More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2171 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2171  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 509 aa  1065    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1938  Radical SAM domain protein  74.65 
 
 		 500 aa  805    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2118  Radical SAM domain protein  71.43 
 
 		 502 aa  763    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2273  radical SAM domain-containing protein  71.6 
 
 		 498 aa  775    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1424  Radical SAM domain protein  67.68 
 
 		 520 aa  738    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.186266 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1456  radical SAM domain-containing protein  54.71 
 
 		 504 aa  589  1e-167  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.213421  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2971  radical SAM family protein  54.1 
 
 		 504 aa  586  1e-166  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4335  radical SAM domain-containing protein  55.83 
 
 		 498 aa  588  1e-166  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1159  Radical SAM domain protein  55.21 
 
 		 502 aa  587  1e-166  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0548  radical SAM domain-containing protein  53.47 
 
 		 504 aa  584  1.0000000000000001e-165  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3595  Radical SAM domain protein  51.1 
 
 		 501 aa  564  1.0000000000000001e-159  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0251  radical SAM domain-containing protein  51.22 
 
 		 493 aa  551  1e-155  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1280  radical SAM/B12 binding domain-containing protein  52.65 
 
 		 503 aa  538  1e-151  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1091  radical SAM domain-containing protein  52.04 
 
 		 503 aa  528  1e-149  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0346077  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1063  radical SAM domain protein  51.43 
 
 		 503 aa  525  1e-148  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000246609  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3558  radical SAM domain-containing protein  49.18 
 
 		 490 aa  508  9.999999999999999e-143  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2171  radical SAM domain-containing protein  46.44 
 
 		 512 aa  488  1e-136  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0986  radical SAM domain-containing protein  47.28 
 
 		 600 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1621  Elongator protein 3/MiaB/NifB  40.61 
 
 		 522 aa  378  1e-103  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0718144 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02131  Fe-S oxidoreductase  38.6 
 
 		 524 aa  375  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1724  radical SAM family protein  40.45 
 
 		 533 aa  375  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1795  cobalamin B12-binding  39.92 
 
 		 529 aa  368  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2340  Elongator protein 3/MiaB/NifB  38.6 
 
 		 524 aa  367  1e-100  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2895  cobalamin vitamin B12-binding / radical SAM protein  38.82 
 
 		 546 aa  366  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1155  Radical SAM domain protein  39.48 
 
 		 522 aa  363  3e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4019  Radical SAM domain protein  39.71 
 
 		 529 aa  361  2e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000347162 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1946  radical SAM domain-containing protein  37.76 
 
 		 523 aa  361  2e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2939  radical SAM domain-containing protein  40.57 
 
 		 521 aa  359  8e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.379543 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5168  radical SAM domain-containing protein  39.1 
 
 		 527 aa  354  2.9999999999999997e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1061  cobalamin B12-binding  37.83 
 
 		 529 aa  350  2e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000412719  decreased coverage  0.00000367319 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2041  radical SAM domain-containing protein  37.98 
 
 		 529 aa  351  2e-95  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0738  Radical SAM domain protein  36.89 
 
 		 525 aa  344  2e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.170027 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4531  Radical SAM domain protein  37 
 
 		 533 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3182  radical SAM domain-containing protein  40.33 
 
 		 534 aa  336  5.999999999999999e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0165397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3826  radical SAM domain-containing protein  35.81 
 
 		 561 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1443  radical SAM domain-containing protein  33.6 
 
 		 531 aa  301  2e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2276  Fe-S oxidoreductase  34.61 
 
 		 553 aa  298  2e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0810466  normal  0.289169 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4269  Radical SAM domain protein  33.46 
 
 		 527 aa  297  3e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.529915  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2962  hypothetical protein  34.81 
 
 		 528 aa  292  9e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.770652  normal  0.353316 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3160  Radical SAM domain protein  34.19 
 
 		 539 aa  292  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1718  radical SAM family protein  34.21 
 
 		 527 aa  291  2e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.545031  normal  0.172284 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3580  radical SAM family protein  33.8 
 
 		 527 aa  288  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.161582  normal  0.666907 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2689  radical SAM family protein  34.13 
 
 		 527 aa  286  5e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1712  radical SAM family protein  33.2 
 
 		 528 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.5358  normal  0.03933 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1895  Radical SAM domain protein  30.8 
 
 		 546 aa  283  6.000000000000001e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.556208 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4494  Radical SAM domain protein  32.06 
 
 		 547 aa  280  4e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.265076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4012  radical SAM domain-containing protein  31.99 
 
 		 547 aa  278  1e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.809186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4381  Radical SAM domain protein  31.99 
 
 		 547 aa  278  1e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.401964 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1896  Radical SAM domain protein  35.71 
 
 		 554 aa  278  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.620591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1897  Radical SAM domain protein  32.66 
 
 		 542 aa  276  5e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250876  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2322  radical SAM family Fe-S protein  32.91 
 
 		 523 aa  271  1e-71  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.3784  normal  0.0341381 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0364  radical SAM domain-containing protein  32.46 
 
 		 543 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3842  radical SAM domain-containing protein  31.65 
 
 		 547 aa  268  2e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.18892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3848  hypothetical protein  36.1 
 
 		 532 aa  258  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0151131  normal  0.930541 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6080  radical SAM domain-containing protein  32.16 
 
 		 527 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0853304  hitchhiker  0.00330735 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0831  radical SAM family protein  30.42 
 
 		 444 aa  202  9.999999999999999e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00311604  normal  0.515432 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1690  radical SAM family protein  31.5 
 
 		 428 aa  195  1e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1178  radical SAM domain-containing protein  31.18 
 
 		 439 aa  192  9e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2205  Radical SAM domain protein  29.69 
 
 		 428 aa  192  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0323  Radical SAM domain protein  31.58 
 
 		 433 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.733207  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3611  radical SAM domain-containing protein  32.01 
 
 		 429 aa  188  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0241  BchE/P-methylase family protein  30.17 
 
 		 430 aa  181  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.222091  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13580  Radical SAM domain protein  31.94 
 
 		 446 aa  182  2e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1034  Radical SAM domain protein  31.79 
 
 		 474 aa  179  1e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1895  radical SAM domain-containing protein  31.52 
 
 		 476 aa  172  9e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1320  Elongator protein 3/MiaB/NifB  30.6 
 
 		 472 aa  172  1e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0069427  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1708  Radical SAM domain protein  30.99 
 
 		 473 aa  170  5e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.995289  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0838  Radical SAM domain protein  31.38 
 
 		 472 aa  169  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2462  radical SAM domain-containing protein  30.15 
 
 		 480 aa  169  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2566  radical SAM family protein  28.24 
 
 		 441 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1598  Radical SAM domain protein  32.03 
 
 		 477 aa  167  4e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0215  Radical SAM domain protein  29.21 
 
 		 483 aa  167  4e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2302  Radical SAM domain protein  28.68 
 
 		 471 aa  167  5e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000207035  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2116  Radical SAM domain protein  30.17 
 
 		 475 aa  164  5.0000000000000005e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000436427  normal  0.738755 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0104  Elongator protein 3/MiaB/NifB  27.88 
 
 		 471 aa  161  2e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.016324  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3130  Radical SAM domain protein  25.94 
 
 		 448 aa  161  3e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3993  Radical SAM domain protein  26.36 
 
 		 449 aa  160  4e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1503  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.83 
 
 		 478 aa  159  1e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0448289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2324  radical SAM domain-containing protein  26.35 
 
 		 434 aa  159  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0154  Elongator protein 3/MiaB/NifB  31.14 
 
 		 479 aa  158  2e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000374319  normal  0.695654 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2195  Radical SAM domain protein  27.38 
 
 		 471 aa  158  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2147  Radical SAM domain protein  27.38 
 
 		 471 aa  158  3e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0248  BchE/P-methylase family protein  29.05 
 
 		 428 aa  155  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2351  Radical SAM domain protein  30.19 
 
 		 470 aa  155  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1994  radical SAM domain-containing protein  28.32 
 
 		 462 aa  152  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.725365  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5391  Radical SAM domain protein  27.3 
 
 		 471 aa  151  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0376  radical SAM domain-containing protein  26.46 
 
 		 433 aa  150  4e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0414491  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3089  radical SAM domain-containing protein  26.13 
 
 		 444 aa  150  5e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1459  Radical SAM domain protein  30.68 
 
 		 477 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.71373  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3135  radical SAM family Fe-S protein  26.37 
 
 		 490 aa  146  8.000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.183959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2204  Radical SAM domain protein  29.71 
 
 		 426 aa  146  8.000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1700  cobalamin B12-binding/radical SAM family protein  27.34 
 
 		 434 aa  143  6e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000292659  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2599  radical SAM domain-containing protein  27.72 
 
 		 486 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2428  radical SAM domain-containing protein  26.84 
 
 		 477 aa  139  1e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000104661  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0021  Radical SAM domain protein  27.82 
 
 		 445 aa  137  4e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1898  Radical SAM domain protein  28.01 
 
 		 459 aa  137  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3614  radical SAM domain-containing protein  27.39 
 
 		 451 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0689  Radical SAM domain protein  26.86 
 
 		 459 aa  124  4e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1023  Radical SAM domain protein  24.71 
 
 		 467 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1255  radical SAM domain-containing protein  25.26 
 
 		 441 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>