71.2  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000393045  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1200  cobalamin B12-binding domain-containing protein  22.26 
 
 		 441 aa  70.9  0.00000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4964  radical SAM family protein  23.46 
 
 		 476 aa  70.5  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.576294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0376  radical SAM domain-containing protein  28.18 
 
 		 433 aa  70.1  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0414491  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1255  radical SAM domain-containing protein  22.61 
 
 		 441 aa  70.1  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1038  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  27.06 
 
 		 479 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000337224 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1009  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  27.06 
 
 		 479 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2185  Radical SAM domain protein  29.65 
 
 		 473 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000424629  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3370  cobalamin B12-binding  25.09 
 
 		 618 aa  69.3  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.818313  normal  0.0333946 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0797  Radical SAM domain protein  26.05 
 
 		 489 aa  68.6  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1049  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 398 aa  68.6  0.0000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3883  radical SAM family protein  27.42 
 
 		 577 aa  68.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.153148  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3382  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  27.53 
 
 		 473 aa  68.2  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1024  Radical SAM domain protein  25.48 
 
 		 467 aa  67.8  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3991  Radical SAM domain protein  27.32 
 
 		 572 aa  67  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0878  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  26.97 
 
 		 473 aa  67  0.0000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.858521  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3504  cobalamin B12-binding/radical SAM family protein  23.47 
 
 		 677 aa  67  0.0000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4030  Radical SAM domain protein  27.72 
 
 		 573 aa  66.6  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0233  Radical SAM domain protein  22.07 
 
 		 723 aa  65.9  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.677011 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0800  radical SAM domain-containing protein  24.55 
 
 		 455 aa  65.9  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.422662  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1034  radical SAM domain-containing protein  25.13 
 
 		 393 aa  65.9  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.851598  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2324  radical SAM domain-containing protein  26.77 
 
 		 434 aa  65.9  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0710  radical SAM domain-containing protein  26.37 
 
 		 516 aa  65.9  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631588 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1836  radical SAM domain-containing protein  25.58 
 
 		 474 aa  65.5  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1169  radical SAM family protein  22.18 
 
 		 372 aa  65.1  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.198127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1938  Radical SAM domain protein  27.32 
 
 		 500 aa  65.5  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3195  Radical SAM domain protein  25.21 
 
 		 552 aa  64.7  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00554212 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3364  Radical SAM domain protein  23.1 
 
 		 564 aa  64.7  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.669906 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2319  radical SAM family Fe-S protein  26.29 
 
 		 501 aa  65.1  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.518236  normal  0.0137531 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0504  radical SAM domain-containing protein  27.01 
 
 		 471 aa  64.7  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3186  radical SAM family protein  28.74 
 
 		 583 aa  64.3  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1178  radical SAM domain-containing protein  25.89 
 
 		 439 aa  63.5  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2929  radical SAM domain-containing protein  28.65 
 
 		 497 aa  63.5  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.43282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1424  Radical SAM domain protein  27.33 
 
 		 520 aa  63.5  0.000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.186266 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4199  cobalamin B12-binding:radical SAM family protein  23.44 
 
 		 548 aa  62.8  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.122489 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3165  Fe-S oxidoreductase  25.4 
 
 		 459 aa  63.2  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00148517 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2118  Radical SAM domain protein  29.27 
 
 		 502 aa  63.2  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1625  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  25.59 
 
 		 558 aa  63.2  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2171  radical SAM domain-containing protein  30.2 
 
 		 512 aa  63.2  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2473  radical SAM domain-containing protein  21.94 
 
 		 468 aa  62.8  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0785227  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2171  Radical SAM domain protein  26.18 
 
 		 509 aa  62.4  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1159  radical SAM family protein  22.69 
 
 		 510 aa  62.4  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.044499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1735  cobalamin B12-binding domain protein  24.5 
 
 		 590 aa  62  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0577  radical SAM domain-containing protein  26.23 
 
 		 473 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2796  radical SAM domain-containing protein  26.23 
 
 		 481 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0536346  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1767  radical SAM domain-containing protein  26.23 
 
 		 503 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.580532  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1626  Radical SAM domain protein  25.56 
 
 		 444 aa  61.2  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1750  radical SAM domain-containing protein  26.23 
 
 		 473 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.499976  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>