242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0893 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1053  FO synthase subunit 2  90.25 
 
 		 370 aa  676    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0893  FO synthase subunit 2  100 
 
 		 359 aa  738    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1621  FO synthase subunit 2  92.48 
 
 		 359 aa  684    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1071  FO synthase subunit 2  79.89 
 
 		 359 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0750  FO synthase subunit 2  61.6 
 
 		 362 aa  476  1e-133  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.054782  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1072  FO synthase subunit 2  61.84 
 
 		 358 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1620  FO synthase subunit 2  62.95 
 
 		 358 aa  437  1e-121  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1054  FO synthase subunit 2  61.84 
 
 		 358 aa  433  1e-120  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3416  FO synthase subunit 2  53.17 
 
 		 376 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.90673  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3417  FO synthase subunit 2  49.43 
 
 		 384 aa  342  4e-93  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.1497 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1303  FO synthase subunit 2  53.14 
 
 		 356 aa  341  1e-92  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0975  FO synthase  46.94 
 
 		 792 aa  338  9.999999999999999e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.156535  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11198  FO synthase  48.48 
 
 		 856 aa  337  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.152769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4032  FO synthase  49.24 
 
 		 859 aa  335  7e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.249392  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4107  FO synthase  49.24 
 
 		 859 aa  335  7e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4262  FO synthase  49.24 
 
 		 859 aa  335  7e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0918112 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2167  FO synthase  49.24 
 
 		 859 aa  333  2e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0462649 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1148  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  47.02 
 
 		 863 aa  330  2e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.064662  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0592  radical SAM domain-containing protein  45.81 
 
 		 419 aa  329  5.0000000000000004e-89  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4533  FO synthase  48.62 
 
 		 859 aa  328  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0059  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  43.75 
 
 		 453 aa  318  9e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0814  FO synthase  46.67 
 
 		 842 aa  318  1e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.333048  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3619  FO synthase  47.71 
 
 		 841 aa  317  1e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2623  Radical SAM domain protein  44.07 
 
 		 800 aa  317  2e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000614503  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0863  FO synthase  43.35 
 
 		 852 aa  312  4.999999999999999e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.241376  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4252  Radical SAM domain protein  43.79 
 
 		 435 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0745  FO synthase  42.98 
 
 		 899 aa  311  1e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5865  FO synthase  43.27 
 
 		 944 aa  310  2e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.342546  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0048  radical SAM domain-containing protein  42.86 
 
 		 367 aa  309  4e-83  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8766  FO synthase  45.99 
 
 		 857 aa  309  4e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.977085  normal  0.875781 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1376  FO synthase  44.24 
 
 		 867 aa  308  8e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1115  radical SAM domain-containing protein  45.2 
 
 		 418 aa  307  2.0000000000000002e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4075  Radical SAM domain protein  43.23 
 
 		 859 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0284  radical SAM domain-containing protein  45.67 
 
 		 358 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6472  FO synthase  46.15 
 
 		 838 aa  303  3.0000000000000004e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1483  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  43.64 
 
 		 872 aa  303  4.0000000000000003e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0946  FO synthase  44.01 
 
 		 860 aa  301  9e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0746  radical SAM domain-containing protein  46.41 
 
 		 881 aa  301  1e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.331413 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0888  FO synthase  43.4 
 
 		 836 aa  301  1e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0248143 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4048  hypothetical protein  42.86 
 
 		 429 aa  298  7e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.129032  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4423  FO synthase  43.1 
 
 		 820 aa  295  9e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0769  FO synthase  43.33 
 
 		 884 aa  294  2e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0435943  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2970  hypothetical protein  42.82 
 
 		 366 aa  293  3e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0040  radical SAM domain-containing protein  42.29 
 
 		 362 aa  292  7e-78  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3771  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  43.15 
 
 		 875 aa  291  1e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0050  Radical SAM domain protein  43.71 
 
 		 365 aa  291  1e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2519  FO synthase  41.08 
 
 		 871 aa  291  2e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.391262  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1304  FO synthase subunit 2  41.55 
 
 		 356 aa  288  7e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51122  predicted protein  43.07 
 
 		 841 aa  287  2e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0345053 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0717  FO synthase  41.97 
 
 		 779 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00851827 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4262  Radical SAM domain protein  40.91 
 
 		 826 aa  284  2.0000000000000002e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.296294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2116  FO synthase subunit 2  43.44 
 
 		 398 aa  279  6e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3281  FO synthase subunit 2  42.86 
 
 		 381 aa  276  5e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.370195  normal  0.662491 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0775  FO synthase subunit 2  40.87 
 
 		 391 aa  275  8e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.848355  hitchhiker  0.00153433 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0038  radical SAM domain-containing protein  40.3 
 
 		 362 aa  274  1.0000000000000001e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3040  FO synthase subunit 2  41.62 
 
 		 384 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.591688  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0194  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  42.86 
 
 		 382 aa  274  2.0000000000000002e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.200924  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0047  radical SAM domain-containing protein  39.83 
 
 		 362 aa  272  6e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3080  FO synthase subunit 2  41.06 
 
 		 384 aa  271  1e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1434  FO synthase subunit 2  44.88 
 
 		 376 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0411  Radical SAM domain protein  38.46 
 
 		 364 aa  264  2e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0686  FO synthase subunit 2  41.76 
 
 		 386 aa  261  1e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0123  hypothetical protein  42.43 
 
 		 361 aa  260  2e-68  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4165  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  39.2 
 
 		 741 aa  259  4e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.358903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4090  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  39.49 
 
 		 737 aa  259  4e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0388859 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0441  radical SAM domain-containing protein  39.19 
 
 		 361 aa  259  6e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0900  Radical SAM domain protein  41.57 
 
 		 757 aa  259  7e-68  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.180074  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3391  hypothetical protein  39.77 
 
 		 360 aa  256  3e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.352496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4284  radical SAM domain-containing protein  39.77 
 
 		 360 aa  256  3e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4147  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  38.64 
 
 		 737 aa  256  6e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.280737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1450  Radical SAM domain protein  36.99 
 
 		 368 aa  255  7e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000839661  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0218  Radical SAM domain protein  38.9 
 
 		 358 aa  253  3e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2410  hypothetical protein  38.25 
 
 		 361 aa  252  6e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0234  Radical SAM domain protein  38.62 
 
 		 358 aa  251  9.000000000000001e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1645  Radical SAM domain protein  38.46 
 
 		 358 aa  249  4e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000004914  hitchhiker  0.00000000624327 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2193  radical SAM domain-containing protein  40.41 
 
 		 355 aa  249  4e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4285  radical SAM domain-containing protein  39.43 
 
 		 364 aa  249  5e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1157  radical SAM domain-containing protein  37.39 
 
 		 359 aa  248  8e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.423135  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1089  radical SAM domain-containing protein  37.09 
 
 		 368 aa  248  1e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0404  hypothetical protein  37.22 
 
 		 349 aa  247  2e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0797  hypothetical protein  36.86 
 
 		 371 aa  246  4e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.106816  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1528  hypothetical protein  37.39 
 
 		 363 aa  244  9.999999999999999e-64  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0235  Radical SAM domain protein  38.29 
 
 		 357 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.568527  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1159  hypothetical protein  36.65 
 
 		 356 aa  243  3e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.34532  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0320  hypothetical protein  36.97 
 
 		 355 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000157308  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0315  Radical SAM domain protein  37.18 
 
 		 360 aa  241  1e-62  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1280  Radical SAM domain protein  36.02 
 
 		 381 aa  241  2e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0219  Radical SAM domain protein  37.14 
 
 		 357 aa  241  2e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0551  radical SAM domain-containing protein  38.18 
 
 		 372 aa  240  2e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0260021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0671  Radical SAM domain protein  38.07 
 
 		 355 aa  239  5e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1643  Radical SAM domain protein  38.36 
 
 		 367 aa  239  5e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000555203  hitchhiker  0.00000328368 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0798  hypothetical protein  37.43 
 
 		 371 aa  239  5.999999999999999e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.22786  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0801  hypothetical protein  37.32 
 
 		 348 aa  238  9e-62  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000463089  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0742  radical SAM domain-containing protein  35.33 
 
 		 365 aa  238  1e-61  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.547138 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1619  hypothetical protein  37.29 
 
 		 348 aa  238  2e-61  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.320855  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1272  radical SAM domain-containing protein  39.05 
 
 		 355 aa  237  2e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1091  radical SAM domain-containing protein  41.27 
 
 		 356 aa  237  2e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1007  Radical SAM domain protein  35.84 
 
 		 369 aa  237  3e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0379726 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3088  radical SAM domain-containing protein  37.71 
 
 		 354 aa  236  3e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.675437  unclonable  0.0000126154 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0487  hypothetical protein  36.44 
 
 		 348 aa  235  9e-61  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.995091  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>