53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_3838 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_3838  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 156 aa  319  8e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0486  radical SAM domain-containing protein  95.17 
 
 		 295 aa  281  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3965  radical SAM domain-containing protein  95.17 
 
 		 295 aa  281  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0530  radical SAM domain-containing protein  92.41 
 
 		 295 aa  271  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3501  radical SAM domain-containing protein  92.41 
 
 		 295 aa  271  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0528  hypothetical protein  86.21 
 
 		 295 aa  254  3e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0456  radical SAM domain-containing protein  78.32 
 
 		 309 aa  228  3e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0453  radical SAM domain-containing protein  76.22 
 
 		 294 aa  222  2e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0407  hypothetical protein  74.13 
 
 		 294 aa  221  4e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4516  radical SAM domain-containing protein  74.83 
 
 		 293 aa  220  4.9999999999999996e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.193684 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3076  radical SAM family protein  78.32 
 
 		 292 aa  218  1.9999999999999999e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0110421  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3411  Elongator protein 3/MiaB/NifB  73.43 
 
 		 257 aa  207  4e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3395  radical SAM domain-containing protein  73.43 
 
 		 292 aa  191  2e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00495336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1475  radical SAM domain-containing protein  62.94 
 
 		 298 aa  187  5.999999999999999e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0640288  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25810  hypothetical protein  62.94 
 
 		 298 aa  169  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.723648  normal  0.254703 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2205  hypothetical protein  62.94 
 
 		 298 aa  169  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42445  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1640  radical SAM domain-containing protein  61.38 
 
 		 297 aa  168  3e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.387627  normal  0.955096 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1360  radical SAM domain-containing protein  63.51 
 
 		 300 aa  157  4e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.397431  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1884  radical SAM family protein  57.24 
 
 		 296 aa  150  5.9999999999999996e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.295187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3046  radical SAM family protein  41.26 
 
 		 293 aa  88.2  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1151  Radical SAM domain protein  34.75 
 
 		 291 aa  87  8e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.388903 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0919  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, Fe-S oxidoreductase  37.23 
 
 		 292 aa  87  9e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2142  Radical SAM domain protein  34.59 
 
 		 291 aa  84.7  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.608518  decreased coverage  0.00173745 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2654  Radical SAM domain protein  36.76 
 
 		 291 aa  83.6  9e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000344406  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2529  radical SAM domain-containing protein  41.32 
 
 		 296 aa  81.3  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.496911  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0365  radical SAM domain-containing protein  34.56 
 
 		 289 aa  75.1  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00570597  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0717  radical SAM domain-containing protein  33.09 
 
 		 292 aa  74.3  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2989  radical SAM domain-containing protein  37.6 
 
 		 293 aa  71.6  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000144866  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0173  radical SAM domain-containing protein  33.83 
 
 		 292 aa  71.6  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000741532  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0443  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, putative  34.35 
 
 		 291 aa  70.5  0.000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3790  Radical SAM domain protein  37.61 
 
 		 338 aa  69.3  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.135303  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3059  radical SAM domain-containing protein  36.36 
 
 		 293 aa  68.9  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0423  radical SAM family protein  34.38 
 
 		 293 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2963  radical SAM domain-containing protein  36.24 
 
 		 293 aa  65.9  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.854509 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3668  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 293 aa  64.7  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000789266  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0657  Radical SAM domain protein  35.83 
 
 		 292 aa  64.3  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0201  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 293 aa  63.9  0.0000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2999  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase putative  32.26 
 
 		 388 aa  62.4  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1162  Radical SAM domain protein  33.07 
 
 		 295 aa  60.8  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0199468 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1410  Radical SAM domain protein  31.36 
 
 		 377 aa  58.9  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3100  Radical SAM domain protein  31.5 
 
 		 295 aa  57.8  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.358776  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3617  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase, Fe-S oxidoreductase  37.74 
 
 		 293 aa  57  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2265  Radical SAM domain protein  34.75 
 
 		 293 aa  56.6  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2870  Radical SAM domain protein  29.31 
 
 		 373 aa  56.2  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.578576 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1744  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 380 aa  54.7  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00743194  decreased coverage  0.000183859 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26860  Fe-S oxidoreductase  28.69 
 
 		 291 aa  52  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2726  Radical SAM domain protein  30.09 
 
 		 399 aa  51.2  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3023  radical SAM domain-containing protein  36.92 
 
 		 386 aa  50.4  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1505  radical SAM domain-containing protein  25.81 
 
 		 292 aa  48.9  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00044584 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25530  Fe-S oxidoreductase  28.45 
 
 		 308 aa  48.1  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.261112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02260  Fe-S oxidoreductase  27.27 
 
 		 293 aa  48.1  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04170  Fe-S oxidoreductase  28.09 
 
 		 293 aa  42.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.63469 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13790  Fe-S oxidoreductase  27.21 
 
 		 297 aa  41.6  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>