234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_2298 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_2298  Elongator protein 3/MiaB/NifB  100 
 
 		 465 aa  940    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.217918  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2669  Elongator protein 3/MiaB/NifB  87.93 
 
 		 528 aa  814    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0247408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30001  Fe-S oxidoreductase  70.88 
 
 		 532 aa  684    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.601707 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18361  Fe-S oxidoreductase  65.09 
 
 		 513 aa  623  1e-177  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1652  Elongator protein 3/MiaB/NifB  59.3 
 
 		 546 aa  547  1e-154  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.606653  normal  0.975032 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0586  radical SAM family protein  55.19 
 
 		 544 aa  524  1e-147  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3436  Radical SAM domain protein  56.98 
 
 		 537 aa  518  1e-146  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000587564 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4039  Radical SAM domain protein  56.22 
 
 		 538 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.461651 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3512  radical SAM family protein  54 
 
 		 540 aa  516  1.0000000000000001e-145  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.170838  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4678  radical SAM domain-containing protein  52.8 
 
 		 543 aa  509  1e-143  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.863222  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4437  Radical SAM domain protein  54.08 
 
 		 537 aa  506  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.07608 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4375  Radical SAM domain protein  54.08 
 
 		 537 aa  505  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3961  radical SAM domain-containing protein  36.8 
 
 		 566 aa  245  1.9999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000506678  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0418  radical SAM family protein  37.2 
 
 		 557 aa  233  7.000000000000001e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0548  Radical SAM domain protein  36.51 
 
 		 557 aa  231  2e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.011862  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_288  radical SAM domain protein  33.12 
 
 		 559 aa  228  1e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000164247  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0327  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 544 aa  228  2e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00004315  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0348  radical SAM domain-containing protein  32.33 
 
 		 544 aa  227  4e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000123778  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0560  Radical SAM domain protein  35.37 
 
 		 557 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.12594e-30 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3766  radical SAM domain-containing protein  39.05 
 
 		 593 aa  222  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1455  radical SAM domain-containing protein  36.81 
 
 		 619 aa  220  3e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14180  Fe-S oxidoreductase  33.81 
 
 		 626 aa  220  5e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3698  Radical SAM domain protein  36.94 
 
 		 589 aa  219  7.999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.360742  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3781  Radical SAM domain protein  36.71 
 
 		 589 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3640  radical SAM family protein  36.28 
 
 		 589 aa  217  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3282  radical SAM domain-containing protein  33.67 
 
 		 563 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0422762  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2463  radical SAM domain-containing protein  33.82 
 
 		 640 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.123021 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3459  radical SAM domain-containing protein  35.28 
 
 		 663 aa  215  1.9999999999999998e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.525782  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2185  Elongator protein 3/MiaB/NifB  34.7 
 
 		 644 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.972123  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0662  Radical SAM domain protein  35.09 
 
 		 545 aa  214  3.9999999999999995e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0764321  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2195  Fe-S oxidoreductase  36.14 
 
 		 573 aa  212  1e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.113281  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7274  Fe-S oxidoreductase  34.23 
 
 		 636 aa  211  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.867612  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3475  radical SAM domain-containing protein  35.56 
 
 		 613 aa  211  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00430694  normal  0.324644 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0470  Radical SAM domain protein  34.03 
 
 		 828 aa  211  2e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0753  radical SAM domain-containing protein  34.3 
 
 		 654 aa  210  4e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0676  Radical SAM domain protein  32.47 
 
 		 621 aa  209  6e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00732227  normal  0.444552 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1544  Radical SAM domain protein  33.68 
 
 		 640 aa  209  8e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0496911  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1233  Radical SAM domain protein  32.43 
 
 		 597 aa  208  2e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7280  Radical SAM domain protein  34.43 
 
 		 645 aa  206  9e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3062  radical SAM domain-containing protein  35.89 
 
 		 563 aa  204  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.477497  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1176  Radical SAM domain protein  34.5 
 
 		 655 aa  204  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1374  radical SAM domain-containing protein  32.84 
 
 		 610 aa  204  4e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1263  Radical SAM domain protein  32.96 
 
 		 681 aa  202  8e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0245777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0312  Elongator protein 3/MiaB/NifB  36.02 
 
 		 887 aa  201  1.9999999999999998e-50  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0525  Radical SAM domain protein  30.67 
 
 		 657 aa  201  3e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.268937  normal  0.0105227 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2030  Elongator protein 3/MiaB/NifB  33.6 
 
 		 894 aa  200  3.9999999999999996e-50  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1585  Radical SAM domain protein  33.61 
 
 		 642 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.458582  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0351  radical SAM domain-containing protein  34.39 
 
 		 826 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.247056  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06130  Fe-S oxidoreductase  30.92 
 
 		 626 aa  200  3.9999999999999996e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000171239 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1511  Radical SAM domain protein  31.2 
 
 		 627 aa  200  5e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0300  radical SAM domain-containing protein  32.47 
 
 		 842 aa  200  5e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000298698  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2538  radical SAM domain-containing protein  30.15 
 
 		 624 aa  199  7e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569062  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3191  radical SAM family protein  33.62 
 
 		 842 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0845541  hitchhiker  0.0000000000326362 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4341  Radical SAM domain protein  30.95 
 
 		 618 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.898209  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1616  hypothetical protein  32.34 
 
 		 638 aa  198  2.0000000000000003e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14150  Radical SAM domain protein  29.24 
 
 		 626 aa  198  2.0000000000000003e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000319843  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0554  radical SAM family protein  35.37 
 
 		 626 aa  197  3e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5483  Radical SAM domain-containing protein  32.7 
 
 		 653 aa  197  4.0000000000000005e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1610  radical SAM domain-containing protein  33.26 
 
 		 849 aa  197  5.000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3484  radical SAM domain-containing protein  33.54 
 
 		 663 aa  196  6e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3383  Radical SAM domain protein  32.61 
 
 		 645 aa  195  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.660882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3863  radical SAM domain-containing protein  33.54 
 
 		 661 aa  194  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.721561  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_002936  DET1629  radical SAM domain-containing protein  31.91 
 
 		 611 aa  194  3e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1317  Radical SAM domain protein  28.87 
 
 		 614 aa  194  4e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2131  Radical SAM domain protein  32.82 
 
 		 613 aa  193  5e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0156  radical SAM domain-containing protein  31.62 
 
 		 599 aa  192  9e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0158  radical SAM domain-containing protein  31.22 
 
 		 599 aa  191  2e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.172348  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0156  radical SAM family protein  30.28 
 
 		 613 aa  191  2e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0158  Radical SAM domain protein  33.85 
 
 		 828 aa  191  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16231  Fe-S oxidoreductase  33.58 
 
 		 882 aa  191  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1216  radical SAM family protein  34.62 
 
 		 679 aa  190  4e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.837024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2585  Fe-S oxidoreductase  32.48 
 
 		 836 aa  190  5.999999999999999e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00679393  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0731  Radical SAM domain protein  35.9 
 
 		 898 aa  189  8e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3240  radical SAM domain-containing protein  33.26 
 
 		 812 aa  188  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.47861  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3328  Radical SAM domain protein  29.72 
 
 		 633 aa  189  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00435818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0730  Radical SAM domain protein  35.9 
 
 		 898 aa  189  1e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2123  radical SAM domain-containing protein  32.3 
 
 		 617 aa  188  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0450793  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0695  radical SAM family protein  35.66 
 
 		 898 aa  188  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.609463  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2565  radical SAM domain-containing protein  31.09 
 
 		 628 aa  188  2e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0141  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 828 aa  187  3e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1241  Radical SAM domain protein  29 
 
 		 551 aa  187  5e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0874851  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0737  radical SAM domain-containing protein  33.73 
 
 		 897 aa  186  7e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0267  Radical SAM domain protein  30.69 
 
 		 874 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148371  decreased coverage  0.00763103 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0512  Radical SAM domain protein  33.93 
 
 		 852 aa  184  4.0000000000000006e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00242025  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0485  radical SAM family protein  30.77 
 
 		 910 aa  183  5.0000000000000004e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363594  normal  0.576766 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2388  radical SAM domain-containing protein  31.07 
 
 		 617 aa  182  8.000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.938561  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2100  radical SAM domain-containing protein  31.07 
 
 		 617 aa  182  8.000000000000001e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.232765  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0387  Radical SAM domain protein  31.2 
 
 		 860 aa  182  9.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1159  radical SAM family protein  34.61 
 
 		 510 aa  182  2e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.044499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0978  radical SAM domain-containing protein  33.16 
 
 		 600 aa  181  2.9999999999999997e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0097  radical SAM domain-containing protein  32.38 
 
 		 817 aa  179  9e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3784  Protein of unknown function DUF2344  34.63 
 
 		 971 aa  179  9e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.539179  normal  0.106507 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1946  Radical SAM domain protein  32.9 
 
 		 619 aa  177  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5264  radical SAM domain-containing protein  32.97 
 
 		 677 aa  177  4e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.187686 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0662  Radical SAM domain protein  32.13 
 
 		 856 aa  175  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0682  Radical SAM domain protein  32.13 
 
 		 857 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.877734 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1202  Radical SAM domain protein  31.34 
 
 		 600 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1280  radical SAM family protein  31.28 
 
 		 879 aa  172  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00695626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0877  Elongator protein 3/MiaB/NifB  32.35 
 
 		 872 aa  171  3e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00856877 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0670  hypothetical protein  29.62 
 
 		 898 aa  169  1e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>