211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2195 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2195  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
367 aa  757    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1643  Radical SAM domain protein  70.3 
 
 
367 aa  538  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000555203  hitchhiker  0.00000328368 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1089  radical SAM domain-containing protein  62.94 
 
 
368 aa  506  9.999999999999999e-143  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1846  hypothetical protein  60.39 
 
 
373 aa  451  1.0000000000000001e-126  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4284  radical SAM domain-containing protein  57.91 
 
 
360 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3391  hypothetical protein  55.34 
 
 
360 aa  428  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.352496  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0625  Radical SAM domain protein  57.02 
 
 
359 aa  425  1e-118  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.834734  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1450  Radical SAM domain protein  54.72 
 
 
368 aa  427  1e-118  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000839661  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0441  radical SAM domain-containing protein  54.8 
 
 
361 aa  422  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1271  radical SAM domain-containing protein  52.88 
 
 
367 aa  412  1e-114  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3578  radical SAM domain-containing protein  55.97 
 
 
359 aa  412  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0234  Radical SAM domain protein  53.28 
 
 
358 aa  413  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0218  Radical SAM domain protein  52.42 
 
 
358 aa  411  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2163  radical SAM domain-containing protein  51.93 
 
 
367 aa  406  1.0000000000000001e-112  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0319  hypothetical protein  52.39 
 
 
362 aa  382  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000596234  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1157  radical SAM domain-containing protein  50.98 
 
 
359 aa  384  1e-105  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.423135  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0372  hypothetical protein  49.86 
 
 
388 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.153227  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3089  radical SAM domain-containing protein  50.42 
 
 
373 aa  379  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.185999  hitchhiker  0.000152785 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1499  Radical SAM domain protein  50.97 
 
 
373 aa  379  1e-104  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0400  Radical SAM domain protein  49.29 
 
 
388 aa  378  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0401  Radical SAM domain protein  49.29 
 
 
388 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.575372  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0551  radical SAM domain-containing protein  48.48 
 
 
372 aa  372  1e-102  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0260021  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4206  radical SAM domain-containing protein  49.01 
 
 
387 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0810  Radical SAM domain protein  48.21 
 
 
364 aa  366  1e-100  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0537641  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1188  Radical SAM domain protein  46.46 
 
 
387 aa  359  3e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.12301 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0787  Radical SAM domain-containing protein  47.08 
 
 
391 aa  358  9.999999999999999e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.464244  normal  0.667055 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0097  Radical SAM domain protein  47.92 
 
 
386 aa  357  1.9999999999999998e-97  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2097  hypothetical protein  46.39 
 
 
376 aa  350  3e-95  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0332172  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0149  Radical SAM domain protein  45.35 
 
 
358 aa  343  2e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00717785  normal  0.324103 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0798  hypothetical protein  45.13 
 
 
371 aa  342  5e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.22786  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1279  Radical SAM domain protein  45.36 
 
 
380 aa  337  9.999999999999999e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1525  Radical SAM domain protein  45.9 
 
 
396 aa  334  1e-90  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.155468  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0587  Radical SAM domain-containing protein  44.04 
 
 
390 aa  328  1.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.888096  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8066  Radical SAM domain protein  43.92 
 
 
386 aa  322  4e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.437454  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0519  hypothetical protein  45.51 
 
 
382 aa  321  9.999999999999999e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.520088 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4713  Radical SAM domain protein  45.17 
 
 
393 aa  321  9.999999999999999e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0317853  normal  0.0266117 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2962  Radical SAM domain protein  43.23 
 
 
360 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0300282  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6111  radical SAM domain-containing protein  44.57 
 
 
392 aa  321  1.9999999999999998e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0611343  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0259  hypothetical protein  43.73 
 
 
384 aa  317  3e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.341096  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1686  Radical SAM domain protein  43.22 
 
 
354 aa  317  3e-85  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4085  radical SAM domain-containing protein  43.25 
 
 
389 aa  317  3e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.181055 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0315  Radical SAM domain protein  46.13 
 
 
360 aa  316  4e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1475  hypothetical protein  39.89 
 
 
350 aa  312  4.999999999999999e-84  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.904959  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4505  radical SAM domain-containing protein  42.98 
 
 
389 aa  311  9e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.325974  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1645  Radical SAM domain protein  45.66 
 
 
358 aa  311  1e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000004914  hitchhiker  0.00000000624327 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1483  hypothetical protein  41.64 
 
 
353 aa  309  5e-83  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2193  radical SAM domain-containing protein  44.72 
 
 
355 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1091  radical SAM domain-containing protein  46.24 
 
 
356 aa  306  5.0000000000000004e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1880  Radical SAM domain protein  41.93 
 
 
397 aa  302  5.000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0832  hypothetical protein  41.21 
 
 
353 aa  301  2e-80  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.709091  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1844  hypothetical protein  46.86 
 
 
360 aa  294  2e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1370  hypothetical protein  40.52 
 
 
354 aa  292  6e-78  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0427  hypothetical protein  40.46 
 
 
354 aa  290  2e-77  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0282  hypothetical protein  40.52 
 
 
354 aa  289  5.0000000000000004e-77  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0584  hypothetical protein  38.72 
 
 
360 aa  289  5.0000000000000004e-77  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0220  hypothetical protein  42.98 
 
 
353 aa  289  5.0000000000000004e-77  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1560  hypothetical protein  39.94 
 
 
354 aa  288  1e-76  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0671  Radical SAM domain protein  42.69 
 
 
355 aa  282  5.000000000000001e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1407  Radical SAM domain protein  41.74 
 
 
352 aa  279  5e-74  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0801  hypothetical protein  42.61 
 
 
348 aa  279  5e-74  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000463089  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0850  Radical SAM domain protein  42.07 
 
 
350 aa  276  4e-73  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000345291  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1159  hypothetical protein  42.58 
 
 
356 aa  276  5e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.34532  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0235  Radical SAM domain protein  40.91 
 
 
357 aa  275  7e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.568527  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3618  radical SAM domain-containing protein  41.16 
 
 
357 aa  275  8e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0320  hypothetical protein  41.53 
 
 
355 aa  271  1e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000157308  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0742  radical SAM domain-containing protein  39.62 
 
 
365 aa  271  1e-71  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.547138 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1029  hypothetical protein  41.45 
 
 
359 aa  270  4e-71  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.148113  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0404  hypothetical protein  39.88 
 
 
349 aa  269  5e-71  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0442  radical SAM domain-containing protein  39.04 
 
 
354 aa  269  5.9999999999999995e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1619  hypothetical protein  41.04 
 
 
348 aa  268  1e-70  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.320855  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0219  Radical SAM domain protein  39.77 
 
 
357 aa  268  1e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3417  FO synthase subunit 2  39.27 
 
 
384 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.1497 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0550  radical SAM domain-containing protein  39.14 
 
 
375 aa  265  8e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0244585  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4285  radical SAM domain-containing protein  39.22 
 
 
364 aa  265  1e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4707  radical SAM domain-containing protein  39.83 
 
 
399 aa  262  8e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1189  Radical SAM domain protein  38.29 
 
 
386 aa  262  8e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.355638 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3390  hypothetical protein  37.85 
 
 
353 aa  261  2e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0554  radical SAM domain-containing protein  36.11 
 
 
372 aa  260  2e-68  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.420102 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1272  radical SAM domain-containing protein  40.57 
 
 
355 aa  260  2e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2881  hypothetical protein  39.18 
 
 
348 aa  260  3e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1528  hypothetical protein  39.88 
 
 
363 aa  259  6e-68  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0797  hypothetical protein  36.8 
 
 
371 aa  258  1e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.106816  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1303  FO synthase subunit 2  39.27 
 
 
356 aa  258  1e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0686  hypothetical protein  42.2 
 
 
348 aa  256  3e-67  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.725444  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0738  radical SAM domain-containing protein  37.46 
 
 
359 aa  256  6e-67  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000230285 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8059  Radical SAM domain protein  36.54 
 
 
404 aa  255  7e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1735  Radical SAM domain protein  38.26 
 
 
345 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00136048  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3416  FO synthase subunit 2  38.98 
 
 
376 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.90673  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3088  radical SAM domain-containing protein  39.48 
 
 
354 aa  254  2.0000000000000002e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.675437  unclonable  0.0000126154 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1007  Radical SAM domain protein  39.88 
 
 
369 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0379726 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3637  Radical SAM domain protein  41.05 
 
 
347 aa  253  3e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0533  hypothetical protein  36.52 
 
 
395 aa  253  4.0000000000000004e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.271829  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0487  hypothetical protein  41.83 
 
 
348 aa  253  5.000000000000001e-66  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.995091  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0038  radical SAM domain-containing protein  35.75 
 
 
362 aa  253  5.000000000000001e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1280  Radical SAM domain protein  35.46 
 
 
381 aa  252  7e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0512  hypothetical protein  41.83 
 
 
348 aa  252  9.000000000000001e-66  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1477  hypothetical protein  41.55 
 
 
348 aa  251  1e-65  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.32235  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1417  radical SAM domain-containing protein  39.83 
 
 
364 aa  251  1e-65  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.111618 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0222  radical SAM domain-containing protein  39.59 
 
 
353 aa  250  2e-65  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.255233  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2410  hypothetical protein  35.63 
 
 
361 aa  250  2e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>