243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2787 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_2787  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 543 aa  1122    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2351  Radical SAM domain protein  30.86 
 
 		 426 aa  76.3  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4478  radical SAM family protein  31.87 
 
 		 554 aa  70.5  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.140837  normal  0.22726 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0166  radical SAM domain-containing protein  29.41 
 
 		 424 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0270  Radical SAM domain protein  29.19 
 
 		 929 aa  70.1  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.669686  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0296  radical SAM domain protein  29.41 
 
 		 438 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2336  radical SAM family Fe-S protein  29.65 
 
 		 553 aa  67  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0837539 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4030  Radical SAM domain protein  26.92 
 
 		 573 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2253  Radical SAM domain protein  27.88 
 
 		 461 aa  65.5  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000552814 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3883  radical SAM family protein  27.6 
 
 		 577 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.153148  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3991  Radical SAM domain protein  28.12 
 
 		 572 aa  64.7  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2990  Radical SAM domain protein  28.4 
 
 		 423 aa  64.7  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00051449  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4531  Radical SAM domain protein  29.3 
 
 		 533 aa  64.3  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1442  radical SAM domain-containing protein  30.36 
 
 		 457 aa  63.2  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.418493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0201  radical SAM domain-containing protein  28.24 
 
 		 484 aa  61.6  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3363  Radical SAM domain protein  25.23 
 
 		 1288 aa  61.6  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1061  cobalamin B12-binding  28.85 
 
 		 529 aa  61.2  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000412719  decreased coverage  0.00000367319 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1767  radical SAM domain-containing protein  25.26 
 
 		 503 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.580532  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2201  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  25.1 
 
 		 473 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0577  radical SAM domain-containing protein  25.26 
 
 		 473 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2859  Fe-S oxidoreductase  25.26 
 
 		 473 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0021  Radical SAM domain protein  30.72 
 
 		 445 aa  60.8  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2852  radical SAM domain-containing protein  25.26 
 
 		 481 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2737  radical SAM domain-containing protein  25.26 
 
 		 481 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2796  radical SAM domain-containing protein  25.26 
 
 		 481 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0536346  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1750  radical SAM domain-containing protein  25.26 
 
 		 473 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.499976  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3574  radical SAM domain-containing protein  32.86 
 
 		 461 aa  60.8  0.00000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2166  radical SAM family Fe-S protein  29.67 
 
 		 495 aa  60.5  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1626  Radical SAM domain protein  28.14 
 
 		 444 aa  59.7  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2062  putative methyltransferase, or Fe-S oxidoreductase  27.31 
 
 		 473 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.6809  normal  0.16843 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0385  hypothetical protein  27.31 
 
 		 473 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20660  MoaA, NifB, PqqE, radical SAM superfamily protein  24.38 
 
 		 470 aa  60.1  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1994  radical SAM domain-containing protein  28.49 
 
 		 462 aa  60.1  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.725365  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1456  radical SAM domain-containing protein  27.67 
 
 		 504 aa  58.9  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.213421  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1690  radical SAM family protein  32.14 
 
 		 428 aa  58.5  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4778  response regulator receiver protein  27.63 
 
 		 675 aa  58.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0104454 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1179  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  24.7 
 
 		 474 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.846685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2076  radical SAM domain-containing protein  33.1 
 
 		 432 aa  57.8  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00571731 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0241  BchE/P-methylase family protein  29.59 
 
 		 430 aa  57.8  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.222091  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0504  radical SAM domain-containing protein  28.65 
 
 		 471 aa  57.4  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3233  radical SAM domain-containing protein  27.89 
 
 		 531 aa  57.4  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2894  radical SAM family protein  28.42 
 
 		 613 aa  57.4  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.80419 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3130  Radical SAM domain protein  25.32 
 
 		 448 aa  57.4  0.0000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1899  radical SAM family protein  31.71 
 
 		 591 aa  57  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.807924 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3468  radical SAM family protein  30.28 
 
 		 592 aa  57  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.453671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2490  radical SAM family protein  28.09 
 
 		 605 aa  56.2  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.497518  normal  0.319547 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3408  radical SAM family protein  25.46 
 
 		 473 aa  56.6  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0875  radical SAM family Fe-S protein  30.61 
 
 		 495 aa  57  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2772  Radical SAM domain protein  28.65 
 
 		 598 aa  56.2  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0906  cobalamin B12-binding domain protein  29.11 
 
 		 456 aa  56.6  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2035  Elongator protein 3/MiaB/NifB  31.08 
 
 		 518 aa  55.8  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0832  Radical SAM domain protein  28.31 
 
 		 527 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.170506 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2147  Radical SAM domain protein  29.76 
 
 		 471 aa  56.2  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2195  Radical SAM domain protein  29.76 
 
 		 471 aa  56.2  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3058  radical SAM domain-containing protein  30.57 
 
 		 529 aa  55.5  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111955  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2205  Radical SAM domain protein  30.25 
 
 		 428 aa  55.5  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1621  Elongator protein 3/MiaB/NifB  28.03 
 
 		 522 aa  55.1  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0718144 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3422  Radical SAM domain protein  26.82 
 
 		 541 aa  55.5  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3496  radical SAM family Fe-S protein  31.14 
 
 		 437 aa  55.5  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.256122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0202  radical SAM domain-containing protein  25.27 
 
 		 454 aa  55.1  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0942  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  28.3 
 
 		 528 aa  55.1  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00162998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0308  Elongator protein 3/MiaB/NifB  30.41 
 
 		 529 aa  54.7  0.000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0799  Elongator protein 3  24.72 
 
 		 526 aa  54.7  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0831  radical SAM family protein  30.43 
 
 		 444 aa  54.7  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00311604  normal  0.515432 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0879  radical SAM family Fe-S protein  28.21 
 
 		 488 aa  54.7  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.293304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4964  radical SAM family protein  24.4 
 
 		 476 aa  54.7  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.576294  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1648  Radical SAM domain protein  27.35 
 
 		 450 aa  54.7  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0195  Radical SAM domain protein  30.99 
 
 		 431 aa  54.7  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.780626  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0797  Radical SAM domain protein  23.81 
 
 		 489 aa  54.7  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1163  Radical SAM domain protein  26.79 
 
 		 472 aa  54.3  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1243  radical SAM domain-containing protein  26.28 
 
 		 533 aa  54.3  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.445572  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0204  radical SAM domain-containing protein  30.13 
 
 		 452 aa  54.3  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.306375  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1584  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  30 
 
 		 527 aa  54.3  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4901  radical SAM family protein  25 
 
 		 474 aa  53.9  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.413487  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3585  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  26.83 
 
 		 548 aa  53.9  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0670454 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4999  Radical SAM domain protein  26.76 
 
 		 591 aa  53.9  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.694875  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4370  radical SAM domain-containing protein  26.98 
 
 		 501 aa  53.9  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4225  radical SAM domain-containing protein  23.9 
 
 		 576 aa  53.9  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.332961 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4810  radical SAM family protein  30.54 
 
 		 607 aa  53.9  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1016  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester oxidative cyclase  25.84 
 
 		 584 aa  53.9  0.000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16891  Fe-S oxidoreductase  28.22 
 
 		 539 aa  53.9  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.779533  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0249  radical SAM domain-containing protein  30.28 
 
 		 431 aa  53.5  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.178286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1735  cobalamin B12-binding domain protein  25.69 
 
 		 590 aa  52.8  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1150  oxidative cyclase-related protein  23.7 
 
 		 475 aa  52.8  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2888  B12 binding /radical SAM domain-containing protein  25.41 
 
 		 503 aa  53.5  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00308859  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3569  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  25 
 
 		 478 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.663184 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2041  radical SAM domain-containing protein  25.95 
 
 		 529 aa  53.1  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1255  radical SAM domain-containing protein  27.68 
 
 		 441 aa  53.1  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3595  Radical SAM domain protein  25.32 
 
 		 501 aa  53.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1590  Fe-S oxidoreductase  28.22 
 
 		 539 aa  53.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  hitchhiker  0.00141696  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0454  radical SAM domain-containing protein  23.9 
 
 		 576 aa  53.5  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.849524 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3614  radical SAM domain-containing protein  27.01 
 
 		 451 aa  53.5  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5168  radical SAM domain-containing protein  26.92 
 
 		 527 aa  53.1  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2089  Radical SAM domain protein  28.31 
 
 		 530 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.670556 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2281  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  28.57 
 
 		 520 aa  52.8  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1836  radical SAM domain-containing protein  22.87 
 
 		 474 aa  52.8  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3848  hypothetical protein  27.06 
 
 		 532 aa  53.5  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0151131  normal  0.930541 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2065  Radical SAM domain protein  28.31 
 
 		 530 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1163  Radical SAM domain protein  23.89 
 
 		 444 aa  52.8  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1795  cobalamin B12-binding  26.92 
 
 		 529 aa  52.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>