229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0336 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0354  radical SAM domain-containing protein  99.15 
 
 		 471 aa  944    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0336  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 486 aa  981    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0161  radical SAM domain-containing protein  45.3 
 
 		 469 aa  389  1e-107  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0204  radical SAM domain-containing protein  42.98 
 
 		 452 aa  355  1e-96  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.573337  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3961  radical SAM domain-containing protein  34.09 
 
 		 566 aa  233  5e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000506678  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0560  Radical SAM domain protein  34.97 
 
 		 557 aa  233  7.000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.12594e-30 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0548  Radical SAM domain protein  34.98 
 
 		 557 aa  229  1e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.011862  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3640  radical SAM family protein  32.5 
 
 		 589 aa  226  7e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3781  Radical SAM domain protein  32.29 
 
 		 589 aa  219  7e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3698  Radical SAM domain protein  32.43 
 
 		 589 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.360742  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3282  radical SAM domain-containing protein  32.31 
 
 		 563 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0422762  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0418  radical SAM family protein  32.09 
 
 		 557 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0662  Radical SAM domain protein  31.59 
 
 		 545 aa  213  7e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0764321  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3766  radical SAM domain-containing protein  32.43 
 
 		 593 aa  209  7e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3062  radical SAM domain-containing protein  32.48 
 
 		 563 aa  209  9e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.477497  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4341  Radical SAM domain protein  30.62 
 
 		 618 aa  208  2e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.898209  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14150  Radical SAM domain protein  31.12 
 
 		 626 aa  203  6e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000319843  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2538  radical SAM domain-containing protein  30.28 
 
 		 624 aa  203  7e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569062  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1455  radical SAM domain-containing protein  30.99 
 
 		 619 aa  201  1.9999999999999998e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3475  radical SAM domain-containing protein  29.6 
 
 		 613 aa  201  1.9999999999999998e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00430694  normal  0.324644 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0327  radical SAM domain-containing protein  31.32 
 
 		 544 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00004315  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1241  Radical SAM domain protein  29.98 
 
 		 551 aa  199  6e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0874851  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2131  Radical SAM domain protein  32.52 
 
 		 613 aa  199  7e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2601  Radical SAM domain protein  29.78 
 
 		 553 aa  199  7.999999999999999e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_288  radical SAM domain protein  31.32 
 
 		 559 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000164247  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0470  Radical SAM domain protein  29.34 
 
 		 828 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0387  Radical SAM domain protein  30.67 
 
 		 860 aa  197  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0348  radical SAM domain-containing protein  30.87 
 
 		 544 aa  196  6e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000123778  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1280  radical SAM family protein  29.63 
 
 		 879 aa  196  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00695626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2195  Fe-S oxidoreductase  31.43 
 
 		 573 aa  194  2e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.113281  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0878  Radical SAM domain protein  30.24 
 
 		 509 aa  194  4e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000778999  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1202  Radical SAM domain protein  31.7 
 
 		 600 aa  193  5e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1233  Radical SAM domain protein  31.36 
 
 		 597 aa  191  2e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1317  Radical SAM domain protein  28.83 
 
 		 614 aa  190  4e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16231  Fe-S oxidoreductase  27.73 
 
 		 882 aa  188  2e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2123  radical SAM domain-containing protein  32.41 
 
 		 617 aa  188  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0450793  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2100  radical SAM domain-containing protein  28.66 
 
 		 617 aa  187  3e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.232765  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0485  radical SAM family protein  28.25 
 
 		 910 aa  187  3e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363594  normal  0.576766 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2388  radical SAM domain-containing protein  28.46 
 
 		 617 aa  187  4e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.938561  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0312  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.61 
 
 		 887 aa  186  6e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2030  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.18 
 
 		 894 aa  186  9e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0158  radical SAM domain-containing protein  29.78 
 
 		 599 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.172348  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0156  radical SAM family protein  29.57 
 
 		 613 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0554  radical SAM family protein  29.42 
 
 		 626 aa  185  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3328  Radical SAM domain protein  30.92 
 
 		 633 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00435818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0156  radical SAM domain-containing protein  30.31 
 
 		 599 aa  184  3e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0662  Radical SAM domain protein  29.04 
 
 		 856 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0682  Radical SAM domain protein  29.04 
 
 		 857 aa  184  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.877734 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0179  radical SAM domain-containing protein  28.91 
 
 		 591 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.11642  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0267  Radical SAM domain protein  28.42 
 
 		 874 aa  182  9.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148371  decreased coverage  0.00763103 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0670  hypothetical protein  28.36 
 
 		 898 aa  180  4e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0877  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.18 
 
 		 872 aa  179  7e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00856877 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0695  radical SAM family protein  28.51 
 
 		 898 aa  179  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.609463  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2565  radical SAM domain-containing protein  27.67 
 
 		 628 aa  179  1e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0731  Radical SAM domain protein  28.31 
 
 		 898 aa  178  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0978  radical SAM domain-containing protein  29.68 
 
 		 600 aa  178  2e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0351  radical SAM domain-containing protein  29.77 
 
 		 826 aa  177  3e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.247056  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1629  radical SAM domain-containing protein  28.51 
 
 		 611 aa  177  4e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0525  Radical SAM domain protein  26.73 
 
 		 657 aa  177  4e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.268937  normal  0.0105227 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1946  Radical SAM domain protein  30.73 
 
 		 619 aa  177  6e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0730  Radical SAM domain protein  28.31 
 
 		 898 aa  176  9e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3191  radical SAM family protein  30.59 
 
 		 842 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0845541  hitchhiker  0.0000000000326362 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1454  radical SAM domain-containing protein  31.87 
 
 		 434 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1511  Radical SAM domain protein  28.32 
 
 		 627 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0300  radical SAM domain-containing protein  27.42 
 
 		 842 aa  173  5e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000298698  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0737  radical SAM domain-containing protein  27.09 
 
 		 897 aa  173  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3787  Radical SAM domain protein  29.94 
 
 		 525 aa  172  9e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.182556  normal  0.243034 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3784  Protein of unknown function DUF2344  29.33 
 
 		 971 aa  172  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.539179  normal  0.106507 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3240  radical SAM domain-containing protein  29.89 
 
 		 812 aa  172  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.47861  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1701  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.91 
 
 		 860 aa  172  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1159  radical SAM family protein  27.07 
 
 		 510 aa  171  2e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.044499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0512  Radical SAM domain protein  28.41 
 
 		 852 aa  171  2e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00242025  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0097  radical SAM domain-containing protein  31.39 
 
 		 817 aa  171  2e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1610  radical SAM domain-containing protein  28.6 
 
 		 849 aa  171  4e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1644  radical SAM domain-containing protein  29.98 
 
 		 864 aa  170  6e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1374  radical SAM domain-containing protein  28.2 
 
 		 610 aa  169  1e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0676  Radical SAM domain protein  27.94 
 
 		 621 aa  167  2.9999999999999998e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00732227  normal  0.444552 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0239  Beta tubulin, autoregulation binding site  28.83 
 
 		 897 aa  167  4e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0547979 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2585  Fe-S oxidoreductase  29.78 
 
 		 836 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00679393  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1616  hypothetical protein  29.58 
 
 		 638 aa  166  9e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0158  Radical SAM domain protein  29.53 
 
 		 828 aa  161  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0141  Radical SAM domain protein  29.05 
 
 		 828 aa  161  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1025  Radical SAM domain protein  30.27 
 
 		 922 aa  158  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0375  radical SAM domain-containing protein  30.25 
 
 		 438 aa  158  3e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0386229 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1897  radical SAM domain-containing protein  32.28 
 
 		 483 aa  156  6e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.487619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1544  radical SAM domain-containing protein  30 
 
 		 438 aa  153  7e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2185  Elongator protein 3/MiaB/NifB  27.21 
 
 		 644 aa  152  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.972123  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0461  radical SAM domain-containing protein  30 
 
 		 438 aa  152  1e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0446  radical SAM domain-containing protein  28.9 
 
 		 439 aa  151  2e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.627124  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2192  Protein of unknown function DUF2344  27.03 
 
 		 842 aa  150  4e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2669  Elongator protein 3/MiaB/NifB  28.98 
 
 		 528 aa  149  8e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0247408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0457  radical SAM domain-containing protein  29.17 
 
 		 519 aa  146  8.000000000000001e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.211287  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0304  radical SAM domain-containing protein  31.22 
 
 		 483 aa  146  8.000000000000001e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30001  Fe-S oxidoreductase  28.1 
 
 		 532 aa  145  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.601707 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5483  Radical SAM domain-containing protein  25.5 
 
 		 653 aa  144  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1263  Radical SAM domain protein  25.49 
 
 		 681 aa  144  3e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0245777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1585  Radical SAM domain protein  26.3 
 
 		 642 aa  142  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.458582  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0586  radical SAM family protein  28.26 
 
 		 544 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7274  Fe-S oxidoreductase  26.54 
 
 		 636 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.867612  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7280  Radical SAM domain protein  27.13 
 
 		 645 aa  141  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>