125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_2313 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_0711  radical SAM domain-containing protein  83.8 
 
 		 531 aa  948    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.826726  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2083  radical SAM domain-containing protein  84.12 
 
 		 530 aa  933    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2313  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 532 aa  1090    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.356702  hitchhiker  0.00154549 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1317  radical SAM domain-containing protein  64.6 
 
 		 546 aa  719    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.484061 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1955  radical SAM domain-containing protein  85.12 
 
 		 531 aa  966    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.684281  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1667  Radical SAM domain protein  49.8 
 
 		 503 aa  530  1e-149  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.26969  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1228  radical SAM domain-containing protein  48.75 
 
 		 515 aa  509  1e-143  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.641175  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1953  radical SAM domain-containing protein  49.22 
 
 		 503 aa  511  1e-143  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1133  Radical SAM domain protein  49.9 
 
 		 531 aa  493  9.999999999999999e-139  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0197015  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0018  radical SAM domain-containing protein  35.01 
 
 		 497 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1457  Radical SAM domain protein  31.59 
 
 		 528 aa  223  6e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0781401  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1284  radical SAM domain-containing protein  30.22 
 
 		 530 aa  214  1.9999999999999998e-54  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1429  Radical SAM domain protein  31.14 
 
 		 497 aa  212  1e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.322628  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0681  Radical SAM domain protein  32.38 
 
 		 502 aa  209  1e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.0000702668  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1853  radical SAM domain-containing protein  33.19 
 
 		 548 aa  206  6e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0336  radical SAM domain-containing protein  32.37 
 
 		 526 aa  204  2e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1388  radical SAM domain-containing protein  30.14 
 
 		 574 aa  199  7.999999999999999e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0065  Radical SAM domain protein  29.54 
 
 		 524 aa  186  1.0000000000000001e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.109928  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1049  radical SAM domain-containing protein  26.76 
 
 		 398 aa  70.5  0.00000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1034  radical SAM domain-containing protein  25.68 
 
 		 393 aa  69.7  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.851598  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0931  radical SAM domain-containing protein  24.92 
 
 		 369 aa  67.4  0.0000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.297129  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0750  Radical SAM domain protein  25.09 
 
 		 405 aa  66.2  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0391  radical SAM domain-containing protein  27.27 
 
 		 435 aa  65.1  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1200  cobalamin B12-binding domain-containing protein  26.94 
 
 		 441 aa  63.5  0.000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1757  Radical SAM domain protein  24.35 
 
 		 535 aa  62.8  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0257963  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0501  MiaB-like tRNA modifying enzyme  25.24 
 
 		 430 aa  62.4  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0311  radical SAM domain-containing protein  26.85 
 
 		 393 aa  61.6  0.00000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1890  radical SAM domain-containing protein  26.69 
 
 		 398 aa  61.6  0.00000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2487  Fe-S oxidoreductase  23.67 
 
 		 609 aa  59.7  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1443  radical SAM domain-containing protein  26.05 
 
 		 410 aa  59.7  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.664587  normal  0.058788 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1169  radical SAM family protein  23.84 
 
 		 372 aa  58.9  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.198127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1255  radical SAM domain-containing protein  26.2 
 
 		 441 aa  59.3  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1202  radical SAM domain-containing protein  27.27 
 
 		 412 aa  58.9  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2992  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 622 aa  58.2  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0050661  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0897  Radical SAM domain protein  22.98 
 
 		 564 aa  55.8  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000336813  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1100  radical SAM domain-containing protein  22.02 
 
 		 470 aa  56.2  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1369  radical SAM domain-containing protein  22.98 
 
 		 556 aa  55.5  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000805279  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0078  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  25.37 
 
 		 435 aa  55.1  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.68199  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0201  radical SAM domain-containing protein  22.49 
 
 		 484 aa  54.7  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3387  Radical SAM domain protein  30.22 
 
 		 557 aa  54.7  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.384607  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2638  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  24.37 
 
 		 512 aa  54.3  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1044  radical SAM domain-containing protein  25.28 
 
 		 369 aa  53.5  0.000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.877972 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0523  radical SAM domain-containing protein  24.61 
 
 		 371 aa  53.5  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  23.39 
 
 		 1250 aa  53.1  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0871  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  23.02 
 
 		 554 aa  52.8  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0859  Radical SAM domain protein  22.46 
 
 		 557 aa  52.8  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0689  Radical SAM domain protein  21.85 
 
 		 459 aa  52.4  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0766  radical SAM domain-containing protein  25.61 
 
 		 397 aa  51.6  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1374  radical SAM domain-containing protein  26.42 
 
 		 610 aa  51.2  0.00004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3057  Radical SAM domain protein  22.89 
 
 		 518 aa  51.2  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00748759  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0720  Fe-S oxidoreductase  23.47 
 
 		 377 aa  51.2  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2490  radical SAM family protein  34.62 
 
 		 605 aa  50.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.497518  normal  0.319547 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0742  radical SAM domain-containing protein  25.81 
 
 		 397 aa  51.2  0.00005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0741  radical SAM domain-containing protein  26.17 
 
 		 623 aa  50.4  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1168  radical SAM family protein  23.93 
 
 		 566 aa  50.4  0.00008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1633  radical SAM domain-containing protein  25.37 
 
 		 369 aa  50.4  0.00008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.806615  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0273  radical SAM domain-containing protein  23.36 
 
 		 589 aa  50.1  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0302705  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0614  radical SAM domain-containing protein  22.62 
 
 		 570 aa  50.4  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.69222  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3863  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  23.68 
 
 		 580 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0582854  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0373  MiaB-like tRNA modifying enzyme  24.14 
 
 		 411 aa  50.1  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0801  hypothetical protein  22.63 
 
 		 366 aa  49.7  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000530348 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0896  hypothetical protein  27.19 
 
 		 364 aa  49.7  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6404  Mg-protoporphyrin IX monomethyl ester oxidative cyclase 66kD subunit  21.85 
 
 		 534 aa  50.1  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1261  MiaB-like tRNA modifying enzyme  23.95 
 
 		 422 aa  50.1  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3364  Radical SAM domain protein  22.64 
 
 		 564 aa  49.3  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.669906 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1016  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester oxidative cyclase  25.5 
 
 		 584 aa  48.9  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2577  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  22.99 
 
 		 674 aa  48.9  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.451691  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0902  radical SAM domain-containing protein  24.65 
 
 		 369 aa  49.3  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.981157  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1298  radical SAM domain-containing protein  27.03 
 
 		 600 aa  48.5  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0233  Radical SAM domain protein  22.16 
 
 		 723 aa  48.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.677011 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1926  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  26.29 
 
 		 444 aa  47.8  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.587814  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0124  radical SAM domain-containing protein  21.82 
 
 		 625 aa  47.8  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0216543  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1324  radical SAM domain-containing protein  23.67 
 
 		 369 aa  47.8  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.527969 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0893  Radical SAM domain protein  23.42 
 
 		 681 aa  47.8  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.878222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1864  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  22.44 
 
 		 565 aa  47.4  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.599667  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1404  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 562 aa  47  0.0008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00022345  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1629  radical SAM domain-containing protein  25.51 
 
 		 611 aa  46.2  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1898  Radical SAM domain protein  30.82 
 
 		 459 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4039  Radical SAM domain protein  26.58 
 
 		 538 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.461651 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3812  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  22.12 
 
 		 569 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1469  radical SAM family Fe-S protein  21.91 
 
 		 368 aa  46.6  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1487  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  22.46 
 
 		 567 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1062  radical SAM domain-containing protein  21.74 
 
 		 372 aa  46.6  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1598  Radical SAM domain protein  29.41 
 
 		 477 aa  46.6  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3240  radical SAM domain-containing protein  29.9 
 
 		 812 aa  45.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.47861  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0972  2-methylthioadenine synthetase  25.18 
 
 		 445 aa  46.2  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4375  Radical SAM domain protein  26.36 
 
 		 537 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17011  Fe-S oxidoreductase  23.97 
 
 		 539 aa  45.8  0.002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4437  Radical SAM domain protein  26.36 
 
 		 537 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.07608 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12746  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  23.99 
 
 		 512 aa  46.2  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000618798  normal  0.207012 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2941  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 625 aa  45.8  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.151615 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1047  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  24.14 
 
 		 438 aa  45.8  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000312807  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0662  Radical SAM domain protein  23.71 
 
 		 545 aa  45.8  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0764321  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2772  Radical SAM domain protein  31.73 
 
 		 598 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1511  Radical SAM domain protein  25.51 
 
 		 627 aa  45.4  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0323  Radical SAM domain protein  30.3 
 
 		 433 aa  45.4  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.733207  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1163  Radical SAM domain protein  22.57 
 
 		 444 aa  45.4  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0488  Radical SAM domain protein  27.48 
 
 		 575 aa  45.4  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0278  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  21.31 
 
 		 443 aa  45.4  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1188  MiaB-like tRNA modifying enzyme  21.74 
 
 		 449 aa  45.1  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>