More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1063 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1280  radical SAM/B12 binding domain-containing protein  93.64 
 
 		 503 aa  993    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1063  radical SAM domain protein  100 
 
 		 503 aa  1046    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000246609  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1091  radical SAM domain-containing protein  94.63 
 
 		 503 aa  1001    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0346077  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0548  radical SAM domain-containing protein  55.47 
 
 		 504 aa  592  1e-168  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1159  Radical SAM domain protein  55.35 
 
 		 502 aa  585  1e-166  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2971  radical SAM family protein  55.8 
 
 		 504 aa  587  1e-166  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1456  radical SAM domain-containing protein  55.42 
 
 		 504 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.213421  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4335  radical SAM domain-containing protein  54.75 
 
 		 498 aa  579  1e-164  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3595  Radical SAM domain protein  53.13 
 
 		 501 aa  576  1.0000000000000001e-163  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0251  radical SAM domain-containing protein  52.24 
 
 		 493 aa  559  1e-158  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2273  radical SAM domain-containing protein  52.35 
 
 		 498 aa  542  1e-153  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2118  Radical SAM domain protein  52.04 
 
 		 502 aa  530  1e-149  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2171  Radical SAM domain protein  51.43 
 
 		 509 aa  525  1e-148  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1938  Radical SAM domain protein  51.22 
 
 		 500 aa  524  1e-147  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2171  radical SAM domain-containing protein  50.51 
 
 		 512 aa  522  1e-147  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3558  radical SAM domain-containing protein  50.41 
 
 		 490 aa  521  1e-146  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1424  Radical SAM domain protein  49.18 
 
 		 520 aa  516  1.0000000000000001e-145  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.186266 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0986  radical SAM domain-containing protein  46.76 
 
 		 600 aa  457  1e-127  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2895  cobalamin vitamin B12-binding / radical SAM protein  42.83 
 
 		 546 aa  395  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02131  Fe-S oxidoreductase  40.64 
 
 		 524 aa  388  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1621  Elongator protein 3/MiaB/NifB  41.21 
 
 		 522 aa  387  1e-106  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0718144 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4019  Radical SAM domain protein  41.28 
 
 		 529 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000347162 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2340  Elongator protein 3/MiaB/NifB  40.24 
 
 		 524 aa  377  1e-103  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5168  radical SAM domain-containing protein  40.2 
 
 		 527 aa  370  1e-101  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1795  cobalamin B12-binding  39.8 
 
 		 529 aa  370  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1155  Radical SAM domain protein  39.53 
 
 		 522 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1061  cobalamin B12-binding  39.44 
 
 		 529 aa  367  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000412719  decreased coverage  0.00000367319 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2939  radical SAM domain-containing protein  41.77 
 
 		 521 aa  365  1e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.379543 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1724  radical SAM family protein  39.39 
 
 		 533 aa  364  2e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3826  radical SAM domain-containing protein  41.11 
 
 		 561 aa  359  7e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0738  Radical SAM domain protein  38.15 
 
 		 525 aa  358  9.999999999999999e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.170027 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3182  radical SAM domain-containing protein  40.81 
 
 		 534 aa  355  1e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0165397  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2041  radical SAM domain-containing protein  39.52 
 
 		 529 aa  351  2e-95  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1946  radical SAM domain-containing protein  38.79 
 
 		 523 aa  349  7e-95  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4531  Radical SAM domain protein  37.83 
 
 		 533 aa  348  1e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1896  Radical SAM domain protein  35.71 
 
 		 554 aa  300  3e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.620591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4269  Radical SAM domain protein  34.73 
 
 		 527 aa  300  3e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.529915  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1897  Radical SAM domain protein  37.71 
 
 		 542 aa  299  7e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250876  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1443  radical SAM domain-containing protein  33.6 
 
 		 531 aa  299  7e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1895  Radical SAM domain protein  35 
 
 		 546 aa  299  1e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.556208 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1718  radical SAM family protein  34.66 
 
 		 527 aa  296  5e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.545031  normal  0.172284 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2962  hypothetical protein  34.58 
 
 		 528 aa  293  4e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.770652  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0364  radical SAM domain-containing protein  37.66 
 
 		 543 aa  292  1e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4494  Radical SAM domain protein  35.85 
 
 		 547 aa  291  2e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.265076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2689  radical SAM family protein  34.39 
 
 		 527 aa  291  2e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2276  Fe-S oxidoreductase  34.18 
 
 		 553 aa  289  9e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0810466  normal  0.289169 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4012  radical SAM domain-containing protein  35.22 
 
 		 547 aa  289  1e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.809186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3580  radical SAM family protein  33.97 
 
 		 527 aa  288  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.161582  normal  0.666907 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4381  Radical SAM domain protein  35.01 
 
 		 547 aa  287  4e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.401964 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3842  radical SAM domain-containing protein  35.42 
 
 		 547 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.18892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3848  hypothetical protein  35.83 
 
 		 532 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0151131  normal  0.930541 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1712  radical SAM family protein  33.05 
 
 		 528 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.5358  normal  0.03933 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3160  Radical SAM domain protein  33.89 
 
 		 539 aa  278  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2322  radical SAM family Fe-S protein  32.42 
 
 		 523 aa  271  1e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.3784  normal  0.0341381 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6080  radical SAM domain-containing protein  35.79 
 
 		 527 aa  226  9e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0853304  hitchhiker  0.00330735 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1690  radical SAM family protein  32.14 
 
 		 428 aa  182  1e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1178  radical SAM domain-containing protein  29.66 
 
 		 439 aa  182  1e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0831  radical SAM family protein  30.99 
 
 		 444 aa  179  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00311604  normal  0.515432 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2205  Radical SAM domain protein  30 
 
 		 428 aa  176  6e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3611  radical SAM domain-containing protein  32.32 
 
 		 429 aa  172  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3130  Radical SAM domain protein  28.74 
 
 		 448 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0241  BchE/P-methylase family protein  30.73 
 
 		 430 aa  162  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.222091  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0323  Radical SAM domain protein  30.59 
 
 		 433 aa  158  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.733207  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13580  Radical SAM domain protein  29.82 
 
 		 446 aa  152  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1459  Radical SAM domain protein  29.19 
 
 		 477 aa  151  3e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.71373  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1898  Radical SAM domain protein  29.41 
 
 		 459 aa  149  9e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3993  Radical SAM domain protein  27.37 
 
 		 449 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0154  Elongator protein 3/MiaB/NifB  28.45 
 
 		 479 aa  146  7.0000000000000006e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000374319  normal  0.695654 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3135  radical SAM family Fe-S protein  27.65 
 
 		 490 aa  145  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.183959  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2599  radical SAM domain-containing protein  27.69 
 
 		 486 aa  144  3e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0215  Radical SAM domain protein  27.82 
 
 		 483 aa  143  7e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0248  BchE/P-methylase family protein  27.68 
 
 		 428 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1994  radical SAM domain-containing protein  29.05 
 
 		 462 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.725365  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0104  Elongator protein 3/MiaB/NifB  27.64 
 
 		 471 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.016324  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2116  Radical SAM domain protein  27.29 
 
 		 475 aa  140  4.999999999999999e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000436427  normal  0.738755 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2204  Radical SAM domain protein  27.56 
 
 		 426 aa  140  6e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2462  radical SAM domain-containing protein  27.15 
 
 		 480 aa  140  7e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2302  Radical SAM domain protein  27.98 
 
 		 471 aa  140  7.999999999999999e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000207035  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2566  radical SAM family protein  25.9 
 
 		 441 aa  138  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1700  cobalamin B12-binding/radical SAM family protein  27.9 
 
 		 434 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000292659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2351  Radical SAM domain protein  27.75 
 
 		 470 aa  134  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2195  Radical SAM domain protein  27.89 
 
 		 471 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2147  Radical SAM domain protein  27.89 
 
 		 471 aa  134  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0838  Radical SAM domain protein  29.24 
 
 		 472 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1503  Elongator protein 3/MiaB/NifB  28.73 
 
 		 478 aa  133  9e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0448289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2324  radical SAM domain-containing protein  25.41 
 
 		 434 aa  131  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3089  radical SAM domain-containing protein  28.04 
 
 		 444 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1320  Elongator protein 3/MiaB/NifB  28.29 
 
 		 472 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0069427  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1598  Radical SAM domain protein  27.85 
 
 		 477 aa  130  5.0000000000000004e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5391  Radical SAM domain protein  26.57 
 
 		 471 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1034  Radical SAM domain protein  29.32 
 
 		 474 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0021  Radical SAM domain protein  26.38 
 
 		 445 aa  126  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1895  radical SAM domain-containing protein  28.8 
 
 		 476 aa  126  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3614  radical SAM domain-containing protein  27.59 
 
 		 451 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1708  Radical SAM domain protein  26.55 
 
 		 473 aa  121  3e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.995289  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1023  Radical SAM domain protein  25.26 
 
 		 467 aa  120  7.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1089  radical SAM family Fe-S protein  28.02 
 
 		 591 aa  116  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.977516  normal  0.0200721 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0671  Radical SAM domain protein  25.13 
 
 		 468 aa  114  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1644  radical SAM domain-containing protein  23.47 
 
 		 468 aa  113  8.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1255  radical SAM domain-containing protein  27.76 
 
 		 441 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>