More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2971 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU0548  radical SAM domain-containing protein  82.94 
 
 
504 aa  874    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3595  Radical SAM domain protein  62.4 
 
 
501 aa  666    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2971  radical SAM family protein  100 
 
 
504 aa  1031    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1456  radical SAM domain-containing protein  68.64 
 
 
504 aa  709    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.213421  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4335  radical SAM domain-containing protein  69.28 
 
 
498 aa  712    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1159  Radical SAM domain protein  63.77 
 
 
502 aa  679    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2118  Radical SAM domain protein  55.92 
 
 
502 aa  597  1e-169  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1280  radical SAM/B12 binding domain-containing protein  54.65 
 
 
503 aa  588  1e-167  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2273  radical SAM domain-containing protein  55.12 
 
 
498 aa  591  1e-167  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1063  radical SAM domain protein  55.8 
 
 
503 aa  587  1e-166  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000246609  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1091  radical SAM domain-containing protein  55.05 
 
 
503 aa  587  1e-166  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0346077  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2171  Radical SAM domain protein  54.1 
 
 
509 aa  586  1e-166  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1424  Radical SAM domain protein  54.49 
 
 
520 aa  573  1.0000000000000001e-162  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.186266 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1938  Radical SAM domain protein  53.58 
 
 
500 aa  563  1.0000000000000001e-159  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0251  radical SAM domain-containing protein  49.7 
 
 
493 aa  546  1e-154  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3558  radical SAM domain-containing protein  52.75 
 
 
490 aa  522  1e-147  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2171  radical SAM domain-containing protein  52.75 
 
 
512 aa  525  1e-147  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0986  radical SAM domain-containing protein  47.27 
 
 
600 aa  465  9.999999999999999e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2895  cobalamin vitamin B12-binding / radical SAM protein  46.93 
 
 
546 aa  415  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1621  Elongator protein 3/MiaB/NifB  42.54 
 
 
522 aa  398  1e-109  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0718144 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02131  Fe-S oxidoreductase  40.77 
 
 
524 aa  392  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4019  Radical SAM domain protein  41.87 
 
 
529 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000347162 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1724  radical SAM family protein  39.92 
 
 
533 aa  385  1e-105  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2340  Elongator protein 3/MiaB/NifB  40.77 
 
 
524 aa  382  1e-104  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5168  radical SAM domain-containing protein  40.94 
 
 
527 aa  379  1e-104  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1795  cobalamin B12-binding  40.45 
 
 
529 aa  379  1e-103  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2939  radical SAM domain-containing protein  46.52 
 
 
521 aa  378  1e-103  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.379543 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1946  radical SAM domain-containing protein  41.48 
 
 
523 aa  375  1e-102  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1155  Radical SAM domain protein  41.01 
 
 
522 aa  372  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1061  cobalamin B12-binding  38.91 
 
 
529 aa  371  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000412719  decreased coverage  0.00000367319 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2041  radical SAM domain-containing protein  40.92 
 
 
529 aa  371  1e-101  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0738  Radical SAM domain protein  40.37 
 
 
525 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.170027 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3182  radical SAM domain-containing protein  43.46 
 
 
534 aa  355  1e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0165397  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3826  radical SAM domain-containing protein  43.06 
 
 
561 aa  349  8e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4531  Radical SAM domain protein  38.88 
 
 
533 aa  342  1e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2322  radical SAM family Fe-S protein  36.89 
 
 
523 aa  312  1e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.3784  normal  0.0341381 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1896  Radical SAM domain protein  37.03 
 
 
554 aa  311  2e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.620591  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4494  Radical SAM domain protein  38.08 
 
 
547 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.265076  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3842  radical SAM domain-containing protein  37.66 
 
 
547 aa  306  8.000000000000001e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.18892  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4012  radical SAM domain-containing protein  37.03 
 
 
547 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.809186  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4381  Radical SAM domain protein  37.03 
 
 
547 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.401964 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2962  hypothetical protein  34.92 
 
 
528 aa  301  1e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.770652  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1443  radical SAM domain-containing protein  35.28 
 
 
531 aa  300  5e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0364  radical SAM domain-containing protein  36.61 
 
 
543 aa  299  9e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4269  Radical SAM domain protein  35.64 
 
 
527 aa  298  2e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.529915  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2276  Fe-S oxidoreductase  36.11 
 
 
553 aa  296  8e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0810466  normal  0.289169 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3848  hypothetical protein  40.98 
 
 
532 aa  295  9e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0151131  normal  0.930541 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1897  Radical SAM domain protein  36.95 
 
 
542 aa  294  2e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250876  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1895  Radical SAM domain protein  35.01 
 
 
546 aa  295  2e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.556208 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3160  Radical SAM domain protein  36.63 
 
 
539 aa  294  3e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1718  radical SAM family protein  34.8 
 
 
527 aa  291  2e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.545031  normal  0.172284 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1712  radical SAM family protein  34.27 
 
 
528 aa  291  3e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.5358  normal  0.03933 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3580  radical SAM family protein  34.38 
 
 
527 aa  286  4e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.161582  normal  0.666907 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2689  radical SAM family protein  35.93 
 
 
527 aa  286  5.999999999999999e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6080  radical SAM domain-containing protein  34.95 
 
 
527 aa  246  6.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0853304  hitchhiker  0.00330735 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2205  Radical SAM domain protein  34.05 
 
 
428 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3611  radical SAM domain-containing protein  34 
 
 
429 aa  204  3e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1690  radical SAM family protein  33.81 
 
 
428 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0323  Radical SAM domain protein  34.94 
 
 
433 aa  194  4e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.733207  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0241  BchE/P-methylase family protein  33.41 
 
 
430 aa  193  7e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.222091  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0831  radical SAM family protein  31.06 
 
 
444 aa  190  5e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00311604  normal  0.515432 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1178  radical SAM domain-containing protein  30.75 
 
 
439 aa  189  7e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3130  Radical SAM domain protein  26.95 
 
 
448 aa  174  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13580  Radical SAM domain protein  30.45 
 
 
446 aa  168  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3993  Radical SAM domain protein  28.32 
 
 
449 aa  167  5e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1994  radical SAM domain-containing protein  30.81 
 
 
462 aa  166  1.0000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.725365  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0248  BchE/P-methylase family protein  32.3 
 
 
428 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2324  radical SAM domain-containing protein  29.25 
 
 
434 aa  163  6e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1598  Radical SAM domain protein  31.16 
 
 
477 aa  163  7e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2566  radical SAM family protein  27.23 
 
 
441 aa  162  9e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1459  Radical SAM domain protein  32.12 
 
 
477 aa  161  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.71373  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2599  radical SAM domain-containing protein  30.84 
 
 
486 aa  161  3e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3089  radical SAM domain-containing protein  28.04 
 
 
444 aa  161  3e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2204  Radical SAM domain protein  31.22 
 
 
426 aa  159  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1898  Radical SAM domain protein  30.68 
 
 
459 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147153  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1700  cobalamin B12-binding/radical SAM family protein  31.53 
 
 
434 aa  157  4e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000292659  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3135  radical SAM family Fe-S protein  29.78 
 
 
490 aa  154  5e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.183959  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2302  Radical SAM domain protein  29.17 
 
 
471 aa  151  3e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000207035  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5391  Radical SAM domain protein  29.97 
 
 
471 aa  150  6e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2195  Radical SAM domain protein  30.16 
 
 
471 aa  150  6e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0838  Radical SAM domain protein  29.78 
 
 
472 aa  150  7e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2147  Radical SAM domain protein  30.16 
 
 
471 aa  150  7e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0376  radical SAM domain-containing protein  25.52 
 
 
433 aa  145  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0414491  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1034  Radical SAM domain protein  28.95 
 
 
474 aa  144  4e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2462  radical SAM domain-containing protein  26.79 
 
 
480 aa  143  6e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0215  Radical SAM domain protein  28.92 
 
 
483 aa  143  8e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0154  Elongator protein 3/MiaB/NifB  30.07 
 
 
479 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000374319  normal  0.695654 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1320  Elongator protein 3/MiaB/NifB  28.02 
 
 
472 aa  139  2e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0069427  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1708  Radical SAM domain protein  29.53 
 
 
473 aa  137  5e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.995289  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2116  Radical SAM domain protein  28.06 
 
 
475 aa  136  8e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000436427  normal  0.738755 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1895  radical SAM domain-containing protein  29.83 
 
 
476 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0021  Radical SAM domain protein  27.96 
 
 
445 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0104  Elongator protein 3/MiaB/NifB  27.12 
 
 
471 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.016324  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2351  Radical SAM domain protein  28.43 
 
 
470 aa  133  9e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1503  Elongator protein 3/MiaB/NifB  30.35 
 
 
478 aa  133  9e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0448289  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3614  radical SAM domain-containing protein  27.92 
 
 
451 aa  126  8.000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0671  Radical SAM domain protein  25.13 
 
 
468 aa  122  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1255  radical SAM domain-containing protein  26.55 
 
 
441 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1200  cobalamin B12-binding domain-containing protein  26.55 
 
 
441 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2428  radical SAM domain-containing protein  24.81 
 
 
477 aa  117  5e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000104661  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>