14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0896 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0896  hypothetical protein  100 
 
 		 364 aa  735    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1457  Radical SAM domain protein  25.51 
 
 		 528 aa  107  2e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0781401  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0681  Radical SAM domain protein  26.93 
 
 		 502 aa  90.1  6e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.0000702668  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1284  radical SAM domain-containing protein  29.63 
 
 		 530 aa  87.4  4e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2083  radical SAM domain-containing protein  29.52 
 
 		 530 aa  58.9  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1955  radical SAM domain-containing protein  26.82 
 
 		 531 aa  58.2  0.0000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.684281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2313  radical SAM domain-containing protein  28.11 
 
 		 532 aa  57.4  0.0000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.356702  hitchhiker  0.00154549 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0711  radical SAM domain-containing protein  26.19 
 
 		 531 aa  56.6  0.0000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.826726  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0336  radical SAM domain-containing protein  30.54 
 
 		 526 aa  53.9  0.000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0018  radical SAM domain-containing protein  30 
 
 		 497 aa  53.5  0.000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0065  Radical SAM domain protein  28.8 
 
 		 524 aa  52.8  0.000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.109928  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1133  Radical SAM domain protein  27.4 
 
 		 531 aa  48.1  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0197015  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1853  radical SAM domain-containing protein  35.14 
 
 		 548 aa  47.4  0.0004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1317  radical SAM domain-containing protein  33.65 
 
 		 546 aa  44.3  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.484061 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>