114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1853 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1853  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 548 aa  1117    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1429  Radical SAM domain protein  32.7 
 
 		 497 aa  249  1e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.322628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0018  radical SAM domain-containing protein  34.75 
 
 		 497 aa  243  7.999999999999999e-63  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1228  radical SAM domain-containing protein  31.67 
 
 		 515 aa  230  6e-59  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.641175  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1133  Radical SAM domain protein  33.56 
 
 		 531 aa  215  9.999999999999999e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0197015  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2313  radical SAM domain-containing protein  33.19 
 
 		 532 aa  206  6e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.356702  hitchhiker  0.00154549 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1955  radical SAM domain-containing protein  32.11 
 
 		 531 aa  201  3.9999999999999996e-50  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.684281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1953  radical SAM domain-containing protein  28.44 
 
 		 503 aa  199  7.999999999999999e-50  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1457  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 		 528 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0781401  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0065  Radical SAM domain protein  31.97 
 
 		 524 aa  199  1.0000000000000001e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.109928  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2083  radical SAM domain-containing protein  31.97 
 
 		 530 aa  194  5e-48  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0681  Radical SAM domain protein  34.24 
 
 		 502 aa  193  6e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.0000702668  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1667  Radical SAM domain protein  30.2 
 
 		 503 aa  192  2e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.26969  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1317  radical SAM domain-containing protein  32.08 
 
 		 546 aa  191  4e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.484061 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1284  radical SAM domain-containing protein  31.21 
 
 		 530 aa  188  2e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0336  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 526 aa  187  6e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0711  radical SAM domain-containing protein  30.39 
 
 		 531 aa  183  6e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.826726  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1388  radical SAM domain-containing protein  30.43 
 
 		 574 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0750  Radical SAM domain protein  24.83 
 
 		 405 aa  65.5  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1034  radical SAM domain-containing protein  25.85 
 
 		 393 aa  63.2  0.00000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.851598  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1890  radical SAM domain-containing protein  26.56 
 
 		 398 aa  57  0.0000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1323  Radical SAM domain protein  24.11 
 
 		 360 aa  55.1  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1049  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 398 aa  54.7  0.000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1443  radical SAM domain-containing protein  25.58 
 
 		 410 aa  53.9  0.000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.664587  normal  0.058788 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1248  RNA modification enzyme, MiaB family  21.35 
 
 		 543 aa  53.1  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0437289  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0201  radical SAM domain-containing protein  29.05 
 
 		 484 aa  53.5  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1807  RNA modification enzyme, MiaB family  22.48 
 
 		 451 aa  52.8  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000210311  decreased coverage  0.000315868 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0311  radical SAM domain-containing protein  24.33 
 
 		 393 aa  52.8  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1202  radical SAM domain-containing protein  25.25 
 
 		 412 aa  52.4  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3986  RNA modification enzyme, MiaB family  21.63 
 
 		 508 aa  52.4  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.219223  normal  0.0213004 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1044  RNA modification enzyme, MiaB family  22.47 
 
 		 534 aa  51.6  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.852588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0501  MiaB-like tRNA modifying enzyme  25.11 
 
 		 430 aa  50.8  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1494  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  23.33 
 
 		 439 aa  51.2  0.00005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0683  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  23.33 
 
 		 439 aa  50.8  0.00006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1513  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  25.22 
 
 		 433 aa  50.4  0.00008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.627818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0742  radical SAM domain-containing protein  23.53 
 
 		 397 aa  50.4  0.00009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1610  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  24.11 
 
 		 471 aa  49.7  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.34792  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0766  radical SAM domain-containing protein  24.14 
 
 		 397 aa  50.1  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2208  RNA modification enzyme, MiaB family  21.9 
 
 		 528 aa  50.1  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.494815  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0523  radical SAM domain-containing protein  24.89 
 
 		 371 aa  49.3  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0124  radical SAM domain-containing protein  21.91 
 
 		 625 aa  49.3  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0216543  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12746  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  21.31 
 
 		 512 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000618798  normal  0.207012 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1947  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  22.6 
 
 		 497 aa  48.9  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01247  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  21.23 
 
 		 460 aa  49.7  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00700  putative SAM/TRAM family methylase protein  20.98 
 
 		 482 aa  48.5  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0599  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  25.29 
 
 		 472 aa  48.1  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0485  radical SAM family protein  25.66 
 
 		 910 aa  47.8  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363594  normal  0.576766 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1882  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  22.68 
 
 		 497 aa  47.8  0.0005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0145242  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0237  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  24.64 
 
 		 447 aa  47.4  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09080  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  23.08 
 
 		 442 aa  47  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.370572  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1793  RNA modification enzyme, MiaB family  22.53 
 
 		 503 aa  47  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.513666  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0689  Radical SAM domain protein  21.55 
 
 		 459 aa  47  0.0009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1169  radical SAM family protein  23.28 
 
 		 372 aa  46.2  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.198127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3800  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  24.71 
 
 		 472 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3967  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  20.51 
 
 		 512 aa  46.6  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.149181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0517  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  24.71 
 
 		 472 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0538  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  24.71 
 
 		 472 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2950  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  22.63 
 
 		 441 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3387  Radical SAM domain protein  23.23 
 
 		 557 aa  47  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.384607  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0127  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  21.36 
 
 		 442 aa  46.6  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0233399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0543  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  24.71 
 
 		 472 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0127  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  21.36 
 
 		 446 aa  47  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0728871  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2225  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  21.64 
 
 		 502 aa  46.2  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.550449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2620  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  20.96 
 
 		 441 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.364941  normal  0.313039 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2334  tRNA-i(6)A37 modification enzyme MiaB  21.73 
 
 		 459 aa  45.8  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6297  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  21.69 
 
 		 453 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1782  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  21.69 
 
 		 453 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.339702  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2429  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  21.41 
 
 		 510 aa  45.8  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130764 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1495  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  24.05 
 
 		 451 aa  45.8  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.421573  hitchhiker  0.000974888 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1673  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  21.89 
 
 		 442 aa  45.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.548183  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17650  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  22.66 
 
 		 510 aa  45.8  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.07758  normal  0.960959 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2123  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  25.11 
 
 		 451 aa  45.8  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000417118  normal  0.0490217 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2139  RNA modification enzyme, MiaB family  24.3 
 
 		 450 aa  45.1  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.110862 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0662  Radical SAM domain protein  38.3 
 
 		 856 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0682  Radical SAM domain protein  38.3 
 
 		 857 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.877734 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3028  Radical SAM domain protein  27.06 
 
 		 572 aa  45.1  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.377577  normal  0.0472174 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1944  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  21.51 
 
 		 437 aa  45.4  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41308  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1297  Radical SAM domain protein  27.23 
 
 		 575 aa  44.7  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1807  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  21.69 
 
 		 453 aa  45.1  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.580296 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1999  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  24.76 
 
 		 441 aa  45.1  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.504921 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0996  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  19.73 
 
 		 474 aa  45.1  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0697135  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11680  RNA modification enzyme, MiaB family  21.9 
 
 		 450 aa  45.1  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0952269  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07430  tRNA-N(6)-(isopentenyl)adenosine-37 thiotransferase enzyme MiaB  21.73 
 
 		 448 aa  44.7  0.004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000348325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0811  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  22 
 
 		 494 aa  44.7  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2840  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  20.91 
 
 		 441 aa  44.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3451  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  24.31 
 
 		 476 aa  44.7  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0499  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  24.31 
 
 		 476 aa  44.7  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.717124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3627  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  24.31 
 
 		 480 aa  44.7  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0896  hypothetical protein  36.28 
 
 		 364 aa  44.3  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1803  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  22.07 
 
 		 524 aa  44.7  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.6995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3910  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  24.53 
 
 		 448 aa  44.7  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0803729 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1029  Radical SAM domain protein  23.95 
 
 		 472 aa  44.3  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.585202  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0859  Radical SAM domain protein  22.26 
 
 		 557 aa  44.3  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2638  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  23.44 
 
 		 512 aa  44.3  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0391  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 435 aa  44.3  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23170  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  21.2 
 
 		 557 aa  44.3  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.144121 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2402  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  21.77 
 
 		 467 aa  44.3  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0720  Fe-S oxidoreductase  24.82 
 
 		 377 aa  43.9  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0485  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  25.35 
 
 		 493 aa  43.9  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.926409 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1128  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  22.67 
 
 		 446 aa  43.9  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>