More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0799 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_23771  Fe-S oxidoreductase  72.75 
 
 		 538 aa  765    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0282707 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16891  Fe-S oxidoreductase  64.65 
 
 		 539 aa  719    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.779533  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0832  Radical SAM domain protein  77.59 
 
 		 527 aa  862    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.170506 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2089  Radical SAM domain protein  78.35 
 
 		 530 aa  878    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.670556 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1063  Fe-S oxidoreductase  70.61 
 
 		 537 aa  764    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.297828  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1258  radical SAM family protein  79.16 
 
 		 529 aa  880    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2035  Elongator protein 3/MiaB/NifB  74.8 
 
 		 518 aa  784    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0308  Elongator protein 3/MiaB/NifB  74.76 
 
 		 529 aa  804    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16191  Fe-S oxidoreductase  68.46 
 
 		 544 aa  755    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.468335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1590  Fe-S oxidoreductase  65.23 
 
 		 539 aa  722    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  hitchhiker  0.00141696  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0799  Elongator protein 3  100 
 
 		 526 aa  1090    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0679  radical SAM domain-containing protein  77.73 
 
 		 532 aa  859    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.538704  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16781  Fe-S oxidoreductase  63.78 
 
 		 539 aa  714    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2963  Radical SAM domain protein  77.07 
 
 		 522 aa  862    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2065  Radical SAM domain protein  77.84 
 
 		 530 aa  880    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19381  Fe-S oxidoreductase  69.63 
 
 		 537 aa  759    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17011  Fe-S oxidoreductase  64.84 
 
 		 539 aa  719    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0238  radical SAM domain-containing protein  31.19 
 
 		 461 aa  120  9e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.140637  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3608  radical SAM domain-containing protein  25.85 
 
 		 459 aa  103  7e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2195  Radical SAM domain protein  31.08 
 
 		 460 aa  102  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.565929  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1693  radical SAM family protein  26.76 
 
 		 467 aa  100  9e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2577  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  25.32 
 
 		 674 aa  88.6  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.451691  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0920  radical SAM domain-containing protein  27.14 
 
 		 451 aa  87.8  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1699  Radical SAM domain protein  26.32 
 
 		 424 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000206113  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3090  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  22.53 
 
 		 476 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000038537  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3165  Fe-S oxidoreductase  25.95 
 
 		 459 aa  85.1  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00148517 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2873  radical SAM domain-containing protein  25.34 
 
 		 520 aa  83.2  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000297506  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2523  Radical SAM domain protein  26.06 
 
 		 424 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0388324 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2566  radical SAM domain-containing protein  27.06 
 
 		 426 aa  80.5  0.00000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.162584  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0820  Radical SAM domain protein  30.39 
 
 		 583 aa  80.5  0.00000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2963  radical SAM domain-containing protein  29.61 
 
 		 476 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000286011  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4478  radical SAM family protein  30.29 
 
 		 554 aa  80.1  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.140837  normal  0.22726 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1648  Radical SAM domain protein  27.42 
 
 		 450 aa  78.6  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2416  radical SAM family protein  24.18 
 
 		 475 aa  77.8  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000137144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4225  radical SAM domain-containing protein  28.31 
 
 		 576 aa  77.4  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.332961 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0454  radical SAM domain-containing protein  28.31 
 
 		 576 aa  77.4  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.849524 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3504  cobalamin B12-binding/radical SAM family protein  25.16 
 
 		 677 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2171  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 512 aa  76.6  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1150  oxidative cyclase-related protein  23.23 
 
 		 475 aa  75.9  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3593  radical SAM domain-containing protein  26.22 
 
 		 472 aa  74.3  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000974767  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3058  radical SAM domain-containing protein  24.52 
 
 		 529 aa  74.3  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111955  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1016  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester oxidative cyclase  25.27 
 
 		 584 aa  73.9  0.000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2283  Radical SAM domain protein  27.11 
 
 		 473 aa  73.9  0.000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.257116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0689  Radical SAM domain protein  24.77 
 
 		 459 aa  73.6  0.000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3186  radical SAM family protein  27.01 
 
 		 583 aa  73.2  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  25.81 
 
 		 1250 aa  72.8  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3195  Radical SAM domain protein  25.52 
 
 		 552 aa  72.8  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00554212 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3569  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  27.48 
 
 		 478 aa  73.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.663184 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4087  radical SAM domain-containing protein  30.13 
 
 		 458 aa  73.2  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0897  Radical SAM domain protein  26.77 
 
 		 564 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000336813  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3236  Radical SAM domain protein  27.24 
 
 		 462 aa  72  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0909  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  27.54 
 
 		 681 aa  72  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2825  radical SAM domain-containing protein  24.07 
 
 		 476 aa  71.6  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000393045  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1705  cobalamin B12-binding/radical SAM family protein  25.62 
 
 		 472 aa  70.9  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.900478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0797  Radical SAM domain protein  28.1 
 
 		 489 aa  70.5  0.00000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3553  Radical SAM domain protein  24.29 
 
 		 474 aa  70.5  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4964  radical SAM family protein  25.91 
 
 		 476 aa  70.1  0.00000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.576294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1938  Radical SAM domain protein  28.66 
 
 		 500 aa  69.3  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2351  Radical SAM domain protein  22.28 
 
 		 426 aa  69.7  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1927  cobalamin B12-binding domain protein  26.32 
 
 		 288 aa  70.1  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.2434  normal  0.204325 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4199  cobalamin B12-binding:radical SAM family protein  25 
 
 		 548 aa  68.9  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.122489 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2171  Radical SAM domain protein  28.73 
 
 		 509 aa  68.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0878  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  23.15 
 
 		 473 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.858521  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0233  Radical SAM domain protein  22.07 
 
 		 723 aa  68.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.677011 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1590  Radical SAM domain protein  26 
 
 		 488 aa  69.3  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1061  cobalamin B12-binding  27.65 
 
 		 529 aa  68.2  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000412719  decreased coverage  0.00000367319 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1009  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  24.67 
 
 		 479 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0762  Fe-S oxidoreductase  26.2 
 
 		 484 aa  68.6  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.151938  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3382  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  23.44 
 
 		 473 aa  68.6  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1038  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  24.67 
 
 		 479 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000337224 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4090  radical SAM domain-containing protein  26.03 
 
 		 462 aa  68.2  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4531  Radical SAM domain protein  25.91 
 
 		 533 aa  67.8  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3364  Radical SAM domain protein  26.14 
 
 		 564 aa  67.8  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.669906 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1735  cobalamin B12-binding domain protein  24.36 
 
 		 590 aa  67.4  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0893  Radical SAM domain protein  24.6 
 
 		 681 aa  67.4  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.878222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2273  radical SAM domain-containing protein  29.09 
 
 		 498 aa  67  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2118  Radical SAM domain protein  30.49 
 
 		 502 aa  67  0.0000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0671  Radical SAM domain protein  23.89 
 
 		 468 aa  66.2  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1200  cobalamin B12-binding domain-containing protein  23.57 
 
 		 441 aa  66.2  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2185  Radical SAM domain protein  24.85 
 
 		 473 aa  65.9  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000424629  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2929  radical SAM domain-containing protein  26.24 
 
 		 497 aa  65.9  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.43282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4370  radical SAM domain-containing protein  25.41 
 
 		 501 aa  65.1  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0710  radical SAM domain-containing protein  24.11 
 
 		 516 aa  65.5  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631588 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2796  radical SAM domain-containing protein  23.86 
 
 		 481 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0536346  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2737  radical SAM domain-containing protein  23.86 
 
 		 481 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2852  radical SAM domain-containing protein  23.86 
 
 		 481 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0577  radical SAM domain-containing protein  23.86 
 
 		 473 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2859  Fe-S oxidoreductase  23.86 
 
 		 473 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2473  radical SAM domain-containing protein  24.09 
 
 		 468 aa  64.7  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0785227  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0986  radical SAM domain-containing protein  27.34 
 
 		 600 aa  64.7  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1750  radical SAM domain-containing protein  23.86 
 
 		 473 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.499976  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0042  radical SAM family protein  24.9 
 
 		 502 aa  64.7  0.000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1767  radical SAM domain-containing protein  23.86 
 
 		 503 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.580532  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1024  Radical SAM domain protein  25.86 
 
 		 467 aa  64.7  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0376  radical SAM domain-containing protein  24.24 
 
 		 433 aa  64.3  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0414491  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2319  radical SAM family Fe-S protein  26.39 
 
 		 501 aa  64.3  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.518236  normal  0.0137531 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0838  Radical SAM domain protein  24.79 
 
 		 472 aa  63.9  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0738  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  26.13 
 
 		 515 aa  63.9  0.000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.532709  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0871  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  26.2 
 
 		 554 aa  63.5  0.000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0154  Elongator protein 3/MiaB/NifB  24.5 
 
 		 479 aa  63.5  0.000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000374319  normal  0.695654 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>