186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0161 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0161  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 469 aa  947    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0204  radical SAM domain-containing protein  45.61 
 
 		 452 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.573337  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0336  radical SAM domain-containing protein  45.3 
 
 		 486 aa  374  1e-102  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0354  radical SAM domain-containing protein  45.26 
 
 		 471 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3961  radical SAM domain-containing protein  29.47 
 
 		 566 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000506678  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2601  Radical SAM domain protein  28.04 
 
 		 553 aa  192  9e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0418  radical SAM family protein  27.52 
 
 		 557 aa  192  1e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3640  radical SAM family protein  26.95 
 
 		 589 aa  190  4e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0878  Radical SAM domain protein  25.54 
 
 		 509 aa  189  1e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000778999  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3781  Radical SAM domain protein  26.37 
 
 		 589 aa  188  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3698  Radical SAM domain protein  26.37 
 
 		 589 aa  188  2e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.360742  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3062  radical SAM domain-containing protein  27.12 
 
 		 563 aa  182  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.477497  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3475  radical SAM domain-containing protein  25.93 
 
 		 613 aa  180  4.999999999999999e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00430694  normal  0.324644 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0978  radical SAM domain-containing protein  28.73 
 
 		 600 aa  179  7e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0560  Radical SAM domain protein  27.77 
 
 		 557 aa  178  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.12594e-30 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0548  Radical SAM domain protein  27.86 
 
 		 557 aa  178  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.011862  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1159  radical SAM family protein  27.08 
 
 		 510 aa  177  3e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.044499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3282  radical SAM domain-containing protein  27.18 
 
 		 563 aa  176  7e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0422762  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0662  Radical SAM domain protein  25.74 
 
 		 545 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0764321  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_288  radical SAM domain protein  28.23 
 
 		 559 aa  173  5.999999999999999e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000164247  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0179  radical SAM domain-containing protein  28.99 
 
 		 591 aa  173  5.999999999999999e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.11642  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0327  radical SAM domain-containing protein  27.42 
 
 		 544 aa  172  7.999999999999999e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00004315  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0348  radical SAM domain-containing protein  27.35 
 
 		 544 aa  170  5e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000123778  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1897  radical SAM domain-containing protein  27.42 
 
 		 483 aa  170  5e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.487619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3766  radical SAM domain-containing protein  25.52 
 
 		 593 aa  169  1e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3240  radical SAM domain-containing protein  26.12 
 
 		 812 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.47861  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1241  Radical SAM domain protein  29.42 
 
 		 551 aa  166  8e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0874851  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3191  radical SAM family protein  25.81 
 
 		 842 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0845541  hitchhiker  0.0000000000326362 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0158  Radical SAM domain protein  25.36 
 
 		 828 aa  163  5.0000000000000005e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1436  radical SAM domain-containing protein  27.42 
 
 		 476 aa  162  8.000000000000001e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.37868  decreased coverage  0.00181566 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4678  radical SAM domain-containing protein  28.13 
 
 		 543 aa  162  1e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.863222  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0156  radical SAM domain-containing protein  25.73 
 
 		 599 aa  161  2e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0141  Radical SAM domain protein  25.15 
 
 		 828 aa  161  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0470  Radical SAM domain protein  24.63 
 
 		 828 aa  161  3e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2131  Radical SAM domain protein  28.82 
 
 		 613 aa  161  3e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0586  radical SAM family protein  26.52 
 
 		 544 aa  160  4e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14150  Radical SAM domain protein  27.15 
 
 		 626 aa  160  5e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000319843  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0158  radical SAM domain-containing protein  25.51 
 
 		 599 aa  159  1e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.172348  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2195  Fe-S oxidoreductase  24.59 
 
 		 573 aa  158  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.113281  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1455  radical SAM domain-containing protein  25.93 
 
 		 619 aa  157  3e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0351  radical SAM domain-containing protein  25.55 
 
 		 826 aa  157  3e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.247056  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4039  Radical SAM domain protein  27.88 
 
 		 538 aa  158  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.461651 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0512  Radical SAM domain protein  24.53 
 
 		 852 aa  157  4e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00242025  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0300  radical SAM domain-containing protein  25.65 
 
 		 842 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000298698  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0737  radical SAM domain-containing protein  25.05 
 
 		 897 aa  156  7e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1616  hypothetical protein  25.83 
 
 		 638 aa  155  1e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2585  Fe-S oxidoreductase  23.09 
 
 		 836 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00679393  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4341  Radical SAM domain protein  26.21 
 
 		 618 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.898209  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0156  radical SAM family protein  26.91 
 
 		 613 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1454  radical SAM domain-containing protein  29.25 
 
 		 434 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0525  Radical SAM domain protein  25.51 
 
 		 657 aa  153  5.9999999999999996e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.268937  normal  0.0105227 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0695  radical SAM family protein  25.39 
 
 		 898 aa  153  7e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.609463  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0731  Radical SAM domain protein  25.39 
 
 		 898 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1544  radical SAM domain-containing protein  30.37 
 
 		 438 aa  152  1e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0304  radical SAM domain-containing protein  25.84 
 
 		 483 aa  152  1e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30001  Fe-S oxidoreductase  26.16 
 
 		 532 aa  152  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.601707 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2538  radical SAM domain-containing protein  26.23 
 
 		 624 aa  151  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569062  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3787  Radical SAM domain protein  23.32 
 
 		 525 aa  150  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.182556  normal  0.243034 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1317  Radical SAM domain protein  27.05 
 
 		 614 aa  150  4e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2565  radical SAM domain-containing protein  26.88 
 
 		 628 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0730  Radical SAM domain protein  25.39 
 
 		 898 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5483  Radical SAM domain-containing protein  24.64 
 
 		 653 aa  149  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1202  Radical SAM domain protein  24.95 
 
 		 600 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1652  Elongator protein 3/MiaB/NifB  25.17 
 
 		 546 aa  147  3e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.606653  normal  0.975032 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1610  radical SAM domain-containing protein  24.73 
 
 		 849 aa  148  3e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2669  Elongator protein 3/MiaB/NifB  25.17 
 
 		 528 aa  147  4.0000000000000006e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0247408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3328  Radical SAM domain protein  25.49 
 
 		 633 aa  146  8.000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00435818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0554  radical SAM family protein  26.36 
 
 		 626 aa  145  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3436  Radical SAM domain protein  25.61 
 
 		 537 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000587564 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0753  radical SAM domain-containing protein  24.46 
 
 		 654 aa  145  2e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7280  Radical SAM domain protein  25.27 
 
 		 645 aa  145  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1946  Radical SAM domain protein  24.09 
 
 		 619 aa  144  4e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1176  Radical SAM domain protein  24.12 
 
 		 655 aa  144  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0461  radical SAM domain-containing protein  28.24 
 
 		 438 aa  144  4e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0097  radical SAM domain-containing protein  23.87 
 
 		 817 aa  144  5e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0375  radical SAM domain-containing protein  29.11 
 
 		 438 aa  143  8e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0386229 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2030  Elongator protein 3/MiaB/NifB  25.52 
 
 		 894 aa  142  9.999999999999999e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16231  Fe-S oxidoreductase  24.94 
 
 		 882 aa  142  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2185  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.23 
 
 		 644 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.972123  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0446  radical SAM domain-containing protein  28.34 
 
 		 439 aa  141  3e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.627124  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0312  Elongator protein 3/MiaB/NifB  24.33 
 
 		 887 aa  140  3.9999999999999997e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2388  radical SAM domain-containing protein  25.96 
 
 		 617 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.938561  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2100  radical SAM domain-containing protein  25.96 
 
 		 617 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.232765  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1585  Radical SAM domain protein  24.41 
 
 		 642 aa  140  4.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.458582  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3512  radical SAM family protein  25.94 
 
 		 540 aa  140  7e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.170838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0267  Radical SAM domain protein  25.99 
 
 		 874 aa  140  7e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148371  decreased coverage  0.00763103 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1195  radical SAM domain-containing protein  25.91 
 
 		 478 aa  139  1e-31  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2123  radical SAM domain-containing protein  27.95 
 
 		 617 aa  139  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0450793  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0485  radical SAM family protein  24.69 
 
 		 910 aa  138  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363594  normal  0.576766 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1233  Radical SAM domain protein  26.68 
 
 		 597 aa  138  2e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0662  Radical SAM domain protein  26.37 
 
 		 856 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0682  Radical SAM domain protein  26.37 
 
 		 857 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.877734 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2298  Elongator protein 3/MiaB/NifB  25.98 
 
 		 465 aa  137  4e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.217918  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1544  Radical SAM domain protein  24.03 
 
 		 640 aa  136  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0496911  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0387  Radical SAM domain protein  26.58 
 
 		 860 aa  136  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0670  hypothetical protein  25.42 
 
 		 898 aa  135  1.9999999999999998e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3863  radical SAM domain-containing protein  23.26 
 
 		 661 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.721561  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1280  radical SAM family protein  24.2 
 
 		 879 aa  134  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00695626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0457  radical SAM domain-containing protein  23.68 
 
 		 519 aa  134  3e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.211287  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3484  radical SAM domain-containing protein  23.26 
 
 		 663 aa  134  3e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>