More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1571 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1571  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 505 aa  1039    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.805269  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1018  Radical SAM domain protein  55.56 
 
 		 504 aa  592  1e-168  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0042  radical SAM family protein  52.1 
 
 		 502 aa  535  1e-151  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0866  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase family protein, putative  48.32 
 
 		 504 aa  455  1e-127  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4256  radical SAM family protein  45.28 
 
 		 536 aa  440  9.999999999999999e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3079  radical SAM family protein  47.12 
 
 		 530 aa  429  1e-119  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.265778  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0387  radical SAM domain-containing protein  45.89 
 
 		 552 aa  429  1e-119  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.971696  normal  0.247194 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0959  radical SAM family protein  45.35 
 
 		 530 aa  426  1e-118  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4163  radical SAM family protein  43.77 
 
 		 524 aa  409  1e-113  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2424  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  45.23 
 
 		 551 aa  407  1.0000000000000001e-112  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141544  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1616  radical SAM domain-containing protein  34.45 
 
 		 559 aa  261  1e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.710753  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1897  radical SAM domain-containing protein  34.21 
 
 		 559 aa  261  2e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0197  radical SAM family protein  36.79 
 
 		 656 aa  251  2e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1735  cobalamin B12-binding domain protein  35.28 
 
 		 590 aa  250  5e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3186  radical SAM family protein  33.86 
 
 		 583 aa  249  1e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1016  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester oxidative cyclase  34.72 
 
 		 584 aa  241  2e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0143  cobalamin B12-binding domain-containing protein  33.18 
 
 		 583 aa  238  1e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0605658  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0488  Radical SAM domain protein  31.47 
 
 		 575 aa  237  5.0000000000000005e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0840  cobalamin B12-binding domain protein  32.86 
 
 		 590 aa  234  3e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1757  Radical SAM domain protein  32.67 
 
 		 535 aa  233  6e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0257963  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1298  radical SAM domain-containing protein  35.38 
 
 		 600 aa  231  3e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0859  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 557 aa  230  5e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3387  Radical SAM domain protein  32.92 
 
 		 557 aa  228  2e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.384607  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4724  Radical SAM domain protein  34.12 
 
 		 581 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0614  radical SAM domain-containing protein  32.17 
 
 		 570 aa  212  1e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.69222  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1404  radical SAM domain-containing protein  30.4 
 
 		 562 aa  211  4e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00022345  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0494  Fe-S oxidoreductase  30.94 
 
 		 569 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2992  Radical SAM domain protein  31.7 
 
 		 622 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0050661  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0741  radical SAM domain-containing protein  27.21 
 
 		 623 aa  139  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2487  Fe-S oxidoreductase  28.92 
 
 		 609 aa  136  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0273  radical SAM domain-containing protein  29.4 
 
 		 589 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0302705  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0101  radical SAM family protein  28.77 
 
 		 624 aa  134  5e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00410532  normal  0.882418 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0124  radical SAM domain-containing protein  29.28 
 
 		 625 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0216543  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0076  Radical SAM domain protein  28.64 
 
 		 616 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.3742100000000001e-34 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3180  radical SAM domain-containing protein  28.24 
 
 		 646 aa  127  6e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0093  Radical SAM domain protein  28.04 
 
 		 490 aa  125  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0584264  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2351  Radical SAM domain protein  26.49 
 
 		 426 aa  94  6e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3058  radical SAM domain-containing protein  24.85 
 
 		 529 aa  94  6e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111955  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1171  radical SAM family protein  24.86 
 
 		 563 aa  84.3  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000834486  normal  0.0316133 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2895  cobalamin vitamin B12-binding / radical SAM protein  29.7 
 
 		 546 aa  84.3  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1705  cobalamin B12-binding/radical SAM family protein  23.35 
 
 		 472 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.900478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3593  radical SAM domain-containing protein  22.74 
 
 		 472 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000974767  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2873  radical SAM domain-containing protein  24.79 
 
 		 520 aa  80.5  0.00000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000297506  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2412  radical SAM domain-containing protein  28.36 
 
 		 459 aa  80.1  0.00000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1046  Radical SAM domain protein  24.84 
 
 		 490 aa  78.2  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3415  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  23.28 
 
 		 472 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2413  radical SAM domain-containing protein  25.29 
 
 		 437 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3574  radical SAM domain-containing protein  22.62 
 
 		 461 aa  75.9  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0897  Radical SAM domain protein  25.55 
 
 		 564 aa  75.9  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000336813  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1200  cobalamin B12-binding domain-containing protein  22.65 
 
 		 441 aa  73.6  0.000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0871  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  25.93 
 
 		 554 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2473  radical SAM domain-containing protein  22.73 
 
 		 468 aa  72.8  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0785227  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0114  Elongator protein 3/MiaB/NifB  25.32 
 
 		 609 aa  72.4  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1699  Radical SAM domain protein  25.15 
 
 		 424 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000206113  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0762  Fe-S oxidoreductase  23.49 
 
 		 484 aa  72  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.151938  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2523  Radical SAM domain protein  24.52 
 
 		 424 aa  71.6  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0388324 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0689  Radical SAM domain protein  26.92 
 
 		 459 aa  71.6  0.00000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2566  radical SAM domain-containing protein  24.56 
 
 		 426 aa  71.6  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.162584  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1255  radical SAM domain-containing protein  22.28 
 
 		 441 aa  70.9  0.00000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1302  Radical SAM domain protein  24.32 
 
 		 540 aa  70.9  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0143596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3057  Radical SAM domain protein  21.91 
 
 		 518 aa  70.5  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00748759  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2941  radical SAM domain-containing protein  25.73 
 
 		 625 aa  70.1  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.151615 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1100  radical SAM domain-containing protein  21.92 
 
 		 470 aa  68.9  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3504  cobalamin B12-binding/radical SAM family protein  28.33 
 
 		 677 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3364  Radical SAM domain protein  24.58 
 
 		 564 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.669906 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0138  Radical SAM domain protein  27.97 
 
 		 608 aa  68.9  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000809293  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2171  radical SAM domain-containing protein  27.59 
 
 		 512 aa  68.9  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3233  radical SAM domain-containing protein  22.7 
 
 		 531 aa  65.9  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1119  radical SAM domain-containing protein  23.83 
 
 		 525 aa  66.2  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0138505  normal  0.560391 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0513  Radical SAM domain protein  23.66 
 
 		 609 aa  66.2  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2592  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  23.81 
 
 		 608 aa  65.5  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000154642  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2292  radical SAM domain-containing protein  26.18 
 
 		 634 aa  65.5  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.727503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3713  radical SAM domain-containing protein  24.79 
 
 		 669 aa  65.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3558  radical SAM domain-containing protein  24.93 
 
 		 490 aa  64.7  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1133  radical SAM family protein  24.07 
 
 		 656 aa  63.5  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0262562 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0095  radical SAM domain-containing protein  24.36 
 
 		 651 aa  63.9  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0641109 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3165  Fe-S oxidoreductase  25 
 
 		 459 aa  63.2  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00148517 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1369  radical SAM domain-containing protein  21.01 
 
 		 556 aa  62.4  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000805279  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1626  Radical SAM domain protein  19.95 
 
 		 444 aa  62.4  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2089  Radical SAM domain protein  30.19 
 
 		 530 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.670556 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2185  Radical SAM domain protein  20.05 
 
 		 473 aa  62  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000424629  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0515  Radical SAM domain protein  25.48 
 
 		 603 aa  62.4  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2065  Radical SAM domain protein  30.19 
 
 		 530 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2435  radical SAM domain-containing protein  25.55 
 
 		 524 aa  61.6  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000772503  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2409  radical SAM domain-containing protein  28 
 
 		 495 aa  61.6  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.523158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0931  radical SAM domain-containing protein  26.24 
 
 		 369 aa  61.2  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.297129  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2939  radical SAM domain-containing protein  27.92 
 
 		 521 aa  61.2  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.379543 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1999  radical SAM domain-containing protein  19.23 
 
 		 506 aa  61.2  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0779114  normal  0.18513 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0030  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  24.25 
 
 		 647 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4478  radical SAM family protein  28.07 
 
 		 554 aa  61.2  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.140837  normal  0.22726 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0738  Radical SAM domain protein  25.67 
 
 		 525 aa  60.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.170027 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1668  Elongator protein 3/MiaB/NifB  23.76 
 
 		 612 aa  60.5  0.00000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0607785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0033  B12-binding/radical SAM domain-containing protein  24.47 
 
 		 647 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0643  Radical SAM domain protein  20.88 
 
 		 489 aa  60.5  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2281  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  27.36 
 
 		 520 aa  60.1  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  19.69 
 
 		 1250 aa  59.3  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1243  radical SAM domain-containing protein  28.14 
 
 		 533 aa  59.7  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.445572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2963  Radical SAM domain protein  29.03 
 
 		 522 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1864  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  26.07 
 
 		 565 aa  59.7  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.599667  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3130  Radical SAM domain protein  22.07 
 
 		 448 aa  59.7  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>