238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0742 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0742  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
365 aa  761    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.547138 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0220  radical SAM domain-containing protein  43.1 
 
 
350 aa  315  6e-85  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0222  radical SAM domain-containing protein  44.67 
 
 
353 aa  311  2e-83  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.255233  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0738  radical SAM domain-containing protein  42.73 
 
 
359 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000230285 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1325  radical SAM domain-containing protein  42.69 
 
 
362 aa  302  5.000000000000001e-81  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.270915  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1417  radical SAM domain-containing protein  42.24 
 
 
364 aa  302  6.000000000000001e-81  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.111618 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0798  hypothetical protein  42.86 
 
 
371 aa  290  4e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.22786  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1643  Radical SAM domain protein  41.64 
 
 
367 aa  286  4e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000555203  hitchhiker  0.00000328368 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3391  hypothetical protein  42.74 
 
 
360 aa  285  5.999999999999999e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.352496  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0234  Radical SAM domain protein  40 
 
 
358 aa  285  7e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0218  Radical SAM domain protein  39.72 
 
 
358 aa  285  8e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1089  radical SAM domain-containing protein  41.38 
 
 
368 aa  283  3.0000000000000004e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4284  radical SAM domain-containing protein  41.88 
 
 
360 aa  282  6.000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1188  Radical SAM domain protein  41.85 
 
 
387 aa  281  9e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.12301 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0551  radical SAM domain-containing protein  42.41 
 
 
372 aa  281  9e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0260021  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0441  radical SAM domain-containing protein  41.81 
 
 
361 aa  280  2e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0400  Radical SAM domain protein  40.73 
 
 
388 aa  280  3e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1450  Radical SAM domain protein  40.8 
 
 
368 aa  280  3e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000839661  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0401  Radical SAM domain protein  40.73 
 
 
388 aa  280  4e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.575372  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0097  Radical SAM domain protein  41.33 
 
 
386 aa  279  6e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0372  hypothetical protein  40.73 
 
 
388 aa  278  9e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.153227  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1528  hypothetical protein  41.21 
 
 
363 aa  277  2e-73  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2163  radical SAM domain-containing protein  40.86 
 
 
367 aa  277  3e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0259  hypothetical protein  40.67 
 
 
384 aa  275  8e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.341096  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1846  hypothetical protein  40.4 
 
 
373 aa  274  2.0000000000000002e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4206  radical SAM domain-containing protein  39.04 
 
 
387 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1157  radical SAM domain-containing protein  40.34 
 
 
359 aa  272  8.000000000000001e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.423135  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2195  radical SAM domain-containing protein  39.62 
 
 
367 aa  271  1e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1619  hypothetical protein  40.46 
 
 
348 aa  270  4e-71  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.320855  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3089  radical SAM domain-containing protein  40.73 
 
 
373 aa  268  1e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.185999  hitchhiker  0.000152785 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0625  Radical SAM domain protein  40.17 
 
 
359 aa  267  2e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.834734  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3578  radical SAM domain-containing protein  40.63 
 
 
359 aa  267  2e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8066  Radical SAM domain protein  39.29 
 
 
386 aa  264  2e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.437454  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0554  radical SAM domain-containing protein  38 
 
 
372 aa  264  2e-69  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.420102 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2097  hypothetical protein  37.92 
 
 
376 aa  262  4.999999999999999e-69  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0332172  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1407  Radical SAM domain protein  41.74 
 
 
352 aa  261  1e-68  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2193  radical SAM domain-containing protein  37.68 
 
 
355 aa  261  1e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1645  Radical SAM domain protein  39.72 
 
 
358 aa  261  1e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000004914  hitchhiker  0.00000000624327 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0810  Radical SAM domain protein  39.27 
 
 
364 aa  260  2e-68  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0537641  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0801  hypothetical protein  38.6 
 
 
348 aa  260  2e-68  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000463089  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1280  Radical SAM domain protein  39.81 
 
 
381 aa  259  7e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4505  radical SAM domain-containing protein  38.19 
 
 
389 aa  258  8e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.325974  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1279  Radical SAM domain protein  39.01 
 
 
380 aa  258  9e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3088  radical SAM domain-containing protein  36.66 
 
 
354 aa  258  1e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.675437  unclonable  0.0000126154 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0671  Radical SAM domain protein  38.63 
 
 
355 aa  256  3e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4085  radical SAM domain-containing protein  37.64 
 
 
389 aa  256  3e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.181055 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1029  hypothetical protein  38.37 
 
 
359 aa  256  4e-67  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.148113  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0797  hypothetical protein  36.13 
 
 
371 aa  256  4e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.106816  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0592  radical SAM domain-containing protein  37.16 
 
 
419 aa  256  4e-67  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3390  hypothetical protein  38.4 
 
 
353 aa  256  5e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0587  Radical SAM domain-containing protein  36.94 
 
 
390 aa  255  1.0000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.888096  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0319  hypothetical protein  39.65 
 
 
362 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000596234  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1189  Radical SAM domain protein  36.02 
 
 
386 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.355638 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4252  Radical SAM domain protein  36.01 
 
 
435 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238128  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1525  Radical SAM domain protein  38.44 
 
 
396 aa  253  3e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.155468  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1499  Radical SAM domain protein  38.11 
 
 
373 aa  253  5.000000000000001e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4713  Radical SAM domain protein  38.95 
 
 
393 aa  252  8.000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0317853  normal  0.0266117 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0787  Radical SAM domain-containing protein  36.71 
 
 
391 aa  251  9.000000000000001e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.464244  normal  0.667055 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0519  hypothetical protein  39.43 
 
 
382 aa  251  1e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.520088 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6111  radical SAM domain-containing protein  37.75 
 
 
392 aa  250  2e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0611343  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1091  radical SAM domain-containing protein  40 
 
 
356 aa  251  2e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4285  radical SAM domain-containing protein  37.46 
 
 
364 aa  250  2e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0371  hypothetical protein  37.46 
 
 
626 aa  250  3e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.541832  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0850  Radical SAM domain protein  38.33 
 
 
350 aa  250  3e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000345291  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0442  radical SAM domain-containing protein  36.69 
 
 
354 aa  249  6e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0315  Radical SAM domain protein  38.7 
 
 
360 aa  249  6e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0320  hypothetical protein  39.43 
 
 
355 aa  248  2e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000157308  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1071  FO synthase subunit 2  36.29 
 
 
359 aa  248  2e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1621  FO synthase subunit 2  36.18 
 
 
359 aa  247  2e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0400  Radical SAM domain protein  37.18 
 
 
626 aa  246  3e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.184942  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0399  Radical SAM domain protein  37.18 
 
 
626 aa  247  3e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4207  radical SAM domain-containing protein  36.97 
 
 
625 aa  246  4e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.428604  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1271  radical SAM domain-containing protein  38.12 
 
 
367 aa  245  6.999999999999999e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1272  radical SAM domain-containing protein  37.57 
 
 
355 aa  245  8e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1880  Radical SAM domain protein  36.65 
 
 
397 aa  245  9.999999999999999e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0404  hypothetical protein  37.57 
 
 
349 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0550  radical SAM domain-containing protein  37.35 
 
 
375 aa  243  3e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0244585  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0487  hypothetical protein  38.44 
 
 
348 aa  241  1e-62  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.995091  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1053  FO synthase subunit 2  34.76 
 
 
370 aa  240  2e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1477  hypothetical protein  38.44 
 
 
348 aa  241  2e-62  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.32235  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0832  hypothetical protein  35.96 
 
 
353 aa  240  2.9999999999999997e-62  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.709091  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1416  radical SAM domain-containing protein  36.13 
 
 
358 aa  239  6.999999999999999e-62  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.150894 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0512  hypothetical protein  38.15 
 
 
348 aa  238  1e-61  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0893  FO synthase subunit 2  35.33 
 
 
359 aa  238  1e-61  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0223  radical SAM domain-containing protein  34.93 
 
 
364 aa  237  2e-61  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.772616  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2167  FO synthase  36.13 
 
 
859 aa  237  3e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0462649 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3416  FO synthase subunit 2  36.08 
 
 
376 aa  236  4e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.90673  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0282  hypothetical protein  37.13 
 
 
354 aa  236  6e-61  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4032  FO synthase  36.97 
 
 
859 aa  236  7e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.249392  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4107  FO synthase  36.97 
 
 
859 aa  236  7e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4262  FO synthase  36.97 
 
 
859 aa  235  7e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0918112 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0235  Radical SAM domain protein  36.06 
 
 
357 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.568527  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3417  FO synthase subunit 2  37.22 
 
 
384 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.1497 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0686  hypothetical protein  37.28 
 
 
348 aa  235  1.0000000000000001e-60  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.725444  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1370  hypothetical protein  37.75 
 
 
354 aa  234  2.0000000000000002e-60  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11198  FO synthase  36.21 
 
 
856 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.152769  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1475  hypothetical protein  37.36 
 
 
350 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.904959  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4467  radical SAM domain-containing protein  35.24 
 
 
396 aa  233  5e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.82006  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4048  hypothetical protein  34.25 
 
 
429 aa  232  7.000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.129032  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1159  hypothetical protein  34.37 
 
 
356 aa  232  9e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.34532  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>