235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_2990 on replicon NC_013206
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013206  Aaci_2990  Radical SAM domain protein  100 
 
 
423 aa  877    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00051449  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0166  radical SAM domain-containing protein  64.62 
 
 
424 aa  589  1e-167  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0296  radical SAM domain protein  64.39 
 
 
438 aa  588  1e-167  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1163  Radical SAM domain protein  36.9 
 
 
472 aa  290  3e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2253  Radical SAM domain protein  32.08 
 
 
461 aa  223  6e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000552814 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1520  Radical SAM domain protein  32.69 
 
 
457 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1442  radical SAM domain-containing protein  32.92 
 
 
457 aa  213  5.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.418493  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2438  radical SAM family protein  31.49 
 
 
457 aa  208  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1425  Radical SAM domain protein  30.99 
 
 
457 aa  206  5e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1725  Radical SAM domain protein  36.78 
 
 
438 aa  169  8e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0780  Radical SAM domain protein  24.47 
 
 
517 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1738  cobalamin B12-binding/radical SAM domain-containing Fe-S oxidoreductase  23.95 
 
 
521 aa  87  6e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0738  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  24.93 
 
 
515 aa  86.3  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.532709  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4173  radical SAM domain-containing protein  24.7 
 
 
513 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0261  radical SAM domain/B12 binding domain-containing protein  23.49 
 
 
513 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3883  radical SAM family protein  24.05 
 
 
577 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.153148  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3239  Radical SAM domain protein  23.81 
 
 
513 aa  80.9  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0952946  normal  0.844085 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1100  radical SAM domain-containing protein  22.89 
 
 
470 aa  80.1  0.00000000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3991  Radical SAM domain protein  23.57 
 
 
572 aa  79  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4030  Radical SAM domain protein  23.1 
 
 
573 aa  77  0.0000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2315  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  24.65 
 
 
546 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.03087  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2387  cobalamin B12-binding domain protein  23.67 
 
 
545 aa  73.9  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0353  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  26.17 
 
 
485 aa  73.6  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.90319 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2336  radical SAM family Fe-S protein  23.71 
 
 
553 aa  73.2  0.000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0837539 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1243  radical SAM domain-containing protein  21.99 
 
 
533 aa  71.6  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.445572  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0893  Radical SAM domain protein  22.19 
 
 
681 aa  71.6  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.878222  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0251  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  23.01 
 
 
546 aa  69.3  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.42517  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2585  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  24.65 
 
 
546 aa  69.7  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.908643  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2158  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  22.03 
 
 
546 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.1157  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0204  radical SAM domain-containing protein  23.08 
 
 
452 aa  67.8  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.306375  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0512  Radical SAM domain protein  23.94 
 
 
486 aa  66.6  0.0000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1976  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  23.1 
 
 
546 aa  66.2  0.0000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.175578  normal  0.725626 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2496  radical SAM family protein  21.88 
 
 
502 aa  66.2  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.442433  normal  0.964674 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3863  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  27.79 
 
 
580 aa  66.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0582854  normal  0.393497 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1487  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  25.82 
 
 
567 aa  66.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0671  Radical SAM domain protein  21.81 
 
 
468 aa  65.5  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0229  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  23.1 
 
 
547 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3038  radical SAM family Fe-S protein  22.16 
 
 
523 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.345739  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2281  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  24.93 
 
 
520 aa  65.5  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3102  radical SAM domain-containing protein  21.56 
 
 
487 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0762  Fe-S oxidoreductase  22.08 
 
 
484 aa  65.1  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.151938  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2787  radical SAM domain-containing protein  28.4 
 
 
543 aa  64.7  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3058  radical SAM domain-containing protein  21.64 
 
 
529 aa  64.7  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111955  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3195  Radical SAM domain protein  22.65 
 
 
552 aa  63.9  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00554212 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1864  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  26.1 
 
 
565 aa  64.3  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.599667  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3812  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  24.78 
 
 
569 aa  64.3  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4478  radical SAM family protein  22.33 
 
 
554 aa  64.3  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.140837  normal  0.22726 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3304  Radical SAM domain protein  23.16 
 
 
487 aa  63.9  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.542811  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3553  Radical SAM domain protein  25.52 
 
 
474 aa  63.5  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2450  radical SAM domain-containing protein  24.52 
 
 
590 aa  63.5  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.271447 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0270  Radical SAM domain protein  26.51 
 
 
929 aa  63.5  0.000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.669686  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3574  radical SAM domain-containing protein  21.39 
 
 
461 aa  63.2  0.000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1338  radical SAM/B12 binding domain protein  23.28 
 
 
494 aa  62.8  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_101  radical SAM/B12 binding domain protein  23.28 
 
 
494 aa  62.8  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2963  radical SAM domain-containing protein  21.48 
 
 
476 aa  63.2  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000286011  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0944  Radical SAM domain protein  23.01 
 
 
488 aa  62.8  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000117321 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3993  Radical SAM domain protein  26.67 
 
 
449 aa  62  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3585  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  23.53 
 
 
548 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0670454 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0689  Radical SAM domain protein  23.14 
 
 
459 aa  61.6  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2209  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  23.68 
 
 
546 aa  60.5  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.561885  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05330  Fe-S oxidoreductase  22.68 
 
 
495 aa  60.5  0.00000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0879  radical SAM family Fe-S protein  23.15 
 
 
488 aa  60.8  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.293304  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0797  Radical SAM domain protein  25.31 
 
 
489 aa  60.5  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1014  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  22.96 
 
 
600 aa  60.5  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.770044  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0942  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  24.72 
 
 
528 aa  60.1  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00162998  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2566  radical SAM domain-containing protein  23.42 
 
 
426 aa  60.1  0.00000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.162584  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4087  radical SAM domain-containing protein  21.67 
 
 
458 aa  59.3  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0901376 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1584  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  23.88 
 
 
527 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0643  Radical SAM domain protein  20.96 
 
 
489 aa  58.5  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2637  putative anaerobic magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester [oxidative] cyclase  22.86 
 
 
547 aa  58.5  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.166489 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0281  magnesium-protoporphyrin IX monomethylester oxidative cyclase, 66 kDa subunit(bchE)  20.73 
 
 
612 aa  58.9  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.416035  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1924  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  20.73 
 
 
612 aa  58.9  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.145036  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0906  cobalamin B12-binding domain protein  22.32 
 
 
456 aa  58.2  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0986  radical SAM domain-containing protein  23.14 
 
 
600 aa  58.2  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0874  radical SAM family Fe-S protein  21.41 
 
 
501 aa  58.2  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4778  response regulator receiver protein  22.41 
 
 
675 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0104454 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2203  cobalamin B12-binding domain protein  23.5 
 
 
475 aa  58.2  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2566  radical SAM family protein  24.19 
 
 
441 aa  58.2  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0108  radical SAM domain-containing protein  23.79 
 
 
494 aa  58.2  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0279  radical SAM domain-containing protein  23.27 
 
 
494 aa  58.2  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2185  Radical SAM domain protein  21.08 
 
 
473 aa  57  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000424629  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0247  radical SAM domain-containing protein  22.5 
 
 
487 aa  56.6  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3090  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  22.4 
 
 
476 aa  55.8  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000038537  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1701  radical SAM family protein  23.35 
 
 
469 aa  55.8  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00126936  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3608  radical SAM domain-containing protein  23.91 
 
 
459 aa  55.8  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1150  oxidative cyclase-related protein  26.29 
 
 
475 aa  55.1  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2416  radical SAM family protein  24.08 
 
 
475 aa  55.5  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000137144  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4225  radical SAM domain-containing protein  29.02 
 
 
576 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.332961 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0504  radical SAM domain-containing protein  22.95 
 
 
471 aa  55.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2873  radical SAM domain-containing protein  21.91 
 
 
520 aa  54.7  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000297506  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3614  radical SAM domain-containing protein  23.21 
 
 
451 aa  54.7  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0878  hopanoid biosynthesis associated radical SAM protein HpnJ  20.86 
 
 
473 aa  54.7  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.858521  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0454  radical SAM domain-containing protein  28.5 
 
 
576 aa  55.1  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.849524 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0873  radical SAM family Fe-S protein  23.28 
 
 
501 aa  54.7  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2577  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester (oxidative) cyclase  20.42 
 
 
674 aa  55.1  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.451691  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1625  magnesium-protoporphyrin IX monomethyl ester anaerobic oxidative cyclase  23.17 
 
 
558 aa  54.7  0.000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6404  Mg-protoporphyrin IX monomethyl ester oxidative cyclase 66kD subunit  22.73 
 
 
534 aa  55.1  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1029  Radical SAM domain protein  24.92 
 
 
472 aa  54.7  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.585202  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1200  cobalamin B12-binding domain-containing protein  20.23 
 
 
441 aa  54.3  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2167  radical SAM family protein  22.86 
 
 
444 aa  54.3  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.208329  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>