112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1953 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1667  Radical SAM domain protein  83.67 
 
 		 503 aa  897    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.26969  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1953  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 503 aa  1041    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1228  radical SAM domain-containing protein  54.88 
 
 		 515 aa  591  1e-167  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.641175  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1317  radical SAM domain-containing protein  53.23 
 
 		 546 aa  543  1e-153  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.484061 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1133  Radical SAM domain protein  54.16 
 
 		 531 aa  534  1e-150  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0197015  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1955  radical SAM domain-containing protein  49.7 
 
 		 531 aa  518  1e-146  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.684281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2083  radical SAM domain-containing protein  49.31 
 
 		 530 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0711  radical SAM domain-containing protein  49.8 
 
 		 531 aa  510  1e-143  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.826726  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2313  radical SAM domain-containing protein  49.22 
 
 		 532 aa  511  1e-143  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.356702  hitchhiker  0.00154549 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0018  radical SAM domain-containing protein  33.86 
 
 		 497 aa  263  6.999999999999999e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1429  Radical SAM domain protein  33.11 
 
 		 497 aa  234  3e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.322628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1853  radical SAM domain-containing protein  28.44 
 
 		 548 aa  199  7e-50  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0065  Radical SAM domain protein  28.74 
 
 		 524 aa  199  7.999999999999999e-50  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.109928  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0336  radical SAM domain-containing protein  30.44 
 
 		 526 aa  198  2.0000000000000003e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1388  radical SAM domain-containing protein  30.51 
 
 		 574 aa  197  3e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1457  Radical SAM domain protein  28.97 
 
 		 528 aa  187  4e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0781401  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1284  radical SAM domain-containing protein  31 
 
 		 530 aa  186  7e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0681  Radical SAM domain protein  30.33 
 
 		 502 aa  153  8.999999999999999e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.0000702668  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2171  radical SAM domain-containing protein  24.3 
 
 		 512 aa  62.8  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0689  Radical SAM domain protein  25.67 
 
 		 459 aa  62.8  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1233  Radical SAM domain protein  31.77 
 
 		 597 aa  62.8  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  26.47 
 
 		 1250 aa  59.7  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0931  radical SAM domain-containing protein  24.83 
 
 		 369 aa  58.9  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.297129  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1034  radical SAM domain-containing protein  23.55 
 
 		 393 aa  58.9  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.851598  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0391  radical SAM domain-containing protein  25.96 
 
 		 435 aa  58.2  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0720  Fe-S oxidoreductase  24.91 
 
 		 377 aa  57  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1469  radical SAM family Fe-S protein  23.45 
 
 		 368 aa  57  0.0000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1016  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester oxidative cyclase  27.94 
 
 		 584 aa  56.2  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1049  radical SAM domain-containing protein  23.13 
 
 		 398 aa  53.9  0.000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0831  radical SAM family protein  22.95 
 
 		 444 aa  52.8  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00311604  normal  0.515432 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0201  radical SAM domain-containing protein  21.63 
 
 		 484 aa  53.1  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1374  radical SAM domain-containing protein  25.87 
 
 		 610 aa  52  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0501  MiaB-like tRNA modifying enzyme  22.55 
 
 		 430 aa  51.6  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0558  radical SAM domain-containing protein  22.56 
 
 		 430 aa  51.2  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.236601  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1890  radical SAM domain-containing protein  22.34 
 
 		 398 aa  51.2  0.00004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0097  radical SAM domain-containing protein  26.73 
 
 		 817 aa  50.8  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0300  radical SAM domain-containing protein  27.06 
 
 		 842 aa  50.1  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000298698  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0311  radical SAM domain-containing protein  24.88 
 
 		 393 aa  49.7  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2689  radical SAM family protein  24.1 
 
 		 527 aa  48.9  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0742  radical SAM domain-containing protein  22.62 
 
 		 397 aa  48.1  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1898  Radical SAM domain protein  31.75 
 
 		 459 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2276  Fe-S oxidoreductase  22.39 
 
 		 553 aa  47.8  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0810466  normal  0.289169 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1323  radical SAM domain-containing protein  26.67 
 
 		 441 aa  48.1  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2167  radical SAM family protein  25.23 
 
 		 444 aa  47.8  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.208329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1100  radical SAM domain-containing protein  21.18 
 
 		 470 aa  47.8  0.0005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1424  Radical SAM domain protein  22.62 
 
 		 520 aa  47.8  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.186266 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1159  Radical SAM domain protein  30.77 
 
 		 502 aa  47.8  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1155  Radical SAM domain protein  23.08 
 
 		 522 aa  47.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1807  RNA modification enzyme, MiaB family  23.67 
 
 		 451 aa  47.4  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000210311  decreased coverage  0.000315868 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4437  Radical SAM domain protein  22.17 
 
 		 537 aa  47.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.07608 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0661  radical SAM domain-containing protein  26.63 
 
 		 438 aa  47.4  0.0007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.692136  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0595  radical SAM domain-containing protein  22.97 
 
 		 437 aa  47.4  0.0007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.063528  normal  0.361831 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0251  radical SAM domain-containing protein  22.7 
 
 		 493 aa  47.4  0.0007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4375  Radical SAM domain protein  22.17 
 
 		 537 aa  47.4  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1616  hypothetical protein  24.81 
 
 		 638 aa  47  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0158  radical SAM domain-containing protein  27.69 
 
 		 599 aa  47  0.0008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.172348  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0156  radical SAM domain-containing protein  27.69 
 
 		 599 aa  47  0.0008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0766  radical SAM domain-containing protein  22.3 
 
 		 397 aa  47  0.0008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0228  radical SAM domain-containing protein  25.71 
 
 		 441 aa  47  0.0009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1503  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.27 
 
 		 478 aa  46.2  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0448289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1320  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.81 
 
 		 472 aa  46.6  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0069427  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1652  Elongator protein 3/MiaB/NifB  21.35 
 
 		 546 aa  46.6  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.606653  normal  0.975032 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3468  radical SAM family protein  28.67 
 
 		 592 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.453671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0535  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  21.37 
 
 		 473 aa  46.6  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.538791 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1176  Radical SAM domain protein  26.53 
 
 		 655 aa  46.2  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1044  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 369 aa  46.6  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.877972 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0902  radical SAM domain-containing protein  24.3 
 
 		 369 aa  46.2  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.981157  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1200  cobalamin B12-binding domain-containing protein  24.05 
 
 		 441 aa  47  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0893  Radical SAM domain protein  22.78 
 
 		 681 aa  46.6  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.878222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3387  Radical SAM domain protein  23.59 
 
 		 557 aa  46.2  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.384607  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1629  radical SAM domain-containing protein  25.52 
 
 		 611 aa  45.8  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1511  Radical SAM domain protein  25.52 
 
 		 627 aa  45.4  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3512  radical SAM family protein  27.14 
 
 		 540 aa  45.8  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.170838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1456  radical SAM domain-containing protein  27.95 
 
 		 504 aa  45.8  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.213421  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2479  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  23.03 
 
 		 484 aa  45.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.515921  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0078  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  25 
 
 		 435 aa  45.4  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.68199  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3784  Protein of unknown function DUF2344  24.3 
 
 		 971 aa  45.8  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.539179  normal  0.106507 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0273  radical SAM domain-containing protein  21.18 
 
 		 589 aa  45.4  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0302705  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2487  Fe-S oxidoreductase  19.93 
 
 		 609 aa  44.7  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1633  radical SAM domain-containing protein  24.49 
 
 		 369 aa  45.1  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.806615  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3961  radical SAM domain-containing protein  25.77 
 
 		 566 aa  45.1  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000506678  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0525  Radical SAM domain protein  24.39 
 
 		 657 aa  45.1  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.268937  normal  0.0105227 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1513  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  36.84 
 
 		 433 aa  45.1  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.627818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1045  Radical SAM domain protein  23.14 
 
 		 416 aa  45.1  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0560  Radical SAM domain protein  25.64 
 
 		 557 aa  45.4  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.12594e-30 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0185  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  24.75 
 
 		 440 aa  44.7  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3089  radical SAM domain-containing protein  23.34 
 
 		 444 aa  44.7  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1255  radical SAM domain-containing protein  19.53 
 
 		 441 aa  44.7  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0071  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.13 
 
 		 430 aa  44.7  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1202  radical SAM domain-containing protein  25.24 
 
 		 412 aa  44.7  0.004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0859  Radical SAM domain protein  23.88 
 
 		 557 aa  44.7  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0042  radical SAM family protein  23.86 
 
 		 502 aa  44.3  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3640  radical SAM family protein  22.73 
 
 		 589 aa  44.3  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1369  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  24.4 
 
 		 459 aa  44.3  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.121645  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1435  RNA modification protein  23.65 
 
 		 437 aa  44.3  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40166 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0986  radical SAM domain-containing protein  23.83 
 
 		 600 aa  44.3  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4039  Radical SAM domain protein  22.37 
 
 		 538 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.461651 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1323  Radical SAM domain protein  24.66 
 
 		 360 aa  44.3  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0418  radical SAM family protein  24.87 
 
 		 557 aa  44.3  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0523  radical SAM domain-containing protein  24.87 
 
 		 371 aa  43.9  0.006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>