196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0457 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0457  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 519 aa  1042    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.211287  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1897  radical SAM domain-containing protein  35.93 
 
 		 483 aa  247  4e-64  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.487619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1436  radical SAM domain-containing protein  35.04 
 
 		 476 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.37868  decreased coverage  0.00181566 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0304  radical SAM domain-containing protein  37.07 
 
 		 483 aa  238  1e-61  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_288  radical SAM domain protein  34.27 
 
 		 559 aa  232  2e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000164247  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0327  radical SAM domain-containing protein  33.07 
 
 		 544 aa  230  4e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00004315  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0348  radical SAM domain-containing protein  33.46 
 
 		 544 aa  226  5.0000000000000005e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000123778  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0179  radical SAM domain-containing protein  32.7 
 
 		 591 aa  224  2e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.11642  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0662  Radical SAM domain protein  31.87 
 
 		 545 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0764321  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1195  radical SAM domain-containing protein  35.71 
 
 		 478 aa  221  3e-56  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3240  radical SAM domain-containing protein  32.64 
 
 		 812 aa  216  8e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.47861  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2131  Radical SAM domain protein  30.31 
 
 		 613 aa  216  9e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0418  radical SAM family protein  30.5 
 
 		 557 aa  213  5.999999999999999e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3475  radical SAM domain-containing protein  31.78 
 
 		 613 aa  210  4e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00430694  normal  0.324644 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1159  radical SAM family protein  29.67 
 
 		 510 aa  210  6e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.044499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0156  radical SAM domain-containing protein  31.04 
 
 		 599 aa  209  7e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3961  radical SAM domain-containing protein  30 
 
 		 566 aa  209  7e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000506678  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0158  radical SAM domain-containing protein  30.86 
 
 		 599 aa  209  1e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.172348  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2195  Fe-S oxidoreductase  31.49 
 
 		 573 aa  206  1e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.113281  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1202  Radical SAM domain protein  33.01 
 
 		 600 aa  201  3.9999999999999996e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1616  hypothetical protein  29.27 
 
 		 638 aa  199  1.0000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1233  Radical SAM domain protein  29.11 
 
 		 597 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0548  Radical SAM domain protein  28.68 
 
 		 557 aa  197  3e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.011862  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14150  Radical SAM domain protein  29.37 
 
 		 626 aa  197  3e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000319843  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0351  radical SAM domain-containing protein  29.08 
 
 		 826 aa  197  3e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.247056  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0978  radical SAM domain-containing protein  29.03 
 
 		 600 aa  197  3e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2123  radical SAM domain-containing protein  29.35 
 
 		 617 aa  197  5.000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0450793  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1946  Radical SAM domain protein  31.37 
 
 		 619 aa  196  6e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4341  Radical SAM domain protein  28.91 
 
 		 618 aa  196  8.000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.898209  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3640  radical SAM family protein  30.48 
 
 		 589 aa  196  9e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0470  Radical SAM domain protein  28.97 
 
 		 828 aa  195  1e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0156  radical SAM family protein  29.42 
 
 		 613 aa  195  2e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3781  Radical SAM domain protein  30.26 
 
 		 589 aa  194  3e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3282  radical SAM domain-containing protein  28.46 
 
 		 563 aa  194  3e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0422762  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3698  Radical SAM domain protein  30.83 
 
 		 589 aa  194  4e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.360742  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0560  Radical SAM domain protein  28.18 
 
 		 557 aa  194  4e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.12594e-30 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3062  radical SAM domain-containing protein  30.31 
 
 		 563 aa  193  6e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.477497  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3787  Radical SAM domain protein  32.56 
 
 		 525 aa  191  2e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.182556  normal  0.243034 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0525  Radical SAM domain protein  30.42 
 
 		 657 aa  192  2e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.268937  normal  0.0105227 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0141  Radical SAM domain protein  30.54 
 
 		 828 aa  192  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1644  radical SAM domain-containing protein  30.35 
 
 		 864 aa  190  7e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0512  Radical SAM domain protein  28.86 
 
 		 852 aa  189  9e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00242025  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2585  Fe-S oxidoreductase  30.48 
 
 		 836 aa  189  1e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00679393  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1025  Radical SAM domain protein  27.75 
 
 		 922 aa  189  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3766  radical SAM domain-containing protein  30.34 
 
 		 593 aa  189  1e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0158  Radical SAM domain protein  30.17 
 
 		 828 aa  187  4e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2388  radical SAM domain-containing protein  28.98 
 
 		 617 aa  186  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.938561  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2100  radical SAM domain-containing protein  28.98 
 
 		 617 aa  186  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.232765  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2538  radical SAM domain-containing protein  28.68 
 
 		 624 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569062  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0554  radical SAM family protein  28.52 
 
 		 626 aa  183  5.0000000000000004e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0737  radical SAM domain-containing protein  29.82 
 
 		 897 aa  183  7e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1610  radical SAM domain-containing protein  31.13 
 
 		 849 aa  182  9.000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1652  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.69 
 
 		 546 aa  182  1e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.606653  normal  0.975032 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1511  Radical SAM domain protein  29.08 
 
 		 627 aa  182  2e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2565  radical SAM domain-containing protein  25.67 
 
 		 628 aa  182  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1629  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 611 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3191  radical SAM family protein  30.56 
 
 		 842 aa  181  4e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0845541  hitchhiker  0.0000000000326362 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0239  Beta tubulin, autoregulation binding site  29.14 
 
 		 897 aa  181  4e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0547979 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0485  radical SAM family protein  29.86 
 
 		 910 aa  180  7e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363594  normal  0.576766 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0300  radical SAM domain-containing protein  29.17 
 
 		 842 aa  180  7e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000298698  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1176  Radical SAM domain protein  31.08 
 
 		 655 aa  179  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2601  Radical SAM domain protein  30.79 
 
 		 553 aa  179  1e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0097  radical SAM domain-containing protein  28.02 
 
 		 817 aa  179  1e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1317  Radical SAM domain protein  27.31 
 
 		 614 aa  179  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3328  Radical SAM domain protein  28.26 
 
 		 633 aa  178  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00435818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0461  radical SAM domain-containing protein  28.37 
 
 		 438 aa  176  8e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1701  Elongator protein 3/MiaB/NifB  28.49 
 
 		 860 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1374  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 610 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5264  radical SAM domain-containing protein  31.36 
 
 		 677 aa  175  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.187686 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1544  Radical SAM domain protein  30.81 
 
 		 640 aa  173  5.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0496911  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0695  radical SAM family protein  28.88 
 
 		 898 aa  173  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.609463  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1544  radical SAM domain-containing protein  28.22 
 
 		 438 aa  173  5.999999999999999e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0731  Radical SAM domain protein  28.88 
 
 		 898 aa  173  7.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0586  radical SAM family protein  28.82 
 
 		 544 aa  172  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2192  Protein of unknown function DUF2344  28.2 
 
 		 842 aa  172  1e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7274  Fe-S oxidoreductase  28.7 
 
 		 636 aa  172  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.867612  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3512  radical SAM family protein  27.88 
 
 		 540 aa  171  2e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.170838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4039  Radical SAM domain protein  27.83 
 
 		 538 aa  172  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.461651 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2030  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.87 
 
 		 894 aa  171  3e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0730  Radical SAM domain protein  28.88 
 
 		 898 aa  171  3e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1455  radical SAM domain-containing protein  28.02 
 
 		 619 aa  171  3e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0670  hypothetical protein  29.21 
 
 		 898 aa  170  5e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0375  radical SAM domain-containing protein  27.46 
 
 		 438 aa  170  5e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0386229 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3484  radical SAM domain-containing protein  29.34 
 
 		 663 aa  170  7e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1216  radical SAM family protein  30.25 
 
 		 679 aa  169  9e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.837024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0387  Radical SAM domain protein  30.18 
 
 		 860 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0676  Radical SAM domain protein  29.46 
 
 		 621 aa  169  1e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00732227  normal  0.444552 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3784  Protein of unknown function DUF2344  28.44 
 
 		 971 aa  169  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.539179  normal  0.106507 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0312  Elongator protein 3/MiaB/NifB  30.48 
 
 		 887 aa  168  2e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5483  Radical SAM domain-containing protein  27.77 
 
 		 653 aa  168  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1639  Radical SAM domain protein  27.84 
 
 		 803 aa  168  2e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3863  radical SAM domain-containing protein  29.34 
 
 		 661 aa  168  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.721561  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2463  radical SAM domain-containing protein  30.31 
 
 		 640 aa  168  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.123021 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7280  Radical SAM domain protein  29.75 
 
 		 645 aa  168  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2185  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.42 
 
 		 644 aa  167  4e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.972123  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0753  radical SAM domain-containing protein  28.85 
 
 		 654 aa  167  4e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1585  Radical SAM domain protein  28.85 
 
 		 642 aa  166  8e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.458582  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0662  Radical SAM domain protein  30.08 
 
 		 856 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0682  Radical SAM domain protein  30.08 
 
 		 857 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.877734 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16231  Fe-S oxidoreductase  28.97 
 
 		 882 aa  165  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>