20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1761 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1761  hypothetical protein  100 
 
 
345 aa  701    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.353962  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1787  hypothetical protein  71.8 
 
 
342 aa  505  9.999999999999999e-143  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.815822  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3472  hypothetical protein  52.57 
 
 
332 aa  334  1e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.33558 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1474  hypothetical protein  52.38 
 
 
259 aa  236  4e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1448  hypothetical protein  52.38 
 
 
259 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1928  hypothetical protein  56.31 
 
 
299 aa  230  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0830  hypothetical protein  47.25 
 
 
262 aa  219  3.9999999999999997e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0937793  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2016  hypothetical protein  31.87 
 
 
394 aa  79.3  0.00000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000485133  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4496  hypothetical protein  43.33 
 
 
199 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0369659  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2786  hypothetical protein  32.46 
 
 
117 aa  52.8  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.91017  hitchhiker  0.00691739 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1676  hypothetical protein  22.64 
 
 
285 aa  52.4  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0345503 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2444  hypothetical protein  29.61 
 
 
330 aa  50.1  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5924  hypothetical protein  28.85 
 
 
202 aa  49.7  0.00008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.11783  normal  0.310125 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4563  hypothetical protein  38.33 
 
 
212 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00101881 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2514  helix-hairpin-helix protein  30.77 
 
 
148 aa  48.9  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.355933  normal  0.208797 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2839  hypothetical protein  36.67 
 
 
184 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1758  DNA uptake protein and related DNA-binding proteins  30.7 
 
 
110 aa  47  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0038  hypothetical protein  24.07 
 
 
290 aa  46.2  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1869  hypothetical protein  30.53 
 
 
207 aa  45.1  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00710485  normal  0.186884 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2038  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  28.93 
 
 
130 aa  45.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>