234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2193 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2193  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
355 aa  740    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1645  Radical SAM domain protein  67.44 
 
 
358 aa  524  1e-148  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000004914  hitchhiker  0.00000000624327 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1091  radical SAM domain-containing protein  63.2 
 
 
356 aa  474  1e-132  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0671  Radical SAM domain protein  60.06 
 
 
355 aa  468  1.0000000000000001e-131  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1844  hypothetical protein  59.37 
 
 
360 aa  435  1e-121  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0442  radical SAM domain-containing protein  55.75 
 
 
354 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3390  hypothetical protein  55.43 
 
 
353 aa  410  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4285  radical SAM domain-containing protein  53.39 
 
 
364 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1272  radical SAM domain-containing protein  54.11 
 
 
355 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3618  radical SAM domain-containing protein  54.55 
 
 
357 aa  395  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0320  hypothetical protein  53.24 
 
 
355 aa  392  1e-108  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000157308  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0797  hypothetical protein  51.7 
 
 
371 aa  385  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.106816  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4207  radical SAM domain-containing protein  52.86 
 
 
625 aa  386  1e-106  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.428604  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3088  radical SAM domain-containing protein  55.19 
 
 
354 aa  387  1e-106  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.675437  unclonable  0.0000126154 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3637  Radical SAM domain protein  54.52 
 
 
347 aa  385  1e-106  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0371  hypothetical protein  52.01 
 
 
626 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.541832  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0399  Radical SAM domain protein  52.01 
 
 
626 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0400  Radical SAM domain protein  52.01 
 
 
626 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.184942  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1159  hypothetical protein  50.14 
 
 
356 aa  379  1e-104  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.34532  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0235  Radical SAM domain protein  51.88 
 
 
357 aa  379  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.568527  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1189  Radical SAM domain protein  51.3 
 
 
386 aa  378  1e-103  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.355638 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0219  Radical SAM domain protein  51.57 
 
 
357 aa  377  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1280  Radical SAM domain protein  50.57 
 
 
381 aa  373  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0550  radical SAM domain-containing protein  52.16 
 
 
375 aa  374  1e-102  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0244585  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1007  Radical SAM domain protein  51.91 
 
 
369 aa  369  1e-101  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0379726 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1735  Radical SAM domain protein  49.41 
 
 
345 aa  366  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00136048  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0315  Radical SAM domain protein  52.15 
 
 
360 aa  362  5.0000000000000005e-99  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1407  Radical SAM domain protein  51.02 
 
 
352 aa  358  6e-98  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2811  Radical SAM domain protein  52.41 
 
 
402 aa  357  1.9999999999999998e-97  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.524917  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0801  hypothetical protein  51.16 
 
 
348 aa  356  2.9999999999999997e-97  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000463089  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1029  hypothetical protein  51.45 
 
 
359 aa  354  2e-96  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.148113  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2881  hypothetical protein  51.91 
 
 
348 aa  352  5.9999999999999994e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1619  hypothetical protein  50.72 
 
 
348 aa  349  5e-95  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.320855  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1528  hypothetical protein  49.72 
 
 
363 aa  347  2e-94  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1588  Radical SAM domain protein  48.6 
 
 
374 aa  347  2e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.357687  normal  0.0606442 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0701  Radical SAM domain protein  46.39 
 
 
374 aa  337  9.999999999999999e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0404  hypothetical protein  49.57 
 
 
349 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0850  Radical SAM domain protein  49.71 
 
 
350 aa  336  5e-91  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000345291  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0533  hypothetical protein  45.14 
 
 
395 aa  333  2e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.271829  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4707  radical SAM domain-containing protein  47.96 
 
 
399 aa  334  2e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1477  hypothetical protein  51.01 
 
 
348 aa  330  2e-89  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.32235  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0487  hypothetical protein  51.01 
 
 
348 aa  330  3e-89  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.995091  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4068  radical SAM domain-containing protein  44 
 
 
394 aa  329  3e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.18733 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0512  hypothetical protein  50.72 
 
 
348 aa  328  1.0000000000000001e-88  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4467  radical SAM domain-containing protein  43.84 
 
 
396 aa  326  4.0000000000000003e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.82006  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0686  hypothetical protein  51.3 
 
 
348 aa  325  1e-87  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.725444  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1258  Radical SAM domain-containing protein  43.55 
 
 
385 aa  324  1e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.616603 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0263  hypothetical protein  46.57 
 
 
380 aa  319  5e-86  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1089  radical SAM domain-containing protein  44.97 
 
 
368 aa  318  9e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6099  radical SAM domain-containing protein  45.43 
 
 
515 aa  315  5e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.61579  normal  0.0270865 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8059  Radical SAM domain protein  43.58 
 
 
404 aa  315  6e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2195  radical SAM domain-containing protein  44.72 
 
 
367 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1450  Radical SAM domain protein  41.94 
 
 
368 aa  301  9e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000839661  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0810  Radical SAM domain protein  45.76 
 
 
364 aa  301  2e-80  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0537641  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1157  radical SAM domain-containing protein  41.11 
 
 
359 aa  300  4e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.423135  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0234  Radical SAM domain protein  41.76 
 
 
358 aa  295  6e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1643  Radical SAM domain protein  42.58 
 
 
367 aa  295  1e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000555203  hitchhiker  0.00000328368 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0218  Radical SAM domain protein  41.48 
 
 
358 aa  295  1e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1499  Radical SAM domain protein  41.48 
 
 
373 aa  293  3e-78  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3089  radical SAM domain-containing protein  42.57 
 
 
373 aa  293  4e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.185999  hitchhiker  0.000152785 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4284  radical SAM domain-containing protein  41.69 
 
 
360 aa  292  6e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1789  Radical SAM domain-containing protein  42.98 
 
 
377 aa  291  2e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0319  hypothetical protein  43.5 
 
 
362 aa  288  1e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000596234  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3578  radical SAM domain-containing protein  44.71 
 
 
359 aa  288  1e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3391  hypothetical protein  41.78 
 
 
360 aa  287  2e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.352496  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1998  hypothetical protein  44.01 
 
 
393 aa  286  2.9999999999999996e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.261204  normal  0.689392 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1958  Radical SAM domain protein  43.54 
 
 
379 aa  285  7e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.443092  normal  0.514588 
 
 
-
 
NC_002620  TC0148  hypothetical protein  40.24 
 
 
354 aa  284  1.0000000000000001e-75  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.200407  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0441  radical SAM domain-containing protein  41.24 
 
 
361 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0625  Radical SAM domain protein  41.67 
 
 
359 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.834734  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0592  radical SAM domain-containing protein  40.38 
 
 
419 aa  281  1e-74  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0798  hypothetical protein  40.06 
 
 
371 aa  276  3e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.22786  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1271  radical SAM domain-containing protein  41.11 
 
 
367 aa  276  3e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0551  radical SAM domain-containing protein  39.89 
 
 
372 aa  275  8e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0260021  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3416  FO synthase subunit 2  40.33 
 
 
376 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.90673  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1188  Radical SAM domain protein  40.28 
 
 
387 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.12301 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0740  radical SAM domain-containing protein  42.56 
 
 
347 aa  273  3e-72  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000523159 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4206  radical SAM domain-containing protein  41.53 
 
 
387 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1416  radical SAM domain-containing protein  40.56 
 
 
358 aa  272  7e-72  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.150894 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1846  hypothetical protein  41.57 
 
 
373 aa  271  9e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0400  Radical SAM domain protein  41.57 
 
 
388 aa  271  1e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2163  radical SAM domain-containing protein  37.64 
 
 
367 aa  270  2.9999999999999997e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0401  Radical SAM domain protein  41.01 
 
 
388 aa  269  5.9999999999999995e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.575372  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0217  radical SAM domain-containing protein  41.96 
 
 
353 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.896474  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0372  hypothetical protein  41.01 
 
 
388 aa  268  8e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.153227  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0519  hypothetical protein  39 
 
 
382 aa  266  2.9999999999999995e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.520088 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1303  FO synthase subunit 2  40.67 
 
 
356 aa  265  8.999999999999999e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0259  hypothetical protein  37.33 
 
 
384 aa  264  2e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.341096  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2097  hypothetical protein  39.32 
 
 
376 aa  263  4e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0332172  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0223  radical SAM domain-containing protein  38.61 
 
 
364 aa  262  6.999999999999999e-69  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.772616  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0787  Radical SAM domain-containing protein  39.44 
 
 
391 aa  262  8e-69  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.464244  normal  0.667055 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0742  radical SAM domain-containing protein  37.68 
 
 
365 aa  261  1e-68  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.547138 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1324  radical SAM domain-containing protein  39.7 
 
 
348 aa  258  8e-68  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.161004  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6111  radical SAM domain-containing protein  37.33 
 
 
392 aa  256  5e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0611343  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4048  hypothetical protein  38.08 
 
 
429 aa  255  7e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.129032  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1686  Radical SAM domain protein  39.09 
 
 
354 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1279  Radical SAM domain protein  36.26 
 
 
380 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0554  radical SAM domain-containing protein  36.87 
 
 
372 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.420102 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8066  Radical SAM domain protein  35.44 
 
 
386 aa  253  3e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.437454  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0048  radical SAM domain-containing protein  39.28 
 
 
367 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>