More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_16891 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_2065  Radical SAM domain protein  62.45 
 
 		 530 aa  705    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17011  Fe-S oxidoreductase  96.29 
 
 		 539 aa  1087    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0679  radical SAM domain-containing protein  61.93 
 
 		 532 aa  688    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.538704  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1063  Fe-S oxidoreductase  68.86 
 
 		 537 aa  782    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.297828  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2089  Radical SAM domain protein  62.45 
 
 		 530 aa  705    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.670556 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1258  radical SAM family protein  62.52 
 
 		 529 aa  694    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2035  Elongator protein 3/MiaB/NifB  68.22 
 
 		 518 aa  781    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0308  Elongator protein 3/MiaB/NifB  69.14 
 
 		 529 aa  790    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16781  Fe-S oxidoreductase  83.86 
 
 		 539 aa  957    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1590  Fe-S oxidoreductase  94.49 
 
 		 539 aa  1043    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  hitchhiker  0.00141696  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0799  Elongator protein 3  64.65 
 
 		 526 aa  719    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19381  Fe-S oxidoreductase  68.86 
 
 		 537 aa  781    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16891  Fe-S oxidoreductase  100 
 
 		 539 aa  1118    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.779533  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16191  Fe-S oxidoreductase  66.54 
 
 		 544 aa  769    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.468335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23771  Fe-S oxidoreductase  66.73 
 
 		 538 aa  773    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0282707 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2963  Radical SAM domain protein  63.17 
 
 		 522 aa  692    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0832  Radical SAM domain protein  60.93 
 
 		 527 aa  688    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.170506 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1693  radical SAM family protein  23.53 
 
 		 467 aa  102  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3608  radical SAM domain-containing protein  27.1 
 
 		 459 aa  97.4  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0238  radical SAM domain-containing protein  25.71 
 
 		 461 aa  96.3  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.140637  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2195  Radical SAM domain protein  30.88 
 
 		 460 aa  90.5  8e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.565929  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1699  Radical SAM domain protein  22.28 
 
 		 424 aa  79  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000206113  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  25.96 
 
 		 1250 aa  78.6  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2523  Radical SAM domain protein  23.66 
 
 		 424 aa  78.6  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0388324 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0920  radical SAM domain-containing protein  22.75 
 
 		 451 aa  77  0.0000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3090  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  26.24 
 
 		 476 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000038537  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0909  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  26.15 
 
 		 681 aa  76.3  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2577  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  23.31 
 
 		 674 aa  76.6  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.451691  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3058  radical SAM domain-containing protein  22.09 
 
 		 529 aa  75.1  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111955  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2351  Radical SAM domain protein  23.49 
 
 		 426 aa  74.7  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3165  Fe-S oxidoreductase  24.21 
 
 		 459 aa  73.6  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00148517 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1200  cobalamin B12-binding domain-containing protein  23.21 
 
 		 441 aa  73.6  0.000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2963  radical SAM domain-containing protein  27.37 
 
 		 476 aa  73.6  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000286011  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0689  Radical SAM domain protein  25.39 
 
 		 459 aa  72.4  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3569  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  26.44 
 
 		 478 aa  72.4  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.663184 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2566  radical SAM domain-containing protein  24.31 
 
 		 426 aa  72.8  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.162584  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1255  radical SAM domain-containing protein  23.42 
 
 		 441 aa  72  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0454  radical SAM domain-containing protein  29.27 
 
 		 576 aa  72  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.849524 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1648  Radical SAM domain protein  26.12 
 
 		 450 aa  72  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2873  radical SAM domain-containing protein  21.61 
 
 		 520 aa  70.9  0.00000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000297506  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2416  radical SAM family protein  25.79 
 
 		 475 aa  70.9  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000137144  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3195  Radical SAM domain protein  25.18 
 
 		 552 aa  70.9  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00554212 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4225  radical SAM domain-containing protein  28.78 
 
 		 576 aa  70.5  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.332961 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0820  Radical SAM domain protein  27.8 
 
 		 583 aa  69.7  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1150  oxidative cyclase-related protein  24.74 
 
 		 475 aa  68.6  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3553  Radical SAM domain protein  23.87 
 
 		 474 aa  68.6  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1927  cobalamin B12-binding domain protein  28.7 
 
 		 288 aa  68.2  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.2434  normal  0.204325 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3593  radical SAM domain-containing protein  22.73 
 
 		 472 aa  67.8  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000974767  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1864  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  24.62 
 
 		 565 aa  67.8  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.599667  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2171  radical SAM domain-containing protein  29.33 
 
 		 512 aa  67.8  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1009  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  26.82 
 
 		 479 aa  67  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1038  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  26.82 
 
 		 479 aa  67  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000337224 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1705  cobalamin B12-binding/radical SAM family protein  26.04 
 
 		 472 aa  67  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.900478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1016  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester oxidative cyclase  26.91 
 
 		 584 aa  67  0.0000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2283  Radical SAM domain protein  23.02 
 
 		 473 aa  67  0.0000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.257116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0986  radical SAM domain-containing protein  31.5 
 
 		 600 aa  66.6  0.0000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2825  radical SAM domain-containing protein  25.79 
 
 		 476 aa  67  0.0000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000393045  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3415  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  26.63 
 
 		 472 aa  66.6  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0143  cobalamin B12-binding domain-containing protein  23.29 
 
 		 583 aa  66.2  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0605658  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1061  cobalamin B12-binding  28.49 
 
 		 529 aa  65.5  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000412719  decreased coverage  0.00000367319 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1938  Radical SAM domain protein  27.31 
 
 		 500 aa  65.9  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0710  radical SAM domain-containing protein  26.01 
 
 		 516 aa  66.2  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631588 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1100  radical SAM domain-containing protein  25.21 
 
 		 470 aa  65.1  0.000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2319  radical SAM family Fe-S protein  28.18 
 
 		 501 aa  65.1  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.518236  normal  0.0137531 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0154  Elongator protein 3/MiaB/NifB  24.64 
 
 		 479 aa  64.7  0.000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000374319  normal  0.695654 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3863  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  23.44 
 
 		 580 aa  64.7  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0582854  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0797  Radical SAM domain protein  27.75 
 
 		 489 aa  64.3  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3089  radical SAM domain-containing protein  31.95 
 
 		 444 aa  64.3  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1487  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  24.15 
 
 		 567 aa  64.3  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2185  Radical SAM domain protein  22.73 
 
 		 473 aa  64.3  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000424629  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3057  Radical SAM domain protein  23.77 
 
 		 518 aa  63.9  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00748759  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1795  cobalamin B12-binding  25.77 
 
 		 529 aa  63.5  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1049  radical SAM domain-containing protein  22.67 
 
 		 398 aa  63.5  0.000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3382  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  26.4 
 
 		 473 aa  63.5  0.000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1836  radical SAM domain-containing protein  22.65 
 
 		 474 aa  63.5  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4531  Radical SAM domain protein  25.18 
 
 		 533 aa  63.5  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0251  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  25.17 
 
 		 546 aa  63.2  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.42517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4478  radical SAM family protein  23.79 
 
 		 554 aa  62.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.140837  normal  0.22726 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1178  radical SAM domain-containing protein  23.75 
 
 		 439 aa  62.8  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4030  Radical SAM domain protein  24.55 
 
 		 573 aa  63.5  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0878  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  25.84 
 
 		 473 aa  62.4  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.858521  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0762  Fe-S oxidoreductase  24.7 
 
 		 484 aa  62.4  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.151938  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3883  radical SAM family protein  24.34 
 
 		 577 aa  62.4  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.153148  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3991  Radical SAM domain protein  24.55 
 
 		 572 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3826  radical SAM domain-containing protein  30.22 
 
 		 561 aa  62  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2118  Radical SAM domain protein  24.57 
 
 		 502 aa  62  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3574  radical SAM domain-containing protein  25.51 
 
 		 461 aa  62  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1369  radical SAM domain-containing protein  23.78 
 
 		 556 aa  61.6  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000805279  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4964  radical SAM family protein  26.37 
 
 		 476 aa  61.2  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.576294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1976  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  24.31 
 
 		 546 aa  61.2  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.175578  normal  0.725626 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1424  Radical SAM domain protein  26.38 
 
 		 520 aa  61.2  0.00000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.186266 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1724  radical SAM family protein  28.88 
 
 		 533 aa  61.2  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5168  radical SAM domain-containing protein  26.86 
 
 		 527 aa  60.8  0.00000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4087  radical SAM domain-containing protein  28.28 
 
 		 458 aa  60.8  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1750  radical SAM domain-containing protein  27.07 
 
 		 473 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.499976  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0577  radical SAM domain-containing protein  27.07 
 
 		 473 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2859  Fe-S oxidoreductase  27.07 
 
 		 473 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1767  radical SAM domain-containing protein  27.07 
 
 		 503 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.580532  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2201  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  26.24 
 
 		 473 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1590  Radical SAM domain protein  24.8 
 
 		 488 aa  60.5  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>