79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0065 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_0065  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 524 aa  1082    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.109928  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1388  radical SAM domain-containing protein  36.82 
 
 		 574 aa  369  1e-101  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0336  radical SAM domain-containing protein  35.1 
 
 		 526 aa  265  1e-69  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1133  Radical SAM domain protein  34.44 
 
 		 531 aa  236  1.0000000000000001e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0197015  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1457  Radical SAM domain protein  31.16 
 
 		 528 aa  212  1e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0781401  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0018  radical SAM domain-containing protein  33.56 
 
 		 497 aa  210  6e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1667  Radical SAM domain protein  30.96 
 
 		 503 aa  199  7e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.26969  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1953  radical SAM domain-containing protein  28.74 
 
 		 503 aa  199  9e-50  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1853  radical SAM domain-containing protein  31.97 
 
 		 548 aa  199  1.0000000000000001e-49  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1228  radical SAM domain-containing protein  30.93 
 
 		 515 aa  197  3e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.641175  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1429  Radical SAM domain protein  29.4 
 
 		 497 aa  197  6e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.322628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1284  radical SAM domain-containing protein  30.11 
 
 		 530 aa  194  3e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0681  Radical SAM domain protein  30.86 
 
 		 502 aa  187  6e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.0000702668  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2313  radical SAM domain-containing protein  29.54 
 
 		 532 aa  186  9e-46  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.356702  hitchhiker  0.00154549 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1317  radical SAM domain-containing protein  29.46 
 
 		 546 aa  186  1.0000000000000001e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.484061 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2083  radical SAM domain-containing protein  28.77 
 
 		 530 aa  180  4e-44  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1955  radical SAM domain-containing protein  29.34 
 
 		 531 aa  177  5e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.684281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0711  radical SAM domain-containing protein  30.31 
 
 		 531 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.826726  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1049  radical SAM domain-containing protein  25.98 
 
 		 398 aa  59.7  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1034  radical SAM domain-containing protein  23.24 
 
 		 393 aa  57.8  0.0000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.851598  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2171  radical SAM domain-containing protein  28.31 
 
 		 512 aa  54.3  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1280  radical SAM family protein  26.75 
 
 		 879 aa  54.3  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00695626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2205  Radical SAM domain protein  26.88 
 
 		 428 aa  53.1  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0986  radical SAM domain-containing protein  30.83 
 
 		 600 aa  50.8  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1063  radical SAM domain protein  29.46 
 
 		 503 aa  49.7  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000246609  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0957  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  28.27 
 
 		 430 aa  50.1  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00162656  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1374  radical SAM domain-containing protein  23.89 
 
 		 610 aa  50.1  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1324  radical SAM domain-containing protein  24.59 
 
 		 369 aa  49.7  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.527969 
 
 
-
 
NC_002936  DET1280  radical SAM/B12 binding domain-containing protein  28.15 
 
 		 503 aa  48.9  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0877  Elongator protein 3/MiaB/NifB  22.83 
 
 		 872 aa  48.9  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00856877 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14633  predicted protein  24.02 
 
 		 516 aa  48.5  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.056116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1766  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  23.86 
 
 		 496 aa  48.5  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0935  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  25.62 
 
 		 430 aa  48.1  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000136513  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0800  radical SAM domain-containing protein  26 
 
 		 455 aa  48.1  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.422662  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0485  radical SAM family protein  25.23 
 
 		 910 aa  46.6  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.363594  normal  0.576766 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0311  radical SAM domain-containing protein  25.87 
 
 		 393 aa  46.6  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0323  Radical SAM domain protein  25.91 
 
 		 433 aa  47  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.733207  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2738  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  22.31 
 
 		 448 aa  46.6  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1890  radical SAM domain-containing protein  22.22 
 
 		 398 aa  46.2  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2487  Fe-S oxidoreductase  21.03 
 
 		 609 aa  46.6  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1261  MiaB-like tRNA modifying enzyme  24.37 
 
 		 422 aa  46.2  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2047  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  23.57 
 
 		 497 aa  45.4  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.731125 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0682  Radical SAM domain protein  26.96 
 
 		 857 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.877734 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  23.53 
 
 		 1250 aa  46.2  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1898  Radical SAM domain protein  28.81 
 
 		 459 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0662  Radical SAM domain protein  26.96 
 
 		 856 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1091  radical SAM domain-containing protein  26.79 
 
 		 503 aa  45.8  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0346077  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3698  Radical SAM domain protein  24.2 
 
 		 589 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.360742  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1648  Radical SAM domain protein  23.85 
 
 		 450 aa  45.4  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3199  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  26.89 
 
 		 449 aa  45.1  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1233  Radical SAM domain protein  24.2 
 
 		 597 aa  45.4  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0896  hypothetical protein  28.8 
 
 		 364 aa  45.4  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0241  BchE/P-methylase family protein  23.96 
 
 		 430 aa  45.4  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.222091  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2599  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  23.15 
 
 		 487 aa  44.7  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000474817  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0657  RNA modification protein  29.25 
 
 		 418 aa  45.1  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000290967  normal  0.02979 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0201  radical SAM domain-containing protein  23.4 
 
 		 484 aa  44.7  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0387  Radical SAM domain protein  25.33 
 
 		 860 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1629  radical SAM domain-containing protein  20.99 
 
 		 611 aa  44.3  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1055  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.49 
 
 		 510 aa  44.3  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0758  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  23.1 
 
 		 462 aa  44.3  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.904603  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3240  radical SAM domain-containing protein  25.51 
 
 		 812 aa  44.3  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.47861  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1169  radical SAM family protein  23.11 
 
 		 372 aa  43.9  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.198127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3611  radical SAM domain-containing protein  25.13 
 
 		 429 aa  43.9  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00819  hypothetical protein  23.44 
 
 		 441 aa  43.5  0.008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2807  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  23.44 
 
 		 441 aa  43.5  0.008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.929546  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0988  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  23.44 
 
 		 441 aa  43.5  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.479636  normal  0.703934 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0862  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  23.44 
 
 		 441 aa  43.5  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.746353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2807  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  23.44 
 
 		 441 aa  43.5  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1630  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  23.4 
 
 		 436 aa  43.9  0.008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0566409  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0906  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  23.44 
 
 		 441 aa  43.5  0.008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0895  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  23.44 
 
 		 441 aa  43.5  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.465773  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00802  predicted SAM-dependent methyltransferase  23.44 
 
 		 441 aa  43.5  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2510  ribosomal protein S12 methylthiotransferase  23.44 
 
 		 441 aa  43.5  0.009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.105116  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1202  radical SAM domain-containing protein  24.59 
 
 		 412 aa  43.5  0.009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3205  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  31.75 
 
 		 447 aa  43.5  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.112948  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1456  radical SAM domain-containing protein  23.79 
 
 		 504 aa  43.5  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.213421  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1511  Radical SAM domain protein  23.56 
 
 		 627 aa  43.5  0.009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0267  Radical SAM domain protein  21.54 
 
 		 874 aa  43.5  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00148371  decreased coverage  0.00763103 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1323  radical SAM domain-containing protein  34.62 
 
 		 441 aa  43.5  0.01  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>