61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_1425 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_2438  radical SAM family protein  93.22 
 
 
457 aa  753    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1520  Radical SAM domain protein  97.81 
 
 
457 aa  789    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1425  Radical SAM domain protein  100 
 
 
457 aa  875    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1442  radical SAM domain-containing protein  75.71 
 
 
457 aa  591  1e-168  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.418493  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1163  Radical SAM domain protein  46.7 
 
 
472 aa  415  9.999999999999999e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2253  Radical SAM domain protein  46.26 
 
 
461 aa  341  2e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000552814 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0296  radical SAM domain protein  34.86 
 
 
438 aa  246  4e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0166  radical SAM domain-containing protein  34.86 
 
 
424 aa  246  4e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2990  Radical SAM domain protein  32.45 
 
 
423 aa  242  7.999999999999999e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00051449  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1725  Radical SAM domain protein  37.86 
 
 
438 aa  221  3e-56  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1100  radical SAM domain-containing protein  23.55 
 
 
470 aa  67.4  0.0000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0108  radical SAM domain-containing protein  23.68 
 
 
494 aa  66.2  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0279  radical SAM domain-containing protein  23.4 
 
 
494 aa  66.2  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2566  radical SAM family protein  28.21 
 
 
441 aa  62.8  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1699  Radical SAM domain protein  25.51 
 
 
424 aa  61.2  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000206113  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3574  radical SAM domain-containing protein  19.59 
 
 
461 aa  60.8  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2638  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  27.49 
 
 
512 aa  60.8  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2523  Radical SAM domain protein  25.22 
 
 
424 aa  60.5  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0388324 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0878  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  24.86 
 
 
473 aa  57.8  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.858521  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2074  radical SAM binding protein  26.55 
 
 
598 aa  57  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0385557  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0643  Radical SAM domain protein  23.42 
 
 
489 aa  55.5  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3993  Radical SAM domain protein  21.87 
 
 
449 aa  55.1  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3382  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  24.14 
 
 
473 aa  54.7  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  25.77 
 
 
1250 aa  54.3  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1243  radical SAM domain-containing protein  22.96 
 
 
533 aa  53.1  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.445572  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3231  Radical SAM domain protein  24.91 
 
 
472 aa  51.2  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0201  radical SAM domain-containing protein  25.6 
 
 
484 aa  51.2  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3614  radical SAM domain-containing protein  25.25 
 
 
451 aa  51.2  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1123  RNA modification enzyme, MiaB family  26.4 
 
 
433 aa  51.2  0.00004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.58425  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2351  Radical SAM domain protein  24.22 
 
 
426 aa  50.4  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0873  radical SAM family Fe-S protein  26.98 
 
 
501 aa  49.7  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2324  radical SAM domain-containing protein  25.38 
 
 
434 aa  49.7  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0874  radical SAM family Fe-S protein  26.45 
 
 
501 aa  48.5  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1164  Radical SAM domain protein  25 
 
 
481 aa  48.5  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000149983  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05330  Fe-S oxidoreductase  24.67 
 
 
495 aa  48.5  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0875  radical SAM family Fe-S protein  24.72 
 
 
495 aa  48.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1029  Radical SAM domain protein  25.19 
 
 
472 aa  48.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.585202  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4478  radical SAM family protein  28.06 
 
 
554 aa  47.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.140837  normal  0.22726 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1537  Elongator protein 3/MiaB/NifB  21.4 
 
 
462 aa  47.4  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.537529  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0434  Radical SAM domain protein  28.94 
 
 
432 aa  46.2  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.216188  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3058  radical SAM domain-containing protein  25.71 
 
 
529 aa  46.6  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111955  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12760  MiaB-like tRNA modifying enzyme  25.31 
 
 
438 aa  45.8  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00265105  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1063  Fe-S oxidoreductase  23.53 
 
 
537 aa  45.8  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.297828  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1701  radical SAM family protein  24.29 
 
 
469 aa  45.1  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00126936  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1466  Radical SAM domain protein  25.2 
 
 
467 aa  45.1  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0159808  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00191  Mg-protoporphyrin IX monomethyl ester oxidative cyclase  25.6 
 
 
506 aa  45.1  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1644  radical SAM domain-containing protein  24.5 
 
 
468 aa  45.1  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2083  radical SAM family protein  35.94 
 
 
655 aa  44.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.986681  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1621  MiaB-like tRNA modifying enzyme YliG  40 
 
 
455 aa  44.3  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0278587  hitchhiker  0.00000000647105 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3359  radical SAM family protein  21.61 
 
 
653 aa  43.9  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.39571  normal  0.0330371 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3555  Radical SAM domain protein  24.6 
 
 
448 aa  43.9  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1420  radical SAM domain-containing protein  23.14 
 
 
632 aa  43.9  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19381  Fe-S oxidoreductase  21.83 
 
 
537 aa  43.5  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1626  Radical SAM domain protein  25.42 
 
 
444 aa  43.5  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2227  Radical SAM domain protein  22.11 
 
 
652 aa  43.5  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0276  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  24.16 
 
 
443 aa  43.5  0.008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0476614  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0278  (dimethylallyl)adenosine tRNA methylthiotransferase  24.16 
 
 
443 aa  43.5  0.008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1427  tRNA-i(6)A37 thiotransferase enzyme MiaB  37.04 
 
 
445 aa  43.5  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0581575  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2409  radical SAM domain-containing protein  28.97 
 
 
495 aa  43.5  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.523158  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0879  radical SAM family Fe-S protein  23.46 
 
 
488 aa  43.1  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.293304  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0783  RNA modification enzyme, MiaB family  24.75 
 
 
438 aa  43.1  0.01  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>