287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0348 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0348  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 544 aa  1098    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000123778  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0327  radical SAM domain-containing protein  91.18 
 
 		 544 aa  1022    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00004315  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_288  radical SAM domain protein  95.4 
 
 		 559 aa  1051    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000164247  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3961  radical SAM domain-containing protein  38.8 
 
 		 566 aa  360  4e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000506678  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0418  radical SAM family protein  38.94 
 
 		 557 aa  341  2e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2195  Fe-S oxidoreductase  38.25 
 
 		 573 aa  338  9.999999999999999e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.113281  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0662  Radical SAM domain protein  37.78 
 
 		 545 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0764321  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3282  radical SAM domain-containing protein  36.98 
 
 		 563 aa  335  1e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0422762  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3062  radical SAM domain-containing protein  37.48 
 
 		 563 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.477497  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0560  Radical SAM domain protein  36.01 
 
 		 557 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.12594e-30 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0548  Radical SAM domain protein  36.13 
 
 		 557 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.011862  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3475  radical SAM domain-containing protein  36.18 
 
 		 613 aa  314  2.9999999999999996e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00430694  normal  0.324644 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3698  Radical SAM domain protein  36.09 
 
 		 589 aa  306  6e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.360742  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3781  Radical SAM domain protein  36.09 
 
 		 589 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3640  radical SAM family protein  36.18 
 
 		 589 aa  304  3.0000000000000004e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3766  radical SAM domain-containing protein  35.91 
 
 		 593 aa  304  3.0000000000000004e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0554  radical SAM family protein  34.36 
 
 		 626 aa  276  7e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1629  radical SAM domain-containing protein  33.63 
 
 		 611 aa  271  2e-71  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1455  radical SAM domain-containing protein  33.98 
 
 		 619 aa  270  5e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0586  radical SAM family protein  33.64 
 
 		 544 aa  269  8e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14150  Radical SAM domain protein  30.34 
 
 		 626 aa  269  8.999999999999999e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000319843  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4341  Radical SAM domain protein  31.87 
 
 		 618 aa  268  1e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.898209  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4678  radical SAM domain-containing protein  33.65 
 
 		 543 aa  268  1e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.863222  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0141  Radical SAM domain protein  32.92 
 
 		 828 aa  266  5e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0737  radical SAM domain-containing protein  34.42 
 
 		 897 aa  266  5e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1652  Elongator protein 3/MiaB/NifB  34.23 
 
 		 546 aa  266  8.999999999999999e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.606653  normal  0.975032 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4437  Radical SAM domain protein  33.21 
 
 		 537 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.07608 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1241  Radical SAM domain protein  30.7 
 
 		 551 aa  265  1e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0874851  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3512  radical SAM family protein  33.21 
 
 		 540 aa  266  1e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.170838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1511  Radical SAM domain protein  33.15 
 
 		 627 aa  265  2e-69  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0158  Radical SAM domain protein  32.97 
 
 		 828 aa  265  2e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4375  Radical SAM domain protein  33.21 
 
 		 537 aa  265  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0300  radical SAM domain-containing protein  33.87 
 
 		 842 aa  265  2e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000298698  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1233  Radical SAM domain protein  29.82 
 
 		 597 aa  264  4e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0097  radical SAM domain-containing protein  31.32 
 
 		 817 aa  263  8.999999999999999e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3436  Radical SAM domain protein  31.32 
 
 		 537 aa  262  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000587564 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4039  Radical SAM domain protein  33.78 
 
 		 538 aa  262  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.461651 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1374  radical SAM domain-containing protein  33.04 
 
 		 610 aa  261  2e-68  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2538  radical SAM domain-containing protein  30.76 
 
 		 624 aa  260  6e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569062  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3240  radical SAM domain-containing protein  33.83 
 
 		 812 aa  259  1e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.47861  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3328  Radical SAM domain protein  32.01 
 
 		 633 aa  259  1e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00435818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0156  radical SAM domain-containing protein  32.84 
 
 		 599 aa  257  4e-67  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0351  radical SAM domain-containing protein  32.1 
 
 		 826 aa  257  5e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.247056  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0158  radical SAM domain-containing protein  32.66 
 
 		 599 aa  256  8e-67  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.172348  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3191  radical SAM family protein  33.45 
 
 		 842 aa  255  2.0000000000000002e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0845541  hitchhiker  0.0000000000326362 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2463  radical SAM domain-containing protein  31.85 
 
 		 640 aa  251  3e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.123021 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2131  Radical SAM domain protein  31.17 
 
 		 613 aa  250  4e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14180  Fe-S oxidoreductase  31.47 
 
 		 626 aa  250  4e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1946  Radical SAM domain protein  34.46 
 
 		 619 aa  250  4e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0676  Radical SAM domain protein  30.8 
 
 		 621 aa  250  4e-65  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00732227  normal  0.444552 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0730  Radical SAM domain protein  33.84 
 
 		 898 aa  248  2e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5483  Radical SAM domain-containing protein  31.73 
 
 		 653 aa  247  4e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16231  Fe-S oxidoreductase  31.77 
 
 		 882 aa  247  4.9999999999999997e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30001  Fe-S oxidoreductase  31.43 
 
 		 532 aa  246  6e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.601707 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0731  Radical SAM domain protein  33.84 
 
 		 898 aa  246  8e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1317  Radical SAM domain protein  30.61 
 
 		 614 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1616  hypothetical protein  31.25 
 
 		 638 aa  245  1.9999999999999999e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0525  Radical SAM domain protein  29.95 
 
 		 657 aa  244  1.9999999999999999e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.268937  normal  0.0105227 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1544  Radical SAM domain protein  30.7 
 
 		 640 aa  243  5e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0496911  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2669  Elongator protein 3/MiaB/NifB  31.99 
 
 		 528 aa  243  7.999999999999999e-63  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0247408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1263  Radical SAM domain protein  31.28 
 
 		 681 aa  243  9e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0245777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1585  Radical SAM domain protein  32.94 
 
 		 642 aa  243  1e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.458582  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0695  radical SAM family protein  33.4 
 
 		 898 aa  242  1e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.609463  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1176  Radical SAM domain protein  31.34 
 
 		 655 aa  241  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06130  Fe-S oxidoreductase  32.12 
 
 		 626 aa  241  2.9999999999999997e-62  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000171239 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0156  radical SAM family protein  29.84 
 
 		 613 aa  241  2.9999999999999997e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7274  Fe-S oxidoreductase  30.8 
 
 		 636 aa  240  5.999999999999999e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.867612  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3484  radical SAM domain-containing protein  30.29 
 
 		 663 aa  239  6.999999999999999e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3863  radical SAM domain-containing protein  30.12 
 
 		 661 aa  239  1e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.721561  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2030  Elongator protein 3/MiaB/NifB  32.28 
 
 		 894 aa  236  6e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1025  Radical SAM domain protein  32.6 
 
 		 922 aa  236  7e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1280  radical SAM family protein  33.27 
 
 		 879 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00695626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0387  Radical SAM domain protein  30.37 
 
 		 860 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0470  Radical SAM domain protein  31.68 
 
 		 828 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3459  radical SAM domain-containing protein  30.51 
 
 		 663 aa  234  3e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.525782  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2123  radical SAM domain-containing protein  29.76 
 
 		 617 aa  234  4.0000000000000004e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0450793  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2185  Elongator protein 3/MiaB/NifB  30.56 
 
 		 644 aa  233  5e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.972123  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2585  Fe-S oxidoreductase  33.93 
 
 		 836 aa  231  2e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00679393  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2192  Protein of unknown function DUF2344  32.03 
 
 		 842 aa  232  2e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0662  Radical SAM domain protein  29.32 
 
 		 856 aa  231  3e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0682  Radical SAM domain protein  29.32 
 
 		 857 aa  230  4e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.877734 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3784  Protein of unknown function DUF2344  31.53 
 
 		 971 aa  230  5e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.539179  normal  0.106507 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3787  Radical SAM domain protein  35.19 
 
 		 525 aa  229  9e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.182556  normal  0.243034 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2388  radical SAM domain-containing protein  30.16 
 
 		 617 aa  229  9e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.938561  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1159  radical SAM family protein  32.49 
 
 		 510 aa  229  1e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.044499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2100  radical SAM domain-containing protein  30.16 
 
 		 617 aa  229  1e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.232765  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0485  radical SAM family protein  28.85 
 
 		 910 aa  229  1e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363594  normal  0.576766 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1701  Elongator protein 3/MiaB/NifB  31.56 
 
 		 860 aa  228  2e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0512  Radical SAM domain protein  30.18 
 
 		 852 aa  228  3e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00242025  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18361  Fe-S oxidoreductase  32.48 
 
 		 513 aa  228  3e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0670  hypothetical protein  32.51 
 
 		 898 aa  227  4e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2565  radical SAM domain-containing protein  29.04 
 
 		 628 aa  227  4e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3383  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 645 aa  227  5.0000000000000005e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.660882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2298  Elongator protein 3/MiaB/NifB  32.9 
 
 		 465 aa  226  1e-57  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.217918  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0753  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 654 aa  225  2e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0312  Elongator protein 3/MiaB/NifB  32.02 
 
 		 887 aa  224  4e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1610  radical SAM domain-containing protein  31.56 
 
 		 849 aa  221  1.9999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5264  radical SAM domain-containing protein  29.45 
 
 		 677 aa  221  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.187686 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0267  Radical SAM domain protein  31.76 
 
 		 874 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148371  decreased coverage  0.00763103 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2601  Radical SAM domain protein  29.96 
 
 		 553 aa  220  3.9999999999999997e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>