More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2171 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2171  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 512 aa  1058    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1159  Radical SAM domain protein  54.07 
 
 		 502 aa  549  1e-155  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3595  Radical SAM domain protein  53.77 
 
 		 501 aa  542  1e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1280  radical SAM/B12 binding domain-containing protein  52.13 
 
 		 503 aa  540  9.999999999999999e-153  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1091  radical SAM domain-containing protein  51.21 
 
 		 503 aa  525  1e-148  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0346077  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0548  radical SAM domain-containing protein  51.93 
 
 		 504 aa  524  1e-147  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1063  radical SAM domain protein  50.51 
 
 		 503 aa  522  1e-147  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000246609  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2971  radical SAM family protein  52.75 
 
 		 504 aa  525  1e-147  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1456  radical SAM domain-containing protein  51.93 
 
 		 504 aa  522  1e-147  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.213421  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3558  radical SAM domain-containing protein  50.82 
 
 		 490 aa  521  1e-146  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4335  radical SAM domain-containing protein  51.83 
 
 		 498 aa  519  1e-146  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1938  Radical SAM domain protein  48.41 
 
 		 500 aa  500  1e-140  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2118  Radical SAM domain protein  47.87 
 
 		 502 aa  495  1e-139  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2273  radical SAM domain-containing protein  46.84 
 
 		 498 aa  492  9.999999999999999e-139  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1424  Radical SAM domain protein  47.25 
 
 		 520 aa  490  1e-137  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.186266 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2171  Radical SAM domain protein  46.44 
 
 		 509 aa  488  1e-136  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0251  radical SAM domain-containing protein  45.84 
 
 		 493 aa  475  1e-133  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0986  radical SAM domain-containing protein  46.59 
 
 		 600 aa  455  1e-127  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2895  cobalamin vitamin B12-binding / radical SAM protein  42.33 
 
 		 546 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02131  Fe-S oxidoreductase  45.94 
 
 		 524 aa  378  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3182  radical SAM domain-containing protein  44.65 
 
 		 534 aa  371  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0165397  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2340  Elongator protein 3/MiaB/NifB  45.48 
 
 		 524 aa  370  1e-101  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2939  radical SAM domain-containing protein  42.31 
 
 		 521 aa  364  2e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.379543 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1621  Elongator protein 3/MiaB/NifB  44.27 
 
 		 522 aa  364  2e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0718144 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1724  radical SAM family protein  45.69 
 
 		 533 aa  364  2e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1155  Radical SAM domain protein  41.5 
 
 		 522 aa  359  6e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2041  radical SAM domain-containing protein  44.5 
 
 		 529 aa  358  9e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4019  Radical SAM domain protein  41.09 
 
 		 529 aa  355  7.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000347162 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1061  cobalamin B12-binding  44.05 
 
 		 529 aa  354  2e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000412719  decreased coverage  0.00000367319 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1946  radical SAM domain-containing protein  39.19 
 
 		 523 aa  350  3e-95  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1795  cobalamin B12-binding  40.25 
 
 		 529 aa  350  4e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5168  radical SAM domain-containing protein  43.41 
 
 		 527 aa  346  5e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0738  Radical SAM domain protein  39.55 
 
 		 525 aa  342  7e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.170027 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4531  Radical SAM domain protein  38.55 
 
 		 533 aa  339  5.9999999999999996e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3826  radical SAM domain-containing protein  37.45 
 
 		 561 aa  335  1e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1896  Radical SAM domain protein  36.71 
 
 		 554 aa  291  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.620591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3848  hypothetical protein  39.57 
 
 		 532 aa  277  3e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0151131  normal  0.930541 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2276  Fe-S oxidoreductase  36.51 
 
 		 553 aa  277  4e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0810466  normal  0.289169 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3160  Radical SAM domain protein  35.94 
 
 		 539 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1895  Radical SAM domain protein  35.9 
 
 		 546 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.556208 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3842  radical SAM domain-containing protein  35.98 
 
 		 547 aa  274  3e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.18892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2322  radical SAM family Fe-S protein  33.27 
 
 		 523 aa  273  5.000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.3784  normal  0.0341381 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2962  hypothetical protein  36.28 
 
 		 528 aa  273  5.000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.770652  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4269  Radical SAM domain protein  36.04 
 
 		 527 aa  273  6e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.529915  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1718  radical SAM family protein  36.75 
 
 		 527 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.545031  normal  0.172284 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1443  radical SAM domain-containing protein  35.28 
 
 		 531 aa  270  2.9999999999999997e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2689  radical SAM family protein  35.58 
 
 		 527 aa  267  2.9999999999999995e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4494  Radical SAM domain protein  32.34 
 
 		 547 aa  265  2e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.265076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1712  radical SAM family protein  32.92 
 
 		 528 aa  265  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.5358  normal  0.03933 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3580  radical SAM family protein  35.68 
 
 		 527 aa  265  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.161582  normal  0.666907 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0364  radical SAM domain-containing protein  35.48 
 
 		 543 aa  262  1e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4012  radical SAM domain-containing protein  35 
 
 		 547 aa  261  2e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.809186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4381  Radical SAM domain protein  35 
 
 		 547 aa  261  3e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.401964 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1897  Radical SAM domain protein  31.94 
 
 		 542 aa  257  5e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250876  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6080  radical SAM domain-containing protein  33.04 
 
 		 527 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0853304  hitchhiker  0.00330735 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0831  radical SAM family protein  32.78 
 
 		 444 aa  212  1e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00311604  normal  0.515432 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1178  radical SAM domain-containing protein  31.35 
 
 		 439 aa  210  5e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3611  radical SAM domain-containing protein  34.44 
 
 		 429 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2205  Radical SAM domain protein  33 
 
 		 428 aa  191  2e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13580  Radical SAM domain protein  31.44 
 
 		 446 aa  185  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1690  radical SAM family protein  32.23 
 
 		 428 aa  184  3e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3130  Radical SAM domain protein  30.48 
 
 		 448 aa  176  9e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0323  Radical SAM domain protein  31.11 
 
 		 433 aa  174  3.9999999999999995e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.733207  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0241  BchE/P-methylase family protein  31.2 
 
 		 430 aa  172  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.222091  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1898  Radical SAM domain protein  33.62 
 
 		 459 aa  171  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3089  radical SAM domain-containing protein  28.28 
 
 		 444 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3135  radical SAM family Fe-S protein  29.24 
 
 		 490 aa  164  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.183959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1994  radical SAM domain-containing protein  28.68 
 
 		 462 aa  156  9e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.725365  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5391  Radical SAM domain protein  27.67 
 
 		 471 aa  155  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0021  Radical SAM domain protein  27.54 
 
 		 445 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3993  Radical SAM domain protein  27.88 
 
 		 449 aa  154  4e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2204  Radical SAM domain protein  30.34 
 
 		 426 aa  152  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2566  radical SAM family protein  27.56 
 
 		 441 aa  151  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2599  radical SAM domain-containing protein  28.5 
 
 		 486 aa  151  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1459  Radical SAM domain protein  30.36 
 
 		 477 aa  150  6e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.71373  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1700  cobalamin B12-binding/radical SAM family protein  30.16 
 
 		 434 aa  149  8e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000292659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0215  Radical SAM domain protein  27.06 
 
 		 483 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2302  Radical SAM domain protein  28.89 
 
 		 471 aa  146  8.000000000000001e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000207035  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0104  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.1 
 
 		 471 aa  145  2e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.016324  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2195  Radical SAM domain protein  28.36 
 
 		 471 aa  143  6e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2147  Radical SAM domain protein  28.36 
 
 		 471 aa  143  7e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0248  BchE/P-methylase family protein  28.19 
 
 		 428 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2324  radical SAM domain-containing protein  27.8 
 
 		 434 aa  142  9.999999999999999e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2462  radical SAM domain-containing protein  27.65 
 
 		 480 aa  140  4.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2428  radical SAM domain-containing protein  26.77 
 
 		 477 aa  140  6e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000104661  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1598  Radical SAM domain protein  25.87 
 
 		 477 aa  140  7e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0154  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.21 
 
 		 479 aa  139  1e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000374319  normal  0.695654 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1255  radical SAM domain-containing protein  27.91 
 
 		 441 aa  136  9.999999999999999e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0838  Radical SAM domain protein  26.59 
 
 		 472 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1320  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.1 
 
 		 472 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0069427  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2116  Radical SAM domain protein  27.1 
 
 		 475 aa  132  2.0000000000000002e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000436427  normal  0.738755 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0376  radical SAM domain-containing protein  28.44 
 
 		 433 aa  131  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0414491  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2351  Radical SAM domain protein  27.1 
 
 		 470 aa  131  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1034  Radical SAM domain protein  27.32 
 
 		 474 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1200  cobalamin B12-binding domain-containing protein  27.67 
 
 		 441 aa  130  7.000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1708  Radical SAM domain protein  27.02 
 
 		 473 aa  127  5e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.995289  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1895  radical SAM domain-containing protein  26.82 
 
 		 476 aa  123  7e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1089  radical SAM family Fe-S protein  27.48 
 
 		 591 aa  123  7e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.977516  normal  0.0200721 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3468  radical SAM family protein  28.91 
 
 		 592 aa  120  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.453671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3614  radical SAM domain-containing protein  27.41 
 
 		 451 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>