178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2253 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_2253  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 461 aa  925    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000552814 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1163  Radical SAM domain protein  45.09 
 
 		 472 aa  397  1e-109  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2438  radical SAM family protein  46.04 
 
 		 457 aa  327  4.0000000000000003e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1520  Radical SAM domain protein  46.05 
 
 		 457 aa  322  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1425  Radical SAM domain protein  46.27 
 
 		 457 aa  318  1e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1442  radical SAM domain-containing protein  45.63 
 
 		 457 aa  304  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.418493  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0166  radical SAM domain-containing protein  36.32 
 
 		 424 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0296  radical SAM domain protein  36.08 
 
 		 438 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2990  Radical SAM domain protein  32.08 
 
 		 423 aa  223  7e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00051449  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1725  Radical SAM domain protein  34.73 
 
 		 438 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3614  radical SAM domain-containing protein  25.84 
 
 		 451 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1200  cobalamin B12-binding domain-containing protein  22.99 
 
 		 441 aa  71.6  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1255  radical SAM domain-containing protein  23.08 
 
 		 441 aa  70.5  0.00000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1029  Radical SAM domain protein  24.05 
 
 		 472 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.585202  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05330  Fe-S oxidoreductase  25.79 
 
 		 495 aa  66.6  0.000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2787  radical SAM domain-containing protein  27.88 
 
 		 543 aa  65.5  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0247  radical SAM domain-containing protein  26.7 
 
 		 487 aa  63.5  0.000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2185  Radical SAM domain protein  23.96 
 
 		 473 aa  63.5  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000424629  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1414  MiaB-like tRNA modifying enzyme  24.41 
 
 		 420 aa  63.5  0.000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1182  MiaB-like tRNA modifying enzyme  27.3 
 
 		 441 aa  63.2  0.000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0484271  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3231  Radical SAM domain protein  23.46 
 
 		 472 aa  62.4  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1933  hypothetical protein  24.39 
 
 		 427 aa  62.4  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3390  MiaB-like tRNA modifying enzyme  26.74 
 
 		 426 aa  61.6  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1860  hypothetical protein  24.39 
 
 		 427 aa  62.4  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.17951  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3574  radical SAM domain-containing protein  22.1 
 
 		 461 aa  60.5  0.00000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3205  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  28.73 
 
 		 447 aa  58.9  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.112948  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2948  MiaB-like tRNA modifying enzyme  27.87 
 
 		 410 aa  59.3  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.736746  hitchhiker  0.001764 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2351  Radical SAM domain protein  20.78 
 
 		 426 aa  58.9  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1898  Radical SAM domain protein  29.61 
 
 		 459 aa  58.9  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2873  radical SAM domain-containing protein  23.28 
 
 		 520 aa  58.5  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000297506  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1100  radical SAM domain-containing protein  21.43 
 
 		 470 aa  58.2  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2810  MiaB-like tRNA modifying enzyme  25.68 
 
 		 421 aa  57.8  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.756102  normal  0.266811 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0373  putative MiaB-like tRNA modifying enzyme  26.22 
 
 		 434 aa  57.8  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215959  normal  0.928701 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1016  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester oxidative cyclase  24.77 
 
 		 584 aa  57.4  0.0000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4866  MiaB-like tRNA modifying enzyme  26.7 
 
 		 449 aa  57.4  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0926  MiaB-like tRNA modifying enzyme  23.34 
 
 		 427 aa  57  0.0000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.084888  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0738  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  23.76 
 
 		 515 aa  55.8  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.532709  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1705  cobalamin B12-binding/radical SAM family protein  22.32 
 
 		 472 aa  56.2  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.900478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2721  MiaB-like tRNA modifying enzyme  27.78 
 
 		 410 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2205  Radical SAM domain protein  25.88 
 
 		 428 aa  55.5  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0238  radical SAM domain-containing protein  23.05 
 
 		 461 aa  55.1  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.140637  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2980  MiaB-like tRNA modifying enzyme  26.28 
 
 		 425 aa  54.7  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.065406 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3415  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  24.87 
 
 		 472 aa  54.7  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0214  MiaB-like tRNA modifying enzyme  24.92 
 
 		 420 aa  54.3  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0176423 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2283  Radical SAM domain protein  25.56 
 
 		 473 aa  54.3  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.257116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0412  MiaB-like tRNA modifying enzyme  28.42 
 
 		 437 aa  54.3  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.908018  normal  0.498454 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0248  BchE/P-methylase family protein  26.48 
 
 		 428 aa  53.9  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0270  Radical SAM domain protein  25.7 
 
 		 929 aa  53.5  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.669686  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0831  radical SAM family protein  25 
 
 		 444 aa  53.5  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00311604  normal  0.515432 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1849  MiaB-like tRNA modifying enzyme  27.72 
 
 		 433 aa  53.5  0.000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.922054 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2843  MiaB-like tRNA modifying enzyme  27 
 
 		 410 aa  53.5  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.495489  normal  0.451673 
 
 
-
 
NC_002978  WD0503  MiaB-like tRNA modifying enzyme  24.61 
 
 		 408 aa  52.8  0.00001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1123  RNA modification enzyme, MiaB family  27.37 
 
 		 433 aa  53.1  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.58425  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0201  radical SAM domain-containing protein  26.45 
 
 		 484 aa  53.1  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2566  radical SAM family protein  20.82 
 
 		 441 aa  53.1  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4070  MiaB-like tRNA modifying enzyme  25.34 
 
 		 424 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3611  radical SAM domain-containing protein  25.39 
 
 		 429 aa  52.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3405  MiaB-like tRNA modifying enzyme  27.91 
 
 		 435 aa  53.1  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.227449 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3387  Radical SAM domain protein  24.36 
 
 		 557 aa  52.4  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.384607  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3130  Radical SAM domain protein  20.64 
 
 		 448 aa  52.4  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1055  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  25.76 
 
 		 510 aa  52  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0352  RNA modification enzyme, MiaB family  22.39 
 
 		 458 aa  52.4  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.135679  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0018  MiaB family tRNA modification protein  26.42 
 
 		 427 aa  52  0.00002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1648  Radical SAM domain protein  25.93 
 
 		 450 aa  52  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1243  radical SAM domain-containing protein  18.06 
 
 		 533 aa  52.4  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.445572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0021  Radical SAM domain protein  22.46 
 
 		 445 aa  52.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3593  radical SAM domain-containing protein  25.17 
 
 		 472 aa  52  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000974767  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2497  MiaB-like tRNA modifying enzyme  27.46 
 
 		 411 aa  52.4  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0715823  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0643  Radical SAM domain protein  21.97 
 
 		 489 aa  52  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1626  Radical SAM domain protein  24.56 
 
 		 444 aa  52  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3058  radical SAM domain-containing protein  23.96 
 
 		 529 aa  52.4  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111955  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0360  MiaB-like tRNA modifying enzyme  25.59 
 
 		 422 aa  51.6  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.106341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0407  hypothetical protein  28.86 
 
 		 294 aa  51.6  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1735  cobalamin B12-binding domain protein  24.76 
 
 		 590 aa  51.2  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4478  radical SAM family protein  26.51 
 
 		 554 aa  50.8  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.140837  normal  0.22726 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3993  Radical SAM domain protein  20.08 
 
 		 449 aa  50.8  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0920  radical SAM domain-containing protein  29.26 
 
 		 451 aa  50.4  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2281  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  25.26 
 
 		 520 aa  50.4  0.00006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1994  radical SAM domain-containing protein  24.73 
 
 		 462 aa  50.4  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.725365  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0252  MiaB-like tRNA modifying enzyme  27.47 
 
 		 423 aa  50.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0859  Radical SAM domain protein  23.96 
 
 		 557 aa  50.4  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2204  Radical SAM domain protein  24.63 
 
 		 426 aa  50.1  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1621  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  26.05 
 
 		 455 aa  50.1  0.00009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0278587  hitchhiker  0.00000000647105 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3555  Radical SAM domain protein  25.71 
 
 		 448 aa  50.1  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1699  Radical SAM domain protein  24.21 
 
 		 424 aa  49.7  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000206113  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2775  2-methylthioadenine synthetase  24.92 
 
 		 422 aa  49.7  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.254506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2738  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  24.45 
 
 		 447 aa  49.7  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000461297  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2487  Fe-S oxidoreductase  24.36 
 
 		 609 aa  49.7  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2203  cobalamin B12-binding domain protein  23.32 
 
 		 475 aa  49.3  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0316  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  24.91 
 
 		 567 aa  49.7  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4370  radical SAM domain-containing protein  25.91 
 
 		 501 aa  49.7  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2594  MiaB-like tRNA modifying enzyme  26.1 
 
 		 425 aa  49.7  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.858187 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6404  Mg-protoporphyrin IX monomethyl ester oxidative cyclase 66kD subunit  22.79 
 
 		 534 aa  49.7  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3747  MiaB-like tRNA modifying enzyme  23.16 
 
 		 424 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.771272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1742  radical SAM domain-containing protein  23.88 
 
 		 521 aa  49.7  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3585  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  21.83 
 
 		 548 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0670454 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4173  radical SAM domain-containing protein  24.04 
 
 		 513 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2195  Radical SAM domain protein  24.7 
 
 		 460 aa  49.3  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.565929  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0522  MiaB-like tRNA modifying enzyme  27.57 
 
 		 420 aa  48.9  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5336  MiaB-like tRNA modifying enzyme  26.03 
 
 		 408 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>