More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_3182 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_2895  cobalamin vitamin B12-binding / radical SAM protein  71.37 
 
 
546 aa  712    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3182  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
534 aa  1049    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0165397  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2939  radical SAM domain-containing protein  63.39 
 
 
521 aa  582  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.379543 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3595  Radical SAM domain protein  43.29 
 
 
501 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2171  radical SAM domain-containing protein  44.65 
 
 
512 aa  405  1.0000000000000001e-112  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4335  radical SAM domain-containing protein  44.18 
 
 
498 aa  397  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1159  Radical SAM domain protein  41.92 
 
 
502 aa  397  1e-109  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1456  radical SAM domain-containing protein  43.78 
 
 
504 aa  396  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.213421  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1091  radical SAM domain-containing protein  41.41 
 
 
503 aa  389  1e-107  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0346077  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1280  radical SAM/B12 binding domain-containing protein  41.62 
 
 
503 aa  387  1e-106  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2971  radical SAM family protein  43.46 
 
 
504 aa  388  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0986  radical SAM domain-containing protein  41.73 
 
 
600 aa  383  1e-105  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1063  radical SAM domain protein  40.81 
 
 
503 aa  382  1e-105  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000246609  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1938  Radical SAM domain protein  41.89 
 
 
500 aa  382  1e-105  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0548  radical SAM domain-containing protein  43.78 
 
 
504 aa  377  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2118  Radical SAM domain protein  39.8 
 
 
502 aa  370  1e-101  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02131  Fe-S oxidoreductase  41.52 
 
 
524 aa  372  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2171  Radical SAM domain protein  40.33 
 
 
509 aa  367  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2340  Elongator protein 3/MiaB/NifB  41.52 
 
 
524 aa  361  2e-98  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4019  Radical SAM domain protein  39.54 
 
 
529 aa  360  3e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000347162 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3558  radical SAM domain-containing protein  42.83 
 
 
490 aa  360  4e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2273  radical SAM domain-containing protein  40.24 
 
 
498 aa  359  9e-98  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1621  Elongator protein 3/MiaB/NifB  40.39 
 
 
522 aa  357  1.9999999999999998e-97  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0718144 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1724  radical SAM family protein  39.31 
 
 
533 aa  356  5e-97  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1946  radical SAM domain-containing protein  38.92 
 
 
523 aa  356  5.999999999999999e-97  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1424  Radical SAM domain protein  39.59 
 
 
520 aa  354  2e-96  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.186266 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1155  Radical SAM domain protein  39.24 
 
 
522 aa  354  2e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1061  cobalamin B12-binding  39.76 
 
 
529 aa  353  4e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000412719  decreased coverage  0.00000367319 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0251  radical SAM domain-containing protein  36.45 
 
 
493 aa  350  5e-95  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1896  Radical SAM domain protein  39.09 
 
 
554 aa  342  8e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.620591  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1795  cobalamin B12-binding  38.54 
 
 
529 aa  339  8e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0738  Radical SAM domain protein  38.97 
 
 
525 aa  335  9e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.170027 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5168  radical SAM domain-containing protein  38.55 
 
 
527 aa  335  1e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2041  radical SAM domain-containing protein  38.37 
 
 
529 aa  335  2e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2322  radical SAM family Fe-S protein  36.8 
 
 
523 aa  331  2e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.3784  normal  0.0341381 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3160  Radical SAM domain protein  37.23 
 
 
539 aa  330  4e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4531  Radical SAM domain protein  38.39 
 
 
533 aa  325  1e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3826  radical SAM domain-containing protein  38.76 
 
 
561 aa  323  5e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1718  radical SAM family protein  35.63 
 
 
527 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.545031  normal  0.172284 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1712  radical SAM family protein  35.06 
 
 
528 aa  318  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.5358  normal  0.03933 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0364  radical SAM domain-containing protein  38.25 
 
 
543 aa  317  3e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1897  Radical SAM domain protein  38.86 
 
 
542 aa  317  5e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250876  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3842  radical SAM domain-containing protein  37.09 
 
 
547 aa  317  5e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.18892  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4494  Radical SAM domain protein  36.31 
 
 
547 aa  313  4.999999999999999e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.265076  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4269  Radical SAM domain protein  34.12 
 
 
527 aa  311  2.9999999999999997e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.529915  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4381  Radical SAM domain protein  35.92 
 
 
547 aa  310  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.401964 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4012  radical SAM domain-containing protein  35.92 
 
 
547 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.809186  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3580  radical SAM family protein  34.16 
 
 
527 aa  307  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.161582  normal  0.666907 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1443  radical SAM domain-containing protein  34.58 
 
 
531 aa  300  4e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1895  Radical SAM domain protein  34.73 
 
 
546 aa  300  6e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.556208 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2276  Fe-S oxidoreductase  34.24 
 
 
553 aa  295  1e-78  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0810466  normal  0.289169 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2962  hypothetical protein  33.53 
 
 
528 aa  290  3e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.770652  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2689  radical SAM family protein  34.29 
 
 
527 aa  291  3e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3848  hypothetical protein  39.39 
 
 
532 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0151131  normal  0.930541 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6080  radical SAM domain-containing protein  37.28 
 
 
527 aa  239  1e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0853304  hitchhiker  0.00330735 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3611  radical SAM domain-containing protein  34.5 
 
 
429 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1178  radical SAM domain-containing protein  28.25 
 
 
439 aa  159  1e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2205  Radical SAM domain protein  29.59 
 
 
428 aa  158  3e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1690  radical SAM family protein  32.42 
 
 
428 aa  157  4e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0831  radical SAM family protein  30.6 
 
 
444 aa  157  6e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00311604  normal  0.515432 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3130  Radical SAM domain protein  27.07 
 
 
448 aa  152  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0323  Radical SAM domain protein  31.31 
 
 
433 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.733207  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13580  Radical SAM domain protein  28.41 
 
 
446 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0241  BchE/P-methylase family protein  32.92 
 
 
430 aa  146  7.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.222091  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5391  Radical SAM domain protein  30.33 
 
 
471 aa  143  7e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2599  radical SAM domain-containing protein  30.09 
 
 
486 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1459  Radical SAM domain protein  30.26 
 
 
477 aa  140  6e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.71373  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3089  radical SAM domain-containing protein  27.18 
 
 
444 aa  139  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3135  radical SAM family Fe-S protein  26.76 
 
 
490 aa  133  6.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.183959  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2204  Radical SAM domain protein  30.75 
 
 
426 aa  133  6.999999999999999e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3993  Radical SAM domain protein  26.2 
 
 
449 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2566  radical SAM family protein  25.45 
 
 
441 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2147  Radical SAM domain protein  28.5 
 
 
471 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2428  radical SAM domain-containing protein  26.48 
 
 
477 aa  130  5.0000000000000004e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000104661  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2195  Radical SAM domain protein  28.5 
 
 
471 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0248  BchE/P-methylase family protein  30.31 
 
 
428 aa  127  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1898  Radical SAM domain protein  29.97 
 
 
459 aa  128  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147153  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1200  cobalamin B12-binding domain-containing protein  28.05 
 
 
441 aa  126  1e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1700  cobalamin B12-binding/radical SAM family protein  30.08 
 
 
434 aa  124  6e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000292659  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1255  radical SAM domain-containing protein  28.09 
 
 
441 aa  123  7e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3614  radical SAM domain-containing protein  29.26 
 
 
451 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2302  Radical SAM domain protein  30.21 
 
 
471 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000207035  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1994  radical SAM domain-containing protein  26.14 
 
 
462 aa  120  4.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.725365  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0104  Elongator protein 3/MiaB/NifB  27.17 
 
 
471 aa  119  9.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.016324  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1320  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.81 
 
 
472 aa  119  9.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0069427  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2462  radical SAM domain-containing protein  27.78 
 
 
480 aa  118  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0021  Radical SAM domain protein  27.41 
 
 
445 aa  114  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0154  Elongator protein 3/MiaB/NifB  27.72 
 
 
479 aa  114  5e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000374319  normal  0.695654 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1034  Radical SAM domain protein  27.55 
 
 
474 aa  114  5e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0838  Radical SAM domain protein  28.34 
 
 
472 aa  114  6e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1895  radical SAM domain-containing protein  28.37 
 
 
476 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1975  Radical SAM domain protein  25.26 
 
 
468 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00675749  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1708  Radical SAM domain protein  27.52 
 
 
473 aa  110  8.000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.995289  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3468  radical SAM family protein  30.65 
 
 
592 aa  110  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.453671  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0215  Radical SAM domain protein  26.39 
 
 
483 aa  105  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0671  Radical SAM domain protein  22.53 
 
 
468 aa  104  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2116  Radical SAM domain protein  28.22 
 
 
475 aa  105  3e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000436427  normal  0.738755 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2490  radical SAM family protein  28.01 
 
 
605 aa  104  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.497518  normal  0.319547 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0689  Radical SAM domain protein  25.51 
 
 
459 aa  103  6e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1503  Elongator protein 3/MiaB/NifB  27.47 
 
 
478 aa  103  9e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0448289  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>