253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0327 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0348  radical SAM domain-containing protein  91.18 
 
 		 544 aa  1022    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000123778  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0327  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 544 aa  1104    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00004315  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_288  radical SAM domain protein  90.44 
 
 		 559 aa  1013    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000164247  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3961  radical SAM domain-containing protein  38.53 
 
 		 566 aa  370  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000506678  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2195  Fe-S oxidoreductase  38.55 
 
 		 573 aa  347  4e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.113281  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3282  radical SAM domain-containing protein  37.29 
 
 		 563 aa  346  6e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0422762  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0418  radical SAM family protein  37.73 
 
 		 557 aa  345  1e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0662  Radical SAM domain protein  36.4 
 
 		 545 aa  342  1e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0764321  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3062  radical SAM domain-containing protein  37.41 
 
 		 563 aa  341  2e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.477497  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0560  Radical SAM domain protein  35.87 
 
 		 557 aa  339  8e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.12594e-30 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0548  Radical SAM domain protein  36.31 
 
 		 557 aa  332  1e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.011862  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3475  radical SAM domain-containing protein  35.52 
 
 		 613 aa  325  1e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00430694  normal  0.324644 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3698  Radical SAM domain protein  35.57 
 
 		 589 aa  317  4e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.360742  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3781  Radical SAM domain protein  35.11 
 
 		 589 aa  316  6e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3640  radical SAM family protein  35.36 
 
 		 589 aa  316  7e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3766  radical SAM domain-containing protein  34.57 
 
 		 593 aa  306  8.000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0554  radical SAM family protein  34.36 
 
 		 626 aa  287  2.9999999999999996e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4341  Radical SAM domain protein  32.34 
 
 		 618 aa  280  4e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.898209  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1455  radical SAM domain-containing protein  34.56 
 
 		 619 aa  279  9e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14150  Radical SAM domain protein  29.86 
 
 		 626 aa  278  1e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000319843  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1629  radical SAM domain-containing protein  34.53 
 
 		 611 aa  278  2e-73  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1511  Radical SAM domain protein  34.41 
 
 		 627 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2538  radical SAM domain-containing protein  31.58 
 
 		 624 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569062  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1374  radical SAM domain-containing protein  33.69 
 
 		 610 aa  272  1e-71  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1241  Radical SAM domain protein  31.16 
 
 		 551 aa  271  2e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0874851  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0300  radical SAM domain-containing protein  33.75 
 
 		 842 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000298698  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1233  Radical SAM domain protein  29.95 
 
 		 597 aa  269  1e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0156  radical SAM domain-containing protein  33.39 
 
 		 599 aa  268  2e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0141  Radical SAM domain protein  32.51 
 
 		 828 aa  268  2.9999999999999995e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0158  radical SAM domain-containing protein  33.04 
 
 		 599 aa  266  7e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.172348  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0737  radical SAM domain-containing protein  34.23 
 
 		 897 aa  266  8e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4678  radical SAM domain-containing protein  32.55 
 
 		 543 aa  266  1e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.863222  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0097  radical SAM domain-containing protein  30.9 
 
 		 817 aa  265  1e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0158  Radical SAM domain protein  32.25 
 
 		 828 aa  265  1e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0586  radical SAM family protein  32.68 
 
 		 544 aa  265  2e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0351  radical SAM domain-containing protein  32.28 
 
 		 826 aa  264  3e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.247056  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3512  radical SAM family protein  32.63 
 
 		 540 aa  264  4e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.170838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1652  Elongator protein 3/MiaB/NifB  34.15 
 
 		 546 aa  263  6e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.606653  normal  0.975032 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3328  Radical SAM domain protein  31.62 
 
 		 633 aa  262  2e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00435818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3191  radical SAM family protein  34.36 
 
 		 842 aa  260  4e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0845541  hitchhiker  0.0000000000326362 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2131  Radical SAM domain protein  30.85 
 
 		 613 aa  259  7e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3240  radical SAM domain-containing protein  33.39 
 
 		 812 aa  259  8e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.47861  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0676  Radical SAM domain protein  30.8 
 
 		 621 aa  259  8e-68  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00732227  normal  0.444552 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4437  Radical SAM domain protein  32.51 
 
 		 537 aa  259  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.07608 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4375  Radical SAM domain protein  32.82 
 
 		 537 aa  259  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4039  Radical SAM domain protein  31.38 
 
 		 538 aa  257  5e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.461651 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1946  Radical SAM domain protein  33.1 
 
 		 619 aa  256  6e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3436  Radical SAM domain protein  32.3 
 
 		 537 aa  254  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000587564 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16231  Fe-S oxidoreductase  33.14 
 
 		 882 aa  253  8.000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2463  radical SAM domain-containing protein  30.87 
 
 		 640 aa  252  1e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.123021 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0730  Radical SAM domain protein  32.12 
 
 		 898 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1616  hypothetical protein  31.76 
 
 		 638 aa  251  3e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0731  Radical SAM domain protein  31.96 
 
 		 898 aa  250  4e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1317  Radical SAM domain protein  30.09 
 
 		 614 aa  251  4e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5483  Radical SAM domain-containing protein  30.58 
 
 		 653 aa  250  5e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2669  Elongator protein 3/MiaB/NifB  32.76 
 
 		 528 aa  249  1e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0247408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0525  Radical SAM domain protein  29.38 
 
 		 657 aa  249  1e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.268937  normal  0.0105227 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3863  radical SAM domain-containing protein  30.46 
 
 		 661 aa  248  1e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.721561  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1176  Radical SAM domain protein  30.7 
 
 		 655 aa  248  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3484  radical SAM domain-containing protein  30.64 
 
 		 663 aa  248  2e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1544  Radical SAM domain protein  29.91 
 
 		 640 aa  248  2e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0496911  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0695  radical SAM family protein  31.95 
 
 		 898 aa  248  3e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.609463  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14180  Fe-S oxidoreductase  30.49 
 
 		 626 aa  248  3e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7274  Fe-S oxidoreductase  30.69 
 
 		 636 aa  247  3e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.867612  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0156  radical SAM family protein  29.67 
 
 		 613 aa  247  4e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2185  Elongator protein 3/MiaB/NifB  31.28 
 
 		 644 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.972123  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0470  Radical SAM domain protein  32.67 
 
 		 828 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0387  Radical SAM domain protein  31.13 
 
 		 860 aa  244  3.9999999999999997e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30001  Fe-S oxidoreductase  31 
 
 		 532 aa  244  3.9999999999999997e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.601707 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06130  Fe-S oxidoreductase  30.69 
 
 		 626 aa  243  5e-63  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000171239 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1280  radical SAM family protein  33.73 
 
 		 879 aa  243  6e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00695626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0662  Radical SAM domain protein  30.24 
 
 		 856 aa  243  7.999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0682  Radical SAM domain protein  30.24 
 
 		 857 aa  242  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.877734 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2192  Protein of unknown function DUF2344  32.03 
 
 		 842 aa  241  2.9999999999999997e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2030  Elongator protein 3/MiaB/NifB  32.87 
 
 		 894 aa  241  2.9999999999999997e-62  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2123  radical SAM domain-containing protein  29.53 
 
 		 617 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0450793  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1263  Radical SAM domain protein  30.49 
 
 		 681 aa  241  2.9999999999999997e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0245777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3784  Protein of unknown function DUF2344  32.79 
 
 		 971 aa  240  4e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.539179  normal  0.106507 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2585  Fe-S oxidoreductase  31.98 
 
 		 836 aa  239  8e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00679393  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2388  radical SAM domain-containing protein  29.95 
 
 		 617 aa  239  1e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.938561  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2100  radical SAM domain-containing protein  29.95 
 
 		 617 aa  239  1e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.232765  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3459  radical SAM domain-containing protein  29.75 
 
 		 663 aa  238  2e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.525782  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1701  Elongator protein 3/MiaB/NifB  31.91 
 
 		 860 aa  237  3e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0512  Radical SAM domain protein  30.25 
 
 		 852 aa  237  3e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00242025  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1585  Radical SAM domain protein  30.48 
 
 		 642 aa  236  6e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.458582  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0670  hypothetical protein  33.27 
 
 		 898 aa  234  3e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1025  Radical SAM domain protein  30.48 
 
 		 922 aa  234  3e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0485  radical SAM family protein  29.48 
 
 		 910 aa  233  6e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363594  normal  0.576766 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3383  Radical SAM domain protein  33.53 
 
 		 645 aa  233  8.000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.660882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2565  radical SAM domain-containing protein  28.25 
 
 		 628 aa  232  1e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18361  Fe-S oxidoreductase  32.43 
 
 		 513 aa  230  4e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0267  Radical SAM domain protein  30.84 
 
 		 874 aa  229  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148371  decreased coverage  0.00763103 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1610  radical SAM domain-containing protein  30.92 
 
 		 849 aa  228  2e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0753  radical SAM domain-containing protein  28.45 
 
 		 654 aa  228  2e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2298  Elongator protein 3/MiaB/NifB  32.91 
 
 		 465 aa  228  3e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.217918  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2601  Radical SAM domain protein  29.66 
 
 		 553 aa  226  6e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0312  Elongator protein 3/MiaB/NifB  32.61 
 
 		 887 aa  226  7e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5264  radical SAM domain-containing protein  29.4 
 
 		 677 aa  226  9e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.187686 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7280  Radical SAM domain protein  32.41 
 
 		 645 aa  226  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1202  Radical SAM domain protein  29.36 
 
 		 600 aa  224  4e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>