234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1163 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_1163  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 472 aa  969    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2253  Radical SAM domain protein  45.09 
 
 		 461 aa  397  1e-109  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000552814 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2438  radical SAM family protein  47.67 
 
 		 457 aa  393  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1520  Radical SAM domain protein  47.66 
 
 		 457 aa  385  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1442  radical SAM domain-containing protein  47.74 
 
 		 457 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.418493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1425  Radical SAM domain protein  46.27 
 
 		 457 aa  375  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2990  Radical SAM domain protein  36.9 
 
 		 423 aa  290  4e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00051449  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0166  radical SAM domain-containing protein  35.77 
 
 		 424 aa  278  1e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0296  radical SAM domain protein  35.77 
 
 		 438 aa  278  1e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1725  Radical SAM domain protein  32.47 
 
 		 438 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1100  radical SAM domain-containing protein  24.86 
 
 		 470 aa  84.3  0.000000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2387  cobalamin B12-binding domain protein  22.99 
 
 		 545 aa  82.4  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1243  radical SAM domain-containing protein  21.39 
 
 		 533 aa  81.6  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.445572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3574  radical SAM domain-containing protein  23.65 
 
 		 461 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1029  Radical SAM domain protein  24.5 
 
 		 472 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.585202  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2336  radical SAM family Fe-S protein  24.03 
 
 		 553 aa  75.9  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0837539 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3231  Radical SAM domain protein  26.16 
 
 		 472 aa  73.6  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2074  radical SAM binding protein  26.84 
 
 		 598 aa  72.8  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0385557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0643  Radical SAM domain protein  22.47 
 
 		 489 aa  73.2  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3058  radical SAM domain-containing protein  22.96 
 
 		 529 aa  70.9  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111955  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1738  cobalamin B12-binding/radical SAM domain-containing Fe-S oxidoreductase  23.01 
 
 		 521 aa  69.3  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3057  Radical SAM domain protein  24.52 
 
 		 518 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00748759  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3883  radical SAM family protein  24.63 
 
 		 577 aa  68.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.153148  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1255  radical SAM domain-containing protein  21.71 
 
 		 441 aa  68.2  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3991  Radical SAM domain protein  25.06 
 
 		 572 aa  67.8  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1200  cobalamin B12-binding domain-containing protein  22.72 
 
 		 441 aa  67.8  0.0000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1171  radical SAM family protein  24.22 
 
 		 563 aa  67.4  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000834486  normal  0.0316133 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0353  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  24.62 
 
 		 485 aa  66.2  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.90319 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3195  Radical SAM domain protein  22.22 
 
 		 552 aa  65.9  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00554212 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2963  radical SAM domain-containing protein  26.09 
 
 		 476 aa  63.9  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000286011  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0238  radical SAM domain-containing protein  23.67 
 
 		 461 aa  63.5  0.000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.140637  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0391  radical SAM domain-containing protein  26.51 
 
 		 435 aa  63.5  0.000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2638  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  24.44 
 
 		 512 aa  63.2  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3382  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  24.04 
 
 		 473 aa  62.8  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0201  radical SAM domain-containing protein  23.91 
 
 		 484 aa  61.6  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4370  radical SAM domain-containing protein  26.54 
 
 		 501 aa  61.6  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1369  radical SAM domain-containing protein  23.15 
 
 		 556 aa  60.8  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000805279  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0875  radical SAM family Fe-S protein  25.6 
 
 		 495 aa  60.8  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4030  Radical SAM domain protein  23.92 
 
 		 573 aa  60.5  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1699  Radical SAM domain protein  22.46 
 
 		 424 aa  60.5  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000206113  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2523  Radical SAM domain protein  22.64 
 
 		 424 aa  60.1  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0388324 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0780  Radical SAM domain protein  24.58 
 
 		 517 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4173  radical SAM domain-containing protein  22.13 
 
 		 513 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1648  Radical SAM domain protein  24.54 
 
 		 450 aa  59.7  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0738  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  23.31 
 
 		 515 aa  58.9  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.532709  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1897  radical SAM domain-containing protein  21.37 
 
 		 559 aa  59.3  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2566  radical SAM family protein  26.72 
 
 		 441 aa  58.9  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0261  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  23.62 
 
 		 513 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3993  Radical SAM domain protein  23.61 
 
 		 449 aa  58.2  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0878  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  23.26 
 
 		 473 aa  57.8  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.858521  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0204  radical SAM domain-containing protein  21.93 
 
 		 452 aa  57.4  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.306375  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1616  radical SAM domain-containing protein  21.11 
 
 		 559 aa  57.8  0.0000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.710753  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1123  RNA modification enzyme, MiaB family  27.27 
 
 		 433 aa  57.4  0.0000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.58425  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2416  radical SAM family protein  23.31 
 
 		 475 aa  57.4  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000137144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3608  radical SAM domain-containing protein  25.56 
 
 		 459 aa  57.4  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3090  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  21.59 
 
 		 476 aa  57  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000038537  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3233  radical SAM domain-containing protein  24.8 
 
 		 531 aa  57  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2825  radical SAM domain-containing protein  21.14 
 
 		 476 aa  56.2  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000393045  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3415  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  22.28 
 
 		 472 aa  55.1  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1701  radical SAM family protein  23.89 
 
 		 469 aa  55.1  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00126936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05330  Fe-S oxidoreductase  23.46 
 
 		 495 aa  55.8  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0247  radical SAM domain-containing protein  23.77 
 
 		 487 aa  55.1  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0873  radical SAM family Fe-S protein  23.04 
 
 		 501 aa  55.1  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0874  radical SAM family Fe-S protein  24.61 
 
 		 501 aa  55.1  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1063  Fe-S oxidoreductase  24.46 
 
 		 537 aa  54.7  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.297828  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3165  Fe-S oxidoreductase  20.72 
 
 		 459 aa  54.7  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00148517 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2566  radical SAM domain-containing protein  25.27 
 
 		 426 aa  54.3  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.162584  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2787  radical SAM domain-containing protein  26.63 
 
 		 543 aa  54.7  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1705  cobalamin B12-binding/radical SAM family protein  21.41 
 
 		 472 aa  53.9  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.900478  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3364  Radical SAM domain protein  27.13 
 
 		 564 aa  54.3  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.669906 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2315  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  21.93 
 
 		 546 aa  54.3  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.03087  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1150  oxidative cyclase-related protein  24.19 
 
 		 475 aa  53.9  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1182  MiaB-like tRNA modifying enzyme  26.1 
 
 		 441 aa  53.5  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0484271  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1994  radical SAM domain-containing protein  24.51 
 
 		 462 aa  53.9  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.725365  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0897  Radical SAM domain protein  26.6 
 
 		 564 aa  53.5  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000336813  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2195  Radical SAM domain protein  23.5 
 
 		 460 aa  53.5  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.565929  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1690  radical SAM family protein  25 
 
 		 428 aa  53.5  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3359  radical SAM family protein  24.41 
 
 		 653 aa  53.5  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.39571  normal  0.0330371 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2203  cobalamin B12-binding domain protein  23.05 
 
 		 475 aa  53.5  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  23.71 
 
 		 1250 aa  53.5  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2227  Radical SAM domain protein  23.23 
 
 		 652 aa  53.5  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1323  Radical SAM domain protein  22.02 
 
 		 360 aa  52.8  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3574  MiaB-like tRNA modifying enzyme  29.08 
 
 		 423 aa  53.1  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0270  Radical SAM domain protein  26.55 
 
 		 929 aa  52.8  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.669686  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1049  radical SAM domain-containing protein  22.41 
 
 		 398 aa  52.8  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2929  radical SAM domain-containing protein  22.13 
 
 		 497 aa  52.8  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.43282  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0944  Radical SAM domain protein  25.08 
 
 		 488 aa  52.8  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000117321 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19381  Fe-S oxidoreductase  25.17 
 
 		 537 aa  52.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1617  Radical SAM domain protein  24.85 
 
 		 469 aa  52  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0136432  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3552  Radical SAM domain protein  38.16 
 
 		 488 aa  52.4  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1602  radical SAM family Fe-S protein  23.91 
 
 		 487 aa  52.4  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0879  radical SAM family Fe-S protein  22.79 
 
 		 488 aa  52.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.293304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2283  Radical SAM domain protein  21.53 
 
 		 473 aa  52.4  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.257116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0801  hypothetical protein  23.9 
 
 		 366 aa  52.4  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000530348 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4724  Radical SAM domain protein  22.8 
 
 		 581 aa  51.6  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4516  radical SAM domain-containing protein  28.36 
 
 		 293 aa  51.6  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.193684 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0558  radical SAM domain-containing protein  23.63 
 
 		 430 aa  51.6  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.236601  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0093  Radical SAM domain protein  24.37 
 
 		 490 aa  52  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0584264  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2585  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  21.7 
 
 		 546 aa  51.6  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.908643  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0434  Radical SAM domain protein  24.52 
 
 		 432 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.216188  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>