More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1590 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008817  P9515_16781  Fe-S oxidoreductase  84.42 
 
 		 539 aa  966    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1063  Fe-S oxidoreductase  67.23 
 
 		 537 aa  780    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.297828  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1258  radical SAM family protein  63.91 
 
 		 529 aa  703    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16891  Fe-S oxidoreductase  94.25 
 
 		 539 aa  1066    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.779533  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17011  Fe-S oxidoreductase  94.81 
 
 		 539 aa  1073    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16191  Fe-S oxidoreductase  66.15 
 
 		 544 aa  765    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.468335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2035  Elongator protein 3/MiaB/NifB  68.22 
 
 		 518 aa  781    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0308  Elongator protein 3/MiaB/NifB  69.14 
 
 		 529 aa  790    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2963  Radical SAM domain protein  63.17 
 
 		 522 aa  692    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19381  Fe-S oxidoreductase  68.86 
 
 		 537 aa  780    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1590  Fe-S oxidoreductase  100 
 
 		 539 aa  1118    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  hitchhiker  0.00141696  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0799  Elongator protein 3  65.23 
 
 		 526 aa  723    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2089  Radical SAM domain protein  62.84 
 
 		 530 aa  706    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.670556 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0679  radical SAM domain-containing protein  62.92 
 
 		 532 aa  694    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.538704  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2065  Radical SAM domain protein  62.84 
 
 		 530 aa  706    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23771  Fe-S oxidoreductase  66.15 
 
 		 538 aa  764    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0282707 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0832  Radical SAM domain protein  61.51 
 
 		 527 aa  692    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.170506 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1693  radical SAM family protein  24.66 
 
 		 467 aa  103  8e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0238  radical SAM domain-containing protein  25.71 
 
 		 461 aa  99  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.140637  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3608  radical SAM domain-containing protein  27.39 
 
 		 459 aa  96.7  9e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2195  Radical SAM domain protein  28.85 
 
 		 460 aa  94.4  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.565929  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0920  radical SAM domain-containing protein  21.37 
 
 		 451 aa  80.1  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2523  Radical SAM domain protein  23.57 
 
 		 424 aa  77.4  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0388324 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2873  radical SAM domain-containing protein  22.33 
 
 		 520 aa  76.3  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000297506  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3058  radical SAM domain-containing protein  21.97 
 
 		 529 aa  75.9  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111955  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1699  Radical SAM domain protein  21.92 
 
 		 424 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000206113  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  25.4 
 
 		 1250 aa  75.1  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2351  Radical SAM domain protein  25.48 
 
 		 426 aa  73.6  0.000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3165  Fe-S oxidoreductase  24.84 
 
 		 459 aa  73.2  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00148517 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3090  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  25.7 
 
 		 476 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000038537  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0909  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  24.46 
 
 		 681 aa  73.2  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1648  Radical SAM domain protein  26.12 
 
 		 450 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0454  radical SAM domain-containing protein  28.78 
 
 		 576 aa  71.6  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.849524 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2963  radical SAM domain-containing protein  26.82 
 
 		 476 aa  72  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000286011  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2566  radical SAM domain-containing protein  24.46 
 
 		 426 aa  72  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.162584  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2577  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  22.22 
 
 		 674 aa  71.2  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.451691  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3553  Radical SAM domain protein  24.52 
 
 		 474 aa  70.5  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4225  radical SAM domain-containing protein  28.29 
 
 		 576 aa  70.1  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.332961 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0820  Radical SAM domain protein  27.8 
 
 		 583 aa  69.7  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0689  Radical SAM domain protein  25.54 
 
 		 459 aa  68.9  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3569  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  25.29 
 
 		 478 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.663184 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1150  oxidative cyclase-related protein  22.98 
 
 		 475 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1705  cobalamin B12-binding/radical SAM family protein  25.73 
 
 		 472 aa  68.6  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.900478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2416  radical SAM family protein  25.14 
 
 		 475 aa  68.6  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000137144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1100  radical SAM domain-containing protein  25.31 
 
 		 470 aa  68.6  0.0000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1200  cobalamin B12-binding domain-containing protein  22.92 
 
 		 441 aa  68.2  0.0000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1038  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  28.02 
 
 		 479 aa  67.8  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000337224 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1009  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  28.02 
 
 		 479 aa  67.8  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2171  radical SAM domain-containing protein  29.11 
 
 		 512 aa  67.4  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3593  radical SAM domain-containing protein  26.63 
 
 		 472 aa  67.4  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000974767  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1255  radical SAM domain-containing protein  22.46 
 
 		 441 aa  67  0.0000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1927  cobalamin B12-binding domain protein  28.79 
 
 		 288 aa  66.2  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.2434  normal  0.204325 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0710  radical SAM domain-containing protein  25.79 
 
 		 516 aa  66.2  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631588 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3415  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  26.04 
 
 		 472 aa  65.9  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3195  Radical SAM domain protein  24.09 
 
 		 552 aa  65.9  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00554212 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0986  radical SAM domain-containing protein  30.99 
 
 		 600 aa  65.1  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1864  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  24.92 
 
 		 565 aa  65.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.599667  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0797  Radical SAM domain protein  28.8 
 
 		 489 aa  65.1  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2825  radical SAM domain-containing protein  23.46 
 
 		 476 aa  64.3  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000393045  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2283  Radical SAM domain protein  22.27 
 
 		 473 aa  64.3  0.000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.257116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1938  Radical SAM domain protein  27.57 
 
 		 500 aa  63.2  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0154  Elongator protein 3/MiaB/NifB  27.69 
 
 		 479 aa  62.8  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000374319  normal  0.695654 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3574  radical SAM domain-containing protein  24.7 
 
 		 461 aa  63.2  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3057  Radical SAM domain protein  23.68 
 
 		 518 aa  63.2  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00748759  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2185  Radical SAM domain protein  22.03 
 
 		 473 aa  63.2  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000424629  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1016  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester oxidative cyclase  26.91 
 
 		 584 aa  63.5  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1836  radical SAM domain-containing protein  23.42 
 
 		 474 aa  62.8  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1061  cobalamin B12-binding  25 
 
 		 529 aa  62.4  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000412719  decreased coverage  0.00000367319 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1159  radical SAM family protein  22.85 
 
 		 510 aa  62.8  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.044499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1724  radical SAM family protein  30.27 
 
 		 533 aa  62.8  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1049  radical SAM domain-containing protein  22.86 
 
 		 398 aa  62.8  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2929  radical SAM domain-containing protein  26.23 
 
 		 497 aa  62.4  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.43282  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3382  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  25.84 
 
 		 473 aa  62  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3422  Radical SAM domain protein  29.89 
 
 		 541 aa  62  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1795  cobalamin B12-binding  24.35 
 
 		 529 aa  61.6  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1243  radical SAM domain-containing protein  22.11 
 
 		 533 aa  62  0.00000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.445572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4964  radical SAM family protein  24.45 
 
 		 476 aa  61.6  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.576294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2171  Radical SAM domain protein  25.21 
 
 		 509 aa  61.2  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0800  radical SAM domain-containing protein  25.26 
 
 		 455 aa  61.2  0.00000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.422662  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0143  cobalamin B12-binding domain-containing protein  22.37 
 
 		 583 aa  61.2  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0605658  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1369  radical SAM domain-containing protein  23.45 
 
 		 556 aa  60.8  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000805279  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0762  Fe-S oxidoreductase  24.7 
 
 		 484 aa  61.2  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.151938  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4030  Radical SAM domain protein  24.11 
 
 		 573 aa  60.8  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0671  Radical SAM domain protein  22.31 
 
 		 468 aa  60.8  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0878  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  25.28 
 
 		 473 aa  60.8  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.858521  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2319  radical SAM family Fe-S protein  27.22 
 
 		 501 aa  60.8  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.518236  normal  0.0137531 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4087  radical SAM domain-containing protein  25.62 
 
 		 458 aa  60.8  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0840  cobalamin B12-binding domain protein  23.85 
 
 		 590 aa  60.5  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0577  radical SAM domain-containing protein  27.23 
 
 		 473 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2859  Fe-S oxidoreductase  27.23 
 
 		 473 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3504  cobalamin B12-binding/radical SAM family protein  24.55 
 
 		 677 aa  60.5  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1767  radical SAM domain-containing protein  27.23 
 
 		 503 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.580532  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1626  Radical SAM domain protein  26.37 
 
 		 444 aa  60.1  0.00000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1062  radical SAM domain-containing protein  22.66 
 
 		 372 aa  60.5  0.00000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1487  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  23.65 
 
 		 567 aa  60.1  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1750  radical SAM domain-containing protein  27.23 
 
 		 473 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.499976  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1178  radical SAM domain-containing protein  25.11 
 
 		 439 aa  60.1  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2487  Fe-S oxidoreductase  23.3 
 
 		 609 aa  59.7  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3883  radical SAM family protein  25.37 
 
 		 577 aa  59.7  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.153148  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1169  radical SAM family protein  20.21 
 
 		 372 aa  59.7  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.198127  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>