244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1091 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1091  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
356 aa  724    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2193  radical SAM domain-containing protein  63.2 
 
 
355 aa  498  1e-140  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1645  Radical SAM domain protein  66.86 
 
 
358 aa  501  1e-140  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000004914  hitchhiker  0.00000000624327 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0671  Radical SAM domain protein  65.45 
 
 
355 aa  481  1e-134  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4285  radical SAM domain-containing protein  59.21 
 
 
364 aa  424  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0442  radical SAM domain-containing protein  59.6 
 
 
354 aa  423  1e-117  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0320  hypothetical protein  60.06 
 
 
355 aa  418  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000157308  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1844  hypothetical protein  60.52 
 
 
360 aa  418  1e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3618  radical SAM domain-containing protein  60.63 
 
 
357 aa  419  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3390  hypothetical protein  59.71 
 
 
353 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0219  Radical SAM domain protein  58.54 
 
 
357 aa  415  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3637  Radical SAM domain protein  62.42 
 
 
347 aa  412  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0235  Radical SAM domain protein  58.57 
 
 
357 aa  411  1e-114  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.568527  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1272  radical SAM domain-containing protein  55.93 
 
 
355 aa  393  1e-108  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1159  hypothetical protein  52.82 
 
 
356 aa  386  1e-106  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.34532  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3088  radical SAM domain-containing protein  57.69 
 
 
354 aa  386  1e-106  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.675437  unclonable  0.0000126154 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0797  hypothetical protein  53.45 
 
 
371 aa  383  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.106816  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0315  Radical SAM domain protein  53.58 
 
 
360 aa  381  1e-104  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1735  Radical SAM domain protein  54.12 
 
 
345 aa  379  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00136048  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1189  Radical SAM domain protein  53.74 
 
 
386 aa  379  1e-104  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.355638 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0550  radical SAM domain-containing protein  53.31 
 
 
375 aa  378  1e-104  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0244585  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1007  Radical SAM domain protein  52.91 
 
 
369 aa  375  1e-103  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0379726 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0801  hypothetical protein  49.28 
 
 
348 aa  372  1e-102  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000463089  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4207  radical SAM domain-containing protein  55.04 
 
 
625 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.428604  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0404  hypothetical protein  49.57 
 
 
349 aa  369  1e-101  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2811  Radical SAM domain protein  52.82 
 
 
402 aa  366  1e-100  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.524917  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1280  Radical SAM domain protein  51.86 
 
 
381 aa  365  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0533  hypothetical protein  51.42 
 
 
395 aa  368  1e-100  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.271829  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1619  hypothetical protein  51.01 
 
 
348 aa  365  1e-100  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.320855  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0850  Radical SAM domain protein  49.71 
 
 
350 aa  365  1e-100  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000345291  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1407  Radical SAM domain protein  50.88 
 
 
352 aa  365  1e-100  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2881  hypothetical protein  53.67 
 
 
348 aa  364  1e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1528  hypothetical protein  50.72 
 
 
363 aa  363  2e-99  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0371  hypothetical protein  52.59 
 
 
626 aa  362  5.0000000000000005e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.541832  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0400  Radical SAM domain protein  52.59 
 
 
626 aa  362  8e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.184942  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0399  Radical SAM domain protein  52.59 
 
 
626 aa  361  1e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4467  radical SAM domain-containing protein  50.57 
 
 
396 aa  361  1e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.82006  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4068  radical SAM domain-containing protein  49.43 
 
 
394 aa  353  2.9999999999999997e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.18733 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1258  Radical SAM domain-containing protein  48.3 
 
 
385 aa  350  3e-95  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.616603 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0263  hypothetical protein  53.43 
 
 
380 aa  347  2e-94  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4707  radical SAM domain-containing protein  49.05 
 
 
399 aa  346  3e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6099  radical SAM domain-containing protein  51.14 
 
 
515 aa  342  5.999999999999999e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.61579  normal  0.0270865 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1029  hypothetical protein  46.65 
 
 
359 aa  341  1e-92  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.148113  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0487  hypothetical protein  49.86 
 
 
348 aa  337  2.9999999999999997e-91  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.995091  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8059  Radical SAM domain protein  46.37 
 
 
404 aa  336  2.9999999999999997e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1477  hypothetical protein  49.57 
 
 
348 aa  335  7.999999999999999e-91  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.32235  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1588  Radical SAM domain protein  47.61 
 
 
374 aa  334  1e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.357687  normal  0.0606442 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0512  hypothetical protein  49.57 
 
 
348 aa  333  2e-90  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1089  radical SAM domain-containing protein  49.3 
 
 
368 aa  333  3e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0701  Radical SAM domain protein  45.96 
 
 
374 aa  333  3e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2195  radical SAM domain-containing protein  46.24 
 
 
367 aa  330  2e-89  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0686  hypothetical protein  48.27 
 
 
348 aa  329  4e-89  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.725444  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1450  Radical SAM domain protein  45.96 
 
 
368 aa  317  3e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000839661  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1789  Radical SAM domain-containing protein  48.03 
 
 
377 aa  315  6e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4284  radical SAM domain-containing protein  44.32 
 
 
360 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3391  hypothetical protein  46.81 
 
 
360 aa  311  7.999999999999999e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.352496  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1998  hypothetical protein  47.77 
 
 
393 aa  310  2.9999999999999997e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.261204  normal  0.689392 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0625  Radical SAM domain protein  45.28 
 
 
359 aa  308  8e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.834734  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1643  Radical SAM domain protein  44.29 
 
 
367 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000555203  hitchhiker  0.00000328368 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0234  Radical SAM domain protein  43.79 
 
 
358 aa  305  7e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0218  Radical SAM domain protein  43.5 
 
 
358 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1416  radical SAM domain-containing protein  45.13 
 
 
358 aa  301  1e-80  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.150894 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0441  radical SAM domain-containing protein  45.85 
 
 
361 aa  300  2e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3578  radical SAM domain-containing protein  44.44 
 
 
359 aa  298  7e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1958  Radical SAM domain protein  47.06 
 
 
379 aa  296  5e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.443092  normal  0.514588 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3089  radical SAM domain-containing protein  45.48 
 
 
373 aa  295  7e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.185999  hitchhiker  0.000152785 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0319  hypothetical protein  44.38 
 
 
362 aa  293  3e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000596234  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0217  radical SAM domain-containing protein  44.28 
 
 
353 aa  292  7e-78  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.896474  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1157  radical SAM domain-containing protein  40.56 
 
 
359 aa  290  2e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.423135  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0148  hypothetical protein  43.79 
 
 
354 aa  289  4e-77  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.200407  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1324  radical SAM domain-containing protein  42.43 
 
 
348 aa  288  7e-77  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.161004  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1499  Radical SAM domain protein  39.55 
 
 
373 aa  288  1e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1846  hypothetical protein  44.26 
 
 
373 aa  286  4e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3416  FO synthase subunit 2  42.9 
 
 
376 aa  285  8e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.90673  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2163  radical SAM domain-containing protein  42.09 
 
 
367 aa  284  2.0000000000000002e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0740  radical SAM domain-containing protein  43.81 
 
 
347 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000523159 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0223  radical SAM domain-containing protein  43.62 
 
 
364 aa  282  7.000000000000001e-75  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.772616  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0810  Radical SAM domain protein  39.61 
 
 
364 aa  280  2e-74  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0537641  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0742  radical SAM domain-containing protein  40.56 
 
 
365 aa  276  3e-73  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.547138 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0592  radical SAM domain-containing protein  38.86 
 
 
419 aa  276  6e-73  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0554  radical SAM domain-containing protein  40.11 
 
 
372 aa  275  8e-73  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.420102 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1271  radical SAM domain-containing protein  41.38 
 
 
367 aa  272  6e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0048  radical SAM domain-containing protein  43.49 
 
 
367 aa  270  4e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3417  FO synthase subunit 2  42.66 
 
 
384 aa  269  7e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.1497 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0551  radical SAM domain-containing protein  40.67 
 
 
372 aa  268  8.999999999999999e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0260021  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0284  radical SAM domain-containing protein  45.16 
 
 
358 aa  268  1e-70  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0401  Radical SAM domain protein  41.57 
 
 
388 aa  266  4e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.575372  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1188  Radical SAM domain protein  42.29 
 
 
387 aa  266  5e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.12301 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0400  Radical SAM domain protein  41.29 
 
 
388 aa  265  7e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4206  radical SAM domain-containing protein  41.57 
 
 
387 aa  264  1e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0798  hypothetical protein  40.34 
 
 
371 aa  264  2e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.22786  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0372  hypothetical protein  41.29 
 
 
388 aa  263  3e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.153227  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0587  Radical SAM domain-containing protein  39.18 
 
 
390 aa  261  2e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.888096  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2097  hypothetical protein  40.38 
 
 
376 aa  261  2e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0332172  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1303  FO synthase subunit 2  39.72 
 
 
356 aa  258  1e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8066  Radical SAM domain protein  38.08 
 
 
386 aa  258  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.437454  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4252  Radical SAM domain protein  40.44 
 
 
435 aa  258  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238128  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1115  radical SAM domain-containing protein  40.22 
 
 
418 aa  257  2e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0259  hypothetical protein  39.61 
 
 
384 aa  257  3e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.341096  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0038  radical SAM domain-containing protein  41 
 
 
362 aa  256  5e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>