More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0156 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0978  radical SAM domain-containing protein  53.34 
 
 
600 aa  635    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0158  radical SAM domain-containing protein  99 
 
 
599 aa  1219    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.172348  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0156  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
599 aa  1225    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0179  radical SAM domain-containing protein  51.1 
 
 
591 aa  628  1e-178  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.11642  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1946  Radical SAM domain protein  48.01 
 
 
619 aa  579  1e-164  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1455  radical SAM domain-containing protein  47.52 
 
 
619 aa  572  1.0000000000000001e-162  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1616  hypothetical protein  47.45 
 
 
638 aa  556  1e-157  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3191  radical SAM family protein  48.38 
 
 
842 aa  553  1e-156  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0845541  hitchhiker  0.0000000000326362 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0141  Radical SAM domain protein  48.99 
 
 
828 aa  555  1e-156  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2131  Radical SAM domain protein  47.74 
 
 
613 aa  549  1e-155  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14150  Radical SAM domain protein  45.16 
 
 
626 aa  550  1e-155  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000319843  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1317  Radical SAM domain protein  45.38 
 
 
614 aa  545  1e-154  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0525  Radical SAM domain protein  46.31 
 
 
657 aa  548  1e-154  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.268937  normal  0.0105227 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2538  radical SAM domain-containing protein  44.68 
 
 
624 aa  546  1e-154  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569062  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0470  Radical SAM domain protein  48.05 
 
 
828 aa  546  1e-154  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0351  radical SAM domain-containing protein  46.81 
 
 
826 aa  547  1e-154  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.247056  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0158  Radical SAM domain protein  48.57 
 
 
828 aa  546  1e-154  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0300  radical SAM domain-containing protein  47.89 
 
 
842 aa  543  1e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000298698  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3240  radical SAM domain-containing protein  49.11 
 
 
812 aa  539  9.999999999999999e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.47861  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4341  Radical SAM domain protein  44.35 
 
 
618 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.898209  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0156  radical SAM family protein  46.52 
 
 
613 aa  540  9.999999999999999e-153  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3328  Radical SAM domain protein  42.22 
 
 
633 aa  537  1e-151  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00435818  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2123  radical SAM domain-containing protein  48.73 
 
 
617 aa  536  1e-151  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0450793  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2585  Fe-S oxidoreductase  45.62 
 
 
836 aa  525  1e-147  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00679393  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1610  radical SAM domain-containing protein  46.31 
 
 
849 aa  523  1e-147  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3484  radical SAM domain-containing protein  43.19 
 
 
663 aa  516  1.0000000000000001e-145  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2388  radical SAM domain-containing protein  42.57 
 
 
617 aa  516  1.0000000000000001e-145  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.938561  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2100  radical SAM domain-containing protein  42.57 
 
 
617 aa  516  1.0000000000000001e-145  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.232765  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06130  Fe-S oxidoreductase  42.86 
 
 
626 aa  515  1e-144  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000171239 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3863  radical SAM domain-containing protein  42.69 
 
 
661 aa  512  1e-144  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.721561  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5483  Radical SAM domain-containing protein  42.69 
 
 
653 aa  512  1e-144  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1176  Radical SAM domain protein  42.56 
 
 
655 aa  513  1e-144  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1544  Radical SAM domain protein  43.25 
 
 
640 aa  508  1e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0496911  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2565  radical SAM domain-containing protein  41.06 
 
 
628 aa  511  1e-143  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1629  radical SAM domain-containing protein  42.9 
 
 
611 aa  507  9.999999999999999e-143  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0554  radical SAM family protein  43.02 
 
 
626 aa  506  9.999999999999999e-143  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0239  Beta tubulin, autoregulation binding site  42.93 
 
 
897 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0547979 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1202  Radical SAM domain protein  44.67 
 
 
600 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2463  radical SAM domain-containing protein  42.76 
 
 
640 aa  505  9.999999999999999e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.123021 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2185  Elongator protein 3/MiaB/NifB  42.88 
 
 
644 aa  505  1e-141  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.972123  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1511  Radical SAM domain protein  42.07 
 
 
627 aa  502  1e-141  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1233  Radical SAM domain protein  45.03 
 
 
597 aa  503  1e-141  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0676  Radical SAM domain protein  41.92 
 
 
621 aa  505  1e-141  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00732227  normal  0.444552 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7274  Fe-S oxidoreductase  41.9 
 
 
636 aa  504  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.867612  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1701  Elongator protein 3/MiaB/NifB  42.66 
 
 
860 aa  499  1e-140  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1374  radical SAM domain-containing protein  42.47 
 
 
610 aa  501  1e-140  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1263  Radical SAM domain protein  42.55 
 
 
681 aa  498  1e-140  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0245777  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0097  radical SAM domain-containing protein  44.43 
 
 
817 aa  496  1e-139  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7280  Radical SAM domain protein  42.42 
 
 
645 aa  496  1e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1025  Radical SAM domain protein  41.61 
 
 
922 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0512  Radical SAM domain protein  43.56 
 
 
852 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00242025  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14180  Fe-S oxidoreductase  40.16 
 
 
626 aa  489  1e-137  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3383  Radical SAM domain protein  42.39 
 
 
645 aa  490  1e-137  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.660882  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0753  radical SAM domain-containing protein  41.52 
 
 
654 aa  490  1e-137  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2192  Protein of unknown function DUF2344  43.56 
 
 
842 aa  488  1e-136  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1216  radical SAM family protein  41.33 
 
 
679 aa  484  1e-135  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.837024  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1585  Radical SAM domain protein  40.89 
 
 
642 aa  485  1e-135  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.458582  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3459  radical SAM domain-containing protein  41.54 
 
 
663 aa  483  1e-135  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.525782  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5264  radical SAM domain-containing protein  41.82 
 
 
677 aa  481  1e-134  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.187686 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1644  radical SAM domain-containing protein  41.92 
 
 
864 aa  476  1e-133  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0730  Radical SAM domain protein  40.29 
 
 
898 aa  469  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0695  radical SAM family protein  40.61 
 
 
898 aa  469  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.609463  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0731  Radical SAM domain protein  40.45 
 
 
898 aa  468  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3784  Protein of unknown function DUF2344  41.54 
 
 
971 aa  465  9.999999999999999e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.539179  normal  0.106507 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0737  radical SAM domain-containing protein  39.48 
 
 
897 aa  466  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0387  Radical SAM domain protein  40.56 
 
 
860 aa  452  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2030  Elongator protein 3/MiaB/NifB  39.9 
 
 
894 aa  447  1.0000000000000001e-124  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0267  Radical SAM domain protein  39.67 
 
 
874 aa  439  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148371  decreased coverage  0.00763103 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0312  Elongator protein 3/MiaB/NifB  38.34 
 
 
887 aa  436  1e-121  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0877  Elongator protein 3/MiaB/NifB  40.13 
 
 
872 aa  436  1e-121  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00856877 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16231  Fe-S oxidoreductase  39.97 
 
 
882 aa  438  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0662  Radical SAM domain protein  38.77 
 
 
856 aa  433  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1280  radical SAM family protein  38.29 
 
 
879 aa  433  1e-120  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00695626  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0682  Radical SAM domain protein  38.77 
 
 
857 aa  433  1e-120  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.877734 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0485  radical SAM family protein  39 
 
 
910 aa  426  1e-118  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363594  normal  0.576766 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1639  Radical SAM domain protein  38.41 
 
 
803 aa  418  9.999999999999999e-116  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0670  hypothetical protein  37.27 
 
 
898 aa  417  9.999999999999999e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3475  radical SAM domain-containing protein  34.17 
 
 
613 aa  292  1e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00430694  normal  0.324644 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3961  radical SAM domain-containing protein  32.28 
 
 
566 aa  288  2e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000506678  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1241  Radical SAM domain protein  32.32 
 
 
551 aa  278  2e-73  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0874851  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3698  Radical SAM domain protein  32.32 
 
 
589 aa  277  4e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.360742  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2195  Fe-S oxidoreductase  32.11 
 
 
573 aa  277  5e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.113281  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3781  Radical SAM domain protein  32.32 
 
 
589 aa  276  7e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3766  radical SAM domain-containing protein  33.16 
 
 
593 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3640  radical SAM family protein  32.27 
 
 
589 aa  276  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0418  radical SAM family protein  32.37 
 
 
557 aa  270  7e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0327  radical SAM domain-containing protein  33.39 
 
 
544 aa  268  2e-70  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00004315  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3062  radical SAM domain-containing protein  32.49 
 
 
563 aa  267  4e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.477497  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0548  Radical SAM domain protein  31.83 
 
 
557 aa  265  3e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.011862  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0560  Radical SAM domain protein  31.83 
 
 
557 aa  261  2e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.12594e-30 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_288  radical SAM domain protein  32.47 
 
 
559 aa  258  2e-67  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000164247  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0348  radical SAM domain-containing protein  32.84 
 
 
544 aa  257  4e-67  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000123778  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0662  Radical SAM domain protein  30.47 
 
 
545 aa  248  2e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0764321  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3282  radical SAM domain-containing protein  28.62 
 
 
563 aa  248  2e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0422762  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3512  radical SAM family protein  30.05 
 
 
540 aa  223  9e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.170838  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30001  Fe-S oxidoreductase  30.02 
 
 
532 aa  221  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.601707 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2669  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.87 
 
 
528 aa  219  2e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0247408  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4039  Radical SAM domain protein  28.47 
 
 
538 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.461651 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0586  radical SAM family protein  28.79 
 
 
544 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4678  radical SAM domain-containing protein  28.04 
 
 
543 aa  214  2.9999999999999995e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.863222  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>