34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1725 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1725  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 438 aa  862    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1163  Radical SAM domain protein  32.33 
 
 		 472 aa  204  2e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1442  radical SAM domain-containing protein  39.8 
 
 		 457 aa  203  6e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.418493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2253  Radical SAM domain protein  34.95 
 
 		 461 aa  202  7e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000552814 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2438  radical SAM family protein  38.24 
 
 		 457 aa  200  3e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1425  Radical SAM domain protein  36.85 
 
 		 457 aa  196  7e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1520  Radical SAM domain protein  37.86 
 
 		 457 aa  194  4e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2990  Radical SAM domain protein  30.07 
 
 		 423 aa  173  3.9999999999999995e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00051449  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0166  radical SAM domain-containing protein  25.74 
 
 		 424 aa  154  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0296  radical SAM domain protein  25.74 
 
 		 438 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2873  radical SAM domain-containing protein  25.7 
 
 		 520 aa  58.9  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000297506  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1100  radical SAM domain-containing protein  22.5 
 
 		 470 aa  58.2  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3231  Radical SAM domain protein  25.45 
 
 		 472 aa  51.6  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1029  Radical SAM domain protein  24.39 
 
 		 472 aa  50.8  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.585202  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2654  Radical SAM domain protein  27.33 
 
 		 291 aa  50.1  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000344406  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2227  radical SAM domain-containing protein  27.65 
 
 		 342 aa  49.3  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.775407  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24530  Fe-S oxidoreductase  29.45 
 
 		 293 aa  49.3  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4478  radical SAM family protein  24.5 
 
 		 554 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.140837  normal  0.22726 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0797  Radical SAM domain protein  22.71 
 
 		 489 aa  48.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1975  Radical SAM domain protein  22.1 
 
 		 468 aa  47.4  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00675749  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0558  radical SAM domain-containing protein  25.41 
 
 		 430 aa  46.6  0.0009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.236601  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1151  Radical SAM domain protein  25.81 
 
 		 291 aa  46.2  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.388903 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0407  hypothetical protein  26.9 
 
 		 294 aa  46.2  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1640  radical SAM domain-containing protein  28.97 
 
 		 297 aa  45.8  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.387627  normal  0.955096 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2387  cobalamin B12-binding domain protein  22.91 
 
 		 545 aa  45.1  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1243  radical SAM domain-containing protein  20.3 
 
 		 533 aa  45.4  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.445572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0799  Elongator protein 3  24.14 
 
 		 526 aa  44.7  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0308  Elongator protein 3/MiaB/NifB  23.87 
 
 		 529 aa  44.7  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2035  Elongator protein 3/MiaB/NifB  23.77 
 
 		 518 aa  44.3  0.005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2283  Radical SAM domain protein  22.84 
 
 		 473 aa  43.9  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.257116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3151  radical SAM domain-containing protein  29.52 
 
 		 351 aa  43.9  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0207208  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0504  radical SAM domain-containing protein  20.25 
 
 		 471 aa  43.1  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1063  Fe-S oxidoreductase  24.17 
 
 		 537 aa  43.1  0.01  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.297828  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1855  radical SAM family protein  22.57 
 
 		 638 aa  43.1  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.357803 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>