92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1336 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_1336  hypothetical protein  100 
 
 
379 aa  794    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00270043  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0251  radical SAM domain-containing protein  36.44 
 
 
372 aa  236  4e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.996674  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1798  Radical SAM domain protein  36 
 
 
377 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0702083  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0108  Radical SAM domain protein  36.05 
 
 
429 aa  228  1e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4389  radical SAM domain-containing protein  35.16 
 
 
393 aa  222  8e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.484216 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1575  hypothetical protein  35.26 
 
 
420 aa  221  9.999999999999999e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00249963  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0124  radical SAM family protein  35.51 
 
 
431 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0282893  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09110  predicted DNA-binding protein with the helix-hairpin-helix motif protein  35 
 
 
483 aa  220  3e-56  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.567211  normal  0.851078 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3329  radical SAM domain-containing protein  35.38 
 
 
431 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0407  radical SAM family protein  34.79 
 
 
435 aa  220  3.9999999999999997e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00162852  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3729  radical SAM domain-containing protein  35.16 
 
 
393 aa  219  7e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0105628 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3382  radical SAM domain-containing protein  35.94 
 
 
428 aa  218  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0393  Radical SAM domain protein  34.05 
 
 
397 aa  218  1e-55  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00226682  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0246  hypothetical protein  35.51 
 
 
420 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0320  hypothetical protein  34.83 
 
 
419 aa  217  2.9999999999999998e-55  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.354274 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0306  hypothetical protein  35.36 
 
 
418 aa  216  4e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0825598  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1154  radical SAM family protein  34.85 
 
 
502 aa  216  4e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.848409  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1309  radical SAM domain-containing protein  35.1 
 
 
423 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1202  Radical SAM domain protein  35.13 
 
 
418 aa  214  9.999999999999999e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000160208  normal  0.825886 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1787  radical SAM domain-containing protein  33.77 
 
 
422 aa  213  4.9999999999999996e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1926  Radical SAM domain protein  33.95 
 
 
415 aa  213  4.9999999999999996e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000517647  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2258  Elongator protein 3/MiaB/NifB  34.26 
 
 
414 aa  212  7e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.231457  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3695  Radical SAM domain protein  35.26 
 
 
435 aa  212  1e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000234809  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2338  Radical SAM domain protein  33.16 
 
 
402 aa  212  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.278935  normal  0.595723 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2639  hypothetical protein  34.55 
 
 
417 aa  211  2e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0228  hypothetical protein  33.42 
 
 
417 aa  210  3e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  decreased coverage  0.008996 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0176  radical SAM domain-containing protein  31.94 
 
 
413 aa  210  3e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0388  radical SAM domain-containing protein  37.54 
 
 
400 aa  209  5e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1759  radical SAM family protein  33.33 
 
 
411 aa  209  6e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0826  radical SAM family protein  33.51 
 
 
422 aa  209  9e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.243039  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2365  radical SAM family protein  32.54 
 
 
406 aa  208  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0229751  normal  0.414721 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3540  radical SAM domain-containing protein  33.08 
 
 
403 aa  207  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1192  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  33.77 
 
 
386 aa  207  2e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.052698  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2984  hypothetical protein  33.67 
 
 
412 aa  206  5e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0923725  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2975  Radical SAM domain protein  34.69 
 
 
414 aa  206  6e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.300716  normal  0.0745419 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2123  radical SAM domain-containing protein  32.89 
 
 
406 aa  204  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0767294  normal  0.422246 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1032  hypothetical protein  32.79 
 
 
348 aa  203  3e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4146  radical SAM domain-containing protein  32.55 
 
 
403 aa  204  3e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2852  radical SAM domain-containing protein  32.89 
 
 
406 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0978513 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7467  hypothetical protein  32.31 
 
 
410 aa  203  4e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2714  Radical SAM domain protein  34.69 
 
 
414 aa  203  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2924  radical SAM domain protein  32.89 
 
 
416 aa  202  6e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1900  radical SAM family protein  32.65 
 
 
412 aa  202  8e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.308107 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01933  Radical SAM  31.62 
 
 
413 aa  202  8e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12078  hypothetical protein  33.25 
 
 
420 aa  201  1.9999999999999998e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2501  radical SAM family protein  33.77 
 
 
409 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152187  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2003  Radical SAM domain protein  31.82 
 
 
416 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1282  radical SAM domain-containing protein  33.42 
 
 
432 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15350  predicted DNA-binding protein with the helix-hairpin-helix motif  32.1 
 
 
434 aa  200  3e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000164569  normal  0.0902203 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05010  Radical SAM domain protein  33.51 
 
 
415 aa  200  3e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2768  radical SAM domain-containing protein  32.63 
 
 
406 aa  200  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.723195  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1724  Radical SAM domain protein  33.51 
 
 
461 aa  200  3e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.408853  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0347  hypothetical protein  34.21 
 
 
420 aa  201  3e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3584  radical SAM family protein  31.28 
 
 
413 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6622  radical SAM domain-containing protein  33.51 
 
 
404 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.220752 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0668  Radical SAM domain protein  33.42 
 
 
419 aa  199  5e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.332892  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1155  Radical SAM domain protein  32.8 
 
 
405 aa  199  9e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00303248  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4594  radical SAM domain-containing protein  32.45 
 
 
434 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0194  Radical SAM domain protein  33.25 
 
 
418 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.211109 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3469  radical SAM family protein  31.3 
 
 
406 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2040  radical SAM family protein  32.4 
 
 
421 aa  197  2.0000000000000003e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2262  Radical SAM domain protein  31.54 
 
 
403 aa  197  3e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.625043  normal  0.275727 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0496  radical SAM family protein  30.84 
 
 
469 aa  196  4.0000000000000005e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0909  radical SAM domain-containing protein  33.08 
 
 
406 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.338541  normal  0.891076 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2260  radical SAM domain-containing protein  33.59 
 
 
406 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.249916  normal  0.262865 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2234  DNA-binding protein  33.08 
 
 
406 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.62693  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2166  radical SAM domain-containing protein  33.24 
 
 
386 aa  194  3e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.978798  hitchhiker  0.00000549931 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2067  radical SAM family protein  30.75 
 
 
411 aa  193  3e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.408571  normal  0.630296 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03047  elongator protein 3/MiaB/NifB  30.93 
 
 
414 aa  194  3e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0925  helix-hairpin-helix motif  30.3 
 
 
425 aa  193  4e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000510341 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4056  Radical SAM domain protein  32.2 
 
 
418 aa  193  4e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153991  normal  0.0464079 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2580  radical SAM domain-containing protein  31.35 
 
 
403 aa  191  1e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20747  normal  0.542097 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2305  radical SAM domain-containing protein  31.35 
 
 
403 aa  191  1e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.146682  hitchhiker  0.00602825 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4849  radical SAM domain-containing protein  33.24 
 
 
439 aa  191  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0188693  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4606  radical SAM domain-containing protein  31.57 
 
 
410 aa  190  2.9999999999999997e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1713  Radical SAM domain protein  32.35 
 
 
384 aa  189  9e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00398016  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1467  radical SAM domain-containing protein  34.91 
 
 
386 aa  181  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0281391  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0681  radical SAM domain-containing protein  30.32 
 
 
370 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0554713  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1942  hypothetical protein  34.87 
 
 
298 aa  154  2e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0818  radical SAM domain-containing protein  35.02 
 
 
539 aa  133  3.9999999999999996e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0230  hypothetical protein  29.41 
 
 
343 aa  46.6  0.0007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.896938  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3191  helix-hairpin-helix motif protein  40.98 
 
 
111 aa  46.2  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.732277 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1174  hypothetical protein  35.38 
 
 
658 aa  45.1  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0596  radical SAM domain-containing protein  27.27 
 
 
322 aa  44.7  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.351823  normal  0.189258 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0729  thiamine biosynthesis protein ThiH  26.35 
 
 
354 aa  43.9  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2471  thiazole biosynthesis protein ThiH  26.44 
 
 
372 aa  44.3  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1699  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  33.82 
 
 
181 aa  43.9  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1993  Radical SAM domain protein  28 
 
 
370 aa  43.5  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0631  radical SAM domain-containing protein  25.42 
 
 
314 aa  43.5  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0187035  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1758  DNA uptake protein and related DNA-binding proteins  43.75 
 
 
110 aa  43.1  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2745  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  35 
 
 
200 aa  42.7  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000236948  normal  0.898271 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3047  helix-hairpin-helix motif protein  35.48 
 
 
116 aa  43.1  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>