261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1303 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_1303  FO synthase subunit 2  100 
 
 
356 aa  741    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3416  FO synthase subunit 2  64.23 
 
 
376 aa  500  1e-140  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.90673  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3417  FO synthase subunit 2  57.63 
 
 
384 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.1497 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1304  FO synthase subunit 2  54.52 
 
 
356 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1621  FO synthase subunit 2  54.29 
 
 
359 aa  361  8e-99  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0893  FO synthase subunit 2  53.14 
 
 
359 aa  359  4e-98  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1053  FO synthase subunit 2  52.86 
 
 
370 aa  354  1e-96  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0284  radical SAM domain-containing protein  48.08 
 
 
358 aa  354  1e-96  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1071  FO synthase subunit 2  52.24 
 
 
359 aa  347  2e-94  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0750  FO synthase subunit 2  50.85 
 
 
362 aa  343  4e-93  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.054782  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0592  radical SAM domain-containing protein  48.17 
 
 
419 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0059  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  48.04 
 
 
453 aa  325  1e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4032  FO synthase  48.92 
 
 
859 aa  316  4e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.249392  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4107  FO synthase  48.92 
 
 
859 aa  316  4e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4262  FO synthase  48.92 
 
 
859 aa  316  5e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0918112 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11198  FO synthase  46.72 
 
 
856 aa  312  3.9999999999999997e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.152769  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2623  Radical SAM domain protein  47.56 
 
 
800 aa  311  1e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000614503  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2167  FO synthase  47.85 
 
 
859 aa  311  1e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0462649 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4533  FO synthase  47.99 
 
 
859 aa  308  6.999999999999999e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434673  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4048  hypothetical protein  44.96 
 
 
429 aa  306  3e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.129032  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0975  FO synthase  45.92 
 
 
792 aa  305  8.000000000000001e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.156535  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3619  FO synthase  46.44 
 
 
841 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0814  FO synthase  45.82 
 
 
842 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.333048  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4075  Radical SAM domain protein  46.8 
 
 
859 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1115  radical SAM domain-containing protein  45.24 
 
 
418 aa  303  3.0000000000000004e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4252  Radical SAM domain protein  47.68 
 
 
435 aa  301  1e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238128  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1376  FO synthase  46.48 
 
 
867 aa  300  2e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4423  FO synthase  45.02 
 
 
820 aa  298  7e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308289  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5865  FO synthase  45.57 
 
 
944 aa  298  7e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.342546  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1148  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  46.63 
 
 
863 aa  298  1e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.064662  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0745  FO synthase  42.86 
 
 
899 aa  295  6e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0888  FO synthase  45.57 
 
 
836 aa  295  1e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0248143 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51122  predicted protein  45.02 
 
 
841 aa  294  2e-78  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0345053 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1483  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  45.09 
 
 
872 aa  293  4e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0863  FO synthase  45.26 
 
 
852 aa  291  1e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.241376  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0946  FO synthase  45.57 
 
 
860 aa  291  2e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0717  FO synthase  46.34 
 
 
779 aa  289  5.0000000000000004e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00851827 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8766  FO synthase  45.03 
 
 
857 aa  288  8e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.977085  normal  0.875781 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0746  radical SAM domain-containing protein  46.79 
 
 
881 aa  288  9e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.331413 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3771  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  43.91 
 
 
875 aa  286  4e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2519  FO synthase  43.34 
 
 
871 aa  286  5e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.391262  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0441  radical SAM domain-containing protein  40.34 
 
 
361 aa  285  8e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3391  hypothetical protein  40.62 
 
 
360 aa  285  8e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.352496  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0769  FO synthase  45.06 
 
 
884 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0435943  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0048  radical SAM domain-containing protein  41.86 
 
 
367 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1089  radical SAM domain-containing protein  41.16 
 
 
368 aa  282  6.000000000000001e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2970  hypothetical protein  38.76 
 
 
366 aa  279  5e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0040  radical SAM domain-containing protein  42.07 
 
 
362 aa  279  5e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1450  Radical SAM domain protein  40.98 
 
 
368 aa  279  7e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000839661  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4262  Radical SAM domain protein  43.6 
 
 
826 aa  278  1e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.296294  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6472  FO synthase  44.79 
 
 
838 aa  278  1e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3040  FO synthase subunit 2  41.29 
 
 
384 aa  276  3e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.591688  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0234  Radical SAM domain protein  38.68 
 
 
358 aa  276  4e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3080  FO synthase subunit 2  41.57 
 
 
384 aa  276  5e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2193  radical SAM domain-containing protein  41.23 
 
 
355 aa  275  6e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0218  Radical SAM domain protein  38.38 
 
 
358 aa  275  9e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1072  FO synthase subunit 2  43.62 
 
 
358 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1645  Radical SAM domain protein  40.34 
 
 
358 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000004914  hitchhiker  0.00000000624327 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0625  Radical SAM domain protein  39.78 
 
 
359 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.834734  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0050  Radical SAM domain protein  42.57 
 
 
365 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3281  FO synthase subunit 2  41.53 
 
 
381 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.370195  normal  0.662491 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1499  Radical SAM domain protein  40.97 
 
 
373 aa  273  3e-72  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0320  hypothetical protein  42.59 
 
 
355 aa  273  5.000000000000001e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000157308  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2195  radical SAM domain-containing protein  39.27 
 
 
367 aa  272  6e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4284  radical SAM domain-containing protein  40 
 
 
360 aa  271  1e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1434  FO synthase subunit 2  41.37 
 
 
376 aa  271  1e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1643  Radical SAM domain protein  39.83 
 
 
367 aa  271  2e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000555203  hitchhiker  0.00000328368 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3578  radical SAM domain-containing protein  41.28 
 
 
359 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0038  radical SAM domain-containing protein  41.21 
 
 
362 aa  269  4e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1271  radical SAM domain-containing protein  37.9 
 
 
367 aa  265  1e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0775  FO synthase subunit 2  41.96 
 
 
391 aa  265  1e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.848355  hitchhiker  0.00153433 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0194  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  41.37 
 
 
382 aa  263  3e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.200924  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0671  Radical SAM domain protein  42.36 
 
 
355 aa  261  8.999999999999999e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4285  radical SAM domain-containing protein  39.94 
 
 
364 aa  260  2e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0686  FO synthase subunit 2  40.83 
 
 
386 aa  261  2e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0411  Radical SAM domain protein  39.48 
 
 
364 aa  258  1e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2881  hypothetical protein  43.17 
 
 
348 aa  258  1e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0235  Radical SAM domain protein  39.89 
 
 
357 aa  258  1e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.568527  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0442  radical SAM domain-containing protein  38.4 
 
 
354 aa  257  2e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2116  FO synthase subunit 2  40.46 
 
 
398 aa  257  2e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1157  radical SAM domain-containing protein  40.91 
 
 
359 aa  257  2e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.423135  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1091  radical SAM domain-containing protein  41.9 
 
 
356 aa  257  2e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4090  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  40.4 
 
 
737 aa  257  2e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0388859 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0798  hypothetical protein  38.96 
 
 
371 aa  257  3e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.22786  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4467  radical SAM domain-containing protein  38.06 
 
 
396 aa  256  4e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.82006  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1844  hypothetical protein  41.14 
 
 
360 aa  256  4e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0810  Radical SAM domain protein  38.15 
 
 
364 aa  256  4e-67  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0537641  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0219  Radical SAM domain protein  39.22 
 
 
357 aa  255  7e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4165  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  39.94 
 
 
741 aa  255  9e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.358903  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0900  Radical SAM domain protein  39.66 
 
 
757 aa  255  1.0000000000000001e-66  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.180074  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4068  radical SAM domain-containing protein  37.22 
 
 
394 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.18733 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1846  hypothetical protein  39.11 
 
 
373 aa  254  2.0000000000000002e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4147  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  40.5 
 
 
737 aa  254  2.0000000000000002e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.280737  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0047  radical SAM domain-containing protein  38.37 
 
 
362 aa  253  3e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0404  hypothetical protein  42.24 
 
 
349 aa  251  9.000000000000001e-66  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4206  radical SAM domain-containing protein  36.81 
 
 
387 aa  251  1e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3390  hypothetical protein  37.5 
 
 
353 aa  251  1e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0400  Radical SAM domain protein  36.78 
 
 
388 aa  251  1e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1258  Radical SAM domain-containing protein  37.99 
 
 
385 aa  251  2e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.616603 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3089  radical SAM domain-containing protein  38.04 
 
 
373 aa  251  2e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.185999  hitchhiker  0.000152785 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>