More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1159 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0548  radical SAM domain-containing protein  63.65 
 
 		 504 aa  683    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3595  Radical SAM domain protein  62.65 
 
 		 501 aa  665    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1159  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 502 aa  1039    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2971  radical SAM family protein  63.77 
 
 		 504 aa  679    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4335  radical SAM domain-containing protein  72.06 
 
 		 498 aa  775    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1456  radical SAM domain-containing protein  71.66 
 
 		 504 aa  761    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.213421  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1280  radical SAM/B12 binding domain-containing protein  55.96 
 
 		 503 aa  592  1e-168  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1091  radical SAM domain-containing protein  55.56 
 
 		 503 aa  588  1e-167  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0346077  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1063  radical SAM domain protein  55.35 
 
 		 503 aa  585  1e-166  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000246609  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2171  Radical SAM domain protein  55.21 
 
 		 509 aa  587  1e-166  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1938  Radical SAM domain protein  55.42 
 
 		 500 aa  575  1.0000000000000001e-163  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2118  Radical SAM domain protein  54.29 
 
 		 502 aa  577  1.0000000000000001e-163  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1424  Radical SAM domain protein  53.56 
 
 		 520 aa  567  1e-160  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.186266 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2273  radical SAM domain-containing protein  52.15 
 
 		 498 aa  556  1e-157  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0251  radical SAM domain-containing protein  51.32 
 
 		 493 aa  550  1e-155  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2171  radical SAM domain-containing protein  54.07 
 
 		 512 aa  549  1e-155  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3558  radical SAM domain-containing protein  48.98 
 
 		 490 aa  503  1e-141  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0986  radical SAM domain-containing protein  47.67 
 
 		 600 aa  464  1e-129  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2895  cobalamin vitamin B12-binding / radical SAM protein  42.42 
 
 		 546 aa  392  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1946  radical SAM domain-containing protein  40.08 
 
 		 523 aa  378  1e-103  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1724  radical SAM family protein  40 
 
 		 533 aa  372  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0738  Radical SAM domain protein  40.37 
 
 		 525 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.170027 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1621  Elongator protein 3/MiaB/NifB  38.59 
 
 		 522 aa  371  1e-101  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0718144 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3182  radical SAM domain-containing protein  41.92 
 
 		 534 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0165397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02131  Fe-S oxidoreductase  38.06 
 
 		 524 aa  363  3e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1795  cobalamin B12-binding  38.57 
 
 		 529 aa  361  2e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2041  radical SAM domain-containing protein  38.87 
 
 		 529 aa  358  9.999999999999999e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1061  cobalamin B12-binding  38.93 
 
 		 529 aa  356  6.999999999999999e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000412719  decreased coverage  0.00000367319 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2939  radical SAM domain-containing protein  40.2 
 
 		 521 aa  355  1e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.379543 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5168  radical SAM domain-containing protein  38.37 
 
 		 527 aa  354  2e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2340  Elongator protein 3/MiaB/NifB  37.75 
 
 		 524 aa  353  5e-96  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1155  Radical SAM domain protein  39.62 
 
 		 522 aa  350  3e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4019  Radical SAM domain protein  37.68 
 
 		 529 aa  348  1e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000347162 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4531  Radical SAM domain protein  37.77 
 
 		 533 aa  340  2.9999999999999998e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3826  radical SAM domain-containing protein  37.06 
 
 		 561 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1896  Radical SAM domain protein  34.71 
 
 		 554 aa  286  7e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.620591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4269  Radical SAM domain protein  33.89 
 
 		 527 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.529915  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2962  hypothetical protein  33.54 
 
 		 528 aa  282  9e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.770652  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1718  radical SAM family protein  33.47 
 
 		 527 aa  278  2e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.545031  normal  0.172284 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4494  Radical SAM domain protein  36.04 
 
 		 547 aa  273  6e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.265076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4381  Radical SAM domain protein  36.04 
 
 		 547 aa  271  2e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.401964 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1443  radical SAM domain-containing protein  32.77 
 
 		 531 aa  271  2e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4012  radical SAM domain-containing protein  35.8 
 
 		 547 aa  270  5e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.809186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2276  Fe-S oxidoreductase  32.77 
 
 		 553 aa  269  7e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0810466  normal  0.289169 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3160  Radical SAM domain protein  35.65 
 
 		 539 aa  268  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3580  radical SAM family protein  32.29 
 
 		 527 aa  268  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.161582  normal  0.666907 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1895  Radical SAM domain protein  31.87 
 
 		 546 aa  268  2.9999999999999995e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.556208 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2322  radical SAM family Fe-S protein  35.73 
 
 		 523 aa  266  7e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.3784  normal  0.0341381 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3842  radical SAM domain-containing protein  36.28 
 
 		 547 aa  266  7e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.18892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0364  radical SAM domain-containing protein  35.48 
 
 		 543 aa  264  3e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1712  radical SAM family protein  33.97 
 
 		 528 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.5358  normal  0.03933 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2689  radical SAM family protein  32.91 
 
 		 527 aa  263  6.999999999999999e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3848  hypothetical protein  36.38 
 
 		 532 aa  263  6.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0151131  normal  0.930541 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1897  Radical SAM domain protein  34.61 
 
 		 542 aa  262  1e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250876  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6080  radical SAM domain-containing protein  31.99 
 
 		 527 aa  228  3e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0853304  hitchhiker  0.00330735 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2205  Radical SAM domain protein  31.88 
 
 		 428 aa  197  3e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3611  radical SAM domain-containing protein  32.87 
 
 		 429 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1690  radical SAM family protein  31.95 
 
 		 428 aa  187  5e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0241  BchE/P-methylase family protein  31.95 
 
 		 430 aa  184  3e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.222091  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1178  radical SAM domain-containing protein  29.55 
 
 		 439 aa  183  6e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0831  radical SAM family protein  29.31 
 
 		 444 aa  179  8e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00311604  normal  0.515432 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3130  Radical SAM domain protein  29.75 
 
 		 448 aa  173  6.999999999999999e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13580  Radical SAM domain protein  29.97 
 
 		 446 aa  164  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0323  Radical SAM domain protein  29.8 
 
 		 433 aa  161  3e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.733207  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2302  Radical SAM domain protein  27.42 
 
 		 471 aa  154  5e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000207035  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0248  BchE/P-methylase family protein  29.38 
 
 		 428 aa  153  8e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1994  radical SAM domain-containing protein  30.42 
 
 		 462 aa  153  8e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.725365  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2204  Radical SAM domain protein  29.87 
 
 		 426 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3089  radical SAM domain-containing protein  26.73 
 
 		 444 aa  148  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5391  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 		 471 aa  147  6e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1700  cobalamin B12-binding/radical SAM family protein  28.74 
 
 		 434 aa  146  7.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000292659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1320  Elongator protein 3/MiaB/NifB  28.07 
 
 		 472 aa  145  1e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0069427  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2324  radical SAM domain-containing protein  24.7 
 
 		 434 aa  144  3e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1898  Radical SAM domain protein  28.41 
 
 		 459 aa  144  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2566  radical SAM family protein  26.77 
 
 		 441 aa  143  6e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2462  radical SAM domain-containing protein  28.33 
 
 		 480 aa  143  8e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0215  Radical SAM domain protein  27.27 
 
 		 483 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0104  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.02 
 
 		 471 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.016324  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1034  Radical SAM domain protein  26.91 
 
 		 474 aa  138  2e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3135  radical SAM family Fe-S protein  27.81 
 
 		 490 aa  139  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.183959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0376  radical SAM domain-containing protein  23.64 
 
 		 433 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0414491  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0154  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.53 
 
 		 479 aa  133  6e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000374319  normal  0.695654 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3993  Radical SAM domain protein  25.45 
 
 		 449 aa  133  6e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1459  Radical SAM domain protein  29.33 
 
 		 477 aa  133  7.999999999999999e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.71373  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1598  Radical SAM domain protein  27.25 
 
 		 477 aa  133  9e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0838  Radical SAM domain protein  27.21 
 
 		 472 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0021  Radical SAM domain protein  27.29 
 
 		 445 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2599  radical SAM domain-containing protein  28.27 
 
 		 486 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2428  radical SAM domain-containing protein  24.42 
 
 		 477 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000104661  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1895  radical SAM domain-containing protein  26.23 
 
 		 476 aa  129  9.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1503  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.76 
 
 		 478 aa  127  6e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0448289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2195  Radical SAM domain protein  26.24 
 
 		 471 aa  126  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2147  Radical SAM domain protein  26.24 
 
 		 471 aa  126  9e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2116  Radical SAM domain protein  27.07 
 
 		 475 aa  126  1e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000436427  normal  0.738755 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1708  Radical SAM domain protein  26.36 
 
 		 473 aa  125  1e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.995289  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2351  Radical SAM domain protein  27.9 
 
 		 470 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1255  radical SAM domain-containing protein  24.78 
 
 		 441 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1200  cobalamin B12-binding domain-containing protein  24.56 
 
 		 441 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0671  Radical SAM domain protein  24.75 
 
 		 468 aa  113  9e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3614  radical SAM domain-containing protein  25.82 
 
 		 451 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>