98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0711 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_1955  radical SAM domain-containing protein  88.14 
 
 		 531 aa  991    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.684281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1317  radical SAM domain-containing protein  63.43 
 
 		 546 aa  703    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.484061 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2313  radical SAM domain-containing protein  83.8 
 
 		 532 aa  948    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.356702  hitchhiker  0.00154549 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2083  radical SAM domain-containing protein  82.35 
 
 		 530 aa  916    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0711  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 531 aa  1086    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.826726  normal  0.198807 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1667  Radical SAM domain protein  50.59 
 
 		 503 aa  533  1e-150  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.26969  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1228  radical SAM domain-containing protein  48.28 
 
 		 515 aa  512  1e-144  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.641175  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1953  radical SAM domain-containing protein  49.8 
 
 		 503 aa  510  1e-143  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1133  Radical SAM domain protein  50.2 
 
 		 531 aa  493  9.999999999999999e-139  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0197015  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0018  radical SAM domain-containing protein  32.82 
 
 		 497 aa  241  2e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1457  Radical SAM domain protein  31.4 
 
 		 528 aa  220  5e-56  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0781401  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1429  Radical SAM domain protein  30.94 
 
 		 497 aa  211  2e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.322628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1284  radical SAM domain-containing protein  28.98 
 
 		 530 aa  208  2e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0336  radical SAM domain-containing protein  32.82 
 
 		 526 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0681  Radical SAM domain protein  32.17 
 
 		 502 aa  197  5.000000000000001e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.0000702668  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1388  radical SAM domain-containing protein  29.72 
 
 		 574 aa  193  5e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1853  radical SAM domain-containing protein  30.39 
 
 		 548 aa  183  6e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0065  Radical SAM domain protein  30.31 
 
 		 524 aa  175  1.9999999999999998e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.109928  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1034  radical SAM domain-containing protein  26.71 
 
 		 393 aa  73.6  0.000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.851598  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1049  radical SAM domain-containing protein  25.95 
 
 		 398 aa  70.5  0.00000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0391  radical SAM domain-containing protein  27.27 
 
 		 435 aa  66.2  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0750  Radical SAM domain protein  23.17 
 
 		 405 aa  65.1  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0931  radical SAM domain-containing protein  25.93 
 
 		 369 aa  60.5  0.00000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.297129  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1890  radical SAM domain-containing protein  26.33 
 
 		 398 aa  60.1  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1169  radical SAM family protein  22.92 
 
 		 372 aa  57.8  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.198127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0501  MiaB-like tRNA modifying enzyme  24.02 
 
 		 430 aa  57.8  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2487  Fe-S oxidoreductase  22.12 
 
 		 609 aa  57.8  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1202  radical SAM domain-containing protein  25.41 
 
 		 412 aa  56.2  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0720  Fe-S oxidoreductase  25.16 
 
 		 377 aa  55.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0078  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  24.17 
 
 		 435 aa  55.8  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.68199  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1757  Radical SAM domain protein  23.5 
 
 		 535 aa  55.5  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0257963  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0311  radical SAM domain-containing protein  25.57 
 
 		 393 aa  55.5  0.000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  24.75 
 
 		 1250 aa  54.7  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0689  Radical SAM domain protein  22.37 
 
 		 459 aa  54.7  0.000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0742  radical SAM domain-containing protein  27.84 
 
 		 397 aa  53.9  0.000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1443  radical SAM domain-containing protein  27.75 
 
 		 410 aa  53.9  0.000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.664587  normal  0.058788 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1200  cobalamin B12-binding domain-containing protein  23.5 
 
 		 441 aa  53.5  0.000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0766  radical SAM domain-containing protein  27.44 
 
 		 397 aa  53.5  0.000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1633  radical SAM domain-containing protein  25.18 
 
 		 369 aa  52.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.806615  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0902  radical SAM domain-containing protein  24.33 
 
 		 369 aa  51.6  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.981157  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1324  radical SAM domain-containing protein  24.73 
 
 		 369 aa  51.2  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.527969 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1044  radical SAM domain-containing protein  25.91 
 
 		 369 aa  50.8  0.00007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.877972 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0523  radical SAM domain-containing protein  25.09 
 
 		 371 aa  50.4  0.00007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0896  hypothetical protein  26.19 
 
 		 364 aa  49.7  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1100  radical SAM domain-containing protein  23.53 
 
 		 470 aa  49.7  0.0001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1369  radical SAM domain-containing protein  21.61 
 
 		 556 aa  49.7  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000805279  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3387  Radical SAM domain protein  28.68 
 
 		 557 aa  49.7  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.384607  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0893  Radical SAM domain protein  24.89 
 
 		 681 aa  50.1  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.878222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2992  Radical SAM domain protein  23.7 
 
 		 622 aa  49.3  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0050661  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1261  MiaB-like tRNA modifying enzyme  24.54 
 
 		 422 aa  49.3  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1016  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester oxidative cyclase  23.23 
 
 		 584 aa  49.3  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0201  radical SAM domain-containing protein  22.77 
 
 		 484 aa  48.9  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0796  RNA modification protein  28.5 
 
 		 468 aa  48.9  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.601432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1062  radical SAM domain-containing protein  22.29 
 
 		 372 aa  48.5  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1323  Radical SAM domain protein  22.78 
 
 		 360 aa  48.1  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1469  radical SAM family Fe-S protein  21.86 
 
 		 368 aa  48.1  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0859  Radical SAM domain protein  20.7 
 
 		 557 aa  48.1  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1255  radical SAM domain-containing protein  22.22 
 
 		 441 aa  47.8  0.0005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0871  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  22.94 
 
 		 554 aa  47.4  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4039  Radical SAM domain protein  26.13 
 
 		 538 aa  47.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.461651 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17011  Fe-S oxidoreductase  23.6 
 
 		 539 aa  47.8  0.0006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0686  radical SAM domain-containing protein  22.46 
 
 		 378 aa  47.4  0.0007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0278  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  22.6 
 
 		 443 aa  47  0.0008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0276  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  22.6 
 
 		 443 aa  47  0.0008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0476614  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0558  radical SAM domain-containing protein  24.67 
 
 		 430 aa  47  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.236601  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0373  MiaB-like tRNA modifying enzyme  24.24 
 
 		 411 aa  47  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0972  2-methylthioadenine synthetase  24.45 
 
 		 445 aa  46.2  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2490  radical SAM family protein  27.31 
 
 		 605 aa  47  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.497518  normal  0.319547 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1374  radical SAM domain-containing protein  24.8 
 
 		 610 aa  47  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1282  RNA modification enzyme, MiaB family  23.02 
 
 		 434 aa  45.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1018  Radical SAM domain protein  35 
 
 		 504 aa  46.2  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1168  radical SAM family protein  22.65 
 
 		 566 aa  45.8  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0662  Radical SAM domain protein  25.26 
 
 		 545 aa  45.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0764321  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2477  TPR domain/radical SAM/B12 binding domain-containing protein  23.66 
 
 		 864 aa  45.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2409  radical SAM domain-containing protein  24.27 
 
 		 495 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.523158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0614  radical SAM domain-containing protein  20.81 
 
 		 570 aa  45.8  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.69222  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1298  radical SAM domain-containing protein  25.79 
 
 		 600 aa  45.8  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16891  Fe-S oxidoreductase  24.29 
 
 		 539 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.779533  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1188  MiaB-like tRNA modifying enzyme  22.05 
 
 		 449 aa  45.4  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3512  radical SAM family protein  27.78 
 
 		 540 aa  45.1  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.170838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1320  Elongator protein 3/MiaB/NifB  30.69 
 
 		 472 aa  45.1  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0069427  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1926  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  30.82 
 
 		 444 aa  45.1  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.587814  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1899  radical SAM family protein  31.37 
 
 		 591 aa  45.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.807924 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2577  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  21.9 
 
 		 674 aa  44.7  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.451691  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0042  radical SAM family protein  31.4 
 
 		 502 aa  44.3  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2941  radical SAM domain-containing protein  24.22 
 
 		 625 aa  44.3  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.151615 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2273  radical SAM domain-containing protein  29.37 
 
 		 498 aa  44.3  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0494  Fe-S oxidoreductase  31.39 
 
 		 569 aa  44.3  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0300  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 842 aa  44.3  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000298698  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4375  Radical SAM domain protein  24.55 
 
 		 537 aa  43.9  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16781  Fe-S oxidoreductase  21.71 
 
 		 539 aa  43.9  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1292  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  24.86 
 
 		 474 aa  43.9  0.007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.118878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4437  Radical SAM domain protein  24.55 
 
 		 537 aa  43.9  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.07608 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0097  MiaB-like tRNA modifying enzyme  21.37 
 
 		 434 aa  43.9  0.007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.698002  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0661  radical SAM domain-containing protein  22.9 
 
 		 438 aa  43.9  0.007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.692136  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1436  radical SAM domain-containing protein  23.63 
 
 		 476 aa  43.9  0.008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.37868  decreased coverage  0.00181566 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2195  Radical SAM domain protein  20.99 
 
 		 460 aa  43.5  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.565929  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0233  Radical SAM domain protein  22.67 
 
 		 723 aa  43.5  0.01  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.677011 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>