More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0560 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3062  radical SAM domain-containing protein  61.73 
 
 		 563 aa  676    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.477497  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0418  radical SAM family protein  63.11 
 
 		 557 aa  701    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0548  Radical SAM domain protein  95.68 
 
 		 557 aa  1082    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.011862  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0560  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 557 aa  1130    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.12594e-30 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3961  radical SAM domain-containing protein  65.71 
 
 		 566 aa  733    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000506678  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3282  radical SAM domain-containing protein  54.66 
 
 		 563 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0422762  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2195  Fe-S oxidoreductase  50.27 
 
 		 573 aa  513  1e-144  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.113281  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0662  Radical SAM domain protein  46.65 
 
 		 545 aa  476  1e-133  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0764321  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3475  radical SAM domain-containing protein  44.29 
 
 		 613 aa  439  9.999999999999999e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00430694  normal  0.324644 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3640  radical SAM family protein  42.73 
 
 		 589 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3698  Radical SAM domain protein  42.36 
 
 		 589 aa  411  1e-113  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.360742  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3781  Radical SAM domain protein  42.18 
 
 		 589 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3766  radical SAM domain-containing protein  42.55 
 
 		 593 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0327  radical SAM domain-containing protein  35.87 
 
 		 544 aa  339  8e-92  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00004315  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_288  radical SAM domain protein  36.2 
 
 		 559 aa  333  3e-90  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000164247  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0348  radical SAM domain-containing protein  36.01 
 
 		 544 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000123778  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4341  Radical SAM domain protein  33.93 
 
 		 618 aa  310  5.9999999999999995e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.898209  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14150  Radical SAM domain protein  33.21 
 
 		 626 aa  307  4.0000000000000004e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000319843  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1233  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 597 aa  300  3e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1455  radical SAM domain-containing protein  34.97 
 
 		 619 aa  297  3e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2100  radical SAM domain-containing protein  33.27 
 
 		 617 aa  295  1e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.232765  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2388  radical SAM domain-containing protein  33.27 
 
 		 617 aa  295  2e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.938561  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2131  Radical SAM domain protein  32.73 
 
 		 613 aa  292  1e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1616  hypothetical protein  32.43 
 
 		 638 aa  289  1e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0525  Radical SAM domain protein  31.08 
 
 		 657 aa  288  2e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.268937  normal  0.0105227 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1241  Radical SAM domain protein  33.39 
 
 		 551 aa  286  9e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0874851  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0554  radical SAM family protein  35.42 
 
 		 626 aa  285  1.0000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2538  radical SAM domain-containing protein  31.28 
 
 		 624 aa  284  3.0000000000000004e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569062  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0351  radical SAM domain-containing protein  33.68 
 
 		 826 aa  283  8.000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.247056  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0097  radical SAM domain-containing protein  34.08 
 
 		 817 aa  282  1e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0512  Radical SAM domain protein  34.24 
 
 		 852 aa  280  6e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00242025  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0156  radical SAM family protein  31.23 
 
 		 613 aa  280  7e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3328  Radical SAM domain protein  31.14 
 
 		 633 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00435818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0239  Beta tubulin, autoregulation binding site  32.38 
 
 		 897 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0547979 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2123  radical SAM domain-containing protein  31.61 
 
 		 617 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0450793  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1025  Radical SAM domain protein  33.16 
 
 		 922 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3191  radical SAM family protein  32.98 
 
 		 842 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0845541  hitchhiker  0.0000000000326362 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1374  radical SAM domain-containing protein  32.61 
 
 		 610 aa  272  9e-72  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1644  radical SAM domain-containing protein  33.22 
 
 		 864 aa  272  9e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0695  radical SAM family protein  33.15 
 
 		 898 aa  272  2e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.609463  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0731  Radical SAM domain protein  32.79 
 
 		 898 aa  270  4e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0387  Radical SAM domain protein  31.25 
 
 		 860 aa  269  8e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2565  radical SAM domain-containing protein  31.15 
 
 		 628 aa  268  1e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0730  Radical SAM domain protein  32.79 
 
 		 898 aa  268  1e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1701  Elongator protein 3/MiaB/NifB  33.51 
 
 		 860 aa  268  2e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0737  radical SAM domain-containing protein  31.46 
 
 		 897 aa  267  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0141  Radical SAM domain protein  33.16 
 
 		 828 aa  266  8e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0470  Radical SAM domain protein  29.69 
 
 		 828 aa  266  8.999999999999999e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3784  Protein of unknown function DUF2344  34.17 
 
 		 971 aa  266  1e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.539179  normal  0.106507 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0158  radical SAM domain-containing protein  32.37 
 
 		 599 aa  265  2e-69  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.172348  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1946  Radical SAM domain protein  33.16 
 
 		 619 aa  263  4e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0300  radical SAM domain-containing protein  32.01 
 
 		 842 aa  263  4.999999999999999e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000298698  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1629  radical SAM domain-containing protein  31.41 
 
 		 611 aa  263  8.999999999999999e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3240  radical SAM domain-containing protein  33.39 
 
 		 812 aa  263  8.999999999999999e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.47861  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0158  Radical SAM domain protein  32.99 
 
 		 828 aa  261  2e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0156  radical SAM domain-containing protein  31.83 
 
 		 599 aa  261  2e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1317  Radical SAM domain protein  30.11 
 
 		 614 aa  261  2e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1511  Radical SAM domain protein  30.69 
 
 		 627 aa  257  4e-67  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0877  Elongator protein 3/MiaB/NifB  31.14 
 
 		 872 aa  256  7e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00856877 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06130  Fe-S oxidoreductase  31.82 
 
 		 626 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000171239 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1202  Radical SAM domain protein  31.55 
 
 		 600 aa  254  3e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1610  radical SAM domain-containing protein  32.35 
 
 		 849 aa  254  4.0000000000000004e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0485  radical SAM family protein  30.18 
 
 		 910 aa  253  5.000000000000001e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363594  normal  0.576766 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0753  radical SAM domain-containing protein  31.51 
 
 		 654 aa  253  5.000000000000001e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7274  Fe-S oxidoreductase  31.51 
 
 		 636 aa  252  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.867612  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0662  Radical SAM domain protein  29.95 
 
 		 856 aa  251  2e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1585  Radical SAM domain protein  30.74 
 
 		 642 aa  251  3e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.458582  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0682  Radical SAM domain protein  29.95 
 
 		 857 aa  251  3e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.877734 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2185  Elongator protein 3/MiaB/NifB  31.34 
 
 		 644 aa  248  1e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.972123  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2585  Fe-S oxidoreductase  32.37 
 
 		 836 aa  248  1e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00679393  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1280  radical SAM family protein  29.73 
 
 		 879 aa  247  3e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00695626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1544  Radical SAM domain protein  30.6 
 
 		 640 aa  247  3e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0496911  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0267  Radical SAM domain protein  30.05 
 
 		 874 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148371  decreased coverage  0.00763103 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0312  Elongator protein 3/MiaB/NifB  31.36 
 
 		 887 aa  243  5e-63  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0676  Radical SAM domain protein  29.83 
 
 		 621 aa  243  5e-63  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00732227  normal  0.444552 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2192  Protein of unknown function DUF2344  31.8 
 
 		 842 aa  242  1e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2669  Elongator protein 3/MiaB/NifB  34.01 
 
 		 528 aa  242  1e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0247408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2030  Elongator protein 3/MiaB/NifB  30.89 
 
 		 894 aa  241  2e-62  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1263  Radical SAM domain protein  32.62 
 
 		 681 aa  241  2e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0245777  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2463  radical SAM domain-containing protein  30.65 
 
 		 640 aa  241  2e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.123021 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3459  radical SAM domain-containing protein  30.05 
 
 		 663 aa  241  2e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.525782  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3863  radical SAM domain-containing protein  29.67 
 
 		 661 aa  241  2.9999999999999997e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.721561  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3484  radical SAM domain-containing protein  30.19 
 
 		 663 aa  240  4e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1176  Radical SAM domain protein  30.49 
 
 		 655 aa  240  5.999999999999999e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3383  Radical SAM domain protein  31.35 
 
 		 645 aa  240  5.999999999999999e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.660882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14180  Fe-S oxidoreductase  28.77 
 
 		 626 aa  239  1e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30001  Fe-S oxidoreductase  30.32 
 
 		 532 aa  239  1e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.601707 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5483  Radical SAM domain-containing protein  29.9 
 
 		 653 aa  237  5.0000000000000005e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16231  Fe-S oxidoreductase  29.98 
 
 		 882 aa  237  5.0000000000000005e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1159  radical SAM family protein  32.62 
 
 		 510 aa  236  7e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.044499  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4039  Radical SAM domain protein  29.17 
 
 		 538 aa  235  2.0000000000000002e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.461651 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2601  Radical SAM domain protein  32.53 
 
 		 553 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1652  Elongator protein 3/MiaB/NifB  31.43 
 
 		 546 aa  234  4.0000000000000004e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.606653  normal  0.975032 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1216  radical SAM family protein  31.74 
 
 		 679 aa  233  7.000000000000001e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.837024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0586  radical SAM family protein  30.65 
 
 		 544 aa  232  2e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0670  hypothetical protein  28.88 
 
 		 898 aa  230  4e-59  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3512  radical SAM family protein  29.14 
 
 		 540 aa  230  4e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.170838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0179  radical SAM domain-containing protein  26.98 
 
 		 591 aa  227  3e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.11642  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4437  Radical SAM domain protein  27.84 
 
 		 537 aa  227  5.0000000000000005e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.07608 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4375  Radical SAM domain protein  27.84 
 
 		 537 aa  226  6e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>