More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0143 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0143  cobalamin B12-binding domain-containing protein  100 
 
 		 583 aa  1203    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0605658  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1897  radical SAM domain-containing protein  39.89 
 
 		 559 aa  410  1e-113  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1616  radical SAM domain-containing protein  39.72 
 
 		 559 aa  406  1.0000000000000001e-112  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.710753  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3186  radical SAM family protein  45.78 
 
 		 583 aa  400  9.999999999999999e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1735  cobalamin B12-binding domain protein  40.79 
 
 		 590 aa  376  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0488  Radical SAM domain protein  42.54 
 
 		 575 aa  373  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1016  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester oxidative cyclase  36.49 
 
 		 584 aa  371  1e-101  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0840  cobalamin B12-binding domain protein  38.45 
 
 		 590 aa  364  3e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1404  radical SAM domain-containing protein  36.56 
 
 		 562 aa  347  2e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00022345  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4724  Radical SAM domain protein  38.13 
 
 		 581 aa  340  5e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0197  radical SAM family protein  37.35 
 
 		 656 aa  336  5.999999999999999e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1298  radical SAM domain-containing protein  37.44 
 
 		 600 aa  317  5e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3387  Radical SAM domain protein  34.27 
 
 		 557 aa  294  3e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.384607  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1757  Radical SAM domain protein  38.12 
 
 		 535 aa  293  4e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0257963  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0494  Fe-S oxidoreductase  32.05 
 
 		 569 aa  293  5e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0859  Radical SAM domain protein  33.87 
 
 		 557 aa  289  1e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0614  radical SAM domain-containing protein  33.18 
 
 		 570 aa  280  5e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.69222  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1571  Radical SAM domain protein  33.18 
 
 		 505 aa  238  2e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.805269  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0042  radical SAM family protein  31.72 
 
 		 502 aa  233  6e-60  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0959  radical SAM family protein  31.92 
 
 		 530 aa  227  6e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3079  radical SAM family protein  31.71 
 
 		 530 aa  224  4.9999999999999996e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.265778  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4163  radical SAM family protein  31.08 
 
 		 524 aa  220  6e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1018  Radical SAM domain protein  30.16 
 
 		 504 aa  217  5e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0387  radical SAM domain-containing protein  28.94 
 
 		 552 aa  215  1.9999999999999998e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.971696  normal  0.247194 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2424  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  29.59 
 
 		 551 aa  213  4.9999999999999996e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141544  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4256  radical SAM family protein  28.85 
 
 		 536 aa  209  8e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0866  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase family protein, putative  28.24 
 
 		 504 aa  208  3e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0101  radical SAM family protein  26.77 
 
 		 624 aa  150  7e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00410532  normal  0.882418 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2992  Radical SAM domain protein  25.91 
 
 		 622 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0050661  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0124  radical SAM domain-containing protein  26.28 
 
 		 625 aa  140  7e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0216543  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0741  radical SAM domain-containing protein  24.55 
 
 		 623 aa  137  5e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2487  Fe-S oxidoreductase  24.76 
 
 		 609 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0273  radical SAM domain-containing protein  26.15 
 
 		 589 aa  130  6e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0302705  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0076  Radical SAM domain protein  25.51 
 
 		 616 aa  128  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.3742100000000001e-34 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0093  Radical SAM domain protein  25.99 
 
 		 490 aa  126  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0584264  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0643  Radical SAM domain protein  27.38 
 
 		 489 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3304  Radical SAM domain protein  25.51 
 
 		 487 aa  109  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.542811  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3058  radical SAM domain-containing protein  25.19 
 
 		 529 aa  107  4e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111955  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3180  radical SAM domain-containing protein  25.45 
 
 		 646 aa  107  5e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1100  radical SAM domain-containing protein  26.85 
 
 		 470 aa  107  7e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0944  Radical SAM domain protein  24.93 
 
 		 488 aa  105  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000117321 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0671  Radical SAM domain protein  28.52 
 
 		 468 aa  105  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2434  radical SAM domain-containing protein  23.81 
 
 		 520 aa  96.3  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2435  radical SAM domain-containing protein  24.31 
 
 		 524 aa  95.9  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000772503  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3057  Radical SAM domain protein  24.85 
 
 		 518 aa  95.5  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00748759  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2873  radical SAM domain-containing protein  24.09 
 
 		 520 aa  95.5  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000297506  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0689  Radical SAM domain protein  25.48 
 
 		 459 aa  95.5  3e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1369  radical SAM domain-containing protein  25.33 
 
 		 556 aa  92  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000805279  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2433  radical SAM domain-containing protein  25.97 
 
 		 502 aa  92.4  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2592  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  29.29 
 
 		 608 aa  91.3  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000154642  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3713  radical SAM domain-containing protein  24.58 
 
 		 669 aa  90.9  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3574  radical SAM domain-containing protein  24.28 
 
 		 461 aa  89.7  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0233  Radical SAM domain protein  26.06 
 
 		 723 aa  90.1  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.677011 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2638  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  26.45 
 
 		 512 aa  89  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2185  Radical SAM domain protein  20.77 
 
 		 473 aa  89  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000424629  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0897  Radical SAM domain protein  24.44 
 
 		 564 aa  87.8  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000336813  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2523  Radical SAM domain protein  26.28 
 
 		 424 aa  87.4  7e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0388324 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1171  radical SAM family protein  24.1 
 
 		 563 aa  87.4  7e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000834486  normal  0.0316133 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0114  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.25 
 
 		 609 aa  87  8e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1668  Elongator protein 3/MiaB/NifB  28.23 
 
 		 612 aa  87  9e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0607785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3195  Radical SAM domain protein  25.39 
 
 		 552 aa  86.7  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00554212 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2941  radical SAM domain-containing protein  24.2 
 
 		 625 aa  86.3  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.151615 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0513  Radical SAM domain protein  30.54 
 
 		 609 aa  86.3  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0874  radical SAM family Fe-S protein  26.96 
 
 		 501 aa  85.1  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3415  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  23.27 
 
 		 472 aa  84.7  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0138  Radical SAM domain protein  29.12 
 
 		 608 aa  84.3  0.000000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000809293  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2479  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  23.77 
 
 		 484 aa  83.6  0.000000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.515921  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3364  Radical SAM domain protein  25.43 
 
 		 564 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.669906 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1742  radical SAM domain-containing protein  25.55 
 
 		 521 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1255  radical SAM domain-containing protein  28.82 
 
 		 441 aa  82.8  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1200  cobalamin B12-binding domain-containing protein  28.82 
 
 		 441 aa  82.8  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0762  Fe-S oxidoreductase  25.65 
 
 		 484 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.151938  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3593  radical SAM domain-containing protein  22.93 
 
 		 472 aa  82.8  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000974767  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4199  cobalamin B12-binding:radical SAM family protein  22.97 
 
 		 548 aa  81.6  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.122489 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2283  Radical SAM domain protein  23.41 
 
 		 473 aa  81.3  0.00000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.257116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2473  radical SAM domain-containing protein  25.09 
 
 		 468 aa  80.9  0.00000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0785227  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2413  radical SAM domain-containing protein  23.53 
 
 		 437 aa  80.1  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2577  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  24.6 
 
 		 674 aa  79  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.451691  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0871  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  22.29 
 
 		 554 aa  78.6  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1705  cobalamin B12-binding/radical SAM family protein  22.43 
 
 		 472 aa  78.6  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.900478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2963  radical SAM domain-containing protein  26.6 
 
 		 476 aa  77.4  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000286011  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1063  Fe-S oxidoreductase  27.37 
 
 		 537 aa  77.4  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.297828  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0515  Radical SAM domain protein  28.53 
 
 		 603 aa  77  0.0000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3090  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  25.14 
 
 		 476 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000038537  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3165  Fe-S oxidoreductase  24.35 
 
 		 459 aa  75.5  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00148517 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0353  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  21.64 
 
 		 485 aa  75.5  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.90319 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0876  radical SAM family Fe-S protein  22.97 
 
 		 461 aa  75.5  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.430138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19381  Fe-S oxidoreductase  27.37 
 
 		 537 aa  75.1  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2416  radical SAM family protein  25.96 
 
 		 475 aa  74.7  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000137144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3504  cobalamin B12-binding/radical SAM family protein  23.95 
 
 		 677 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2825  radical SAM domain-containing protein  25.61 
 
 		 476 aa  73.2  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000393045  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1699  Radical SAM domain protein  24.33 
 
 		 424 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000206113  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16191  Fe-S oxidoreductase  24.24 
 
 		 544 aa  72  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.468335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1625  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  24.53 
 
 		 558 aa  72  0.00000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0909  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  24.92 
 
 		 681 aa  72  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1648  Radical SAM domain protein  26.71 
 
 		 450 aa  70.9  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1150  oxidative cyclase-related protein  25 
 
 		 475 aa  70.9  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2393  radical SAM domain-containing protein  22.8 
 
 		 490 aa  70.5  0.00000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.386797  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2281  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  22.89 
 
 		 520 aa  70.5  0.00000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17011  Fe-S oxidoreductase  23.99 
 
 		 539 aa  70.5  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>