217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0404 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0404  hypothetical protein  100 
 
 		 349 aa  725    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0850  Radical SAM domain protein  72.29 
 
 		 350 aa  538  9.999999999999999e-153  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000345291  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1528  hypothetical protein  70.4 
 
 		 363 aa  535  1e-151  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0801  hypothetical protein  69.83 
 
 		 348 aa  535  1e-151  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000463089  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1619  hypothetical protein  68.68 
 
 		 348 aa  522  1e-147  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.320855  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1029  hypothetical protein  69.19 
 
 		 359 aa  503  1e-141  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.148113  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0487  hypothetical protein  69.83 
 
 		 348 aa  496  1e-139  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.995091  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0512  hypothetical protein  69.54 
 
 		 348 aa  494  9.999999999999999e-139  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1477  hypothetical protein  69.54 
 
 		 348 aa  493  9.999999999999999e-139  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.32235  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0686  hypothetical protein  68.39 
 
 		 348 aa  487  1e-136  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.725444  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0671  Radical SAM domain protein  52.59 
 
 		 355 aa  375  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0320  hypothetical protein  51.3 
 
 		 355 aa  368  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000157308  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1844  hypothetical protein  51.59 
 
 		 360 aa  360  2e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3618  radical SAM domain-containing protein  51.3 
 
 		 357 aa  360  2e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0315  Radical SAM domain protein  51.72 
 
 		 360 aa  359  5e-98  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0442  radical SAM domain-containing protein  49.28 
 
 		 354 aa  355  6.999999999999999e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4285  radical SAM domain-containing protein  49.86 
 
 		 364 aa  355  6.999999999999999e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0219  Radical SAM domain protein  48.7 
 
 		 357 aa  352  7e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1091  radical SAM domain-containing protein  49.57 
 
 		 356 aa  352  7e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0235  Radical SAM domain protein  48.7 
 
 		 357 aa  351  1e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.568527  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3390  hypothetical protein  50.73 
 
 		 353 aa  350  3e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1645  Radical SAM domain protein  49.13 
 
 		 358 aa  348  7e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000004914  hitchhiker  0.00000000624327 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1407  Radical SAM domain protein  49.71 
 
 		 352 aa  347  1e-94  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1007  Radical SAM domain protein  46.22 
 
 		 369 aa  346  3e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0379726 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2881  hypothetical protein  50.29 
 
 		 348 aa  342  4e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1159  hypothetical protein  47.26 
 
 		 356 aa  342  5e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.34532  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1280  Radical SAM domain protein  47.83 
 
 		 381 aa  338  5.9999999999999996e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2193  radical SAM domain-containing protein  49.57 
 
 		 355 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2811  Radical SAM domain protein  50.43 
 
 		 402 aa  336  2.9999999999999997e-91  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.524917  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4207  radical SAM domain-containing protein  48.83 
 
 		 625 aa  335  5.999999999999999e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.428604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0371  hypothetical protein  47.98 
 
 		 626 aa  335  9e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.541832  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0399  Radical SAM domain protein  47.69 
 
 		 626 aa  331  9e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0797  hypothetical protein  46.82 
 
 		 371 aa  331  1e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.106816  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1272  radical SAM domain-containing protein  49.42 
 
 		 355 aa  331  1e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0400  Radical SAM domain protein  47.69 
 
 		 626 aa  331  1e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.184942  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3088  radical SAM domain-containing protein  48.12 
 
 		 354 aa  328  9e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.675437  unclonable  0.0000126154 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1735  Radical SAM domain protein  44.93 
 
 		 345 aa  326  4.0000000000000003e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00136048  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1189  Radical SAM domain protein  46.33 
 
 		 386 aa  325  5e-88  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.355638 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0550  radical SAM domain-containing protein  46.18 
 
 		 375 aa  325  8.000000000000001e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0244585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3637  Radical SAM domain protein  48.62 
 
 		 347 aa  324  2e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0533  hypothetical protein  46.36 
 
 		 395 aa  323  3e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.271829  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1258  Radical SAM domain-containing protein  45.19 
 
 		 385 aa  323  4e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.616603 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6099  radical SAM domain-containing protein  47.23 
 
 		 515 aa  321  9.999999999999999e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.61579  normal  0.0270865 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0263  hypothetical protein  46.36 
 
 		 380 aa  310  2.9999999999999997e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4467  radical SAM domain-containing protein  44.31 
 
 		 396 aa  309  4e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.82006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4707  radical SAM domain-containing protein  44.13 
 
 		 399 aa  306  3e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4068  radical SAM domain-containing protein  43.73 
 
 		 394 aa  306  5.0000000000000004e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.18733 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8059  Radical SAM domain protein  43.84 
 
 		 404 aa  304  1.0000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0701  Radical SAM domain protein  43.23 
 
 		 374 aa  293  2e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0148  hypothetical protein  40.88 
 
 		 354 aa  286  4e-76  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.200407  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1588  Radical SAM domain protein  41.11 
 
 		 374 aa  277  2e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.357687  normal  0.0606442 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0217  radical SAM domain-containing protein  42.4 
 
 		 353 aa  277  2e-73  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.896474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1789  Radical SAM domain-containing protein  43.87 
 
 		 377 aa  275  6e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0740  radical SAM domain-containing protein  42.48 
 
 		 347 aa  275  9e-73  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000523159 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1416  radical SAM domain-containing protein  42.32 
 
 		 358 aa  273  4.0000000000000004e-72  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.150894 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1958  Radical SAM domain protein  45.06 
 
 		 379 aa  273  4.0000000000000004e-72  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.443092  normal  0.514588 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0554  radical SAM domain-containing protein  43.65 
 
 		 372 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.420102 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1499  Radical SAM domain protein  41.28 
 
 		 373 aa  270  2.9999999999999997e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2195  radical SAM domain-containing protein  39.88 
 
 		 367 aa  269  4e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1089  radical SAM domain-containing protein  37.32 
 
 		 368 aa  267  2e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1998  hypothetical protein  43.73 
 
 		 393 aa  266  4e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.261204  normal  0.689392 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1324  radical SAM domain-containing protein  40.97 
 
 		 348 aa  266  4e-70  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.161004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4284  radical SAM domain-containing protein  40.69 
 
 		 360 aa  265  8.999999999999999e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0234  Radical SAM domain protein  37.93 
 
 		 358 aa  260  3e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3578  radical SAM domain-containing protein  39.26 
 
 		 359 aa  259  6e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0223  radical SAM domain-containing protein  39.19 
 
 		 364 aa  259  6e-68  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.772616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1157  radical SAM domain-containing protein  38.29 
 
 		 359 aa  258  1e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.423135  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0218  Radical SAM domain protein  37.36 
 
 		 358 aa  258  1e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0625  Radical SAM domain protein  39.26 
 
 		 359 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.834734  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0551  radical SAM domain-containing protein  38.22 
 
 		 372 aa  253  3e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0260021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1450  Radical SAM domain protein  37.64 
 
 		 368 aa  253  5.000000000000001e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000839661  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0401  Radical SAM domain protein  37.61 
 
 		 388 aa  252  5.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.575372  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0400  Radical SAM domain protein  37.32 
 
 		 388 aa  252  6e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0810  Radical SAM domain protein  38.68 
 
 		 364 aa  252  7e-66  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0537641  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3391  hypothetical protein  38.11 
 
 		 360 aa  252  8.000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.352496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0372  hypothetical protein  37.32 
 
 		 388 aa  251  1e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.153227  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1053  FO synthase subunit 2  37.5 
 
 		 370 aa  250  3e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0441  radical SAM domain-containing protein  37.82 
 
 		 361 aa  248  1e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0319  hypothetical protein  37.18 
 
 		 362 aa  248  1e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000596234  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0893  FO synthase subunit 2  37.22 
 
 		 359 aa  247  2e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1643  Radical SAM domain protein  36.78 
 
 		 367 aa  247  2e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000555203  hitchhiker  0.00000328368 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1621  FO synthase subunit 2  37.22 
 
 		 359 aa  248  2e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0048  radical SAM domain-containing protein  38.73 
 
 		 367 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0742  radical SAM domain-containing protein  37.57 
 
 		 365 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.547138 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4206  radical SAM domain-containing protein  36.1 
 
 		 387 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0592  radical SAM domain-containing protein  37.75 
 
 		 419 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2097  hypothetical protein  35.53 
 
 		 376 aa  241  1e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0332172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0284  radical SAM domain-containing protein  39.74 
 
 		 358 aa  238  9e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0097  Radical SAM domain protein  37.9 
 
 		 386 aa  237  2e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0787  Radical SAM domain-containing protein  36.96 
 
 		 391 aa  237  2e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.464244  normal  0.667055 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1271  radical SAM domain-containing protein  36.44 
 
 		 367 aa  236  5.0000000000000005e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1303  FO synthase subunit 2  40.4 
 
 		 356 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4048  hypothetical protein  36 
 
 		 429 aa  234  2.0000000000000002e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.129032  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0798  hypothetical protein  37.22 
 
 		 371 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.22786  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1071  FO synthase subunit 2  34.76 
 
 		 359 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0863  FO synthase  39.02 
 
 		 852 aa  233  3e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.241376  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0750  FO synthase subunit 2  36.65 
 
 		 362 aa  232  6e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.054782  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1846  hypothetical protein  36.75 
 
 		 373 aa  231  1e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4252  Radical SAM domain protein  37.74 
 
 		 435 aa  231  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2410  hypothetical protein  36.92 
 
 		 361 aa  231  2e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>