131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_2083 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_0711  radical SAM domain-containing protein  82.35 
 
 		 531 aa  928    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.826726  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2083  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 530 aa  1076    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2313  radical SAM domain-containing protein  84.12 
 
 		 532 aa  943    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.356702  hitchhiker  0.00154549 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1317  radical SAM domain-containing protein  63.79 
 
 		 546 aa  709    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.484061 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1955  radical SAM domain-containing protein  82.77 
 
 		 531 aa  941    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.684281  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1667  Radical SAM domain protein  51.19 
 
 		 503 aa  538  9.999999999999999e-153  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.26969  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1953  radical SAM domain-containing protein  49.31 
 
 		 503 aa  518  1.0000000000000001e-145  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1133  Radical SAM domain protein  51.39 
 
 		 531 aa  507  9.999999999999999e-143  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0197015  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1228  radical SAM domain-containing protein  48.08 
 
 		 515 aa  504  1e-141  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.641175  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0018  radical SAM domain-containing protein  34.17 
 
 		 497 aa  253  5.000000000000001e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1457  Radical SAM domain protein  30.24 
 
 		 528 aa  224  3e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0781401  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1284  radical SAM domain-containing protein  32.28 
 
 		 530 aa  215  9.999999999999999e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1429  Radical SAM domain protein  31.51 
 
 		 497 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.322628  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0681  Radical SAM domain protein  32.98 
 
 		 502 aa  208  2e-52  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.0000702668  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0336  radical SAM domain-containing protein  30.82 
 
 		 526 aa  200  6e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1853  radical SAM domain-containing protein  31.97 
 
 		 548 aa  194  4e-48  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1388  radical SAM domain-containing protein  29.07 
 
 		 574 aa  194  4e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0065  Radical SAM domain protein  28.77 
 
 		 524 aa  181  4e-44  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.109928  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0931  radical SAM domain-containing protein  26.44 
 
 		 369 aa  72  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.297129  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1049  radical SAM domain-containing protein  24.59 
 
 		 398 aa  67  0.0000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1034  radical SAM domain-containing protein  25.34 
 
 		 393 aa  66.2  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.851598  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0750  Radical SAM domain protein  24.83 
 
 		 405 aa  63.9  0.000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1324  radical SAM domain-containing protein  26.43 
 
 		 369 aa  63.2  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.527969 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2487  Fe-S oxidoreductase  23.67 
 
 		 609 aa  62  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0689  Radical SAM domain protein  25.08 
 
 		 459 aa  62.4  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1169  radical SAM family protein  24.39 
 
 		 372 aa  61.6  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.198127  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0871  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  24.31 
 
 		 554 aa  59.7  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0523  radical SAM domain-containing protein  27.93 
 
 		 371 aa  60.1  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3387  Radical SAM domain protein  31.65 
 
 		 557 aa  59.3  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.384607  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0897  Radical SAM domain protein  23.6 
 
 		 564 aa  58.5  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000336813  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0078  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  23.75 
 
 		 435 aa  58.5  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.68199  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1757  Radical SAM domain protein  26.29 
 
 		 535 aa  57.8  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0257963  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0859  Radical SAM domain protein  22.19 
 
 		 557 aa  58.2  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0201  radical SAM domain-containing protein  22.9 
 
 		 484 aa  57.8  0.0000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0720  Fe-S oxidoreductase  25.8 
 
 		 377 aa  57  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1100  radical SAM domain-containing protein  24.32 
 
 		 470 aa  57  0.0000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1016  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester oxidative cyclase  30.46 
 
 		 584 aa  56.6  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0391  radical SAM domain-containing protein  25.43 
 
 		 435 aa  56.6  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0501  MiaB-like tRNA modifying enzyme  24.27 
 
 		 430 aa  56.6  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  24.83 
 
 		 1250 aa  55.8  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1369  radical SAM domain-containing protein  23.3 
 
 		 556 aa  55.1  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000805279  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0766  radical SAM domain-containing protein  24.48 
 
 		 397 aa  54.7  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1200  cobalamin B12-binding domain-containing protein  23.77 
 
 		 441 aa  54.7  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1890  radical SAM domain-containing protein  25.08 
 
 		 398 aa  54.3  0.000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1298  radical SAM domain-containing protein  20.22 
 
 		 600 aa  53.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0742  radical SAM domain-containing protein  24.47 
 
 		 397 aa  53.1  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1323  Radical SAM domain protein  24.72 
 
 		 360 aa  52.8  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1320  Elongator protein 3/MiaB/NifB  30.16 
 
 		 472 aa  51.2  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0069427  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3863  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  24.43 
 
 		 580 aa  51.2  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0582854  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1469  radical SAM family Fe-S protein  23.2 
 
 		 368 aa  51.6  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0373  MiaB-like tRNA modifying enzyme  25.43 
 
 		 411 aa  51.2  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0311  radical SAM domain-containing protein  25.84 
 
 		 393 aa  51.2  0.00004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1044  radical SAM domain-containing protein  25.19 
 
 		 369 aa  51.6  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.877972 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3057  Radical SAM domain protein  24.14 
 
 		 518 aa  50.8  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00748759  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0238  radical SAM domain-containing protein  26.2 
 
 		 461 aa  50.8  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.140637  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0896  hypothetical protein  28.57 
 
 		 364 aa  50.8  0.00006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3364  Radical SAM domain protein  22.88 
 
 		 564 aa  50.4  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.669906 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3812  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  23.89 
 
 		 569 aa  50.4  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1926  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  32.24 
 
 		 444 aa  50.4  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.587814  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1255  radical SAM domain-containing protein  23.24 
 
 		 441 aa  50.1  0.00009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1202  radical SAM domain-containing protein  26.13 
 
 		 412 aa  50.1  0.00009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2490  radical SAM family protein  25.93 
 
 		 605 aa  50.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.497518  normal  0.319547 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2577  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  23.16 
 
 		 674 aa  49.7  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.451691  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1374  radical SAM domain-containing protein  26.58 
 
 		 610 aa  49.7  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2992  Radical SAM domain protein  22.68 
 
 		 622 aa  50.1  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0050661  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1443  radical SAM domain-containing protein  24.6 
 
 		 410 aa  49.3  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.664587  normal  0.058788 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1864  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  24.21 
 
 		 565 aa  49.3  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.599667  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1487  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  23.89 
 
 		 567 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2638  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  22.53 
 
 		 512 aa  48.9  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0323  Radical SAM domain protein  29.85 
 
 		 433 aa  48.1  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.733207  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1633  radical SAM domain-containing protein  24.07 
 
 		 369 aa  48.1  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.806615  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0488  Radical SAM domain protein  28.24 
 
 		 575 aa  48.1  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0796  RNA modification protein  28.5 
 
 		 468 aa  48.1  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.601432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1168  radical SAM family protein  24.68 
 
 		 566 aa  47.8  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1163  Radical SAM domain protein  28.78 
 
 		 444 aa  47.8  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0902  radical SAM domain-containing protein  23.88 
 
 		 369 aa  47.8  0.0005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.981157  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1261  MiaB-like tRNA modifying enzyme  22.54 
 
 		 422 aa  47.8  0.0005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1404  radical SAM domain-containing protein  32.82 
 
 		 562 aa  47.8  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00022345  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1047  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25 
 
 		 438 aa  47.8  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000312807  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1705  Radical SAM domain protein  26.07 
 
 		 589 aa  47.4  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.871388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1598  Radical SAM domain protein  27.45 
 
 		 477 aa  47.4  0.0007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1898  Radical SAM domain protein  29.5 
 
 		 459 aa  47  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1463  radical SAM domain-containing protein  22.63 
 
 		 528 aa  47  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0741  radical SAM domain-containing protein  23.72 
 
 		 623 aa  47  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0278  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  23.58 
 
 		 443 aa  47  0.0008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1188  MiaB-like tRNA modifying enzyme  21.03 
 
 		 449 aa  47  0.0008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0276  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  23.58 
 
 		 443 aa  47  0.0008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0476614  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0614  radical SAM domain-containing protein  22.58 
 
 		 570 aa  47  0.0009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.69222  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0494  Fe-S oxidoreductase  31.65 
 
 		 569 aa  47  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1899  radical SAM family protein  28.83 
 
 		 591 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.807924 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0233  Radical SAM domain protein  31.72 
 
 		 723 aa  46.6  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.677011 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0909  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  23.36 
 
 		 681 aa  47  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1507  Radical SAM domain protein  25.5 
 
 		 591 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0686  radical SAM domain-containing protein  20.49 
 
 		 378 aa  46.2  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2941  radical SAM domain-containing protein  21.51 
 
 		 625 aa  46.6  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.151615 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2772  Radical SAM domain protein  27.47 
 
 		 598 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0104  Elongator protein 3/MiaB/NifB  29.92 
 
 		 471 aa  45.8  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.016324  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4478  radical SAM family protein  23.08 
 
 		 554 aa  46.2  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.140837  normal  0.22726 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1034  Radical SAM domain protein  31.82 
 
 		 474 aa  45.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0513  radical SAM domain-containing protein  26.55 
 
 		 445 aa  45.8  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000241934  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>