226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0354 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0354  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
471 aa  952    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0336  radical SAM domain-containing protein  99.15 
 
 
486 aa  944    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0161  radical SAM domain-containing protein  45.26 
 
 
469 aa  373  1e-102  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0204  radical SAM domain-containing protein  42.6 
 
 
452 aa  336  5.999999999999999e-91  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.573337  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3961  radical SAM domain-containing protein  34.62 
 
 
566 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000506678  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0560  Radical SAM domain protein  34.94 
 
 
557 aa  232  1e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.12594e-30 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0548  Radical SAM domain protein  34.94 
 
 
557 aa  228  2e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.011862  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3640  radical SAM family protein  31.94 
 
 
589 aa  226  5.0000000000000005e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3781  Radical SAM domain protein  31.75 
 
 
589 aa  220  5e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3698  Radical SAM domain protein  31.88 
 
 
589 aa  219  1e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.360742  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3282  radical SAM domain-containing protein  31.6 
 
 
563 aa  216  5e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0422762  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0662  Radical SAM domain protein  31.66 
 
 
545 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0764321  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0418  radical SAM family protein  33.33 
 
 
557 aa  213  7.999999999999999e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3766  radical SAM domain-containing protein  32.43 
 
 
593 aa  210  4e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3062  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 
563 aa  207  5e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.477497  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4341  Radical SAM domain protein  30.4 
 
 
618 aa  206  8e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.898209  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2601  Radical SAM domain protein  30.22 
 
 
553 aa  204  4e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3475  radical SAM domain-containing protein  31.21 
 
 
613 aa  203  5e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00430694  normal  0.324644 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0327  radical SAM domain-containing protein  31.26 
 
 
544 aa  203  5e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00004315  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14150  Radical SAM domain protein  30.9 
 
 
626 aa  202  9e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000319843  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1455  radical SAM domain-containing protein  31.21 
 
 
619 aa  202  9.999999999999999e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2538  radical SAM domain-containing protein  30.07 
 
 
624 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569062  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_288  radical SAM domain protein  31.06 
 
 
559 aa  200  5e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000164247  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2131  Radical SAM domain protein  32.74 
 
 
613 aa  199  6e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0348  radical SAM domain-containing protein  30.47 
 
 
544 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000123778  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0387  Radical SAM domain protein  30.89 
 
 
860 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1241  Radical SAM domain protein  30.11 
 
 
551 aa  197  3e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0874851  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1280  radical SAM family protein  29.12 
 
 
879 aa  195  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00695626  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2195  Fe-S oxidoreductase  31.43 
 
 
573 aa  194  4e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.113281  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1202  Radical SAM domain protein  30.4 
 
 
600 aa  193  4e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0470  Radical SAM domain protein  29.26 
 
 
828 aa  192  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0878  Radical SAM domain protein  30.02 
 
 
509 aa  192  1e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000778999  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1233  Radical SAM domain protein  30.91 
 
 
597 aa  191  2e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1317  Radical SAM domain protein  28.63 
 
 
614 aa  189  7e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2100  radical SAM domain-containing protein  28.8 
 
 
617 aa  189  1e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.232765  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2123  radical SAM domain-containing protein  32.41 
 
 
617 aa  187  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0450793  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2388  radical SAM domain-containing protein  28.6 
 
 
617 aa  188  2e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.938561  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0485  radical SAM family protein  28.45 
 
 
910 aa  188  2e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363594  normal  0.576766 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0158  radical SAM domain-containing protein  30 
 
 
599 aa  187  4e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.172348  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2030  Elongator protein 3/MiaB/NifB  28.97 
 
 
894 aa  185  1.0000000000000001e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0554  radical SAM family protein  30.42 
 
 
626 aa  186  1.0000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16231  Fe-S oxidoreductase  27.65 
 
 
882 aa  185  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0156  radical SAM domain-containing protein  29.56 
 
 
599 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0179  radical SAM domain-containing protein  29 
 
 
591 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.11642  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0312  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.4 
 
 
887 aa  184  2.0000000000000003e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0156  radical SAM family protein  29.84 
 
 
613 aa  183  4.0000000000000006e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0662  Radical SAM domain protein  29.91 
 
 
856 aa  184  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0682  Radical SAM domain protein  29.91 
 
 
857 aa  183  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.877734 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0267  Radical SAM domain protein  28.63 
 
 
874 aa  182  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148371  decreased coverage  0.00763103 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3328  Radical SAM domain protein  30.26 
 
 
633 aa  182  9.000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00435818  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2565  radical SAM domain-containing protein  28.26 
 
 
628 aa  180  4e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0978  radical SAM domain-containing protein  29.39 
 
 
600 aa  180  4.999999999999999e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0877  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.18 
 
 
872 aa  180  5.999999999999999e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00856877 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0670  hypothetical protein  28.77 
 
 
898 aa  179  1e-43  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1629  radical SAM domain-containing protein  28.71 
 
 
611 aa  178  2e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0351  radical SAM domain-containing protein  28.98 
 
 
826 aa  177  3e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.247056  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1946  Radical SAM domain protein  30.73 
 
 
619 aa  177  4e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0695  radical SAM family protein  28.11 
 
 
898 aa  176  7e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.609463  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1454  radical SAM domain-containing protein  31.65 
 
 
434 aa  176  8e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0525  Radical SAM domain protein  27.16 
 
 
657 aa  176  8e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.268937  normal  0.0105227 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1511  Radical SAM domain protein  28.51 
 
 
627 aa  176  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3787  Radical SAM domain protein  29.36 
 
 
525 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.182556  normal  0.243034 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0731  Radical SAM domain protein  28.11 
 
 
898 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0300  radical SAM domain-containing protein  28.45 
 
 
842 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000298698  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3191  radical SAM family protein  31.18 
 
 
842 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0845541  hitchhiker  0.0000000000326362 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0730  Radical SAM domain protein  28.11 
 
 
898 aa  173  5e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1159  radical SAM family protein  27.82 
 
 
510 aa  172  1e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.044499  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0097  radical SAM domain-containing protein  31.39 
 
 
817 aa  172  1e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3240  radical SAM domain-containing protein  29.67 
 
 
812 aa  171  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.47861  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3784  Protein of unknown function DUF2344  29.11 
 
 
971 aa  171  2e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.539179  normal  0.106507 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1701  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.91 
 
 
860 aa  171  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0512  Radical SAM domain protein  28.41 
 
 
852 aa  172  2e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00242025  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0676  Radical SAM domain protein  27.86 
 
 
621 aa  171  3e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00732227  normal  0.444552 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0737  radical SAM domain-containing protein  26.88 
 
 
897 aa  170  5e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1374  radical SAM domain-containing protein  28.4 
 
 
610 aa  170  6e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1610  radical SAM domain-containing protein  28.72 
 
 
849 aa  169  8e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0239  Beta tubulin, autoregulation binding site  29.04 
 
 
897 aa  168  2e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0547979 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1616  hypothetical protein  29.58 
 
 
638 aa  167  4e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1644  radical SAM domain-containing protein  29.53 
 
 
864 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2585  Fe-S oxidoreductase  29.33 
 
 
836 aa  163  6e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00679393  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0141  Radical SAM domain protein  29.6 
 
 
828 aa  161  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0158  Radical SAM domain protein  28.98 
 
 
828 aa  160  4e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0375  radical SAM domain-containing protein  30.73 
 
 
438 aa  160  5e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0386229 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1025  Radical SAM domain protein  29.21 
 
 
922 aa  158  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1897  radical SAM domain-containing protein  31.72 
 
 
483 aa  158  2e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.487619  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1544  radical SAM domain-containing protein  30.47 
 
 
438 aa  157  4e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0461  radical SAM domain-containing protein  30.47 
 
 
438 aa  156  9e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0446  radical SAM domain-containing protein  29.17 
 
 
439 aa  154  2e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.627124  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2669  Elongator protein 3/MiaB/NifB  28.33 
 
 
528 aa  154  4e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0247408  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2185  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.7 
 
 
644 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.972123  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1263  Radical SAM domain protein  26.4 
 
 
681 aa  147  3e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0245777  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2192  Protein of unknown function DUF2344  26.82 
 
 
842 aa  147  3e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30001  Fe-S oxidoreductase  28.19 
 
 
532 aa  146  9e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.601707 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0457  radical SAM domain-containing protein  29.17 
 
 
519 aa  146  1e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.211287  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0304  radical SAM domain-containing protein  30.98 
 
 
483 aa  144  3e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2298  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.71 
 
 
465 aa  143  7e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.217918  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1585  Radical SAM domain protein  26.3 
 
 
642 aa  143  7e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.458582  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0586  radical SAM family protein  28.35 
 
 
544 aa  143  9e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5483  Radical SAM domain-containing protein  25.61 
 
 
653 aa  142  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7280  Radical SAM domain protein  27.13 
 
 
645 aa  141  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>