219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2601 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2601  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 553 aa  1121    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2195  Fe-S oxidoreductase  33.93 
 
 		 573 aa  271  2e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.113281  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3961  radical SAM domain-containing protein  33.27 
 
 		 566 aa  267  4e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000506678  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3766  radical SAM domain-containing protein  33.27 
 
 		 593 aa  258  2e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0418  radical SAM family protein  33.27 
 
 		 557 aa  254  3e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3640  radical SAM family protein  32.98 
 
 		 589 aa  253  6e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3475  radical SAM domain-containing protein  31.25 
 
 		 613 aa  250  6e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00430694  normal  0.324644 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3698  Radical SAM domain protein  32.27 
 
 		 589 aa  249  7e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.360742  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3062  radical SAM domain-containing protein  32.52 
 
 		 563 aa  249  1e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.477497  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3781  Radical SAM domain protein  32.45 
 
 		 589 aa  249  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0560  Radical SAM domain protein  32.53 
 
 		 557 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.12594e-30 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3282  radical SAM domain-containing protein  30.67 
 
 		 563 aa  232  1e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0422762  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0662  Radical SAM domain protein  31.5 
 
 		 545 aa  229  7e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0764321  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0548  Radical SAM domain protein  32.47 
 
 		 557 aa  228  2e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.011862  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1241  Radical SAM domain protein  28.39 
 
 		 551 aa  228  3e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0874851  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0327  radical SAM domain-containing protein  29.66 
 
 		 544 aa  226  6e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00004315  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14150  Radical SAM domain protein  26.72 
 
 		 626 aa  221  3e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000319843  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0348  radical SAM domain-containing protein  29.96 
 
 		 544 aa  220  3.9999999999999997e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000123778  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0351  radical SAM domain-containing protein  28.26 
 
 		 826 aa  217  5.9999999999999996e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.247056  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_288  radical SAM domain protein  29 
 
 		 559 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000164247  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0470  Radical SAM domain protein  26.73 
 
 		 828 aa  206  7e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2131  Radical SAM domain protein  25.71 
 
 		 613 aa  203  6e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1455  radical SAM domain-containing protein  29.11 
 
 		 619 aa  203  8e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4341  Radical SAM domain protein  27.19 
 
 		 618 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.898209  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3240  radical SAM domain-containing protein  29.04 
 
 		 812 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.47861  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1616  hypothetical protein  28.62 
 
 		 638 aa  197  3e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2388  radical SAM domain-containing protein  27.33 
 
 		 617 aa  196  1e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.938561  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2100  radical SAM domain-containing protein  27.33 
 
 		 617 aa  196  1e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.232765  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2123  radical SAM domain-containing protein  25.13 
 
 		 617 aa  195  1e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0450793  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1159  radical SAM family protein  31.33 
 
 		 510 aa  194  3e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.044499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3512  radical SAM family protein  28.09 
 
 		 540 aa  192  1e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.170838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0161  radical SAM domain-containing protein  28.04 
 
 		 469 aa  192  1e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0354  radical SAM domain-containing protein  30.22 
 
 		 471 aa  192  2e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1644  radical SAM domain-containing protein  28.47 
 
 		 864 aa  192  2e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2565  radical SAM domain-containing protein  24.79 
 
 		 628 aa  191  2e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0554  radical SAM family protein  27.82 
 
 		 626 aa  190  7e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0179  radical SAM domain-containing protein  24.43 
 
 		 591 aa  189  1e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.11642  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1317  Radical SAM domain protein  27.47 
 
 		 614 aa  188  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0336  radical SAM domain-containing protein  29.78 
 
 		 486 aa  187  3e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4437  Radical SAM domain protein  26.53 
 
 		 537 aa  187  3e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.07608 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4375  Radical SAM domain protein  26.53 
 
 		 537 aa  187  4e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3191  radical SAM family protein  27.68 
 
 		 842 aa  186  7e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0845541  hitchhiker  0.0000000000326362 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3784  Protein of unknown function DUF2344  28.85 
 
 		 971 aa  186  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.539179  normal  0.106507 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1652  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.35 
 
 		 546 aa  186  1.0000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.606653  normal  0.975032 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1946  Radical SAM domain protein  28.52 
 
 		 619 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2538  radical SAM domain-containing protein  25.6 
 
 		 624 aa  184  4.0000000000000006e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569062  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4039  Radical SAM domain protein  26.81 
 
 		 538 aa  183  6e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.461651 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0158  Radical SAM domain protein  27.87 
 
 		 828 aa  182  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0586  radical SAM family protein  26.79 
 
 		 544 aa  181  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2585  Fe-S oxidoreductase  27.68 
 
 		 836 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00679393  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0141  Radical SAM domain protein  27.99 
 
 		 828 aa  181  4e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0753  radical SAM domain-containing protein  26.87 
 
 		 654 aa  180  4.999999999999999e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0512  Radical SAM domain protein  26.42 
 
 		 852 aa  180  7e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00242025  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2669  Elongator protein 3/MiaB/NifB  31.06 
 
 		 528 aa  179  8e-44  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0247408  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1629  radical SAM domain-containing protein  25.47 
 
 		 611 aa  179  1e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2030  Elongator protein 3/MiaB/NifB  25.17 
 
 		 894 aa  178  2e-43  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1511  Radical SAM domain protein  25.59 
 
 		 627 aa  178  2e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4678  radical SAM domain-containing protein  27.15 
 
 		 543 aa  178  3e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.863222  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0737  radical SAM domain-containing protein  28.71 
 
 		 897 aa  177  5e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3328  Radical SAM domain protein  25.3 
 
 		 633 aa  177  6e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00435818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3436  Radical SAM domain protein  27.75 
 
 		 537 aa  176  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000587564 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1176  Radical SAM domain protein  26.76 
 
 		 655 aa  176  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0300  radical SAM domain-containing protein  26.59 
 
 		 842 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000298698  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0097  radical SAM domain-containing protein  26.72 
 
 		 817 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0730  Radical SAM domain protein  27.99 
 
 		 898 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1374  radical SAM domain-containing protein  25.3 
 
 		 610 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0978  radical SAM domain-containing protein  26.06 
 
 		 600 aa  174  2.9999999999999996e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0731  Radical SAM domain protein  27.99 
 
 		 898 aa  174  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0457  radical SAM domain-containing protein  31.48 
 
 		 519 aa  173  7.999999999999999e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.211287  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1233  Radical SAM domain protein  25.6 
 
 		 597 aa  173  9e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0525  Radical SAM domain protein  24.96 
 
 		 657 aa  172  1e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.268937  normal  0.0105227 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1202  Radical SAM domain protein  27.61 
 
 		 600 aa  172  1e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0158  radical SAM domain-containing protein  26.53 
 
 		 599 aa  171  2e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.172348  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0312  Elongator protein 3/MiaB/NifB  25.81 
 
 		 887 aa  171  3e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1639  Radical SAM domain protein  24.04 
 
 		 803 aa  171  3e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1544  Radical SAM domain protein  26.71 
 
 		 640 aa  171  3e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0496911  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3787  Radical SAM domain protein  31.08 
 
 		 525 aa  171  4e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.182556  normal  0.243034 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0695  radical SAM family protein  28.21 
 
 		 898 aa  170  5e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.609463  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1610  radical SAM domain-containing protein  27.41 
 
 		 849 aa  169  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0204  radical SAM domain-containing protein  27.97 
 
 		 452 aa  168  2e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.573337  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0156  radical SAM domain-containing protein  26.22 
 
 		 599 aa  167  5.9999999999999996e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30001  Fe-S oxidoreductase  27.81 
 
 		 532 aa  166  8e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.601707 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5483  Radical SAM domain-containing protein  25.8 
 
 		 653 aa  166  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0156  radical SAM family protein  25.13 
 
 		 613 aa  166  1.0000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5264  radical SAM domain-containing protein  25.91 
 
 		 677 aa  166  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.187686 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1216  radical SAM family protein  27.14 
 
 		 679 aa  164  3e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.837024  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3383  Radical SAM domain protein  27.32 
 
 		 645 aa  164  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.660882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1025  Radical SAM domain protein  26.29 
 
 		 922 aa  164  3e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0387  Radical SAM domain protein  24.53 
 
 		 860 aa  164  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2463  radical SAM domain-containing protein  27.27 
 
 		 640 aa  164  3e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.123021 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7274  Fe-S oxidoreductase  26.12 
 
 		 636 aa  164  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.867612  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2185  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.42 
 
 		 644 aa  163  7e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.972123  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0662  Radical SAM domain protein  24.23 
 
 		 856 aa  163  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0375  radical SAM domain-containing protein  26.35 
 
 		 438 aa  163  9e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0386229 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0682  Radical SAM domain protein  24.23 
 
 		 857 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.877734 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0239  Beta tubulin, autoregulation binding site  26.06 
 
 		 897 aa  162  2e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0547979 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1544  radical SAM domain-containing protein  27.25 
 
 		 438 aa  161  3e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0877  Elongator protein 3/MiaB/NifB  25.42 
 
 		 872 aa  160  5e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00856877 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0267  Radical SAM domain protein  24.88 
 
 		 874 aa  160  6e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148371  decreased coverage  0.00763103 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1701  Elongator protein 3/MiaB/NifB  24.78 
 
 		 860 aa  160  7e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>