More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1159 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1159  radical SAM family protein  100 
 
 		 510 aa  1041    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.044499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3787  Radical SAM domain protein  41.92 
 
 		 525 aa  364  2e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.182556  normal  0.243034 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3282  radical SAM domain-containing protein  35.11 
 
 		 563 aa  265  2e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0422762  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0418  radical SAM family protein  32.75 
 
 		 557 aa  261  2e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3475  radical SAM domain-containing protein  34.42 
 
 		 613 aa  259  6e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00430694  normal  0.324644 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3062  radical SAM domain-containing protein  34.02 
 
 		 563 aa  258  1e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.477497  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3961  radical SAM domain-containing protein  32.14 
 
 		 566 aa  250  3e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000506678  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0560  Radical SAM domain protein  32.62 
 
 		 557 aa  236  7e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.12594e-30 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0662  Radical SAM domain protein  32.61 
 
 		 545 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0764321  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0548  Radical SAM domain protein  31.68 
 
 		 557 aa  230  4e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.011862  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3640  radical SAM family protein  32.35 
 
 		 589 aa  230  4e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0348  radical SAM domain-containing protein  32.49 
 
 		 544 aa  229  1e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000123778  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3781  Radical SAM domain protein  31.95 
 
 		 589 aa  227  3e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3698  Radical SAM domain protein  31.95 
 
 		 589 aa  227  3e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.360742  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3240  radical SAM domain-containing protein  31.9 
 
 		 812 aa  227  5.0000000000000005e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.47861  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1241  Radical SAM domain protein  29.34 
 
 		 551 aa  226  6e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0874851  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_288  radical SAM domain protein  31.51 
 
 		 559 aa  225  2e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000164247  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2195  Fe-S oxidoreductase  29.92 
 
 		 573 aa  224  3e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.113281  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1233  Radical SAM domain protein  30.33 
 
 		 597 aa  224  3e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0351  radical SAM domain-containing protein  30.7 
 
 		 826 aa  223  4e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.247056  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0327  radical SAM domain-containing protein  31.37 
 
 		 544 aa  223  7e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00004315  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30001  Fe-S oxidoreductase  31.34 
 
 		 532 aa  222  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.601707 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3512  radical SAM family protein  31.64 
 
 		 540 aa  219  7.999999999999999e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.170838  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2131  Radical SAM domain protein  27.64 
 
 		 613 aa  213  7e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0586  radical SAM family protein  30.08 
 
 		 544 aa  211  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3191  radical SAM family protein  30.9 
 
 		 842 aa  212  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0845541  hitchhiker  0.0000000000326362 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1652  Elongator protein 3/MiaB/NifB  30.96 
 
 		 546 aa  211  3e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.606653  normal  0.975032 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2669  Elongator protein 3/MiaB/NifB  33.95 
 
 		 528 aa  210  5e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0247408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3436  Radical SAM domain protein  31.47 
 
 		 537 aa  208  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000587564 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0730  Radical SAM domain protein  31.26 
 
 		 898 aa  208  2e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0485  radical SAM family protein  28.79 
 
 		 910 aa  207  4e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363594  normal  0.576766 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3766  radical SAM domain-containing protein  31.51 
 
 		 593 aa  206  6e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0695  radical SAM family protein  30.83 
 
 		 898 aa  206  6e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.609463  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2030  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.92 
 
 		 894 aa  206  1e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0731  Radical SAM domain protein  30.89 
 
 		 898 aa  206  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0877  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.73 
 
 		 872 aa  204  5e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00856877 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4678  radical SAM domain-containing protein  30.2 
 
 		 543 aa  203  7e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.863222  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4039  Radical SAM domain protein  29.45 
 
 		 538 aa  203  8e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.461651 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0670  hypothetical protein  29.21 
 
 		 898 aa  201  1.9999999999999998e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0662  Radical SAM domain protein  29.65 
 
 		 856 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0682  Radical SAM domain protein  29.65 
 
 		 857 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.877734 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1946  Radical SAM domain protein  29.64 
 
 		 619 aa  200  5e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1280  radical SAM family protein  30.04 
 
 		 879 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00695626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3328  Radical SAM domain protein  27.61 
 
 		 633 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00435818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14180  Fe-S oxidoreductase  28.65 
 
 		 626 aa  198  2.0000000000000003e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0156  radical SAM domain-containing protein  27.98 
 
 		 599 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0312  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.2 
 
 		 887 aa  197  3e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0158  radical SAM domain-containing protein  27.78 
 
 		 599 aa  197  3e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.172348  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0300  radical SAM domain-containing protein  30.89 
 
 		 842 aa  197  6e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000298698  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0676  Radical SAM domain protein  28.81 
 
 		 621 aa  196  6e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00732227  normal  0.444552 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0737  radical SAM domain-containing protein  30 
 
 		 897 aa  196  7e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4341  Radical SAM domain protein  28.36 
 
 		 618 aa  195  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.898209  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2538  radical SAM domain-containing protein  26.25 
 
 		 624 aa  194  3e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569062  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2601  Radical SAM domain protein  31.33 
 
 		 553 aa  194  3e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0097  radical SAM domain-containing protein  28.74 
 
 		 817 aa  194  4e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0457  radical SAM domain-containing protein  29.53 
 
 		 519 aa  194  5e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.211287  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1263  Radical SAM domain protein  29.06 
 
 		 681 aa  192  1e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0245777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4375  Radical SAM domain protein  28.11 
 
 		 537 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0470  Radical SAM domain protein  27.8 
 
 		 828 aa  192  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4437  Radical SAM domain protein  28.11 
 
 		 537 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.07608 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1616  hypothetical protein  27.06 
 
 		 638 aa  192  1e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1511  Radical SAM domain protein  27 
 
 		 627 aa  192  1e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1317  Radical SAM domain protein  28.08 
 
 		 614 aa  192  1e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2123  radical SAM domain-containing protein  26.85 
 
 		 617 aa  191  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0450793  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1436  radical SAM domain-containing protein  31.45 
 
 		 476 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.37868  decreased coverage  0.00181566 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7274  Fe-S oxidoreductase  31.05 
 
 		 636 aa  190  5e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.867612  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0204  radical SAM domain-containing protein  30.89 
 
 		 452 aa  190  5e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.573337  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0525  Radical SAM domain protein  27.68 
 
 		 657 aa  189  9e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.268937  normal  0.0105227 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1455  radical SAM domain-containing protein  27.58 
 
 		 619 aa  189  1e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1374  radical SAM domain-containing protein  27.67 
 
 		 610 aa  189  1e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0554  radical SAM family protein  28.04 
 
 		 626 aa  189  1e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0156  radical SAM family protein  28.35 
 
 		 613 aa  189  1e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1629  radical SAM domain-containing protein  27.19 
 
 		 611 aa  188  2e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0141  Radical SAM domain protein  27.92 
 
 		 828 aa  188  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2565  radical SAM domain-containing protein  26.2 
 
 		 628 aa  188  2e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0267  Radical SAM domain protein  28.15 
 
 		 874 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148371  decreased coverage  0.00763103 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1025  Radical SAM domain protein  30.72 
 
 		 922 aa  187  3e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18361  Fe-S oxidoreductase  28.34 
 
 		 513 aa  187  4e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2585  Fe-S oxidoreductase  28.29 
 
 		 836 aa  187  4e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00679393  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1544  Radical SAM domain protein  28.79 
 
 		 640 aa  187  4e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0496911  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1202  Radical SAM domain protein  29.76 
 
 		 600 aa  187  4e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0387  Radical SAM domain protein  27.24 
 
 		 860 aa  186  8e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16231  Fe-S oxidoreductase  27.4 
 
 		 882 aa  185  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0158  Radical SAM domain protein  27.48 
 
 		 828 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0512  Radical SAM domain protein  27.77 
 
 		 852 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00242025  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0179  radical SAM domain-containing protein  26.32 
 
 		 591 aa  184  3e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.11642  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1644  radical SAM domain-containing protein  27.44 
 
 		 864 aa  184  4.0000000000000006e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3784  Protein of unknown function DUF2344  30.18 
 
 		 971 aa  184  5.0000000000000004e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.539179  normal  0.106507 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2298  Elongator protein 3/MiaB/NifB  34.61 
 
 		 465 aa  182  1e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.217918  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2463  radical SAM domain-containing protein  28.96 
 
 		 640 aa  182  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.123021 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3459  radical SAM domain-containing protein  29.61 
 
 		 663 aa  181  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.525782  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0978  radical SAM domain-containing protein  27.15 
 
 		 600 aa  179  8e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2185  Elongator protein 3/MiaB/NifB  28.02 
 
 		 644 aa  179  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.972123  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1176  Radical SAM domain protein  28.51 
 
 		 655 aa  178  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1897  radical SAM domain-containing protein  28.18 
 
 		 483 aa  179  2e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.487619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0161  radical SAM domain-containing protein  27.42 
 
 		 469 aa  177  4e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0239  Beta tubulin, autoregulation binding site  28.08 
 
 		 897 aa  177  5e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0547979 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0461  radical SAM domain-containing protein  27.85 
 
 		 438 aa  176  8e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0375  radical SAM domain-containing protein  27 
 
 		 438 aa  176  9e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0386229 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3863  radical SAM domain-containing protein  27.75 
 
 		 661 aa  176  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.721561  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>