225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1475 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1475  hypothetical protein  100 
 
 
350 aa  733    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.904959  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1483  hypothetical protein  67.43 
 
 
353 aa  511  1e-144  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1686  Radical SAM domain protein  63.25 
 
 
354 aa  496  1e-139  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0220  hypothetical protein  67.14 
 
 
353 aa  489  1e-137  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1560  hypothetical protein  63.61 
 
 
354 aa  478  1e-134  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0427  hypothetical protein  63.19 
 
 
354 aa  479  1e-134  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0832  hypothetical protein  62.57 
 
 
353 aa  480  1e-134  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.709091  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0584  hypothetical protein  62.64 
 
 
360 aa  480  1e-134  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1370  hypothetical protein  63.04 
 
 
354 aa  479  1e-134  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0282  hypothetical protein  63.61 
 
 
354 aa  476  1e-133  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4284  radical SAM domain-containing protein  46.31 
 
 
360 aa  332  6e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3391  hypothetical protein  45.17 
 
 
360 aa  329  4e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.352496  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0441  radical SAM domain-containing protein  44.6 
 
 
361 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1499  Radical SAM domain protein  46.26 
 
 
373 aa  322  4e-87  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0234  Radical SAM domain protein  42.45 
 
 
358 aa  319  5e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0625  Radical SAM domain protein  43.3 
 
 
359 aa  319  6e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.834734  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0218  Radical SAM domain protein  41.88 
 
 
358 aa  317  3e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2195  radical SAM domain-containing protein  39.89 
 
 
367 aa  312  3.9999999999999997e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4206  radical SAM domain-containing protein  43.34 
 
 
387 aa  312  6.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0097  Radical SAM domain protein  41.76 
 
 
386 aa  311  2e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0372  hypothetical protein  42.45 
 
 
388 aa  310  2.9999999999999997e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.153227  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0401  Radical SAM domain protein  42.45 
 
 
388 aa  309  5e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.575372  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0400  Radical SAM domain protein  42.17 
 
 
388 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1089  radical SAM domain-containing protein  38.51 
 
 
368 aa  307  2.0000000000000002e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1450  Radical SAM domain protein  40.86 
 
 
368 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000839661  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0798  hypothetical protein  41.88 
 
 
371 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.22786  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0149  Radical SAM domain protein  41.71 
 
 
358 aa  303  4.0000000000000003e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00717785  normal  0.324103 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2163  radical SAM domain-containing protein  42.61 
 
 
367 aa  302  5.000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1271  radical SAM domain-containing protein  40.46 
 
 
367 aa  302  5.000000000000001e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1157  radical SAM domain-containing protein  39.71 
 
 
359 aa  300  4e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.423135  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0551  radical SAM domain-containing protein  39.38 
 
 
372 aa  298  9e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0260021  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1188  Radical SAM domain protein  40.17 
 
 
387 aa  296  4e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.12301 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0319  hypothetical protein  40.96 
 
 
362 aa  293  4e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000596234  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1279  Radical SAM domain protein  40.62 
 
 
380 aa  292  7e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3089  radical SAM domain-containing protein  39.77 
 
 
373 aa  290  2e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.185999  hitchhiker  0.000152785 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4713  Radical SAM domain protein  41.64 
 
 
393 aa  290  2e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0317853  normal  0.0266117 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3578  radical SAM domain-containing protein  41.31 
 
 
359 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0259  hypothetical protein  40.29 
 
 
384 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.341096  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0787  Radical SAM domain-containing protein  40 
 
 
391 aa  285  5.999999999999999e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.464244  normal  0.667055 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1846  hypothetical protein  39.6 
 
 
373 aa  285  1.0000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1643  Radical SAM domain protein  37.89 
 
 
367 aa  283  4.0000000000000003e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000555203  hitchhiker  0.00000328368 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1880  Radical SAM domain protein  41.83 
 
 
397 aa  282  7.000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0810  Radical SAM domain protein  39.54 
 
 
364 aa  279  5e-74  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0537641  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1525  Radical SAM domain protein  38.61 
 
 
396 aa  278  1e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.155468  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8066  Radical SAM domain protein  38.44 
 
 
386 aa  272  7e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.437454  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0519  hypothetical protein  38.92 
 
 
382 aa  271  1e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.520088 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2097  hypothetical protein  38.46 
 
 
376 aa  271  1e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0332172  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0315  Radical SAM domain protein  38.79 
 
 
360 aa  270  2e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0587  Radical SAM domain-containing protein  37.33 
 
 
390 aa  269  5e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.888096  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2962  Radical SAM domain protein  40.64 
 
 
360 aa  266  5.999999999999999e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0300282  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6111  radical SAM domain-containing protein  37.78 
 
 
392 aa  265  8.999999999999999e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0611343  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4085  radical SAM domain-containing protein  37.22 
 
 
389 aa  252  6e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.181055 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4505  radical SAM domain-containing protein  36.67 
 
 
389 aa  249  4e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.325974  normal  0.0287993 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0671  Radical SAM domain protein  37.14 
 
 
355 aa  249  5e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2193  radical SAM domain-containing protein  36.49 
 
 
355 aa  249  6e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1407  Radical SAM domain protein  36.95 
 
 
352 aa  244  1.9999999999999999e-63  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1645  Radical SAM domain protein  36.31 
 
 
358 aa  241  1e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000004914  hitchhiker  0.00000000624327 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1844  hypothetical protein  37.68 
 
 
360 aa  238  1e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1272  radical SAM domain-containing protein  35.94 
 
 
355 aa  235  8e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1091  radical SAM domain-containing protein  36.47 
 
 
356 aa  235  8e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0742  radical SAM domain-containing protein  37.36 
 
 
365 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.547138 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0235  Radical SAM domain protein  36.21 
 
 
357 aa  232  7.000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.568527  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0219  Radical SAM domain protein  35.71 
 
 
357 aa  232  9e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3390  hypothetical protein  35.92 
 
 
353 aa  231  2e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0371  hypothetical protein  35.57 
 
 
626 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.541832  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2811  Radical SAM domain protein  34.47 
 
 
402 aa  231  2e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.524917  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4207  radical SAM domain-containing protein  34.99 
 
 
625 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.428604  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1280  Radical SAM domain protein  32.07 
 
 
381 aa  231  2e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0533  hypothetical protein  33.9 
 
 
395 aa  230  3e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.271829  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0399  Radical SAM domain protein  35.86 
 
 
626 aa  230  3e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8059  Radical SAM domain protein  34.75 
 
 
404 aa  230  3e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0400  Radical SAM domain protein  35.86 
 
 
626 aa  229  4e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.184942  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3088  radical SAM domain-containing protein  35.17 
 
 
354 aa  229  4e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.675437  unclonable  0.0000126154 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3417  FO synthase subunit 2  35.96 
 
 
384 aa  229  5e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.1497 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0263  hypothetical protein  35.94 
 
 
380 aa  229  5e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4467  radical SAM domain-containing protein  33.82 
 
 
396 aa  228  1e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.82006  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4068  radical SAM domain-containing protein  34.11 
 
 
394 aa  227  2e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.18733 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3416  FO synthase subunit 2  36.84 
 
 
376 aa  226  4e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.90673  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0740  radical SAM domain-containing protein  36.76 
 
 
347 aa  226  4e-58  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000523159 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0442  radical SAM domain-containing protein  34.77 
 
 
354 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3618  radical SAM domain-containing protein  36.09 
 
 
357 aa  226  6e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0320  hypothetical protein  34.48 
 
 
355 aa  225  8e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000157308  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0797  hypothetical protein  33.33 
 
 
371 aa  224  2e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.106816  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0550  radical SAM domain-containing protein  31.05 
 
 
375 aa  223  3e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0244585  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4285  radical SAM domain-containing protein  35.24 
 
 
364 aa  223  3e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1258  Radical SAM domain-containing protein  33.53 
 
 
385 aa  222  7e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.616603 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1189  Radical SAM domain protein  31.7 
 
 
386 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.355638 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1324  radical SAM domain-containing protein  34.88 
 
 
348 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.161004  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1303  FO synthase subunit 2  37.43 
 
 
356 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0404  hypothetical protein  34.88 
 
 
349 aa  218  8.999999999999998e-56  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6099  radical SAM domain-containing protein  35.04 
 
 
515 aa  217  2e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.61579  normal  0.0270865 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1416  radical SAM domain-containing protein  32.47 
 
 
358 aa  217  2.9999999999999998e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.150894 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0222  radical SAM domain-containing protein  33.82 
 
 
353 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.255233  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0850  Radical SAM domain protein  34.2 
 
 
350 aa  216  7e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000345291  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1735  Radical SAM domain protein  32.74 
 
 
345 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00136048  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1159  hypothetical protein  34.01 
 
 
356 aa  214  9.999999999999999e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.34532  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0738  radical SAM domain-containing protein  34.12 
 
 
359 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000230285 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0284  radical SAM domain-containing protein  34.59 
 
 
358 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0592  radical SAM domain-containing protein  34.21 
 
 
419 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0217  radical SAM domain-containing protein  34.13 
 
 
353 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.896474  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>