272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4341 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1317  Radical SAM domain protein  57.83 
 
 		 614 aa  729    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0554  radical SAM family protein  55.08 
 
 		 626 aa  704    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3328  Radical SAM domain protein  60.26 
 
 		 633 aa  790    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00435818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2388  radical SAM domain-containing protein  52.85 
 
 		 617 aa  652    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.938561  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2100  radical SAM domain-containing protein  52.85 
 
 		 617 aa  653    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.232765  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1616  hypothetical protein  55.37 
 
 		 638 aa  696    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1455  radical SAM domain-containing protein  56 
 
 		 619 aa  712    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2123  radical SAM domain-containing protein  53.82 
 
 		 617 aa  673    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0450793  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0156  radical SAM family protein  57.29 
 
 		 613 aa  725    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1946  Radical SAM domain protein  52.98 
 
 		 619 aa  664    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4341  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 618 aa  1284    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.898209  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14150  Radical SAM domain protein  52.51 
 
 		 626 aa  705    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000319843  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2538  radical SAM domain-containing protein  61.56 
 
 		 624 aa  798    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569062  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0525  Radical SAM domain protein  49.67 
 
 		 657 aa  632  1e-180  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.268937  normal  0.0105227 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0300  radical SAM domain-containing protein  49.92 
 
 		 842 aa  630  1e-179  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000298698  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3191  radical SAM family protein  50.68 
 
 		 842 aa  619  1e-176  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0845541  hitchhiker  0.0000000000326362 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2131  Radical SAM domain protein  50.08 
 
 		 613 aa  620  1e-176  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2585  Fe-S oxidoreductase  48.91 
 
 		 836 aa  617  1e-175  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00679393  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0141  Radical SAM domain protein  49.66 
 
 		 828 aa  615  1e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0351  radical SAM domain-containing protein  47.57 
 
 		 826 aa  617  1e-175  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.247056  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2565  radical SAM domain-containing protein  48.27 
 
 		 628 aa  610  1e-173  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0158  Radical SAM domain protein  48.67 
 
 		 828 aa  605  9.999999999999999e-173  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0470  Radical SAM domain protein  47.47 
 
 		 828 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3240  radical SAM domain-containing protein  49.65 
 
 		 812 aa  598  1e-170  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.47861  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1610  radical SAM domain-containing protein  48.91 
 
 		 849 aa  582  1.0000000000000001e-165  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1374  radical SAM domain-containing protein  46.63 
 
 		 610 aa  563  1.0000000000000001e-159  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1629  radical SAM domain-containing protein  45.29 
 
 		 611 aa  555  1e-157  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2185  Elongator protein 3/MiaB/NifB  44.23 
 
 		 644 aa  557  1e-157  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.972123  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7274  Fe-S oxidoreductase  43.09 
 
 		 636 aa  557  1e-157  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.867612  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1176  Radical SAM domain protein  43.53 
 
 		 655 aa  556  1e-157  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5483  Radical SAM domain-containing protein  43.94 
 
 		 653 aa  558  1e-157  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1544  Radical SAM domain protein  43.3 
 
 		 640 aa  557  1e-157  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0496911  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1511  Radical SAM domain protein  44.95 
 
 		 627 aa  555  1e-156  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0753  radical SAM domain-containing protein  42.97 
 
 		 654 aa  552  1e-156  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0097  radical SAM domain-containing protein  45.79 
 
 		 817 aa  555  1e-156  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2463  radical SAM domain-containing protein  42.42 
 
 		 640 aa  548  1e-155  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.123021 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0512  Radical SAM domain protein  45.95 
 
 		 852 aa  549  1e-155  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00242025  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1233  Radical SAM domain protein  45.5 
 
 		 597 aa  548  1e-154  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3383  Radical SAM domain protein  43.02 
 
 		 645 aa  542  1e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.660882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7280  Radical SAM domain protein  42.95 
 
 		 645 aa  541  9.999999999999999e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0156  radical SAM domain-containing protein  44.35 
 
 		 599 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0158  radical SAM domain-containing protein  44.21 
 
 		 599 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.172348  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3484  radical SAM domain-containing protein  41.44 
 
 		 663 aa  536  1e-151  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3784  Protein of unknown function DUF2344  46.17 
 
 		 971 aa  536  1e-151  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.539179  normal  0.106507 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3863  radical SAM domain-containing protein  41.6 
 
 		 661 aa  536  1e-151  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.721561  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1202  Radical SAM domain protein  45.55 
 
 		 600 aa  532  1e-150  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14180  Fe-S oxidoreductase  43.73 
 
 		 626 aa  530  1e-149  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1585  Radical SAM domain protein  42.01 
 
 		 642 aa  530  1e-149  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.458582  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3459  radical SAM domain-containing protein  41.92 
 
 		 663 aa  529  1e-149  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.525782  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0737  radical SAM domain-containing protein  42.49 
 
 		 897 aa  527  1e-148  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06130  Fe-S oxidoreductase  41.35 
 
 		 626 aa  524  1e-147  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000171239 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0676  Radical SAM domain protein  43 
 
 		 621 aa  524  1e-147  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00732227  normal  0.444552 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0695  radical SAM family protein  43.05 
 
 		 898 aa  521  1e-146  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.609463  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0731  Radical SAM domain protein  43.05 
 
 		 898 aa  519  1e-146  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0730  Radical SAM domain protein  43.05 
 
 		 898 aa  518  1.0000000000000001e-145  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1644  radical SAM domain-containing protein  44.93 
 
 		 864 aa  517  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0239  Beta tubulin, autoregulation binding site  43.09 
 
 		 897 aa  518  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0547979 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5264  radical SAM domain-containing protein  41.21 
 
 		 677 aa  514  1e-144  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.187686 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1701  Elongator protein 3/MiaB/NifB  43.76 
 
 		 860 aa  512  1e-144  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1216  radical SAM family protein  40.06 
 
 		 679 aa  508  9.999999999999999e-143  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.837024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1025  Radical SAM domain protein  43.02 
 
 		 922 aa  508  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0387  Radical SAM domain protein  42.72 
 
 		 860 aa  502  1e-141  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1263  Radical SAM domain protein  41.88 
 
 		 681 aa  500  1e-140  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0245777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0682  Radical SAM domain protein  42.48 
 
 		 857 aa  491  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.877734 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0662  Radical SAM domain protein  42.48 
 
 		 856 aa  491  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0978  radical SAM domain-containing protein  40.99 
 
 		 600 aa  483  1e-135  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2192  Protein of unknown function DUF2344  43.95 
 
 		 842 aa  484  1e-135  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1280  radical SAM family protein  41 
 
 		 879 aa  480  1e-134  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00695626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2030  Elongator protein 3/MiaB/NifB  41.29 
 
 		 894 aa  480  1e-134  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0877  Elongator protein 3/MiaB/NifB  41.29 
 
 		 872 aa  481  1e-134  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00856877 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0267  Radical SAM domain protein  40.29 
 
 		 874 aa  481  1e-134  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148371  decreased coverage  0.00763103 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0179  radical SAM domain-containing protein  42.45 
 
 		 591 aa  481  1e-134  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.11642  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0312  Elongator protein 3/MiaB/NifB  40.48 
 
 		 887 aa  478  1e-133  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0485  radical SAM family protein  39.94 
 
 		 910 aa  471  1.0000000000000001e-131  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363594  normal  0.576766 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0670  hypothetical protein  38.89 
 
 		 898 aa  463  1e-129  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16231  Fe-S oxidoreductase  39.74 
 
 		 882 aa  457  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1639  Radical SAM domain protein  35.43 
 
 		 803 aa  393  1e-108  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3475  radical SAM domain-containing protein  38.01 
 
 		 613 aa  382  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00430694  normal  0.324644 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3961  radical SAM domain-containing protein  37.17 
 
 		 566 aa  339  7e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000506678  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3766  radical SAM domain-containing protein  36.61 
 
 		 593 aa  337  3.9999999999999995e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2195  Fe-S oxidoreductase  35.74 
 
 		 573 aa  334  3e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.113281  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3698  Radical SAM domain protein  35.01 
 
 		 589 aa  331  3e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.360742  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3640  radical SAM family protein  35.18 
 
 		 589 aa  330  4e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3781  Radical SAM domain protein  35.01 
 
 		 589 aa  329  8e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0560  Radical SAM domain protein  33.93 
 
 		 557 aa  310  6.999999999999999e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.12594e-30 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0418  radical SAM family protein  34.42 
 
 		 557 aa  307  4.0000000000000004e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0548  Radical SAM domain protein  33.21 
 
 		 557 aa  307  4.0000000000000004e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.011862  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3062  radical SAM domain-containing protein  34.98 
 
 		 563 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.477497  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3282  radical SAM domain-containing protein  33.75 
 
 		 563 aa  303  5.000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0422762  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1241  Radical SAM domain protein  31.54 
 
 		 551 aa  288  2e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0874851  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0327  radical SAM domain-containing protein  32.34 
 
 		 544 aa  280  4e-74  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00004315  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_288  radical SAM domain protein  31.27 
 
 		 559 aa  270  4e-71  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000164247  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0348  radical SAM domain-containing protein  31.87 
 
 		 544 aa  268  2e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000123778  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0586  radical SAM family protein  30.88 
 
 		 544 aa  256  6e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0662  Radical SAM domain protein  31.08 
 
 		 545 aa  248  2e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0764321  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4678  radical SAM domain-containing protein  30.36 
 
 		 543 aa  246  8e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.863222  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3436  Radical SAM domain protein  31.35 
 
 		 537 aa  245  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000587564 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3512  radical SAM family protein  31.52 
 
 		 540 aa  242  1e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.170838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1652  Elongator protein 3/MiaB/NifB  30.7 
 
 		 546 aa  241  2e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.606653  normal  0.975032 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4437  Radical SAM domain protein  30.78 
 
 		 537 aa  240  5e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.07608 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>