More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0738 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_1946  radical SAM domain-containing protein  70.45 
 
 
523 aa  772    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0738  Radical SAM domain protein  100 
 
 
525 aa  1083    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.170027 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1061  cobalamin B12-binding  56.45 
 
 
529 aa  600  1e-170  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000412719  decreased coverage  0.00000367319 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4531  Radical SAM domain protein  57.5 
 
 
533 aa  596  1e-169  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4019  Radical SAM domain protein  54.37 
 
 
529 aa  579  1e-164  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000347162 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1795  cobalamin B12-binding  54.26 
 
 
529 aa  576  1.0000000000000001e-163  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1724  radical SAM family protein  53.31 
 
 
533 aa  573  1.0000000000000001e-162  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2041  radical SAM domain-containing protein  53.83 
 
 
529 aa  571  1e-161  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5168  radical SAM domain-containing protein  52.27 
 
 
527 aa  565  1e-160  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1621  Elongator protein 3/MiaB/NifB  53.64 
 
 
522 aa  563  1.0000000000000001e-159  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0718144 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1155  Radical SAM domain protein  53.79 
 
 
522 aa  556  1e-157  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02131  Fe-S oxidoreductase  50.1 
 
 
524 aa  524  1e-147  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2340  Elongator protein 3/MiaB/NifB  49.13 
 
 
524 aa  517  1.0000000000000001e-145  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0548  radical SAM domain-containing protein  41.3 
 
 
504 aa  367  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1159  Radical SAM domain protein  40.37 
 
 
502 aa  369  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4335  radical SAM domain-containing protein  40.62 
 
 
498 aa  367  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2971  radical SAM family protein  40.37 
 
 
504 aa  367  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1456  radical SAM domain-containing protein  42.4 
 
 
504 aa  369  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.213421  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1091  radical SAM domain-containing protein  38.99 
 
 
503 aa  363  5.0000000000000005e-99  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0346077  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3595  Radical SAM domain protein  39.67 
 
 
501 aa  360  4e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1063  radical SAM domain protein  38.15 
 
 
503 aa  358  9.999999999999999e-98  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000246609  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3558  radical SAM domain-containing protein  41.75 
 
 
490 aa  357  1.9999999999999998e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1280  radical SAM/B12 binding domain-containing protein  37.75 
 
 
503 aa  355  7.999999999999999e-97  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3826  radical SAM domain-containing protein  39.55 
 
 
561 aa  351  2e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0986  radical SAM domain-containing protein  39.8 
 
 
600 aa  348  2e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2171  Radical SAM domain protein  36.89 
 
 
509 aa  344  2e-93  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2171  radical SAM domain-containing protein  39.55 
 
 
512 aa  342  8e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2118  Radical SAM domain protein  38.61 
 
 
502 aa  340  5e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2273  radical SAM domain-containing protein  36.25 
 
 
498 aa  333  4e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1938  Radical SAM domain protein  36.65 
 
 
500 aa  329  6e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0251  radical SAM domain-containing protein  36.2 
 
 
493 aa  324  2e-87  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2895  cobalamin vitamin B12-binding / radical SAM protein  38.84 
 
 
546 aa  317  3e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1424  Radical SAM domain protein  35.71 
 
 
520 aa  314  2.9999999999999996e-84  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.186266 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3182  radical SAM domain-containing protein  38.97 
 
 
534 aa  307  3e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0165397  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2939  radical SAM domain-containing protein  38.36 
 
 
521 aa  301  1e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.379543 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4381  Radical SAM domain protein  35.85 
 
 
547 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.401964 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4012  radical SAM domain-containing protein  35.85 
 
 
547 aa  283  5.000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.809186  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4494  Radical SAM domain protein  35.85 
 
 
547 aa  281  2e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.265076  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1896  Radical SAM domain protein  35.24 
 
 
554 aa  280  4e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.620591  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1897  Radical SAM domain protein  36.1 
 
 
542 aa  276  7e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250876  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2276  Fe-S oxidoreductase  33.21 
 
 
553 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0810466  normal  0.289169 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1718  radical SAM family protein  35.24 
 
 
527 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.545031  normal  0.172284 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3842  radical SAM domain-containing protein  34.59 
 
 
547 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.18892  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4269  Radical SAM domain protein  32.7 
 
 
527 aa  269  8e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.529915  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0364  radical SAM domain-containing protein  34.7 
 
 
543 aa  268  1e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1895  Radical SAM domain protein  32.04 
 
 
546 aa  268  2e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.556208 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1712  radical SAM family protein  33.06 
 
 
528 aa  268  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.5358  normal  0.03933 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3160  Radical SAM domain protein  33.27 
 
 
539 aa  266  7e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2322  radical SAM family Fe-S protein  32.57 
 
 
523 aa  263  4e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.3784  normal  0.0341381 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2962  hypothetical protein  37.8 
 
 
528 aa  263  6e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.770652  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2689  radical SAM family protein  31.88 
 
 
527 aa  262  1e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3580  radical SAM family protein  32.63 
 
 
527 aa  260  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.161582  normal  0.666907 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1443  radical SAM domain-containing protein  31.57 
 
 
531 aa  251  2e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3848  hypothetical protein  36.24 
 
 
532 aa  232  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0151131  normal  0.930541 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6080  radical SAM domain-containing protein  35.76 
 
 
527 aa  196  9e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0853304  hitchhiker  0.00330735 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0241  BchE/P-methylase family protein  30.9 
 
 
430 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.222091  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3611  radical SAM domain-containing protein  31.11 
 
 
429 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0323  Radical SAM domain protein  30.42 
 
 
433 aa  171  3e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.733207  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1178  radical SAM domain-containing protein  27.66 
 
 
439 aa  162  9e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0831  radical SAM family protein  28.06 
 
 
444 aa  159  8e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00311604  normal  0.515432 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2205  Radical SAM domain protein  27.51 
 
 
428 aa  155  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1690  radical SAM family protein  28.81 
 
 
428 aa  154  4e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1898  Radical SAM domain protein  30.84 
 
 
459 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147153  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13580  Radical SAM domain protein  29.86 
 
 
446 aa  152  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2204  Radical SAM domain protein  31.03 
 
 
426 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1700  cobalamin B12-binding/radical SAM family protein  31.41 
 
 
434 aa  140  7e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000292659  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0248  BchE/P-methylase family protein  30.57 
 
 
428 aa  138  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1034  Radical SAM domain protein  26.52 
 
 
474 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3130  Radical SAM domain protein  26.74 
 
 
448 aa  131  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3089  radical SAM domain-containing protein  27.9 
 
 
444 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3993  Radical SAM domain protein  25.6 
 
 
449 aa  130  8.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2566  radical SAM family protein  25.93 
 
 
441 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2324  radical SAM domain-containing protein  25.51 
 
 
434 aa  127  6e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2147  Radical SAM domain protein  27.42 
 
 
471 aa  126  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2195  Radical SAM domain protein  27.42 
 
 
471 aa  126  9e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1708  Radical SAM domain protein  26.9 
 
 
473 aa  124  3e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.995289  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0154  Elongator protein 3/MiaB/NifB  28.61 
 
 
479 aa  125  3e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000374319  normal  0.695654 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0838  Radical SAM domain protein  27.41 
 
 
472 aa  124  4e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3614  radical SAM domain-containing protein  27.23 
 
 
451 aa  124  6e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1503  Elongator protein 3/MiaB/NifB  28.65 
 
 
478 aa  123  7e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0448289  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1598  Radical SAM domain protein  27.39 
 
 
477 aa  123  9.999999999999999e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0376  radical SAM domain-containing protein  26.43 
 
 
433 aa  121  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0414491  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2599  radical SAM domain-containing protein  27.6 
 
 
486 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2428  radical SAM domain-containing protein  24.78 
 
 
477 aa  120  4.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000104661  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1895  radical SAM domain-containing protein  27.47 
 
 
476 aa  119  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2351  Radical SAM domain protein  26.08 
 
 
470 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1459  Radical SAM domain protein  27.51 
 
 
477 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.71373  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2462  radical SAM domain-containing protein  26.12 
 
 
480 aa  117  6.9999999999999995e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1994  radical SAM domain-containing protein  25.81 
 
 
462 aa  116  7.999999999999999e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.725365  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3135  radical SAM family Fe-S protein  25.36 
 
 
490 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.183959  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2302  Radical SAM domain protein  25.06 
 
 
471 aa  114  3e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000207035  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1320  Elongator protein 3/MiaB/NifB  25.75 
 
 
472 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0069427  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05330  Fe-S oxidoreductase  26.76 
 
 
495 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2116  Radical SAM domain protein  25.21 
 
 
475 aa  108  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000436427  normal  0.738755 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4478  radical SAM family protein  27.81 
 
 
554 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.140837  normal  0.22726 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1089  radical SAM family Fe-S protein  25.59 
 
 
591 aa  108  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.977516  normal  0.0200721 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0114  Elongator protein 3/MiaB/NifB  25.93 
 
 
609 aa  107  6e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5391  Radical SAM domain protein  26.78 
 
 
471 aa  106  9e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3468  radical SAM family protein  32.23 
 
 
592 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.453671  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0215  Radical SAM domain protein  25 
 
 
483 aa  102  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>