73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1520 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1520  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 457 aa  878    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1425  Radical SAM domain protein  97.81 
 
 		 457 aa  772    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2438  radical SAM family protein  92.78 
 
 		 457 aa  754    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1442  radical SAM domain-containing protein  75.49 
 
 		 457 aa  592  1e-168  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.418493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1163  Radical SAM domain protein  47.66 
 
 		 472 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2253  Radical SAM domain protein  46.04 
 
 		 461 aa  339  5.9999999999999996e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000552814 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0296  radical SAM domain protein  34.77 
 
 		 438 aa  242  9e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2990  Radical SAM domain protein  32.45 
 
 		 423 aa  242  1e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00051449  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0166  radical SAM domain-containing protein  34.77 
 
 		 424 aa  242  1e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1725  Radical SAM domain protein  37.86 
 
 		 438 aa  218  2e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0279  radical SAM domain-containing protein  23.96 
 
 		 494 aa  69.7  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0108  radical SAM domain-containing protein  24.23 
 
 		 494 aa  69.3  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1100  radical SAM domain-containing protein  23.26 
 
 		 470 aa  67.4  0.0000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1699  Radical SAM domain protein  26.43 
 
 		 424 aa  64.7  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000206113  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2074  radical SAM binding protein  26.84 
 
 		 598 aa  62  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0385557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2638  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  27.49 
 
 		 512 aa  62.4  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3574  radical SAM domain-containing protein  19.48 
 
 		 461 aa  60.1  0.00000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0643  Radical SAM domain protein  24.02 
 
 		 489 aa  58.9  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0878  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  25.14 
 
 		 473 aa  58.9  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.858521  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1243  radical SAM domain-containing protein  23.3 
 
 		 533 aa  57.8  0.0000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.445572  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2523  Radical SAM domain protein  26.33 
 
 		 424 aa  57.8  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0388324 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2566  radical SAM family protein  26.28 
 
 		 441 aa  57.4  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0353  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  25.99 
 
 		 485 aa  57  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.90319 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3382  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  24.68 
 
 		 473 aa  56.6  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  26.29 
 
 		 1250 aa  56.6  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3993  Radical SAM domain protein  21.87 
 
 		 449 aa  55.1  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0201  radical SAM domain-containing protein  25.94 
 
 		 484 aa  53.5  0.000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0874  radical SAM family Fe-S protein  27.74 
 
 		 501 aa  53.5  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3614  radical SAM domain-containing protein  24.32 
 
 		 451 aa  52.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1123  RNA modification enzyme, MiaB family  26.8 
 
 		 433 aa  53.1  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.58425  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0434  Radical SAM domain protein  30.21 
 
 		 432 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.216188  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2351  Radical SAM domain protein  21.6 
 
 		 426 aa  52.4  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2324  radical SAM domain-containing protein  25.88 
 
 		 434 aa  52.4  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0873  radical SAM family Fe-S protein  25.4 
 
 		 501 aa  49.3  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1626  Radical SAM domain protein  27.12 
 
 		 444 aa  48.5  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3231  Radical SAM domain protein  24.18 
 
 		 472 aa  48.9  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1164  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 481 aa  48.1  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000149983  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0238  radical SAM domain-containing protein  28.21 
 
 		 461 aa  48.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.140637  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0875  radical SAM family Fe-S protein  24.72 
 
 		 495 aa  47.8  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1499  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  27.46 
 
 		 443 aa  47.8  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1537  Elongator protein 3/MiaB/NifB  21.83 
 
 		 462 aa  47.4  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.537529  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4478  radical SAM family protein  24.22 
 
 		 554 aa  47  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.140837  normal  0.22726 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1644  radical SAM domain-containing protein  24.45 
 
 		 468 aa  47.4  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3058  radical SAM domain-containing protein  25.71 
 
 		 529 aa  47  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111955  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0509  radical SAM domain-containing protein  30 
 
 		 430 aa  46.2  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1171  radical SAM family protein  23.71 
 
 		 563 aa  46.6  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000834486  normal  0.0316133 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3359  radical SAM family protein  22.11 
 
 		 653 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.39571  normal  0.0330371 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4804  tRNA-i(6)A37 modification enzyme MiaB  26.32 
 
 		 442 aa  46.2  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.557764  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0253  2-methylthioadenine synthetase  26.89 
 
 		 444 aa  45.4  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.484105  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4345  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  26.2 
 
 		 442 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0376  radical SAM domain-containing protein  25.2 
 
 		 433 aa  45.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0414491  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1128  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.96 
 
 		 446 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1029  Radical SAM domain protein  25.53 
 
 		 472 aa  45.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.585202  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2227  Radical SAM domain protein  22.61 
 
 		 652 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1757  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  18.64 
 
 		 431 aa  45.1  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0713  hypothetical protein  21.35 
 
 		 438 aa  45.1  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1701  radical SAM family protein  23.78 
 
 		 469 aa  45.1  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00126936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0963  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  22.99 
 
 		 442 aa  45.1  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1427  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  38.89 
 
 		 445 aa  44.7  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0581575  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0270  Radical SAM domain protein  22.31 
 
 		 929 aa  45.1  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.669686  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1089  radical SAM family Fe-S protein  23.22 
 
 		 591 aa  44.3  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.977516  normal  0.0200721 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1621  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  40 
 
 		 455 aa  44.3  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0278587  hitchhiker  0.00000000647105 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12350  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.84 
 
 		 446 aa  44.3  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0247  radical SAM domain-containing protein  25.64 
 
 		 487 aa  44.3  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12760  MiaB-like tRNA modifying enzyme  24.12 
 
 		 438 aa  44.3  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00265105  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1466  Radical SAM domain protein  25.2 
 
 		 467 aa  44.3  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0159808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2283  Radical SAM domain protein  23.96 
 
 		 473 aa  44.3  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.257116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1420  radical SAM domain-containing protein  24.18 
 
 		 632 aa  44.3  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1324  radical SAM domain-containing protein  24.09 
 
 		 369 aa  44.3  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.527969 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2479  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  23.08 
 
 		 484 aa  43.5  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.515921  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2083  radical SAM family protein  35.94 
 
 		 655 aa  43.5  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.986681  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0783  RNA modification enzyme, MiaB family  24.63 
 
 		 438 aa  43.1  0.009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2409  radical SAM domain-containing protein  29.21 
 
 		 495 aa  43.5  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.523158  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>